MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3

Total Repeats: 3226

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009928	AAC	2	6	58	63	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009928	AGA	2	6	197	202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009928	TAC	2	6	244	249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009928	TGC	2	6	280	285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009928	AGG	2	6	334	339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340457
6	NC_009928	TGC	2	6	395	400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340457
7	NC_009928	CAG	2	6	430	435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340457
8	NC_009928	CTT	2	6	504	509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340458
9	NC_009928	AGC	2	6	517	522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340458
10	NC_009928	TGA	2	6	809	814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340458
11	NC_009928	AAT	2	6	1026	1031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340458
12	NC_009928	TGT	2	6	1181	1186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340458
13	NC_009928	ATC	2	6	1314	1319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009928	AGC	2	6	1321	1326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009928	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340459
16	NC_009928	TGA	2	6	1620	1625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340459
17	NC_009928	ATT	2	6	1626	1631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340459
18	NC_009928	CGA	2	6	1714	1719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340459
19	NC_009928	GAG	2	6	1907	1912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340459
20	NC_009928	TCT	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340459
21	NC_009928	CTT	2	6	2204	2209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340460
22	NC_009928	ACA	2	6	2336	2341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_009928	CAG	2	6	2363	2368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_009928	CTT	2	6	2381	2386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_009928	TGC	2	6	2474	2479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009928	GCA	2	6	2539	2544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009928	ATT	2	6	2568	2573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009928	TGC	2	6	2575	2580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009928	GGC	2	6	2624	2629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009928	CTT	2	6	2698	2703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340461
31	NC_009928	AGC	2	6	2707	2712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340461
32	NC_009928	CTT	2	6	2784	2789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340461
33	NC_009928	GCT	2	6	2810	2815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340461
34	NC_009928	CAT	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340461
35	NC_009928	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340461
36	NC_009928	TCC	2	6	3138	3143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_009928	CCA	2	6	3155	3160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_009928	TTC	2	6	3196	3201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009928	TTC	2	6	3315	3320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340462
40	NC_009928	TTC	2	6	3344	3349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340462
41	NC_009928	CTC	2	6	3350	3355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340462
42	NC_009928	CTC	2	6	3554	3559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340462
43	NC_009928	GAA	2	6	3853	3858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_009928	TGA	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340464
45	NC_009928	GTT	2	6	4221	4226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340464
46	NC_009928	TAG	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340464
47	NC_009928	CCT	2	6	4400	4405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340464
48	NC_009928	GCA	2	6	4555	4560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340464
49	NC_009928	CCA	2	6	4636	4641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340464
50	NC_009928	CTG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340464
51	NC_009928	TTC	2	6	4734	4739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340464
52	NC_009928	TAC	2	6	4784	4789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340464
53	NC_009928	AGA	2	6	4847	4852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009928	TGA	2	6	4984	4989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340465
55	NC_009928	GGA	2	6	5078	5083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340465
56	NC_009928	TGG	2	6	5164	5169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340465
57	NC_009928	ATG	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340465
58	NC_009928	TGG	2	6	5252	5257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009928	TGA	3	9	5406	5414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340466
60	NC_009928	AGT	2	6	5545	5550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340466
61	NC_009928	AGC	2	6	5615	5620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009928	CAG	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009928	TGA	2	6	6201	6206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009928	AGG	2	6	6505	6510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009928	CTT	2	6	7083	7088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340468
66	NC_009928	CAG	2	6	7108	7113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340468
67	NC_009928	TCG	2	6	7130	7135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340468
68	NC_009928	ATT	2	6	7547	7552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340468
69	NC_009928	TGG	2	6	7716	7721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340468
70	NC_009928	TGA	2	6	7754	7759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340468
71	NC_009928	GAT	2	6	7764	7769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340468
72	NC_009928	CAG	2	6	7848	7853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340468
73	NC_009928	CAA	2	6	7914	7919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340468
74	NC_009928	CGC	2	6	8019	8024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340468
75	NC_009928	AGA	2	6	8103	8108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
76	NC_009928	AGC	2	6	8139	8144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340468
77	NC_009928	GCC	2	6	8152	8157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340468
78	NC_009928	ACA	3	9	8181	8189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340468
79	NC_009928	GGA	2	6	8433	8438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340468
80	NC_009928	AAG	2	6	9066	9071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
81	NC_009928	GCT	2	6	9307	9312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340468
82	NC_009928	TGA	2	6	9317	9322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340468
83	NC_009928	GTG	2	6	9330	9335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340468
84	NC_009928	CCA	2	6	9475	9480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340468
85	NC_009928	AAG	2	6	9495	9500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
86	NC_009928	TGG	2	6	9519	9524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340468
87	NC_009928	GCC	2	6	9609	9614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340468
88	NC_009928	GAA	3	9	9648	9656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
89	NC_009928	GAC	2	6	9715	9720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340468
90	NC_009928	GTG	2	6	9756	9761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340468
91	NC_009928	GCC	2	6	9828	9833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340468
92	NC_009928	AAG	2	6	9897	9902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
93	NC_009928	CAA	2	6	9909	9914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340468
94	NC_009928	GTG	2	6	9915	9920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340468
95	NC_009928	TTG	2	6	10277	10282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340468
96	NC_009928	TTA	2	6	10408	10413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009928	GCT	2	6	10443	10448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009928	TTG	2	6	10470	10475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009928	CAA	2	6	10516	10521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009928	ATT	2	6	10577	10582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009928	ATA	2	6	10655	10660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340469
102	NC_009928	TTC	2	6	10693	10698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340469
103	NC_009928	ACA	2	6	10731	10736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340469
104	NC_009928	TAT	2	6	10737	10742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340469
105	NC_009928	CTT	2	6	10749	10754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340469
106	NC_009928	CAA	2	6	10822	10827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340469
107	NC_009928	GAT	2	6	10835	10840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340469
