MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 97244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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93002	NC_009484	GCT	2	6	3238927	3238932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261941
93003	NC_009484	CGC	2	6	3238933	3238938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261941
93004	NC_009484	CG	3	6	3238972	3238977	0 %	0 %	50 %	50 %	148261941
93005	NC_009484	CTG	2	6	3238985	3238990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261941
93006	NC_009484	GCG	2	6	3239006	3239011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261941
93007	NC_009484	CCG	2	6	3239025	3239030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261941
93008	NC_009484	GCC	2	6	3239075	3239080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261941
93009	NC_009484	CGC	2	6	3239107	3239112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261941
93010	NC_009484	CG	3	6	3239129	3239134	0 %	0 %	50 %	50 %	148261941
93011	NC_009484	GGC	2	6	3239167	3239172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261941
93012	NC_009484	GCA	2	6	3239179	3239184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148261941
93013	NC_009484	TCCTGC	2	12	3239265	3239276	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	148261941
93014	NC_009484	GC	3	6	3239275	3239280	0 %	0 %	50 %	50 %	148261941
93015	NC_009484	GCC	2	6	3239315	3239320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261941
93016	NC_009484	CTG	2	6	3239336	3239341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261941
93017	NC_009484	GAC	2	6	3239354	3239359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148261941
93018	NC_009484	GC	3	6	3239396	3239401	0 %	0 %	50 %	50 %	148261941
93019	NC_009484	AGC	2	6	3239403	3239408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148261941
93020	NC_009484	GGC	2	6	3239413	3239418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261941
93021	NC_009484	CG	3	6	3239443	3239448	0 %	0 %	50 %	50 %	148261941
93022	NC_009484	CGGCGC	2	12	3239506	3239517	0 %	0 %	50 %	50 %	148261941
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93026	NC_009484	CAT	2	6	3239606	3239611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148261941
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93041	NC_009484	GC	4	8	3240022	3240029	0 %	0 %	50 %	50 %	148261941
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93053	NC_009484	TCG	2	6	3240429	3240434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261942
93054	NC_009484	GCCGC	2	10	3240442	3240451	0 %	0 %	40 %	60 %	148261942
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93104	NC_009484	CCGCG	2	10	3242237	3242246	0 %	0 %	40 %	60 %	148261944
93105	NC_009484	CG	3	6	3242357	3242362	0 %	0 %	50 %	50 %	148261944
93106	NC_009484	TCG	2	6	3242365	3242370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261944
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93117	NC_009484	GCCG	2	8	3242720	3242727	0 %	0 %	50 %	50 %	148261944
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93208	NC_009484	CGCGC	2	10	3245844	3245853	0 %	0 %	40 %	60 %	148261947
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93231	NC_009484	CG	3	6	3246609	3246614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93232	NC_009484	CTG	2	6	3246635	3246640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148261948
93233	NC_009484	CG	3	6	3246658	3246663	0 %	0 %	50 %	50 %	148261948
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93351	NC_009484	GGC	2	6	3250392	3250397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261951
93352	NC_009484	GC	3	6	3250421	3250426	0 %	0 %	50 %	50 %	148261951
93353	NC_009484	CG	5	10	3250441	3250450	0 %	0 %	50 %	50 %	148261951
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93467	NC_009484	CGC	3	9	3253763	3253771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148261953
93468	NC_009484	GCG	2	6	3253788	3253793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93469	NC_009484	GCC	2	6	3253826	3253831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93470	NC_009484	C	6	6	3253830	3253835	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
93471	NC_009484	TGGC	2	8	3253914	3253921	0 %	25 %	50 %	25 %	148261954
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93475	NC_009484	CGG	2	6	3254124	3254129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261954
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93487	NC_009484	CG	3	6	3254714	3254719	0 %	0 %	50 %	50 %	148261955
93488	NC_009484	GGC	2	6	3254736	3254741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148261955
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93490	NC_009484	GCAA	2	8	3254813	3254820	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93491	NC_009484	CCG	2	6	3254825	3254830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93492	NC_009484	GA	3	6	3254842	3254847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93493	NC_009484	CCCGG	2	10	3254860	3254869	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
93494	NC_009484	TGA	2	6	3254889	3254894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93495	NC_009484	CG	3	6	3254953	3254958	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93496	NC_009484	GTC	2	6	3254993	3254998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93497	NC_009484	CGT	2	6	3254999	3255004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93498	NC_009484	AATGCA	2	12	3255157	3255168	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	148261956
93499	NC_009484	TTC	2	6	3255206	3255211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148261956
93500	NC_009484	CGA	2	6	3255352	3255357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148261956

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