MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB1

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009926	TTCCG	2	10	796	805	0 %	40 %	20 %	40 %	158339656
2	NC_009926	CAATC	2	10	1162	1171	40 %	20 %	0 %	40 %	158339656
3	NC_009926	ACACT	2	10	2689	2698	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_009926	GAATA	2	10	4146	4155	60 %	20 %	20 %	0 %	158339661
5	NC_009926	GAAAC	2	10	5444	5453	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_009926	CAATG	2	10	7976	7985	40 %	20 %	20 %	20 %	158339665
7	NC_009926	CCAAG	2	10	12633	12642	40 %	0 %	20 %	40 %	158339668
8	NC_009926	CAGTT	2	10	13100	13109	20 %	40 %	20 %	20 %	158339668
9	NC_009926	TCCAC	2	10	20164	20173	20 %	20 %	0 %	60 %	158339674
10	NC_009926	GAATG	2	10	23588	23597	40 %	20 %	40 %	0 %	158339676
11	NC_009926	TCAAA	2	10	23776	23785	60 %	20 %	0 %	20 %	158339676
12	NC_009926	GACAA	2	10	25583	25592	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_009926	GCTTG	2	10	25803	25812	0 %	40 %	40 %	20 %	158339677
14	NC_009926	GGGTC	2	10	26515	26524	0 %	20 %	60 %	20 %	158339677
15	NC_009926	AAGCT	2	10	29121	29130	40 %	20 %	20 %	20 %	158339680
16	NC_009926	TTGAC	2	10	35290	35299	20 %	40 %	20 %	20 %	158339684
17	NC_009926	GCCAA	2	10	35323	35332	40 %	0 %	20 %	40 %	158339684
18	NC_009926	GGAGT	2	10	36875	36884	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009926	TTGGA	2	10	37587	37596	20 %	40 %	40 %	0 %	158339687
20	NC_009926	GGTAA	2	10	41850	41859	40 %	20 %	40 %	0 %	158339688
21	NC_009926	GACTT	2	10	44737	44746	20 %	40 %	20 %	20 %	158339692
22	NC_009926	TCAAC	2	10	45130	45139	40 %	20 %	0 %	40 %	158339692
23	NC_009926	TAAAC	2	10	45893	45902	60 %	20 %	0 %	20 %	158339692
24	NC_009926	CATAT	2	10	46460	46469	40 %	40 %	0 %	20 %	158339692
25	NC_009926	AAATC	2	10	47737	47746	60 %	20 %	0 %	20 %	158339693
26	NC_009926	AGTCA	2	10	49126	49135	40 %	20 %	20 %	20 %	158339695
27	NC_009926	ATCGT	2	10	55317	55326	20 %	40 %	20 %	20 %	158339704
28	NC_009926	AACAT	2	10	57627	57636	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_009926	TCAGA	2	10	57733	57742	40 %	20 %	20 %	20 %	158339708
30	NC_009926	TTCAG	2	10	57910	57919	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_009926	GCATT	2	10	58442	58451	20 %	40 %	20 %	20 %	158339709
32	NC_009926	TAGAA	2	10	59020	59029	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009926	CACCT	2	10	60003	60012	20 %	20 %	0 %	60 %	158339712
34	NC_009926	GCAGA	2	10	60109	60118	40 %	0 %	40 %	20 %	158339712
35	NC_009926	CATCA	2	10	61059	61068	40 %	20 %	0 %	40 %	158339711
36	NC_009926	AGGAA	2	10	61398	61407	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009926	AATCA	2	10	62791	62800	60 %	20 %	0 %	20 %	158339715
38	NC_009926	TTGAG	2	10	63281	63290	20 %	40 %	40 %	0 %	158339715
39	NC_009926	ACAAT	2	10	64222	64231	60 %	20 %	0 %	20 %	158339718
40	NC_009926	GCTCG	2	10	64648	64657	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_009926	AGTTG	2	10	70077	70086	20 %	40 %	40 %	0 %	158339727
42	NC_009926	TGGGG	2	10	72733	72742	0 %	20 %	80 %	0 %	158339729
43	NC_009926	CAAGC	2	10	73506	73515	40 %	0 %	20 %	40 %	158339731