108	NC_009928	CTG	3	9	11070	11078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340469
109	NC_009928	AAG	2	6	11089	11094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340469
110	NC_009928	GTT	2	6	11162	11167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340469
111	NC_009928	TAA	2	6	11290	11295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340469
112	NC_009928	TGA	2	6	11321	11326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340469
113	NC_009928	ACG	2	6	11375	11380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340469
114	NC_009928	GCC	2	6	11536	11541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340469
115	NC_009928	TGG	2	6	11645	11650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340469
116	NC_009928	TGA	2	6	11739	11744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340469
117	NC_009928	TGA	2	6	11775	11780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340469
118	NC_009928	AAT	2	6	11846	11851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340469
119	NC_009928	CAC	2	6	11967	11972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340469
120	NC_009928	TTG	2	6	11998	12003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340469
121	NC_009928	ATG	2	6	12050	12055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340469
122	NC_009928	CAA	2	6	12168	12173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340469
123	NC_009928	GTT	2	6	12174	12179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340469
124	NC_009928	GCA	2	6	12441	12446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340469
125	NC_009928	CTG	2	6	12453	12458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340469
126	NC_009928	GAT	2	6	12469	12474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340469
127	NC_009928	TTC	2	6	12496	12501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340469
128	NC_009928	ACC	2	6	12548	12553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340469
129	NC_009928	TTG	2	6	12604	12609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340469
130	NC_009928	TCA	2	6	13096	13101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340470
131	NC_009928	TCT	2	6	13107	13112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340470
132	NC_009928	CTC	2	6	13221	13226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340470
133	NC_009928	TAC	2	6	13249	13254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340470
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251	NC_009928	ATG	2	6	21713	21718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
252	NC_009928	CCT	2	6	21817	21822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340475
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255	NC_009928	GCT	2	6	22281	22286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_009928	TTG	2	6	22331	22336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340476
257	NC_009928	GGC	2	6	22359	22364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158340476
258	NC_009928	TGG	2	6	22461	22466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
259	NC_009928	TAT	2	6	22483	22488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_009928	CAA	2	6	22501	22506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_009928	CTA	2	6	22665	22670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340477
262	NC_009928	GCA	2	6	22679	22684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340477
263	NC_009928	TGT	2	6	22948	22953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
264	NC_009928	GAA	2	6	22964	22969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
265	NC_009928	ACA	2	6	23083	23088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
266	NC_009928	ACA	2	6	23115	23120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_009928	GTT	2	6	23126	23131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
268	NC_009928	AAT	2	6	23139	23144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_009928	ATA	2	6	23313	23318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_009928	TCC	2	6	23453	23458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340478
271	NC_009928	AAG	2	6	23488	23493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340478
272	NC_009928	TTA	2	6	23532	23537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340478
273	NC_009928	TCT	2	6	23541	23546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340478
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277	NC_009928	TCC	2	6	23899	23904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340478
278	NC_009928	GCT	2	6	23997	24002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340478
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281	NC_009928	ATT	2	6	24147	24152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340478
282	NC_009928	CAA	2	6	24196	24201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340478
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288	NC_009928	CAA	2	6	24612	24617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340478
289	NC_009928	GCT	2	6	24663	24668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340478
290	NC_009928	ATT	2	6	24749	24754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340478
291	NC_009928	TCT	2	6	24824	24829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340478
292	NC_009928	ATG	2	6	24841	24846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340478
293	NC_009928	TGA	2	6	25016	25021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340478
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300	NC_009928	TGA	2	6	25847	25852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340478
301	NC_009928	ATG	2	6	25957	25962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340478
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324	NC_009928	GAA	2	6	28513	28518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
325	NC_009928	GAG	2	6	28521	28526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
326	NC_009928	CTG	2	6	28668	28673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
327	NC_009928	GAG	2	6	28699	28704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
328	NC_009928	CCT	2	6	28712	28717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
329	NC_009928	TAA	2	6	28812	28817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
330	NC_009928	ACC	2	6	28912	28917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
331	NC_009928	TTC	2	6	28942	28947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
332	NC_009928	AAG	2	6	29003	29008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
333	NC_009928	TGA	2	6	29205	29210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
334	NC_009928	CTT	2	6	29211	29216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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336	NC_009928	CGA	2	6	29301	29306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
337	NC_009928	TCT	2	6	29352	29357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
338	NC_009928	CAT	2	6	29577	29582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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340	NC_009928	TGC	2	6	29756	29761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
341	NC_009928	AGG	2	6	29851	29856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
342	NC_009928	GGT	2	6	29884	29889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
343	NC_009928	TGC	3	9	29984	29992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
344	NC_009928	CAA	2	6	30189	30194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
345	NC_009928	AGC	2	6	30240	30245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340484
346	NC_009928	GAG	2	6	30290	30295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340484
347	NC_009928	TTG	2	6	30516	30521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340485
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351	NC_009928	TTC	2	6	30726	30731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340485
352	NC_009928	GAT	2	6	30779	30784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340485
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354	NC_009928	GTG	2	6	30970	30975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340485
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358	NC_009928	ATC	2	6	31457	31462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340485
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361	NC_009928	CTT	2	6	31765	31770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340485
362	NC_009928	ATC	2	6	31814	31819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340486
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375	NC_009928	CAC	2	6	32631	32636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340487
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381	NC_009928	AAC	2	6	33187	33192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340487
382	NC_009928	AGC	2	6	33197	33202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340487
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384	NC_009928	GAA	2	6	33253	33258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340487
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386	NC_009928	CTG	2	6	33510	33515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340487
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