MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY01

Total Repeats: 178

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009467	AGGCA	2	10	466	475	40 %	0 %	40 %	20 %	148243636
2	NC_009467	GCGGT	2	10	1062	1071	0 %	20 %	60 %	20 %	148243636
3	NC_009467	GCGTG	2	10	1121	1130	0 %	20 %	60 %	20 %	148243636
4	NC_009467	CTGCA	2	10	1365	1374	20 %	20 %	20 %	40 %	148243636
5	NC_009467	CGTGG	2	10	2851	2860	0 %	20 %	60 %	20 %	148243637
6	NC_009467	CCTTC	2	10	4722	4731	0 %	40 %	0 %	60 %	148243639
7	NC_009467	GCACT	2	10	7079	7088	20 %	20 %	20 %	40 %	148243641
8	NC_009467	AGGCA	2	10	7297	7306	40 %	0 %	40 %	20 %	148243641
9	NC_009467	CGGCG	2	10	7482	7491	0 %	0 %	60 %	40 %	148243641
10	NC_009467	GCGCC	2	10	9721	9730	0 %	0 %	40 %	60 %	148243641
11	NC_009467	TCGGG	2	10	10017	10026	0 %	20 %	60 %	20 %	148243642
12	NC_009467	CGAAG	2	10	10356	10365	40 %	0 %	40 %	20 %	148243642
13	NC_009467	CCGAC	2	10	10490	10499	20 %	0 %	20 %	60 %	148243642
14	NC_009467	GCGCC	3	15	13005	13019	0 %	0 %	40 %	60 %	148243645
15	NC_009467	ACGAA	2	10	18033	18042	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_009467	CAGTC	2	10	19438	19447	20 %	20 %	20 %	40 %	148243652
17	NC_009467	TCCTA	2	10	20713	20722	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_009467	CGGCG	2	10	23931	23940	0 %	0 %	60 %	40 %	148243655
19	NC_009467	GCTGA	2	10	25672	25681	20 %	20 %	40 %	20 %	148243657
20	NC_009467	GAGTG	2	10	27706	27715	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009467	CGCGC	2	10	28709	28718	0 %	0 %	40 %	60 %	148243661
22	NC_009467	GTACG	2	10	29840	29849	20 %	20 %	40 %	20 %	148243662
23	NC_009467	GGTTC	2	10	31758	31767	0 %	40 %	40 %	20 %	148243663
24	NC_009467	ATCCG	2	10	32784	32793	20 %	20 %	20 %	40 %	148243664
25	NC_009467	GCGCC	2	10	33530	33539	0 %	0 %	40 %	60 %	148243664
26	NC_009467	ACGCT	2	10	35103	35112	20 %	20 %	20 %	40 %	148243666
27	NC_009467	GTCTT	2	10	35355	35364	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_009467	TCTCG	2	10	36498	36507	0 %	40 %	20 %	40 %	148243668
29	NC_009467	CCGGC	2	10	37556	37565	0 %	0 %	40 %	60 %	148243668
30	NC_009467	CGCGG	2	10	37678	37687	0 %	0 %	60 %	40 %	148243668
31	NC_009467	TCATC	2	10	39228	39237	20 %	40 %	0 %	40 %	148243668
32	NC_009467	GTCTG	2	10	41520	41529	0 %	40 %	40 %	20 %	148243668
33	NC_009467	TGCGC	2	10	42721	42730	0 %	20 %	40 %	40 %	148243668
34	NC_009467	GGCTC	2	10	43655	43664	0 %	20 %	40 %	40 %	148243668
35	NC_009467	GCTGT	2	10	43711	43720	0 %	40 %	40 %	20 %	148243668
36	NC_009467	TCGGC	2	10	45209	45218	0 %	20 %	40 %	40 %	148243669
37	NC_009467	GTCAC	2	10	45258	45267	20 %	20 %	20 %	40 %	148243669
38	NC_009467	CCGGG	2	10	45497	45506	0 %	0 %	60 %	40 %	148243670
39	NC_009467	CTCCA	2	10	46381	46390	20 %	20 %	0 %	60 %	148243671
40	NC_009467	GCGCC	2	10	46968	46977	0 %	0 %	40 %	60 %	148243671
41	NC_009467	GTTCG	2	10	47314	47323	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_009467	TACCG	2	10	47875	47884	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_009467	TCGCC	2	10	51034	51043	0 %	20 %	20 %	60 %	148243673
44	NC_009467	CTCAC	2	10	51507	51516	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_009467	CGGCG	2	10	52253	52262	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
46	NC_009467	CCGTG	2	10	52892	52901	0 %	20 %	40 %	40 %	148243675
47	NC_009467	ACCGA	2	10	53842	53851	40 %	0 %	20 %	40 %	148243677
48	NC_009467	GATGC	2	10	55162	55171	20 %	20 %	40 %	20 %	148243679
49	NC_009467	TTCTG	2	10	55424	55433	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_009467	TCGGG	2	10	55798	55807	0 %	20 %	60 %	20 %	148243680
