MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY05

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009471	CA	3	6	107	112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009471	GC	3	6	611	616	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
3	NC_009471	CG	3	6	643	648	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
4	NC_009471	GC	3	6	785	790	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
5	NC_009471	GC	3	6	807	812	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
6	NC_009471	GC	3	6	957	962	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
7	NC_009471	CG	5	10	1530	1539	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
8	NC_009471	CG	3	6	1627	1632	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
9	NC_009471	CG	3	6	1745	1750	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
10	NC_009471	CG	3	6	2081	2086	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
11	NC_009471	GC	3	6	2360	2365	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
12	NC_009471	GC	3	6	2383	2388	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
13	NC_009471	GC	3	6	2469	2474	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
14	NC_009471	CG	3	6	2516	2521	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
15	NC_009471	GC	3	6	3793	3798	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
16	NC_009471	CG	3	6	4439	4444	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
17	NC_009471	CG	4	8	4587	4594	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
18	NC_009471	CG	4	8	4830	4837	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
19	NC_009471	CG	3	6	5196	5201	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
20	NC_009471	CG	3	6	5253	5258	0 %	0 %	50 %	50 %	148244089
21	NC_009471	CT	3	6	6037	6042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009471	CG	3	6	7668	7673	0 %	0 %	50 %	50 %	148244092
23	NC_009471	GC	3	6	8305	8310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_009471	CG	3	6	10542	10547	0 %	0 %	50 %	50 %	148244094
25	NC_009471	GA	3	6	11366	11371	50 %	0 %	50 %	0 %	148244095
26	NC_009471	GC	3	6	11425	11430	0 %	0 %	50 %	50 %	148244095
27	NC_009471	GC	3	6	11457	11462	0 %	0 %	50 %	50 %	148244095
28	NC_009471	GC	3	6	11938	11943	0 %	0 %	50 %	50 %	148244095
29	NC_009471	CG	3	6	12447	12452	0 %	0 %	50 %	50 %	148244095
30	NC_009471	CG	3	6	13157	13162	0 %	0 %	50 %	50 %	148244096
31	NC_009471	GC	3	6	13340	13345	0 %	0 %	50 %	50 %	148244096
32	NC_009471	CG	3	6	13381	13386	0 %	0 %	50 %	50 %	148244096
33	NC_009471	GC	3	6	14166	14171	0 %	0 %	50 %	50 %	148244097
34	NC_009471	GA	3	6	14416	14421	50 %	0 %	50 %	0 %	148244097
35	NC_009471	GC	3	6	14812	14817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009471	GC	3	6	14860	14865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009471	CG	3	6	15912	15917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009471	GC	4	8	16140	16147	0 %	0 %	50 %	50 %	148244100
39	NC_009471	CG	3	6	16935	16940	0 %	0 %	50 %	50 %	148244102
40	NC_009471	GC	3	6	17044	17049	0 %	0 %	50 %	50 %	148244102
41	NC_009471	CG	3	6	17449	17454	0 %	0 %	50 %	50 %	148244102
42	NC_009471	CG	3	6	17907	17912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_009471	GC	3	6	18561	18566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009471	GA	3	6	19556	19561	50 %	0 %	50 %	0 %	148244104
45	NC_009471	CG	3	6	19958	19963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_009471	TC	3	6	20064	20069	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_009471	GA	3	6	20428	20433	50 %	0 %	50 %	0 %	148244105
48	NC_009471	GT	3	6	20501	20506	0 %	50 %	50 %	0 %	148244105
49	NC_009471	GA	3	6	21151	21156	50 %	0 %	50 %	0 %	148244105
50	NC_009471	AG	3	6	21278	21283	50 %	0 %	50 %	0 %	148244105
51	NC_009471	GC	3	6	22030	22035	0 %	0 %	50 %	50 %	148244105
52	NC_009471	CG	3	6	22047	22052	0 %	0 %	50 %	50 %	148244105
53	NC_009471	GC	4	8	22264	22271	0 %	0 %	50 %	50 %	148244105
54	NC_009471	CG	3	6	22562	22567	0 %	0 %	50 %	50 %	148244105
55	NC_009471	GC	4	8	22767	22774	0 %	0 %	50 %	50 %	148244105
56	NC_009471	CG	3	6	22931	22936	0 %	0 %	50 %	50 %	148244105
57	NC_009471	TG	3	6	23044	23049	0 %	50 %	50 %	0 %	148244105
58	NC_009471	AG	3	6	23339	23344	50 %	0 %	50 %	0 %	148244106
59	NC_009471	CG	3	6	24023	24028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009471	AC	3	6	24227	24232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009471	CG	3	6	24986	24991	0 %	0 %	50 %	50 %	148244107
62	NC_009471	AT	3	6	25987	25992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009471	TG	3	6	26014	26019	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_009471	AG	3	6	26359	26364	50 %	0 %	50 %	0 %	148244108
65	NC_009471	GC	3	6	26801	26806	0 %	0 %	50 %	50 %	148244108
66	NC_009471	TA	3	6	27147	27152	50 %	50 %	0 %	0 %	148244108
67	NC_009471	AT	3	6	27184	27189	50 %	50 %	0 %	0 %	148244108
68	NC_009471	TA	3	6	27404	27409	50 %	50 %	0 %	0 %	148244108
69	NC_009471	AT	4	8	28313	28320	50 %	50 %	0 %	0 %	148244108
70	NC_009471	GC	3	6	29278	29283	0 %	0 %	50 %	50 %	148244109
71	NC_009471	CG	4	8	29405	29412	0 %	0 %	50 %	50 %	148244110
72	NC_009471	GT	3	6	29676	29681	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009471	GT	3	6	29932	29937	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009471	CG	5	10	32473	32482	0 %	0 %	50 %	50 %	148244112
75	NC_009471	TG	4	8	32756	32763	0 %	50 %	50 %	0 %	148244113
76	NC_009471	GC	3	6	32920	32925	0 %	0 %	50 %	50 %	148244113
77	NC_009471	GC	3	6	33255	33260	0 %	0 %	50 %	50 %	148244113
78	NC_009471	GC	3	6	33311	33316	0 %	0 %	50 %	50 %	148244113
79	NC_009471	GC	3	6	33614	33619	0 %	0 %	50 %	50 %	148244113
80	NC_009471	CG	5	10	34086	34095	0 %	0 %	50 %	50 %	148244114
81	NC_009471	CA	3	6	35183	35188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009471	GC	3	6	35548	35553	0 %	0 %	50 %	50 %	148244115
83	NC_009471	CA	3	6	36100	36105	50 %	0 %	0 %	50 %	148244116
84	NC_009471	GC	3	6	36297	36302	0 %	0 %	50 %	50 %	148244116
85	NC_009471	TG	3	6	36380	36385	0 %	50 %	50 %	0 %	148244116
86	NC_009471	AT	4	8	36742	36749	50 %	50 %	0 %	0 %	148244116

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.