MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY02

Total Repeats: 435

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009468	AT	3	6	98	103	50 %	50 %	0 %	0 %	148243808
2	NC_009468	CG	3	6	128	133	0 %	0 %	50 %	50 %	148243808
3	NC_009468	CG	3	6	155	160	0 %	0 %	50 %	50 %	148243808
4	NC_009468	TC	3	6	483	488	0 %	50 %	0 %	50 %	148243808
5	NC_009468	CT	3	6	501	506	0 %	50 %	0 %	50 %	148243808
6	NC_009468	GC	3	6	1541	1546	0 %	0 %	50 %	50 %	148243808
7	NC_009468	TC	3	6	2129	2134	0 %	50 %	0 %	50 %	148243808
8	NC_009468	GC	4	8	2764	2771	0 %	0 %	50 %	50 %	148243808
9	NC_009468	GC	3	6	3130	3135	0 %	0 %	50 %	50 %	148243808
10	NC_009468	CG	3	6	3963	3968	0 %	0 %	50 %	50 %	148243809
11	NC_009468	GC	3	6	4182	4187	0 %	0 %	50 %	50 %	148243809
12	NC_009468	CG	3	6	4294	4299	0 %	0 %	50 %	50 %	148243809
13	NC_009468	GC	3	6	4788	4793	0 %	0 %	50 %	50 %	148243809
14	NC_009468	GC	3	6	4920	4925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_009468	CG	3	6	5410	5415	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_009468	TC	3	6	5486	5491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009468	CG	3	6	5662	5667	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_009468	CG	3	6	5700	5705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_009468	GC	3	6	5945	5950	0 %	0 %	50 %	50 %	148243810
20	NC_009468	CG	3	6	7127	7132	0 %	0 %	50 %	50 %	148243810
21	NC_009468	TC	3	6	7548	7553	0 %	50 %	0 %	50 %	148243810
22	NC_009468	GC	3	6	7783	7788	0 %	0 %	50 %	50 %	148243810
23	NC_009468	GC	3	6	7904	7909	0 %	0 %	50 %	50 %	148243810
24	NC_009468	GC	3	6	7934	7939	0 %	0 %	50 %	50 %	148243810
25	NC_009468	CG	3	6	8999	9004	0 %	0 %	50 %	50 %	148243812
26	NC_009468	CG	4	8	9368	9375	0 %	0 %	50 %	50 %	148243812
27	NC_009468	CG	3	6	9469	9474	0 %	0 %	50 %	50 %	148243812
28	NC_009468	GC	4	8	9984	9991	0 %	0 %	50 %	50 %	148243813
29	NC_009468	CG	3	6	10238	10243	0 %	0 %	50 %	50 %	148243813
30	NC_009468	GC	3	6	10419	10424	0 %	0 %	50 %	50 %	148243813
31	NC_009468	GC	3	6	10548	10553	0 %	0 %	50 %	50 %	148243813
32	NC_009468	CG	3	6	10874	10879	0 %	0 %	50 %	50 %	148243813
33	NC_009468	GC	3	6	10974	10979	0 %	0 %	50 %	50 %	148243813
34	NC_009468	CG	3	6	11937	11942	0 %	0 %	50 %	50 %	148243814
35	NC_009468	GC	3	6	12889	12894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_009468	GC	3	6	12898	12903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009468	AG	3	6	13239	13244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009468	CG	3	6	14140	14145	0 %	0 %	50 %	50 %	148243817
39	NC_009468	CT	3	6	14335	14340	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_009468	GC	4	8	15237	15244	0 %	0 %	50 %	50 %	148243818
41	NC_009468	CG	3	6	15778	15783	0 %	0 %	50 %	50 %	148243818
42	NC_009468	CG	3	6	15949	15954	0 %	0 %	50 %	50 %	148243819
43	NC_009468	GA	3	6	17069	17074	50 %	0 %	50 %	0 %	148243820
44	NC_009468	AC	3	6	17254	17259	50 %	0 %	0 %	50 %	148243820
45	NC_009468	CG	3	6	17334	17339	0 %	0 %	50 %	50 %	148243820
46	NC_009468	GC	3	6	18257	18262	0 %	0 %	50 %	50 %	148243821
47	NC_009468	GC	3	6	19651	19656	0 %	0 %	50 %	50 %	148243822
48	NC_009468	CG	3	6	19755	19760	0 %	0 %	50 %	50 %	148243822
49	NC_009468	GA	3	6	19953	19958	50 %	0 %	50 %	0 %	148243822
50	NC_009468	CG	3	6	19987	19992	0 %	0 %	50 %	50 %	148243822
51	NC_009468	CG	3	6	20346	20351	0 %	0 %	50 %	50 %	148243822