51	NC_009467	CGAAG	2	10	56137	56146	40 %	0 %	40 %	20 %	148243681
52	NC_009467	CCGAC	2	10	56271	56280	20 %	0 %	20 %	60 %	148243681
53	NC_009467	CTTCC	2	10	56456	56465	0 %	40 %	0 %	60 %	148243681
54	NC_009467	GCGCA	2	10	56466	56475	20 %	0 %	40 %	40 %	148243681
55	NC_009467	CGTCT	2	10	57476	57485	0 %	40 %	20 %	40 %	148243682
56	NC_009467	TAGGA	2	10	63779	63788	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_009467	GACTG	2	10	65338	65347	20 %	20 %	40 %	20 %	148243686
58	NC_009467	GGCAT	2	10	65787	65796	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_009467	GCACG	2	10	65974	65983	20 %	0 %	40 %	40 %	148243687
60	NC_009467	CGGTG	2	10	68696	68705	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_009467	GACCT	2	10	69413	69422	20 %	20 %	20 %	40 %	148243690
62	NC_009467	GACCA	2	10	72407	72416	40 %	0 %	20 %	40 %	148243692
63	NC_009467	CCGCG	2	10	75189	75198	0 %	0 %	40 %	60 %	148243693
64	NC_009467	TCGGC	2	10	76538	76547	0 %	20 %	40 %	40 %	148243694
65	NC_009467	TGGCG	2	10	78685	78694	0 %	20 %	60 %	20 %	148243694
66	NC_009467	CCGAC	2	10	78833	78842	20 %	0 %	20 %	60 %	148243694
67	NC_009467	GAACT	2	10	79443	79452	40 %	20 %	20 %	20 %	148243694
68	NC_009467	CCCTG	2	10	79652	79661	0 %	20 %	20 %	60 %	148243694
69	NC_009467	CGGAT	2	10	79845	79854	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
70	NC_009467	GATCC	2	10	81326	81335	20 %	20 %	20 %	40 %	148243696
71	NC_009467	GCGCC	2	10	83636	83645	0 %	0 %	40 %	60 %	148243697
72	NC_009467	TGGTG	2	10	85686	85695	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009467	CACAT	2	10	85871	85880	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_009467	CCGAT	2	10	86990	86999	20 %	20 %	20 %	40 %	148243702
75	NC_009467	CAAAG	2	10	87237	87246	60 %	0 %	20 %	20 %	148243702
76	NC_009467	CTGCC	2	10	87341	87350	0 %	20 %	20 %	60 %	148243702
77	NC_009467	CGCAC	2	10	87794	87803	20 %	0 %	20 %	60 %	148243702
78	NC_009467	CTGCC	2	10	89507	89516	0 %	20 %	20 %	60 %	148243704
79	NC_009467	GCGCG	2	10	89618	89627	0 %	0 %	60 %	40 %	148243704
80	NC_009467	CGCGC	2	10	90070	90079	0 %	0 %	40 %	60 %	148243704
81	NC_009467	CAGCA	2	10	90898	90907	40 %	0 %	20 %	40 %	148243704
82	NC_009467	CCTGG	2	10	92243	92252	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NC_009467	CGGCG	2	10	94375	94384	0 %	0 %	60 %	40 %	148243709
84	NC_009467	CCCGA	2	10	95681	95690	20 %	0 %	20 %	60 %	148243710
85	NC_009467	AGAAT	2	10	96060	96069	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_009467	GCATC	2	10	96321	96330	20 %	20 %	20 %	40 %	148243711
87	NC_009467	ACCGC	2	10	97329	97338	20 %	0 %	20 %	60 %	148243712
88	NC_009467	CCGCG	2	10	98028	98037	0 %	0 %	40 %	60 %	148243713
89	NC_009467	TCGGT	2	10	98962	98971	0 %	40 %	40 %	20 %	148243714
90	NC_009467	CACGG	2	10	99912	99921	20 %	0 %	40 %	40 %	148243717
91	NC_009467	GTGAG	2	10	101297	101306	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009467	TGCCC	2	10	105147	105156	0 %	20 %	20 %	60 %	148243721
93	NC_009467	GTTTC	2	10	105274	105283	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_009467	GTATT	2	10	107207	107216	20 %	60 %	20 %	0 %	148243724
95	NC_009467	CGTGC	2	10	107300	107309	0 %	20 %	40 %	40 %	148243724
96	NC_009467	AAATA	2	10	110794	110803	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009467	GTGGC	2	10	112433	112442	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
98	NC_009467	CAGCG	2	10	112621	112630	20 %	0 %	40 %	40 %	148243729
99	NC_009467	CCGCG	2	10	114174	114183	0 %	0 %	40 %	60 %	148243729
100	NC_009467	GCCCG	2	10	114282	114291	0 %	0 %	40 %	60 %	148243729
