MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 70799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009922	CAT	2	6	21946	21951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319075
502	NC_009922	ACA	2	6	21954	21959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319075
503	NC_009922	AT	3	6	21972	21977	50 %	50 %	0 %	0 %	158319075
504	NC_009922	TGG	2	6	22035	22040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319075
505	NC_009922	CGG	2	6	22101	22106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319075
506	NC_009922	ACC	2	6	22222	22227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319075
507	NC_009922	CAC	2	6	22231	22236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319075
508	NC_009922	AGA	2	6	22284	22289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319075
509	NC_009922	ATAA	2	8	22301	22308	75 %	25 %	0 %	0 %	158319075
510	NC_009922	TAT	2	6	22342	22347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009922	ATG	2	6	22486	22491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319076
512	NC_009922	AAG	2	6	22514	22519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319076
513	NC_009922	GAT	2	6	22616	22621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319076
514	NC_009922	GAAG	2	8	22652	22659	50 %	0 %	50 %	0 %	158319076
515	NC_009922	TA	3	6	22692	22697	50 %	50 %	0 %	0 %	158319076
516	NC_009922	CCA	2	6	22743	22748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319076
517	NC_009922	AATA	2	8	22768	22775	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_009922	A	7	7	22787	22793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
519	NC_009922	GAA	2	6	22885	22890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319077
520	NC_009922	AGA	2	6	22911	22916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319077
521	NC_009922	A	6	6	22921	22926	100 %	0 %	0 %	0 %	158319077
522	NC_009922	TAA	2	6	22932	22937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319077
523	NC_009922	GTC	2	6	22960	22965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319077
524	NC_009922	AAC	2	6	23010	23015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319077
525	NC_009922	GGA	2	6	23074	23079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319077
526	NC_009922	TG	3	6	23129	23134	0 %	50 %	50 %	0 %	158319077
527	NC_009922	GTA	2	6	23167	23172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319077
528	NC_009922	CT	3	6	23208	23213	0 %	50 %	0 %	50 %	158319077
529	NC_009922	ATC	2	6	23243	23248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319077
530	NC_009922	AGA	3	9	23274	23282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319077
531	NC_009922	CT	3	6	23286	23291	0 %	50 %	0 %	50 %	158319077
532	NC_009922	A	6	6	23324	23329	100 %	0 %	0 %	0 %	158319077
533	NC_009922	GGAA	2	8	23617	23624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_009922	AT	3	6	23728	23733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_009922	TA	3	6	23737	23742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
536	NC_009922	ATTG	2	8	23787	23794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
537	NC_009922	A	6	6	23795	23800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_009922	T	6	6	23833	23838	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_009922	TTA	2	6	23859	23864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_009922	A	6	6	23872	23877	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_009922	ATA	2	6	23911	23916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009922	GAA	2	6	23992	23997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319078
543	NC_009922	AGA	2	6	24021	24026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319078
544	NC_009922	TAT	2	6	24041	24046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319078
545	NC_009922	CAT	3	9	24063	24071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319078
546	NC_009922	GAA	2	6	24094	24099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319078
547	NC_009922	ATA	2	6	24125	24130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319078
548	NC_009922	GGC	2	6	24154	24159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319078
549	NC_009922	TTA	2	6	24200	24205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319078
550	NC_009922	GAAA	2	8	24326	24333	75 %	0 %	25 %	0 %	158319078
551	NC_009922	GTG	2	6	24355	24360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319078
552	NC_009922	AGGGT	2	10	24362	24371	20 %	20 %	60 %	0 %	158319078
553	NC_009922	ACTTT	2	10	24385	24394	20 %	60 %	0 %	20 %	158319078
554	NC_009922	AG	3	6	24437	24442	50 %	0 %	50 %	0 %	158319078
555	NC_009922	CAG	2	6	24477	24482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319078
556	NC_009922	AGA	2	6	24510	24515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319078
557	NC_009922	AT	3	6	24554	24559	50 %	50 %	0 %	0 %	158319078
558	NC_009922	AGA	2	6	24623	24628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319078
559	NC_009922	TGG	3	9	24711	24719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319078
560	NC_009922	GAA	2	6	24757	24762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319078
561	NC_009922	T	6	6	24780	24785	0 %	100 %	0 %	0 %	158319078
562	NC_009922	AGA	2	6	24810	24815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319078
563	NC_009922	GAA	2	6	24841	24846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319078
