MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acaryochloris marina MBIC11017 chromosome

Total Repeats: 114291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009925	TTGT	2	8	284697	284704	0 %	75 %	25 %	0 %	158333513
5002	NC_009925	CCA	2	6	284764	284769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158333513
5003	NC_009925	GAT	2	6	284778	284783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333513
5004	NC_009925	ATAG	2	8	284910	284917	50 %	25 %	25 %	0 %	158333513
5005	NC_009925	GGT	2	6	284976	284981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158333513
5006	NC_009925	TGC	2	6	285133	285138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333513
5007	NC_009925	CAC	2	6	285180	285185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158333513
5008	NC_009925	GCT	2	6	285412	285417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333513
5009	NC_009925	T	6	6	285473	285478	0 %	100 %	0 %	0 %	158333513
5010	NC_009925	TTG	2	6	285498	285503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158333513
5011	NC_009925	TTG	2	6	285582	285587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158333513
5012	NC_009925	ACC	2	6	285661	285666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158333513
5013	NC_009925	GGT	2	6	285675	285680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158333513
5014	NC_009925	T	6	6	285732	285737	0 %	100 %	0 %	0 %	158333513
5015	NC_009925	AAG	2	6	285835	285840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158333513
5016	NC_009925	GGA	2	6	285906	285911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158333513
5017	NC_009925	TTTGA	2	10	285943	285952	20 %	60 %	20 %	0 %	158333513
5018	NC_009925	ATT	2	6	285964	285969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158333513
5019	NC_009925	ATTA	2	8	286015	286022	50 %	50 %	0 %	0 %	158333514
5020	NC_009925	ACT	2	6	286085	286090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333514
5021	NC_009925	ATA	2	6	286103	286108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158333514
5022	NC_009925	TTC	2	6	286130	286135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158333514
5023	NC_009925	AGGGA	2	10	286268	286277	40 %	0 %	60 %	0 %	158333514
5024	NC_009925	TCC	2	6	286365	286370	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158333514
5025	NC_009925	CAA	2	6	286411	286416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158333514
5026	NC_009925	AAC	2	6	286448	286453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_009925	TA	3	6	286490	286495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5028	NC_009925	A	6	6	286568	286573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5029	NC_009925	AAC	2	6	286594	286599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_009925	CA	3	6	286622	286627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5031	NC_009925	GAA	2	6	286697	286702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158333515
5032	NC_009925	ATT	2	6	286761	286766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158333515
5033	NC_009925	ATGCCA	2	12	286866	286877	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	158333515
5034	NC_009925	TGAG	2	8	286992	286999	25 %	25 %	50 %	0 %	158333515
5035	NC_009925	GGGT	2	8	287020	287027	0 %	25 %	75 %	0 %	158333515
5036	NC_009925	TGGA	2	8	287061	287068	25 %	25 %	50 %	0 %	158333515
5037	NC_009925	CT	3	6	287091	287096	0 %	50 %	0 %	50 %	158333515
5038	NC_009925	GCT	2	6	287176	287181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333515
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5040	NC_009925	CAA	2	6	287261	287266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158333515
5041	NC_009925	CT	3	6	287339	287344	0 %	50 %	0 %	50 %	158333515
5042	NC_009925	TTCA	2	8	287363	287370	25 %	50 %	0 %	25 %	158333515
5043	NC_009925	AG	3	6	287485	287490	50 %	0 %	50 %	0 %	158333515
5044	NC_009925	TTC	2	6	287519	287524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158333515
5045	NC_009925	ATC	2	6	287529	287534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333515
5046	NC_009925	CTT	2	6	287575	287580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158333515
5047	NC_009925	AAT	2	6	287582	287587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158333515
5048	NC_009925	CAAA	2	8	287724	287731	75 %	0 %	0 %	25 %	158333515
5049	NC_009925	CTT	2	6	287781	287786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158333515
5050	NC_009925	TAA	2	6	287798	287803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158333515
5051	NC_009925	CAA	2	6	287950	287955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158333515
5052	NC_009925	CGG	2	6	287989	287994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158333515
5053	NC_009925	GTC	2	6	287999	288004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333515
5054	NC_009925	GGT	2	6	288086	288091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158333515
5055	NC_009925	ACC	2	6	288111	288116	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158333515
5056	NC_009925	ACC	2	6	288138	288143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158333515
5057	NC_009925	AGT	2	6	288148	288153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333515
5058	NC_009925	ATC	2	6	288228	288233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333515
5059	NC_009925	CAAGGC	2	12	288328	288339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_009925	CCA	2	6	288350	288355	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5061	NC_009925	TAC	2	6	288413	288418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_009925	GTA	2	6	288423	288428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_009925	CGTC	2	8	288491	288498	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_009925	GTT	2	6	288509	288514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_009925	TC	3	6	288565	288570	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5066	NC_009925	ATC	2	6	288620	288625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_009925	GAG	2	6	288724	288729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_009925	GTC	2	6	288772	288777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333516
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5070	NC_009925	TTG	2	6	288934	288939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158333516
5071	NC_009925	CCG	2	6	288981	288986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158333516
5072	NC_009925	TGC	2	6	289104	289109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333516
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5074	NC_009925	CCCA	2	8	289147	289154	25 %	0 %	0 %	75 %	158333516
5075	NC_009925	ATCC	2	8	289192	289199	25 %	25 %	0 %	50 %	158333516
5076	NC_009925	CCA	2	6	289308	289313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158333517
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5082	NC_009925	TTA	2	6	289792	289797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_009925	CTT	2	6	289803	289808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_009925	AGA	2	6	289849	289854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5090	NC_009925	TCA	2	6	290146	290151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333518
5091	NC_009925	ACT	2	6	290155	290160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333518
5092	NC_009925	CAT	3	9	290172	290180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333518
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5094	NC_009925	T	6	6	290257	290262	0 %	100 %	0 %	0 %	158333518
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5097	NC_009925	CT	6	12	290386	290397	0 %	50 %	0 %	50 %	158333518
