MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 70799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009922	AAGC	2	8	183804	183811	50 %	0 %	25 %	25 %	158319211
4002	NC_009922	ATT	2	6	183830	183835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319211
4003	NC_009922	CCT	2	6	183839	183844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4004	NC_009922	TGAAA	2	10	183955	183964	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_009922	AT	3	6	183970	183975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_009922	AGAA	2	8	184032	184039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_009922	CTG	2	6	184060	184065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_009922	TATT	2	8	184084	184091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_009922	A	7	7	184094	184100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_009922	T	7	7	184109	184115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_009922	A	6	6	184166	184171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4012	NC_009922	T	7	7	184199	184205	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_009922	GTAA	2	8	184245	184252	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_009922	A	6	6	184271	184276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_009922	AG	3	6	184279	184284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_009922	A	6	6	184302	184307	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_009922	TA	3	6	184315	184320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_009922	AGG	2	6	184364	184369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_009922	CTT	2	6	184399	184404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319212
4020	NC_009922	TAA	2	6	184423	184428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319212
4021	NC_009922	AT	3	6	184504	184509	50 %	50 %	0 %	0 %	158319212
4022	NC_009922	A	6	6	184510	184515	100 %	0 %	0 %	0 %	158319212
4023	NC_009922	TGCAA	2	10	184531	184540	40 %	20 %	20 %	20 %	158319212
4024	NC_009922	A	6	6	184547	184552	100 %	0 %	0 %	0 %	158319212
4025	NC_009922	A	6	6	184568	184573	100 %	0 %	0 %	0 %	158319212
4026	NC_009922	GAA	2	6	184574	184579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319212
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4028	NC_009922	AG	3	6	184615	184620	50 %	0 %	50 %	0 %	158319212
4029	NC_009922	GAT	2	6	184646	184651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319212
4030	NC_009922	AGA	2	6	184684	184689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319212
4031	NC_009922	TAT	2	6	184710	184715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319212
4032	NC_009922	AG	3	6	184721	184726	50 %	0 %	50 %	0 %	158319212
4033	NC_009922	TCA	2	6	184785	184790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319212
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4035	NC_009922	A	6	6	184855	184860	100 %	0 %	0 %	0 %	158319212
4036	NC_009922	TAAA	2	8	184869	184876	75 %	25 %	0 %	0 %	158319212
4037	NC_009922	A	7	7	184882	184888	100 %	0 %	0 %	0 %	158319212
4038	NC_009922	AGG	2	6	184919	184924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_009922	AT	3	6	184930	184935	50 %	50 %	0 %	0 %	158319213
4040	NC_009922	GAA	2	6	185159	185164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319213
4041	NC_009922	AGG	2	6	185221	185226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_009922	AAAT	2	8	185230	185237	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_009922	TAA	2	6	185255	185260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_009922	AT	3	6	185268	185273	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_009922	T	6	6	185282	185287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_009922	TAA	2	6	185321	185326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_009922	TA	3	6	185360	185365	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_009922	AT	3	6	185386	185391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_009922	TAA	3	9	185419	185427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_009922	AT	3	6	185443	185448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_009922	T	7	7	185448	185454	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_009922	TA	3	6	185464	185469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4053	NC_009922	GGA	2	6	185475	185480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_009922	TAT	2	6	185507	185512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319214
4055	NC_009922	TAA	2	6	185518	185523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319214
4056	NC_009922	TCAAT	2	10	185572	185581	40 %	40 %	0 %	20 %	158319214
4057	NC_009922	GAT	2	6	185661	185666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319214
4058	NC_009922	TA	3	6	185680	185685	50 %	50 %	0 %	0 %	158319214
4059	NC_009922	AGA	2	6	185693	185698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319214
4060	NC_009922	T	8	8	185704	185711	0 %	100 %	0 %	0 %	158319214
4061	NC_009922	T	6	6	185765	185770	0 %	100 %	0 %	0 %	158319214
4062	NC_009922	AT	3	6	185807	185812	50 %	50 %	0 %	0 %	158319214
4063	NC_009922	T	6	6	185850	185855	0 %	100 %	0 %	0 %	158319214
4064	NC_009922	TAT	2	6	185906	185911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319214
4065	NC_009922	GAA	2	6	185919	185924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319214