44	NC_009926	ACCAT	2	10	76478	76487	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_009926	GGCGA	2	10	77878	77887	20 %	0 %	60 %	20 %	158339734
46	NC_009926	AACTG	2	10	78030	78039	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_009926	CTCAC	2	10	79037	79046	20 %	20 %	0 %	60 %	158339736
48	NC_009926	CATTG	2	10	81168	81177	20 %	40 %	20 %	20 %	158339741
49	NC_009926	CAAAC	2	10	81996	82005	60 %	0 %	0 %	40 %	158339742
50	NC_009926	TCCAC	2	10	82631	82640	20 %	20 %	0 %	60 %	158339742
51	NC_009926	TCAGC	2	10	85357	85366	20 %	20 %	20 %	40 %	158339743
52	NC_009926	CATGG	2	10	85376	85385	20 %	20 %	40 %	20 %	158339743
53	NC_009926	ATCTG	2	10	85572	85581	20 %	40 %	20 %	20 %	158339743
54	NC_009926	GGTTT	2	10	85941	85950	0 %	60 %	40 %	0 %	158339743
55	NC_009926	GAATC	2	10	92128	92137	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_009926	TGATT	2	10	94291	94300	20 %	60 %	20 %	0 %	158339754
57	NC_009926	TTGGT	2	10	95773	95782	0 %	60 %	40 %	0 %	158339757
58	NC_009926	AAAAT	2	10	98639	98648	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009926	AGGAT	2	10	100053	100062	40 %	20 %	40 %	0 %	158339766
60	NC_009926	AACCG	2	10	100136	100145	40 %	0 %	20 %	40 %	158339766
61	NC_009926	GCATG	2	10	100533	100542	20 %	20 %	40 %	20 %	158339766
62	NC_009926	TGATT	2	10	100681	100690	20 %	60 %	20 %	0 %	158339766
63	NC_009926	GTCTT	2	10	101580	101589	0 %	60 %	20 %	20 %	158339767
64	NC_009926	TTATT	2	10	102358	102367	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_009926	TAAAG	2	10	102517	102526	60 %	20 %	20 %	0 %	158339768
66	NC_009926	GCTCT	2	10	102654	102663	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_009926	CGTTA	2	10	103206	103215	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_009926	TGTCG	2	10	105149	105158	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_009926	CCTGG	2	10	105191	105200	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
70	NC_009926	ACAAA	2	10	105689	105698	80 %	0 %	0 %	20 %	158339772
71	NC_009926	CGTTA	2	10	106527	106536	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_009926	ATGAA	2	10	111714	111723	60 %	20 %	20 %	0 %	158339776
73	NC_009926	ATTTT	2	10	112380	112389	20 %	80 %	0 %	0 %	158339777
74	NC_009926	CTCTG	2	10	114297	114306	0 %	40 %	20 %	40 %	158339779
75	NC_009926	CTGTC	2	10	116155	116164	0 %	40 %	20 %	40 %	158339780
76	NC_009926	ATTCG	2	10	116392	116401	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_009926	CGGGT	2	10	116834	116843	0 %	20 %	60 %	20 %	158339781
78	NC_009926	AAACC	2	10	119047	119056	60 %	0 %	0 %	40 %	158339787
79	NC_009926	GAAGG	2	10	119591	119600	40 %	0 %	60 %	0 %	158339787
80	NC_009926	CTGCG	2	10	122254	122263	0 %	20 %	40 %	40 %	158339791
81	NC_009926	GGCGA	2	10	123533	123542	20 %	0 %	60 %	20 %	158339791
82	NC_009926	TGAGG	2	10	123902	123911	20 %	20 %	60 %	0 %	158339791
83	NC_009926	ATTTT	2	10	124837	124846	20 %	80 %	0 %	0 %	158339793
84	NC_009926	CATCG	2	10	127691	127700	20 %	20 %	20 %	40 %	158339797
85	NC_009926	CTGCG	2	10	134302	134311	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
86	NC_009926	TGAGG	2	10	135212	135221	20 %	20 %	60 %	0 %	158339805