564	NC_009922	ATT	2	6	24884	24889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319078
565	NC_009922	GAA	2	6	24893	24898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319078
566	NC_009922	AGA	2	6	24906	24911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319078
567	NC_009922	TTTA	2	8	24924	24931	25 %	75 %	0 %	0 %	158319078
568	NC_009922	AAAG	2	8	24946	24953	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
569	NC_009922	TAA	2	6	24987	24992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_009922	A	6	6	25006	25011	100 %	0 %	0 %	0 %	158319079
571	NC_009922	ATCA	2	8	25274	25281	50 %	25 %	0 %	25 %	158319079
572	NC_009922	TAG	2	6	25357	25362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319079
573	NC_009922	TAG	2	6	25367	25372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319079
574	NC_009922	CCA	2	6	25393	25398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319079
575	NC_009922	ATT	2	6	25448	25453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319079
576	NC_009922	TGC	2	6	25462	25467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319079
577	NC_009922	TAA	2	6	25481	25486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319079
578	NC_009922	CTG	2	6	25510	25515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319079
579	NC_009922	TGG	2	6	25528	25533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319079
580	NC_009922	TTA	2	6	25543	25548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319079
581	NC_009922	ATT	2	6	25628	25633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319079
582	NC_009922	ATTGG	2	10	25653	25662	20 %	40 %	40 %	0 %	158319079
583	NC_009922	CTT	2	6	25678	25683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319079
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586	NC_009922	TAT	2	6	25780	25785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319079
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588	NC_009922	TAAA	2	8	25831	25838	75 %	25 %	0 %	0 %	158319079
589	NC_009922	CAA	2	6	25876	25881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319079
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592	NC_009922	CAT	2	6	25940	25945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319079
593	NC_009922	T	7	7	25945	25951	0 %	100 %	0 %	0 %	158319079
594	NC_009922	CTT	2	6	26012	26017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319079
595	NC_009922	TTC	2	6	26036	26041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319079
596	NC_009922	GTT	2	6	26071	26076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319079
597	NC_009922	TCA	2	6	26100	26105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319079
598	NC_009922	CAG	2	6	26198	26203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319079
599	NC_009922	TCTT	2	8	26261	26268	0 %	75 %	0 %	25 %	158319079
600	NC_009922	AAAAT	3	15	26305	26319	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_009922	AT	3	6	26318	26323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_009922	A	6	6	26389	26394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_009922	CTT	2	6	26442	26447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319080
604	NC_009922	TCTT	2	8	26486	26493	0 %	75 %	0 %	25 %	158319080
605	NC_009922	CTTC	2	8	26684	26691	0 %	50 %	0 %	50 %	158319080
606	NC_009922	T	6	6	26773	26778	0 %	100 %	0 %	0 %	158319080
607	NC_009922	CTC	2	6	26791	26796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_009922	TAT	2	6	26802	26807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_009922	A	7	7	26846	26852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_009922	ATT	2	6	26891	26896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_009922	AT	4	8	26917	26924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_009922	AATT	2	8	26939	26946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_009922	TTAATA	2	12	26947	26958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_009922	ATT	2	6	26983	26988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_009922	AAT	2	6	27051	27056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_009922	AAG	2	6	27119	27124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319081
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618	NC_009922	A	6	6	27168	27173	100 %	0 %	0 %	0 %	158319081
619	NC_009922	GAT	2	6	27190	27195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319081
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621	NC_009922	TAC	2	6	27204	27209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319081
622	NC_009922	ATT	2	6	27299	27304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319081
623	NC_009922	TGGAA	2	10	27327	27336	40 %	20 %	40 %	0 %	158319081
624	NC_009922	ATC	2	6	27337	27342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319081
625	NC_009922	TAA	2	6	27375	27380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319081
626	NC_009922	GAA	2	6	27433	27438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319081
627	NC_009922	TGA	2	6	27452	27457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319081
628	NC_009922	ATT	2	6	27620	27625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319081
629	NC_009922	AG	3	6	27724	27729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
630	NC_009922	AAG	2	6	27746	27751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319082
631	NC_009922	TAT	2	6	27759	27764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319082
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