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4067	NC_009922	TAATT	2	10	185978	185987	40 %	60 %	0 %	0 %	158319214
4068	NC_009922	TTC	2	6	186038	186043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319214
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4071	NC_009922	ATA	2	6	186103	186108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319214
4072	NC_009922	TAG	2	6	186208	186213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319214
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4074	NC_009922	TA	4	8	186251	186258	50 %	50 %	0 %	0 %	158319214
4075	NC_009922	GAG	2	6	186264	186269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319214
4076	NC_009922	A	6	6	186333	186338	100 %	0 %	0 %	0 %	158319214
4077	NC_009922	TA	4	8	186365	186372	50 %	50 %	0 %	0 %	158319214
4078	NC_009922	ATG	2	6	186409	186414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_009922	ATT	2	6	186416	186421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_009922	CAT	2	6	186422	186427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_009922	AATTT	2	10	186440	186449	40 %	60 %	0 %	0 %	158319215
4082	NC_009922	TGA	2	6	186512	186517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319215
4083	NC_009922	AACTAG	2	12	186526	186537	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	158319215
4084	NC_009922	ATT	2	6	186575	186580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319215
4085	NC_009922	T	6	6	186619	186624	0 %	100 %	0 %	0 %	158319215
4086	NC_009922	TAC	2	6	186676	186681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319215
4087	NC_009922	AAT	2	6	186682	186687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319215
4088	NC_009922	CTT	2	6	186709	186714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319215
4089	NC_009922	TTC	2	6	186724	186729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319215
4090	NC_009922	AGC	2	6	186824	186829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319215
4091	NC_009922	TCA	2	6	186834	186839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319215
4092	NC_009922	ATG	2	6	186878	186883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319215
4093	NC_009922	ATT	2	6	186920	186925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319215
4094	NC_009922	CCCA	2	8	186943	186950	25 %	0 %	0 %	75 %	158319215
4095	NC_009922	TGAT	2	8	186974	186981	25 %	50 %	25 %	0 %	158319215
4096	NC_009922	AT	3	6	186980	186985	50 %	50 %	0 %	0 %	158319215
4097	NC_009922	AT	3	6	187015	187020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_009922	TA	3	6	187069	187074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_009922	ATAA	2	8	187089	187096	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_009922	ATTTC	2	10	187136	187145	20 %	60 %	0 %	20 %	158319216
4101	NC_009922	TCT	2	6	187162	187167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319216
4102	NC_009922	TGAA	2	8	187255	187262	50 %	25 %	25 %	0 %	158319216
4103	NC_009922	CTT	2	6	187333	187338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319216
4104	NC_009922	TCA	2	6	187430	187435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319216
4105	NC_009922	TCA	2	6	187511	187516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319216
4106	NC_009922	TAT	2	6	187575	187580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319216
4107	NC_009922	GGC	2	6	187645	187650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319216
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4109	NC_009922	GT	3	6	187787	187792	0 %	50 %	50 %	0 %	158319216
4110	NC_009922	AG	3	6	188062	188067	50 %	0 %	50 %	0 %	158319216
4111	NC_009922	AT	3	6	188079	188084	50 %	50 %	0 %	0 %	158319216
4112	NC_009922	T	7	7	188084	188090	0 %	100 %	0 %	0 %	158319216
4113	NC_009922	ATC	2	6	188095	188100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319216
4114	NC_009922	GAT	2	6	188110	188115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319216
4115	NC_009922	GAA	2	6	188121	188126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319216
4116	NC_009922	CTT	2	6	188136	188141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319216
4117	NC_009922	CAT	2	6	188142	188147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319216
4118	NC_009922	AT	3	6	188198	188203	50 %	50 %	0 %	0 %	158319216
4119	NC_009922	GTG	2	6	188205	188210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319216
4120	NC_009922	ATC	2	6	188243	188248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319216
4121	NC_009922	CTT	2	6	188256	188261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319216
4122	NC_009922	GAA	2	6	188274	188279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319216
4123	NC_009922	CT	3	6	188319	188324	0 %	50 %	0 %	50 %	158319216
4124	NC_009922	ATA	2	6	188365	188370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319216
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4126	NC_009922	TTA	2	6	188444	188449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319216
4127	NC_009922	AGT	2	6	188550	188555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319216
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4129	NC_009922	TAG	2	6	188587	188592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319216
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