52	NC_009468	CG	5	10	20736	20745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_009468	GT	3	6	20790	20795	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009468	GC	3	6	22727	22732	0 %	0 %	50 %	50 %	148243824
55	NC_009468	GC	3	6	22841	22846	0 %	0 %	50 %	50 %	148243824
56	NC_009468	CG	3	6	24416	24421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009468	CG	3	6	24506	24511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009468	CG	3	6	24792	24797	0 %	0 %	50 %	50 %	148243826
59	NC_009468	GT	3	6	24822	24827	0 %	50 %	50 %	0 %	148243826
60	NC_009468	AT	3	6	25008	25013	50 %	50 %	0 %	0 %	148243826
61	NC_009468	CG	3	6	26804	26809	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
62	NC_009468	CG	3	6	26864	26869	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
63	NC_009468	GC	3	6	26911	26916	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
64	NC_009468	AC	3	6	26954	26959	50 %	0 %	0 %	50 %	148243829
65	NC_009468	GC	4	8	27976	27983	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
66	NC_009468	AG	3	6	28079	28084	50 %	0 %	50 %	0 %	148243829
67	NC_009468	CG	3	6	28115	28120	0 %	0 %	50 %	50 %	148243829
68	NC_009468	CG	3	6	29257	29262	0 %	0 %	50 %	50 %	148243830
69	NC_009468	TC	3	6	29682	29687	0 %	50 %	0 %	50 %	148243830
70	NC_009468	CG	3	6	30468	30473	0 %	0 %	50 %	50 %	148243830
71	NC_009468	GC	3	6	30516	30521	0 %	0 %	50 %	50 %	148243830
72	NC_009468	GC	3	6	30603	30608	0 %	0 %	50 %	50 %	148243830
73	NC_009468	GC	3	6	30980	30985	0 %	0 %	50 %	50 %	148243831
74	NC_009468	GC	3	6	31392	31397	0 %	0 %	50 %	50 %	148243832
75	NC_009468	GC	3	6	31579	31584	0 %	0 %	50 %	50 %	148243832
76	NC_009468	GA	3	6	31949	31954	50 %	0 %	50 %	0 %	148243832
77	NC_009468	CT	3	6	32328	32333	0 %	50 %	0 %	50 %	148243832
78	NC_009468	GC	3	6	32972	32977	0 %	0 %	50 %	50 %	148243833
79	NC_009468	GC	3	6	33142	33147	0 %	0 %	50 %	50 %	148243834
80	NC_009468	GC	3	6	33721	33726	0 %	0 %	50 %	50 %	148243834
81	NC_009468	AC	3	6	35036	35041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_009468	GC	3	6	35398	35403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_009468	GT	3	6	35541	35546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009468	GT	3	6	35968	35973	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009468	AG	3	6	36382	36387	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009468	TG	3	6	37004	37009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009468	CA	4	8	37655	37662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_009468	GA	3	6	37839	37844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009468	CT	3	6	38624	38629	0 %	50 %	0 %	50 %	148243836
90	NC_009468	GC	4	8	38677	38684	0 %	0 %	50 %	50 %	148243836
91	NC_009468	CG	3	6	38881	38886	0 %	0 %	50 %	50 %	148243836
92	NC_009468	TC	3	6	39279	39284	0 %	50 %	0 %	50 %	148243836
93	NC_009468	GC	3	6	40263	40268	0 %	0 %	50 %	50 %	148243837
94	NC_009468	GC	3	6	40494	40499	0 %	0 %	50 %	50 %	148243837
95	NC_009468	CG	3	6	40669	40674	0 %	0 %	50 %	50 %	148243837
96	NC_009468	GC	3	6	40754	40759	0 %	0 %	50 %	50 %	148243837
97	NC_009468	CG	4	8	40933	40940	0 %	0 %	50 %	50 %	148243837
98	NC_009468	CG	3	6	41296	41301	0 %	0 %	50 %	50 %	148243838
99	NC_009468	GC	4	8	41408	41415	0 %	0 %	50 %	50 %	148243838
100	NC_009468	TA	3	6	41601	41606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009468	GT	3	6	41664	41669	0 %	50 %	50 %	0 %	148243839
102	NC_009468	GC	3	6	42319	42324	0 %	0 %	50 %	50 %	148243840
