MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3

Total Repeats: 4865

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009928	AAC	2	6	58	63	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_009928	AGA	2	6	197	202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_009928	TAC	2	6	244	249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_009928	TGC	2	6	280	285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009928	AGG	2	6	334	339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340457
6	NC_009928	TGC	2	6	395	400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340457
7	NC_009928	CAG	2	6	430	435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340457
8	NC_009928	CTT	2	6	504	509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340458
9	NC_009928	AGC	2	6	517	522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340458
10	NC_009928	AGCT	2	8	796	803	25 %	25 %	25 %	25 %	158340458
11	NC_009928	TGA	2	6	809	814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340458
12	NC_009928	A	6	6	980	985	100 %	0 %	0 %	0 %	158340458
13	NC_009928	AAT	2	6	1026	1031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340458
14	NC_009928	CAATC	2	10	1104	1113	40 %	20 %	0 %	40 %	158340458
15	NC_009928	CGAT	2	8	1151	1158	25 %	25 %	25 %	25 %	158340458
16	NC_009928	TGT	2	6	1181	1186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340458
17	NC_009928	CAGC	2	8	1240	1247	25 %	0 %	25 %	50 %	158340458
18	NC_009928	ATC	2	6	1314	1319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_009928	AGC	2	6	1321	1326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009928	AG	3	6	1391	1396	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009928	TGCG	2	8	1445	1452	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009928	CT	3	6	1538	1543	0 %	50 %	0 %	50 %	158340459
23	NC_009928	CT	3	6	1565	1570	0 %	50 %	0 %	50 %	158340459
24	NC_009928	CT	3	6	1576	1581	0 %	50 %	0 %	50 %	158340459
25	NC_009928	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340459
26	NC_009928	TGA	2	6	1620	1625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340459
27	NC_009928	ATT	2	6	1626	1631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340459
28	NC_009928	T	6	6	1690	1695	0 %	100 %	0 %	0 %	158340459
29	NC_009928	CGA	2	6	1714	1719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340459
30	NC_009928	ATTT	2	8	1807	1814	25 %	75 %	0 %	0 %	158340459
31	NC_009928	T	7	7	1812	1818	0 %	100 %	0 %	0 %	158340459
32	NC_009928	GAG	2	6	1907	1912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340459
33	NC_009928	TCT	2	6	1914	1919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340459
34	NC_009928	A	6	6	1921	1926	100 %	0 %	0 %	0 %	158340459
35	NC_009928	CTT	2	6	2204	2209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340460
36	NC_009928	ACA	2	6	2336	2341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009928	CAG	2	6	2363	2368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009928	CTT	2	6	2381	2386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009928	TTGG	2	8	2433	2440	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009928	TGC	2	6	2474	2479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009928	GCA	2	6	2539	2544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_009928	ATT	2	6	2568	2573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009928	TGC	2	6	2575	2580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009928	GGC	2	6	2624	2629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_009928	ACACT	2	10	2630	2639	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_009928	CTT	2	6	2698	2703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340461
47	NC_009928	AGC	2	6	2707	2712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340461
48	NC_009928	CT	3	6	2773	2778	0 %	50 %	0 %	50 %	158340461
49	NC_009928	CTT	2	6	2784	2789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340461
50	NC_009928	GCT	2	6	2810	2815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340461
51	NC_009928	CAT	2	6	2868	2873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340461
52	NC_009928	GAGC	2	8	2985	2992	25 %	0 %	50 %	25 %	158340461
53	NC_009928	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340461
54	NC_009928	TCC	2	6	3138	3143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_009928	CCA	2	6	3155	3160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_009928	TTC	2	6	3196	3201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009928	GGAG	2	8	3273	3280	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
58	NC_009928	ATCA	2	8	3292	3299	50 %	25 %	0 %	25 %	158340462
59	NC_009928	TTC	2	6	3315	3320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340462
60	NC_009928	TTC	2	6	3344	3349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340462
61	NC_009928	CTC	2	6	3350	3355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340462
62	NC_009928	T	6	6	3425	3430	0 %	100 %	0 %	0 %	158340462
63	NC_009928	GCAA	2	8	3515	3522	50 %	0 %	25 %	25 %	158340462
64	NC_009928	CTC	2	6	3554	3559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340462
65	NC_009928	TGGA	2	8	3600	3607	25 %	25 %	50 %	0 %	158340462
66	NC_009928	AT	3	6	3658	3663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009928	GAA	2	6	3853	3858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009928	CTTAA	2	10	4000	4009	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009928	AC	3	6	4029	4034	50 %	0 %	0 %	50 %	158340464
70	NC_009928	TGA	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340464
71	NC_009928	AGGG	2	8	4193	4200	25 %	0 %	75 %	0 %	158340464
72	NC_009928	GTT	2	6	4221	4226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340464
73	NC_009928	GA	3	6	4271	4276	50 %	0 %	50 %	0 %	158340464