87	NC_009926	TCAGG	2	10	136451	136460	20 %	20 %	40 %	20 %	158339806
88	NC_009926	AAAAC	2	10	137016	137025	80 %	0 %	0 %	20 %	158339807
89	NC_009926	CAGTT	2	10	137396	137405	20 %	40 %	20 %	20 %	158339807
90	NC_009926	GATTC	2	10	137945	137954	20 %	40 %	20 %	20 %	158339807
91	NC_009926	CAATT	2	10	147971	147980	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_009926	CAGAA	2	10	152541	152550	60 %	0 %	20 %	20 %	158339820
93	NC_009926	CTGCT	2	10	152750	152759	0 %	40 %	20 %	40 %	158339820
94	NC_009926	CCACT	2	10	155338	155347	20 %	20 %	0 %	60 %	158339822
95	NC_009926	AGGTT	2	10	158506	158515	20 %	40 %	40 %	0 %	158339824
96	NC_009926	GCTCA	2	10	159838	159847	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_009926	CTTTG	2	10	161747	161756	0 %	60 %	20 %	20 %	158339828
98	NC_009926	CATTA	2	10	162957	162966	40 %	40 %	0 %	20 %	158339830
99	NC_009926	GGCAT	2	10	164667	164676	20 %	20 %	40 %	20 %	158339832
100	NC_009926	ACCTT	2	10	164698	164707	20 %	40 %	0 %	40 %	158339832
101	NC_009926	AAATC	2	10	165245	165254	60 %	20 %	0 %	20 %	158339832
102	NC_009926	GGGAA	2	10	165379	165388	40 %	0 %	60 %	0 %	158339832
103	NC_009926	AGATT	2	10	167495	167504	40 %	40 %	20 %	0 %	158339834
104	NC_009926	GTTGG	2	10	168871	168880	0 %	40 %	60 %	0 %	158339834
105	NC_009926	CTGTC	2	10	168978	168987	0 %	40 %	20 %	40 %	158339834
106	NC_009926	TTGAA	2	10	175380	175389	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009926	TTTGA	2	10	176246	176255	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009926	GCCAC	2	10	176518	176527	20 %	0 %	20 %	60 %	158339844
109	NC_009926	CGTCA	2	10	177293	177302	20 %	20 %	20 %	40 %	158339845
110	NC_009926	CGATG	2	10	184039	184048	20 %	20 %	40 %	20 %	158339852
111	NC_009926	GGAAC	2	10	186713	186722	40 %	0 %	40 %	20 %	158339855
112	NC_009926	TTAGC	2	10	189909	189918	20 %	40 %	20 %	20 %	158339860
113	NC_009926	GAAGA	2	10	190083	190092	60 %	0 %	40 %	0 %	158339860
114	NC_009926	TAACT	2	10	195268	195277	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_009926	AAAGC	2	10	195957	195966	60 %	0 %	20 %	20 %	158339870
116	NC_009926	TTTGC	2	10	196518	196527	0 %	60 %	20 %	20 %	158339489
117	NC_009926	CAGCG	2	10	199125	199134	20 %	0 %	40 %	40 %	158339491
118	NC_009926	TGCTC	2	10	205752	205761	0 %	40 %	20 %	40 %	158339492
119	NC_009926	GCTCA	2	10	207276	207285	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
120	NC_009926	TCAGC	2	10	208654	208663	20 %	20 %	20 %	40 %	158339493
121	NC_009926	TTTCG	2	10	209376	209385	0 %	60 %	20 %	20 %	158339493
122	NC_009926	AATCA	2	10	213176	213185	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_009926	CACGG	2	10	214181	214190	20 %	0 %	40 %	40 %	158339494
124	NC_009926	AGCTC	2	10	215065	215074	20 %	20 %	20 %	40 %	158339494
125	NC_009926	ATCTT	2	10	216150	216159	20 %	60 %	0 %	20 %	158339494
126	NC_009926	ATCGG	2	10	216946	216955	20 %	20 %	40 %	20 %	158339494
127	NC_009926	GGGCT	2	10	217107	217116	0 %	20 %	60 %	20 %	158339494
128	NC_009926	TCCCG	2	10	220858	220867	0 %	20 %	20 %	60 %	158339495
129	NC_009926	CGTTC	2	10	221592	221601	0 %	40 %	20 %	40 %	158339495
