MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 70799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_009922	AAT	2	6	139674	139679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319169
3003	NC_009922	TTA	2	6	139690	139695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319169
3004	NC_009922	TCA	2	6	139719	139724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319169
3005	NC_009922	TATT	2	8	139725	139732	25 %	75 %	0 %	0 %	158319169
3006	NC_009922	GAA	2	6	139752	139757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319169
3007	NC_009922	TAT	2	6	139798	139803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319169
3008	NC_009922	TAA	2	6	139804	139809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319169
3009	NC_009922	TTC	2	6	139818	139823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319169
3010	NC_009922	AAG	2	6	139864	139869	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319169
3011	NC_009922	AAC	2	6	139874	139879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_009922	TAA	2	6	139891	139896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_009922	AAG	2	6	139897	139902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_009922	AATC	2	8	139930	139937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3015	NC_009922	A	6	6	140072	140077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_009922	AGC	2	6	140087	140092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_009922	AGG	2	6	140112	140117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_009922	TGG	2	6	140145	140150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319170
3019	NC_009922	CA	3	6	140207	140212	50 %	0 %	0 %	50 %	158319170
3020	NC_009922	TTAT	2	8	140230	140237	25 %	75 %	0 %	0 %	158319170
3021	NC_009922	GAA	2	6	140353	140358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319170
3022	NC_009922	GGT	3	9	140398	140406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319170
3023	NC_009922	TTA	2	6	140455	140460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319170
3024	NC_009922	AAG	2	6	140462	140467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319170
3025	NC_009922	TAA	2	6	140600	140605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319170
3026	NC_009922	ATG	2	6	140627	140632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319170
3027	NC_009922	AAGAA	2	10	140640	140649	80 %	0 %	20 %	0 %	158319170
3028	NC_009922	TAG	2	6	140655	140660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319170
3029	NC_009922	ATG	2	6	140675	140680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319170
3030	NC_009922	AAT	2	6	140701	140706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319170
3031	NC_009922	ACT	2	6	140729	140734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319170
3032	NC_009922	AAAAGC	2	12	140757	140768	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	158319170
3033	NC_009922	TCA	2	6	140798	140803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319170
3034	NC_009922	ATA	2	6	140816	140821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319170
3035	NC_009922	AGA	2	6	140841	140846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319170
3036	NC_009922	AACA	2	8	140864	140871	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3037	NC_009922	AGC	2	6	140901	140906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_009922	TTTG	2	8	140926	140933	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_009922	ATT	2	6	140985	140990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_009922	GAT	2	6	141041	141046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_009922	TAC	2	6	141050	141055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_009922	GA	3	6	141086	141091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_009922	TAT	2	6	141104	141109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319171
3044	NC_009922	AC	3	6	141170	141175	50 %	0 %	0 %	50 %	158319171
3045	NC_009922	AGGT	2	8	141177	141184	25 %	25 %	50 %	0 %	158319171
3046	NC_009922	GAA	2	6	141233	141238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319171
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3049	NC_009922	T	7	7	141421	141427	0 %	100 %	0 %	0 %	158319171
3050	NC_009922	A	7	7	141548	141554	100 %	0 %	0 %	0 %	158319171
3051	NC_009922	AGT	2	6	141564	141569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319171
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3053	NC_009922	TAA	2	6	141632	141637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_009922	TTA	2	6	141754	141759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319172
3055	NC_009922	ATTT	2	8	141762	141769	25 %	75 %	0 %	0 %	158319172
3056	NC_009922	ATT	2	6	141786	141791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319172
3057	NC_009922	ATA	2	6	141851	141856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319172
3058	NC_009922	GAA	2	6	141901	141906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319172
3059	NC_009922	GAA	2	6	141980	141985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319172
3060	NC_009922	ACT	2	6	142049	142054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319172
3061	NC_009922	TA	3	6	142058	142063	50 %	50 %	0 %	0 %	158319172
3062	NC_009922	TAA	2	6	142164	142169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319172
3063	NC_009922	A	7	7	142168	142174	100 %	0 %	0 %	0 %	158319172
3064	NC_009922	AAG	2	6	142193	142198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319172
3065	NC_009922	GGT	2	6	142222	142227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319172
3066	NC_009922	CGG	2	6	142263	142268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319172
3067	NC_009922	TAT	2	6	142366	142371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319172
3068	NC_009922	CAG	2	6	142406	142411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319172
3069	NC_009922	TAA	2	6	142434	142439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319172
3070	NC_009922	AGATT	2	10	142480	142489	40 %	40 %	20 %	0 %	158319172
3071	NC_009922	T	6	6	142538	142543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_009922	ATACT	2	10	142565	142574	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3073	NC_009922	TGA	2	6	142631	142636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3074	NC_009922	AAG	2	6	142685	142690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3075	NC_009922	TAG	2	6	142695	142700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_009922	CATA	2	8	142816	142823	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3077	NC_009922	ATT	2	6	142848	142853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_009922	A	6	6	142934	142939	100 %	0 %	0 %	0 %	158319173
3079	NC_009922	ATGG	2	8	142964	142971	25 %	25 %	50 %	0 %	158319173
3080	NC_009922	ATG	2	6	143013	143018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319173