74	NC_009928	AATA	2	8	4308	4315	75 %	25 %	0 %	0 %	158340464
75	NC_009928	TAG	2	6	4350	4355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340464
76	NC_009928	CCT	2	6	4400	4405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340464
77	NC_009928	TAAA	2	8	4458	4465	75 %	25 %	0 %	0 %	158340464
78	NC_009928	A	7	7	4476	4482	100 %	0 %	0 %	0 %	158340464
79	NC_009928	T	6	6	4546	4551	0 %	100 %	0 %	0 %	158340464
80	NC_009928	GCA	2	6	4555	4560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340464
81	NC_009928	CCA	2	6	4636	4641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158340464
82	NC_009928	CTG	2	6	4719	4724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340464
83	NC_009928	TTC	2	6	4734	4739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340464
84	NC_009928	CCAT	2	8	4775	4782	25 %	25 %	0 %	50 %	158340464
85	NC_009928	TAC	2	6	4784	4789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340464
86	NC_009928	AGA	2	6	4847	4852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009928	AATC	2	8	4948	4955	50 %	25 %	0 %	25 %	158340465
88	NC_009928	TGA	2	6	4984	4989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340465
89	NC_009928	GGA	2	6	5078	5083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340465
90	NC_009928	GA	3	6	5120	5125	50 %	0 %	50 %	0 %	158340465
91	NC_009928	TGG	2	6	5164	5169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340465
92	NC_009928	ATG	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340465
93	NC_009928	GGCAGG	2	12	5230	5241	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_009928	TGG	2	6	5252	5257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_009928	TGA	3	9	5406	5414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340466
96	NC_009928	TCGT	2	8	5512	5519	0 %	50 %	25 %	25 %	158340466
97	NC_009928	AGT	2	6	5545	5550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340466
98	NC_009928	AGC	2	6	5615	5620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009928	CAG	2	6	5723	5728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_009928	TTAG	2	8	5740	5747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009928	TA	3	6	5825	5830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009928	ATTT	2	8	5837	5844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009928	AGCTA	2	10	5870	5879	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_009928	GTCA	2	8	6030	6037	25 %	25 %	25 %	25 %	158340467
105	NC_009928	GA	3	6	6050	6055	50 %	0 %	50 %	0 %	158340467
106	NC_009928	TGA	2	6	6201	6206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009928	AC	3	6	6246	6251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_009928	AGAA	2	8	6288	6295	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009928	GAAA	2	8	6317	6324	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009928	T	7	7	6332	6338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009928	AGG	2	6	6505	6510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_009928	A	6	6	6538	6543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009928	T	6	6	6708	6713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009928	AGGC	2	8	6838	6845	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_009928	AG	3	6	7002	7007	50 %	0 %	50 %	0 %	158340468
116	NC_009928	CTT	2	6	7083	7088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158340468
117	NC_009928	CAG	2	6	7108	7113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340468
118	NC_009928	TCG	2	6	7130	7135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340468
119	NC_009928	GTCG	2	8	7175	7182	0 %	25 %	50 %	25 %	158340468
120	NC_009928	CT	3	6	7197	7202	0 %	50 %	0 %	50 %	158340468
121	NC_009928	ACCTC	2	10	7493	7502	20 %	20 %	0 %	60 %	158340468
122	NC_009928	ATT	2	6	7547	7552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158340468
123	NC_009928	TGG	2	6	7716	7721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340468
124	NC_009928	TGA	2	6	7754	7759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340468
125	NC_009928	GAT	2	6	7764	7769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340468
126	NC_009928	CAG	2	6	7848	7853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340468
127	NC_009928	ACTC	2	8	7865	7872	25 %	25 %	0 %	50 %	158340468
128	NC_009928	CAA	2	6	7914	7919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340468
129	NC_009928	ACCC	2	8	7920	7927	25 %	0 %	0 %	75 %	158340468
130	NC_009928	C	6	6	7925	7930	0 %	0 %	0 %	100 %	158340468
131	NC_009928	CTGC	2	8	7983	7990	0 %	25 %	25 %	50 %	158340468
132	NC_009928	CGC	2	6	8019	8024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340468
133	NC_009928	AT	3	6	8060	8065	50 %	50 %	0 %	0 %	158340468
134	NC_009928	AGA	2	6	8103	8108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
135	NC_009928	AC	3	6	8124	8129	50 %	0 %	0 %	50 %	158340468
136	NC_009928	AGC	2	6	8139	8144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340468
137	NC_009928	GCC	2	6	8152	8157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340468
138	NC_009928	ACA	3	9	8181	8189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340468
139	NC_009928	CTCAT	2	10	8241	8250	20 %	40 %	0 %	40 %	158340468
140	NC_009928	GGA	2	6	8433	8438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158340468
141	NC_009928	ATGG	2	8	8883	8890	25 %	25 %	50 %	0 %	158340468
142	NC_009928	AAG	2	6	9066	9071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
143	NC_009928	GCT	2	6	9307	9312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340468
144	NC_009928	TGA	2	6	9317	9322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340468
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149	NC_009928	GCC	2	6	9609	9614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340468