130	NC_009926	CCCCG	2	10	222010	222019	0 %	0 %	20 %	80 %	158339495
131	NC_009926	CTGGA	2	10	225868	225877	20 %	20 %	40 %	20 %	158339495
132	NC_009926	TCAGC	2	10	229246	229255	20 %	20 %	20 %	40 %	158339498
133	NC_009926	TCCCG	2	10	234266	234275	0 %	20 %	20 %	60 %	158339498
134	NC_009926	TCCCG	2	10	237566	237575	0 %	20 %	20 %	60 %	158339498
135	NC_009926	AACCG	2	10	238060	238069	40 %	0 %	20 %	40 %	158339498
136	NC_009926	GCTGA	2	10	239035	239044	20 %	20 %	40 %	20 %	158339499
137	NC_009926	AGTAC	2	10	239552	239561	40 %	20 %	20 %	20 %	158339499
138	NC_009926	CTGAA	2	10	239825	239834	40 %	20 %	20 %	20 %	158339499
139	NC_009926	AGCGC	2	10	240877	240886	20 %	0 %	40 %	40 %	158339499
140	NC_009926	GTTCC	2	10	244004	244013	0 %	40 %	20 %	40 %	158339501
141	NC_009926	CTCAA	2	10	246897	246906	40 %	20 %	0 %	40 %	158339505
142	NC_009926	CTGAT	2	10	247330	247339	20 %	40 %	20 %	20 %	158339506
143	NC_009926	TCAGC	2	10	247536	247545	20 %	20 %	20 %	40 %	158339506
144	NC_009926	GATCG	2	10	247971	247980	20 %	20 %	40 %	20 %	158339507
145	NC_009926	ATGGG	2	10	248430	248439	20 %	20 %	60 %	0 %	158339508
146	NC_009926	TGCTC	2	10	248689	248698	0 %	40 %	20 %	40 %	158339509
147	NC_009926	CCCAG	2	10	252299	252308	20 %	0 %	20 %	60 %	158339512
148	NC_009926	CCTGC	2	10	254155	254164	0 %	20 %	20 %	60 %	158339513
149	NC_009926	GGTAC	2	10	254257	254266	20 %	20 %	40 %	20 %	158339513
150	NC_009926	AAGAG	2	10	255245	255254	60 %	0 %	40 %	0 %	158339514
151	NC_009926	TGGAT	2	10	255454	255463	20 %	40 %	40 %	0 %	158339514
152	NC_009926	AAATC	2	10	259535	259544	60 %	20 %	0 %	20 %	158339518
153	NC_009926	CATGA	2	10	260049	260058	40 %	20 %	20 %	20 %	158339518
154	NC_009926	TCCAT	2	10	260490	260499	20 %	40 %	0 %	40 %	158339518
155	NC_009926	GCGAT	2	10	261925	261934	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
156	NC_009926	AAACC	2	10	263508	263517	60 %	0 %	0 %	40 %	158339519
157	NC_009926	CTGAA	2	10	270462	270471	40 %	20 %	20 %	20 %	158339529
158	NC_009926	CTTGC	2	10	270910	270919	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
159	NC_009926	AGGAA	2	10	271063	271072	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
160	NC_009926	CGATG	2	10	271757	271766	20 %	20 %	40 %	20 %	158339530
161	NC_009926	CGATG	2	10	272873	272882	20 %	20 %	40 %	20 %	158339532
162	NC_009926	CAATT	2	10	276091	276100	40 %	40 %	0 %	20 %	158339535
163	NC_009926	AAACT	2	10	277490	277499	60 %	20 %	0 %	20 %	158339535
164	NC_009926	TCAGT	2	10	277848	277857	20 %	40 %	20 %	20 %	158339535
165	NC_009926	ATTTG	2	10	279730	279739	20 %	60 %	20 %	0 %	158339537
166	NC_009926	GATTT	2	10	280962	280971	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_009926	TCAAA	2	10	283006	283015	60 %	20 %	0 %	20 %	158339542
168	NC_009926	ACCAT	2	10	283017	283026	40 %	20 %	0 %	40 %	158339542
169	NC_009926	TGAGC	2	10	283603	283612	20 %	20 %	40 %	20 %	158339542
170	NC_009926	CTTGT	2	10	289010	289019	0 %	60 %	20 %	20 %	158339548
171	NC_009926	ATTTT	2	10	289137	289146	20 %	80 %	0 %	0 %	158339548
172	NC_009926	AATTT	2	10	290752	290761	40 %	60 %	0 %	0 %	158339548
173	NC_009926	GCTTC	2	10	297174	297183	0 %	40 %	20 %	40 %	158339554