103	NC_009468	CG	3	6	45099	45104	0 %	0 %	50 %	50 %	148243842
104	NC_009468	CG	3	6	45725	45730	0 %	0 %	50 %	50 %	148243843
105	NC_009468	GA	3	6	46137	46142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009468	TA	3	6	47059	47064	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009468	TA	3	6	47078	47083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009468	CG	3	6	47766	47771	0 %	0 %	50 %	50 %	148243846
109	NC_009468	CG	3	6	48056	48061	0 %	0 %	50 %	50 %	148243846
110	NC_009468	TG	3	6	48522	48527	0 %	50 %	50 %	0 %	148243847
111	NC_009468	GC	4	8	48873	48880	0 %	0 %	50 %	50 %	148243847
112	NC_009468	TA	4	8	49531	49538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009468	AT	3	6	49650	49655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009468	TA	3	6	49729	49734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009468	TA	3	6	49739	49744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009468	AT	3	6	49845	49850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009468	AT	3	6	49887	49892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_009468	GC	3	6	50110	50115	0 %	0 %	50 %	50 %	148243848
119	NC_009468	GC	3	6	50322	50327	0 %	0 %	50 %	50 %	148243848
120	NC_009468	AC	3	6	50929	50934	50 %	0 %	0 %	50 %	148243848
121	NC_009468	AT	3	6	50975	50980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009468	AC	3	6	51771	51776	50 %	0 %	0 %	50 %	148243849
123	NC_009468	GA	3	6	52682	52687	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009468	AC	3	6	53145	53150	50 %	0 %	0 %	50 %	148243850
125	NC_009468	AG	3	6	53368	53373	50 %	0 %	50 %	0 %	148243850
126	NC_009468	GA	3	6	53480	53485	50 %	0 %	50 %	0 %	148243850
127	NC_009468	CG	3	6	54078	54083	0 %	0 %	50 %	50 %	148243851
128	NC_009468	GC	3	6	54213	54218	0 %	0 %	50 %	50 %	148243851
129	NC_009468	CG	3	6	54629	54634	0 %	0 %	50 %	50 %	148243852
130	NC_009468	CG	3	6	54979	54984	0 %	0 %	50 %	50 %	148243852
131	NC_009468	CG	3	6	55490	55495	0 %	0 %	50 %	50 %	148243853
132	NC_009468	CG	3	6	55679	55684	0 %	0 %	50 %	50 %	148243853
133	NC_009468	CG	3	6	56298	56303	0 %	0 %	50 %	50 %	148243854
134	NC_009468	GC	3	6	56564	56569	0 %	0 %	50 %	50 %	148243855
135	NC_009468	TC	3	6	57386	57391	0 %	50 %	0 %	50 %	148243856
136	NC_009468	CG	3	6	57611	57616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_009468	CG	3	6	58658	58663	0 %	0 %	50 %	50 %	148243858
138	NC_009468	CA	3	6	59098	59103	50 %	0 %	0 %	50 %	148243858
139	NC_009468	CG	4	8	59152	59159	0 %	0 %	50 %	50 %	148243858
140	NC_009468	GC	3	6	60232	60237	0 %	0 %	50 %	50 %	148243860
141	NC_009468	TC	3	6	60530	60535	0 %	50 %	0 %	50 %	148243860
142	NC_009468	AC	3	6	60835	60840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_009468	CG	3	6	61165	61170	0 %	0 %	50 %	50 %	148243861
144	NC_009468	GA	3	6	61395	61400	50 %	0 %	50 %	0 %	148243861
145	NC_009468	CG	3	6	61484	61489	0 %	0 %	50 %	50 %	148243861
146	NC_009468	CG	3	6	61959	61964	0 %	0 %	50 %	50 %	148243862
147	NC_009468	GC	3	6	62350	62355	0 %	0 %	50 %	50 %	148243862
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432	NC_009468	GC	3	6	185976	185981	0 %	0 %	50 %	50 %	148243975
433	NC_009468	GC	3	6	186299	186304	0 %	0 %	50 %	50 %	148243976
434	NC_009468	GC	3	6	186856	186861	0 %	0 %	50 %	50 %	148243976
435	NC_009468	GT	3	6	187051	187056	0 %	50 %	50 %	0 %	148243976

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.