3081	NC_009922	GAAG	2	8	143035	143042	50 %	0 %	50 %	0 %	158319173
3082	NC_009922	GAAG	2	8	143050	143057	50 %	0 %	50 %	0 %	158319173
3083	NC_009922	AT	3	6	143077	143082	50 %	50 %	0 %	0 %	158319173
3084	NC_009922	CTA	2	6	143091	143096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319173
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3088	NC_009922	ATA	2	6	143292	143297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319173
3089	NC_009922	AAT	2	6	143321	143326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319173
3090	NC_009922	AGG	2	6	143352	143357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319173
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3092	NC_009922	GAA	3	9	143520	143528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3093	NC_009922	CTA	2	6	143539	143544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_009922	GAA	2	6	143545	143550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_009922	T	6	6	143554	143559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_009922	A	6	6	143641	143646	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_009922	AGA	2	6	143652	143657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_009922	ATC	2	6	143660	143665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_009922	ATC	2	6	143793	143798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3101	NC_009922	ATGG	2	8	143955	143962	25 %	25 %	50 %	0 %	158319174
3102	NC_009922	ATA	2	6	144091	144096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319174
3103	NC_009922	ACT	2	6	144124	144129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319174
3104	NC_009922	GGT	2	6	144153	144158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319174
3105	NC_009922	TGA	2	6	144182	144187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319174
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3107	NC_009922	ATG	2	6	144210	144215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319174
3108	NC_009922	GTA	2	6	144292	144297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319174
3109	NC_009922	TGG	2	6	144317	144322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319174
3110	NC_009922	TGA	2	6	144353	144358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319174
3111	NC_009922	AAATC	2	10	144401	144410	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3112	NC_009922	TC	3	6	144431	144436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_009922	CA	3	6	144445	144450	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3114	NC_009922	TAA	2	6	144515	144520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_009922	A	7	7	144529	144535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_009922	T	6	6	144606	144611	0 %	100 %	0 %	0 %	158319175
3117	NC_009922	AAG	2	6	144648	144653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319175
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3120	NC_009922	GAA	3	9	144708	144716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319175
3121	NC_009922	GAAC	2	8	144734	144741	50 %	0 %	25 %	25 %	158319175
3122	NC_009922	ATTT	2	8	144746	144753	25 %	75 %	0 %	0 %	158319175
3123	NC_009922	TA	3	6	144793	144798	50 %	50 %	0 %	0 %	158319175
3124	NC_009922	GAA	2	6	144852	144857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319175
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3126	NC_009922	ATC	2	6	144960	144965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319175
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3253	NC_009922	AAT	2	6	151423	151428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319182
3254	NC_009922	GATG	2	8	151505	151512	25 %	25 %	50 %	0 %	158319182
3255	NC_009922	AG	3	6	151590	151595	50 %	0 %	50 %	0 %	158319182
3256	NC_009922	TTA	2	6	151600	151605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319182
3257	NC_009922	GGTCC	2	10	151646	151655	0 %	20 %	40 %	40 %	158319182
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3266	NC_009922	GAA	2	6	151935	151940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3267	NC_009922	T	6	6	151983	151988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3268	NC_009922	ATT	2	6	152022	152027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3269	NC_009922	TA	3	6	152048	152053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3270	NC_009922	TAA	2	6	152070	152075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3271	NC_009922	GAAG	2	8	152136	152143	50 %	0 %	50 %	0 %	158319183
3272	NC_009922	CTT	2	6	152144	152149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319183
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3284	NC_009922	GAT	2	6	152568	152573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319183
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3320	NC_009922	TGA	2	6	154098	154103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319184
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3324	NC_009922	A	6	6	154277	154282	100 %	0 %	0 %	0 %	158319185
3325	NC_009922	AGATC	2	10	154427	154436	40 %	20 %	20 %	20 %	158319185
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3330	NC_009922	TCA	2	6	154848	154853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319185
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3333	NC_009922	GTT	2	6	154923	154928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319185
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3336	NC_009922	T	8	8	154993	155000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3337	NC_009922	AAGA	2	8	155017	155024	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3338	NC_009922	ATTTT	2	10	155059	155068	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3339	NC_009922	CT	3	6	155086	155091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3342	NC_009922	A	6	6	155148	155153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3343	NC_009922	AGA	2	6	155163	155168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3344	NC_009922	AGA	2	6	155179	155184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3345	NC_009922	AGG	2	6	155198	155203	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3361	NC_009922	TAG	2	6	155621	155626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319186
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3364	NC_009922	ACA	2	6	155727	155732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3365	NC_009922	TAT	2	6	155804	155809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319187
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3371	NC_009922	GCA	2	6	156038	156043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319187
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3373	NC_009922	AT	3	6	156170	156175	50 %	50 %	0 %	0 %	158319188
3374	NC_009922	TTTA	2	8	156181	156188	25 %	75 %	0 %	0 %	158319188
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