MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkaliphilus oremlandii OhILAs chromosome

Total Repeats: 70799

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_009922	CCAT	2	8	318104	318111	25 %	25 %	0 %	50 %	158319320
7002	NC_009922	ATT	2	6	318121	318126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319320
7003	NC_009922	ATTAAA	2	12	318151	318162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319320
7004	NC_009922	ATG	2	6	318197	318202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319320
7005	NC_009922	ACC	2	6	318224	318229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319320
7006	NC_009922	AG	3	6	318263	318268	50 %	0 %	50 %	0 %	158319320
7007	NC_009922	TAT	2	6	318313	318318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319320
7008	NC_009922	TGCCA	2	10	318328	318337	20 %	20 %	20 %	40 %	158319320
7009	NC_009922	GTT	2	6	318374	318379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319320
7010	NC_009922	GA	3	6	318381	318386	50 %	0 %	50 %	0 %	158319320
7011	NC_009922	CAG	2	6	318405	318410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319320
7012	NC_009922	TAT	2	6	318436	318441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319320
7013	NC_009922	TA	3	6	318473	318478	50 %	50 %	0 %	0 %	158319320
7014	NC_009922	AAG	2	6	318486	318491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319320
7015	NC_009922	AGCA	2	8	318504	318511	50 %	0 %	25 %	25 %	158319320
7016	NC_009922	CAAA	2	8	318641	318648	75 %	0 %	0 %	25 %	158319321
7017	NC_009922	TTG	3	9	318658	318666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319321
7018	NC_009922	AGATTT	2	12	318668	318679	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158319321
7019	NC_009922	AGA	2	6	318725	318730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319321
7020	NC_009922	AAAG	2	8	318731	318738	75 %	0 %	25 %	0 %	158319321
7021	NC_009922	TTGA	2	8	318810	318817	25 %	50 %	25 %	0 %	158319321
7022	NC_009922	AGA	2	6	318894	318899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319321
7023	NC_009922	ATCT	2	8	318941	318948	25 %	50 %	0 %	25 %	158319321
7024	NC_009922	CGT	2	6	318956	318961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319321
7025	NC_009922	GGC	2	6	319034	319039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	158319321
7026	NC_009922	CAG	2	6	319098	319103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319321
7027	NC_009922	GATG	2	8	319154	319161	25 %	25 %	50 %	0 %	158319321
7028	NC_009922	AGA	2	6	319202	319207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319321
7029	NC_009922	GCA	2	6	319262	319267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319321
7030	NC_009922	AGC	2	6	319268	319273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319321
7031	NC_009922	TTC	2	6	319296	319301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319321
7032	NC_009922	GA	3	6	319355	319360	50 %	0 %	50 %	0 %	158319321
7033	NC_009922	AGG	2	6	319400	319405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319321
7034	NC_009922	GA	3	6	319414	319419	50 %	0 %	50 %	0 %	158319322
7035	NC_009922	TAA	2	6	319546	319551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319322
7036	NC_009922	GAT	2	6	319556	319561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319322
7037	NC_009922	GAAG	2	8	319825	319832	50 %	0 %	50 %	0 %	158319322
7038	NC_009922	AGC	2	6	319855	319860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319322
7039	NC_009922	ATG	2	6	319916	319921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319322
7040	NC_009922	ATT	2	6	319937	319942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319322
7041	NC_009922	TCT	2	6	319957	319962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	158319322
7042	NC_009922	CCA	2	6	320001	320006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	158319322
7043	NC_009922	ATTA	2	8	320054	320061	50 %	50 %	0 %	0 %	158319322
7044	NC_009922	CA	3	6	320105	320110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7045	NC_009922	TTA	2	6	320146	320151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_009922	TAGA	2	8	320204	320211	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7047	NC_009922	TATTGA	2	12	320250	320261	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	158319323
7048	NC_009922	A	6	6	320316	320321	100 %	0 %	0 %	0 %	158319323
7049	NC_009922	TAC	2	6	320340	320345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319323
7050	NC_009922	AAGAG	2	10	320376	320385	60 %	0 %	40 %	0 %	158319323
7051	NC_009922	TA	3	6	320405	320410	50 %	50 %	0 %	0 %	158319323
7052	NC_009922	ATA	2	6	320483	320488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	158319323
7053	NC_009922	AAG	2	6	320505	320510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319323
7054	NC_009922	TATT	2	8	320575	320582	25 %	75 %	0 %	0 %	158319323
7055	NC_009922	AGA	2	6	320637	320642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319323
7056	NC_009922	GAA	2	6	320788	320793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319323
7057	NC_009922	TTTA	2	8	320841	320848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_009922	ACT	2	6	320934	320939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	158319324