150	NC_009928	GAA	3	9	9648	9656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158340468
151	NC_009928	GAC	2	6	9715	9720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158340468
152	NC_009928	GTG	2	6	9756	9761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340468
153	NC_009928	GCC	2	6	9828	9833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158340468
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155	NC_009928	CAA	2	6	9909	9914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340468
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157	NC_009928	TGAA	2	8	10114	10121	50 %	25 %	25 %	0 %	158340468
158	NC_009928	TTG	2	6	10277	10282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340468
159	NC_009928	AT	3	6	10345	10350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_009928	GAAT	2	8	10395	10402	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
161	NC_009928	TTA	2	6	10408	10413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_009928	GCT	2	6	10443	10448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_009928	TTG	2	6	10470	10475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009928	TCAG	2	8	10482	10489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
165	NC_009928	CAA	2	6	10516	10521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_009928	A	7	7	10556	10562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_009928	ATT	2	6	10577	10582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_009928	ATA	2	6	10655	10660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340469
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174	NC_009928	GAAA	2	8	10780	10787	75 %	0 %	25 %	0 %	158340469
175	NC_009928	CAA	2	6	10822	10827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158340469
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184	NC_009928	AG	3	6	11232	11237	50 %	0 %	50 %	0 %	158340469
185	NC_009928	TAA	2	6	11290	11295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158340469
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271	NC_009928	ACCA	2	8	15589	15596	50 %	0 %	0 %	50 %	158340471
272	NC_009928	CAT	2	6	15600	15605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340471
273	NC_009928	TGG	2	6	15629	15634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158340471
274	NC_009928	TTG	2	6	15750	15755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340472
275	NC_009928	GAT	2	6	15759	15764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340472
276	NC_009928	CCT	2	6	15790	15795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340472
277	NC_009928	ATC	2	6	15885	15890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340472
278	NC_009928	CTGAA	2	10	15910	15919	40 %	20 %	20 %	20 %	158340472
279	NC_009928	GAT	2	6	15990	15995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340472
280	NC_009928	TGA	2	6	16042	16047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158340472
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282	NC_009928	GCT	2	6	16226	16231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158340472
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284	NC_009928	TCA	2	6	16423	16428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_009928	TA	3	6	16483	16488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_009928	ATC	2	6	16593	16598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_009928	TGTGG	2	10	16625	16634	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
288	NC_009928	ACT	2	6	16642	16647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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291	NC_009928	TTTG	2	8	16707	16714	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
292	NC_009928	GTAT	2	8	16785	16792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
293	NC_009928	AGGGTT	2	12	16810	16821	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	158340473
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381	NC_009928	CGT	2	6	21655	21660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
382	NC_009928	AGCTT	2	10	21663	21672	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
383	NC_009928	AGT	2	6	21674	21679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
384	NC_009928	ATG	2	6	21713	21718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
385	NC_009928	TGAC	2	8	21750	21757	25 %	25 %	25 %	25 %	158340475
386	NC_009928	ACCGA	2	10	21780	21789	40 %	0 %	20 %	40 %	158340475
387	NC_009928	CCT	2	6	21817	21822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158340475
388	NC_009928	T	6	6	21946	21951	0 %	100 %	0 %	0 %	158340475
389	NC_009928	TGT	2	6	21958	21963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340475
390	NC_009928	TCA	2	6	21984	21989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340475
391	NC_009928	A	7	7	22248	22254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
392	NC_009928	TG	3	6	22269	22274	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
393	NC_009928	GCT	2	6	22281	22286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
394	NC_009928	TTG	2	6	22331	22336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158340476
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396	NC_009928	TGG	2	6	22461	22466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
397	NC_009928	TAT	2	6	22483	22488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_009928	CAA	2	6	22501	22506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
399	NC_009928	TTGG	2	8	22512	22519	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
400	NC_009928	CTA	2	6	22665	22670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158340477
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