174	NC_009926	TTCAA	2	10	300065	300074	40 %	40 %	0 %	20 %	158339555
175	NC_009926	GATAG	2	10	301605	301614	40 %	20 %	40 %	0 %	158339556
176	NC_009926	TTTGT	2	10	301830	301839	0 %	80 %	20 %	0 %	158339556
177	NC_009926	CACCC	2	10	302742	302751	20 %	0 %	0 %	80 %	158339557
178	NC_009926	CTGCG	2	10	303359	303368	0 %	20 %	40 %	40 %	158339557
179	NC_009926	GGGAG	2	10	308252	308261	20 %	0 %	80 %	0 %	158339559
180	NC_009926	TGGAC	2	10	310322	310331	20 %	20 %	40 %	20 %	158339561
181	NC_009926	CCCAA	2	10	310436	310445	40 %	0 %	0 %	60 %	158339561
182	NC_009926	TCCTG	2	10	311059	311068	0 %	40 %	20 %	40 %	158339562
183	NC_009926	GATGG	2	10	311576	311585	20 %	20 %	60 %	0 %	158339562
184	NC_009926	CATCT	2	10	313347	313356	20 %	40 %	0 %	40 %	158339564
185	NC_009926	GCGCT	2	10	313358	313367	0 %	20 %	40 %	40 %	158339564
186	NC_009926	AGGAT	2	10	317004	317013	40 %	20 %	40 %	0 %	158339568
187	NC_009926	CTTTG	2	10	322083	322092	0 %	60 %	20 %	20 %	158339576
188	NC_009926	ATCCG	2	10	323470	323479	20 %	20 %	20 %	40 %	158339579
189	NC_009926	GGCAT	2	10	330004	330013	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
190	NC_009926	TTCCT	2	10	330178	330187	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
191	NC_009926	ACACC	2	10	330572	330581	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
192	NC_009926	ACTTC	2	10	330725	330734	20 %	40 %	0 %	40 %	158339593
193	NC_009926	TCACA	2	10	331772	331781	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
194	NC_009926	AGAGA	2	10	333440	333449	60 %	0 %	40 %	0 %	158339600
195	NC_009926	GGGAG	3	15	333467	333481	20 %	0 %	80 %	0 %	158339600
196	NC_009926	CTTTC	2	10	335005	335014	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
197	NC_009926	CTTTC	2	10	337122	337131	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
198	NC_009926	TCTGC	2	10	342423	342432	0 %	40 %	20 %	40 %	158339619
199	NC_009926	GGGAA	2	10	347099	347108	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
200	NC_009926	GATTT	2	10	348306	348315	20 %	60 %	20 %	0 %	158339629
201	NC_009926	CTCTT	2	10	349461	349470	0 %	60 %	0 %	40 %	158339630
202	NC_009926	CCGAT	2	10	350867	350876	20 %	20 %	20 %	40 %	158339630
203	NC_009926	GAATG	2	10	354478	354487	40 %	20 %	40 %	0 %	158339631
204	NC_009926	AATGT	2	10	355996	356005	40 %	40 %	20 %	0 %	158339632
205	NC_009926	GATCT	2	10	356298	356307	20 %	40 %	20 %	20 %	158339633
206	NC_009926	TGGTC	2	10	356821	356830	0 %	40 %	40 %	20 %	158339636
207	NC_009926	TGCAT	2	10	358396	358405	20 %	40 %	20 %	20 %	158339637
208	NC_009926	GAGCT	2	10	359165	359174	20 %	20 %	40 %	20 %	158339640
209	NC_009926	CGGAA	2	10	362450	362459	40 %	0 %	40 %	20 %	158339646
210	NC_009926	ACCAA	2	10	363396	363405	60 %	0 %	0 %	40 %	158339648
211	NC_009926	AAGCA	2	10	363815	363824	60 %	0 %	20 %	20 %	158339648
212	NC_009926	TTGAT	2	10	368640	368649	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
213	NC_009926	TGGGG	2	10	369914	369923	0 %	20 %	80 %	0 %	158339649
214	NC_009926	CGTCT	2	10	372873	372882	0 %	40 %	20 %	40 %	158339651
215	NC_009926	GGAGT	2	10	373046	373055	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.