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5103	NC_009925	T	6	6	290656	290661	0 %	100 %	0 %	0 %	158333519
5104	NC_009925	TTG	2	6	290773	290778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_009925	CAC	2	6	290789	290794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5106	NC_009925	A	7	7	290828	290834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5107	NC_009925	GTA	2	6	290838	290843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_009925	GTA	2	6	290860	290865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_009925	GTA	2	6	290871	290876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_009925	CTT	2	6	291103	291108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_009925	GTG	2	6	291301	291306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_009925	CAC	2	6	291366	291371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_009925	AGC	2	6	291420	291425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_009925	GTA	2	6	291491	291496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_009925	GTG	2	6	291616	291621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_009925	GTA	2	6	291728	291733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5119	NC_009925	GTA	2	6	291807	291812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_009925	AGG	2	6	291911	291916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5121	NC_009925	TCTG	2	8	291943	291950	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_009925	CCT	2	6	292071	292076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_009925	TGT	2	6	292128	292133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_009925	CCA	2	6	292145	292150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5126	NC_009925	CCA	2	6	292300	292305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5256	NC_009925	AGCGAC	2	12	300426	300437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333529
5257	NC_009925	GCC	2	6	300442	300447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	158333529
5258	NC_009925	GTT	2	6	300458	300463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158333529
5259	NC_009925	TGA	2	6	300543	300548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333529
5260	NC_009925	GA	3	6	300553	300558	50 %	0 %	50 %	0 %	158333529
5261	NC_009925	TGC	2	6	300561	300566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333529
5262	NC_009925	A	6	6	300626	300631	100 %	0 %	0 %	0 %	158333529
5263	NC_009925	AAG	2	6	300641	300646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158333529
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5265	NC_009925	ACCT	2	8	300685	300692	25 %	25 %	0 %	50 %	158333529
5266	NC_009925	CT	3	6	300717	300722	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5267	NC_009925	ATGGCA	2	12	301067	301078	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	158333530
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5269	NC_009925	TCG	2	6	301089	301094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333530
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5271	NC_009925	GAT	2	6	301189	301194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333530
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5273	NC_009925	CAA	2	6	301430	301435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5274	NC_009925	AGGG	2	8	301472	301479	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5275	NC_009925	TGCTT	2	10	301496	301505	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5276	NC_009925	TG	3	6	301529	301534	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5277	NC_009925	T	6	6	301582	301587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5278	NC_009925	CCT	2	6	301747	301752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5279	NC_009925	AGG	2	6	301763	301768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5282	NC_009925	TGG	2	6	301874	301879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158333531
5283	NC_009925	AGG	2	6	301949	301954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158333531
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5287	NC_009925	GATT	2	8	302324	302331	25 %	50 %	25 %	0 %	158333531
5288	NC_009925	GCTG	2	8	302394	302401	0 %	25 %	50 %	25 %	158333531
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5303	NC_009925	TTG	2	6	303225	303230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5304	NC_009925	CT	3	6	303240	303245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5305	NC_009925	TTA	2	6	303254	303259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5321	NC_009925	TCT	2	6	303906	303911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5322	NC_009925	TCCAT	2	10	303944	303953	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5323	NC_009925	CAG	2	6	304030	304035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333533
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5345	NC_009925	CT	3	6	305548	305553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5346	NC_009925	TCA	2	6	305554	305559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5347	NC_009925	CTT	2	6	305640	305645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158333535
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5359	NC_009925	CAG	3	9	306069	306077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333535
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5361	NC_009925	CGA	2	6	306111	306116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333535
5362	NC_009925	T	6	6	306161	306166	0 %	100 %	0 %	0 %	158333535
5363	NC_009925	CAA	3	9	306424	306432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158333535
5364	NC_009925	ATC	2	6	306512	306517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158333535
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5367	NC_009925	T	6	6	306776	306781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5368	NC_009925	GGAC	2	8	306842	306849	25 %	0 %	50 %	25 %	158333536
5369	NC_009925	CTTT	2	8	306864	306871	0 %	75 %	0 %	25 %	158333536
5370	NC_009925	GCG	2	6	307090	307095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158333536
5371	NC_009925	CGT	2	6	307105	307110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333536
5372	NC_009925	CTC	2	6	307135	307140	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	158333536
5373	NC_009925	CAG	2	6	307165	307170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158333536
5374	NC_009925	ATG	2	6	307172	307177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158333536
5375	NC_009925	GTC	2	6	307237	307242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158333536
5376	NC_009925	ACAA	2	8	307300	307307	75 %	0 %	0 %	25 %	158333536
5377	NC_009925	TC	3	6	307308	307313	0 %	50 %	0 %	50 %	158333536
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5379	NC_009925	ACC	2	6	307391	307396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158333536
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5463	NC_009925	GTA	2	6	312514	312519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5478	NC_009925	T	6	6	313519	313524	0 %	100 %	0 %	0 %	158333542
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5497	NC_009925	ACAG	2	8	314547	314554	50 %	0 %	25 %	25 %	158333542
5498	NC_009925	AGA	2	6	314636	314641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158333542
5499	NC_009925	TGGATC	2	12	314768	314779	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	158333542
5500	NC_009925	ACA	2	6	314965	314970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158333542

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