7059	NC_009922	T	8	8	320955	320962	0 %	100 %	0 %	0 %	158319324
7060	NC_009922	GGT	2	6	321026	321031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319324
7061	NC_009922	CT	3	6	321053	321058	0 %	50 %	0 %	50 %	158319324
7062	NC_009922	TCC	2	6	321085	321090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7063	NC_009922	ATC	2	6	321109	321114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7064	NC_009922	AATTA	2	10	321153	321162	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7065	NC_009922	TA	3	6	321161	321166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_009922	AAC	2	6	321189	321194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_009922	AAGTT	2	10	321195	321204	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_009922	AT	3	6	321212	321217	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_009922	ACGA	2	8	321244	321251	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7070	NC_009922	CAA	2	6	321373	321378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	158319325
7071	NC_009922	TTA	2	6	321389	321394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319325
7072	NC_009922	TAG	2	6	321404	321409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319325
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7080	NC_009922	GCT	2	6	321727	321732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319325
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7082	NC_009922	TTAAAG	2	12	321797	321808	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	158319325
7083	NC_009922	TGG	2	6	321819	321824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319325
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7088	NC_009922	TGG	2	6	321999	322004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319325
7089	NC_009922	CAG	2	6	322028	322033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	158319325
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7092	NC_009922	AAAGTA	2	12	322108	322119	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	158319325
7093	NC_009922	CAATG	2	10	322209	322218	40 %	20 %	20 %	20 %	158319325
7094	NC_009922	AAAC	2	8	322225	322232	75 %	0 %	0 %	25 %	158319325
7095	NC_009922	GCT	2	6	322285	322290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	158319325
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7102	NC_009922	A	6	6	322414	322419	100 %	0 %	0 %	0 %	158319325
7103	NC_009922	GGA	2	6	322531	322536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319325
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7106	NC_009922	T	6	6	322766	322771	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_009922	TTG	2	6	322793	322798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_009922	ATA	2	6	322820	322825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_009922	CGC	2	6	322884	322889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7110	NC_009922	AAT	2	6	322984	322989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_009922	TTAT	2	8	323004	323011	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7112	NC_009922	ATTTGT	2	12	323038	323049	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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7114	NC_009922	TAT	2	6	323062	323067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_009922	T	6	6	323067	323072	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_009922	ATAAA	2	10	323077	323086	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_009922	T	6	6	323106	323111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_009922	TA	3	6	323116	323121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_009922	ATT	2	6	323123	323128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319326
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7122	NC_009922	CTCTGT	2	12	323387	323398	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	158319326
7123	NC_009922	CGAT	2	8	323429	323436	25 %	25 %	25 %	25 %	158319326
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7125	NC_009922	TTG	2	6	323483	323488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	158319326
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7229	NC_009922	AGA	3	9	328897	328905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319329
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7231	NC_009922	ATT	2	6	329012	329017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	158319329
7232	NC_009922	GGA	2	6	329073	329078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	158319329
7233	NC_009922	TGA	2	6	329148	329153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	158319329
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7240	NC_009922	A	6	6	329526	329531	100 %	0 %	0 %	0 %	158319329
7241	NC_009922	AGA	2	6	329541	329546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	158319329
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7244	NC_009922	CCGA	2	8	329639	329646	25 %	0 %	25 %	50 %	158319329
7245	NC_009922	ATTT	2	8	329662	329669	25 %	75 %	0 %	0 %	158319329
7246	NC_009922	TGG	2	6	329733	329738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	158319329
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