101	NC_009467	GGCGC	2	10	114850	114859	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
102	NC_009467	GGCGA	2	10	115492	115501	20 %	0 %	60 %	20 %	148243730
103	NC_009467	CGATC	2	10	115713	115722	20 %	20 %	20 %	40 %	148243730
104	NC_009467	TGTGC	2	10	115884	115893	0 %	40 %	40 %	20 %	148243730
105	NC_009467	TCGGC	2	10	119661	119670	0 %	20 %	40 %	40 %	148243732
106	NC_009467	GTCAC	2	10	119710	119719	20 %	20 %	20 %	40 %	148243732
107	NC_009467	GATCG	2	10	125483	125492	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_009467	GACTG	2	10	127826	127835	20 %	20 %	40 %	20 %	148243738
109	NC_009467	TGCGG	2	10	131158	131167	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_009467	CGCGC	2	10	131182	131191	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
111	NC_009467	GCGCC	2	10	132748	132757	0 %	0 %	40 %	60 %	148243742
112	NC_009467	TTGCC	2	10	133164	133173	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_009467	CTGGT	2	10	133972	133981	0 %	40 %	40 %	20 %	148243743
114	NC_009467	CGTGC	2	10	137407	137416	0 %	20 %	40 %	40 %	148243745
115	NC_009467	ATGCC	2	10	137594	137603	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_009467	CACGC	2	10	140703	140712	20 %	0 %	20 %	60 %	148243748
117	NC_009467	GCGCC	2	10	140814	140823	0 %	0 %	40 %	60 %	148243748
118	NC_009467	GCCGC	2	10	141543	141552	0 %	0 %	40 %	60 %	148243748
119	NC_009467	TGCCG	2	10	144031	144040	0 %	20 %	40 %	40 %	148243748
120	NC_009467	GGCCA	2	10	144249	144258	20 %	0 %	40 %	40 %	148243749
121	NC_009467	CGGGA	2	10	145610	145619	20 %	0 %	60 %	20 %	148243751
122	NC_009467	CCGCG	2	10	146283	146292	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
123	NC_009467	CGGTT	2	10	147093	147102	0 %	40 %	40 %	20 %	148243753
124	NC_009467	GCGCC	2	10	148851	148860	0 %	0 %	40 %	60 %	148243755
125	NC_009467	GTGCG	2	10	151907	151916	0 %	20 %	60 %	20 %	148243758
126	NC_009467	CCTCG	2	10	152349	152358	0 %	20 %	20 %	60 %	148243758
127	NC_009467	GCGGT	2	10	152371	152380	0 %	20 %	60 %	20 %	148243758
128	NC_009467	GTCTG	2	10	158208	158217	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
129	NC_009467	ACGCA	2	10	162921	162930	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
130	NC_009467	CGGCT	2	10	163410	163419	0 %	20 %	40 %	40 %	148243770
131	NC_009467	TCGGC	2	10	163498	163507	0 %	20 %	40 %	40 %	148243770
132	NC_009467	GCCGC	2	10	163865	163874	0 %	0 %	40 %	60 %	148243771
133	NC_009467	TGGAA	2	10	165737	165746	40 %	20 %	40 %	0 %	148243772
134	NC_009467	TATTC	2	10	167476	167485	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_009467	TATAT	2	10	167528	167537	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009467	ACCAA	2	10	172731	172740	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_009467	TCCCA	2	10	172846	172855	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
138	NC_009467	GCCGG	2	10	172947	172956	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
139	NC_009467	AAGCT	2	10	173917	173926	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
140	NC_009467	CGCAT	2	10	174471	174480	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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165	NC_009467	CGGTC	2	10	193702	193711	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
166	NC_009467	CGGCG	2	10	194257	194266	0 %	0 %	60 %	40 %	148243798
167	NC_009467	CCTTC	2	10	194401	194410	0 %	40 %	0 %	60 %	148243798
168	NC_009467	CGGGG	2	10	194772	194781	0 %	0 %	80 %	20 %	148243798
169	NC_009467	AGGAG	2	10	195234	195243	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
170	NC_009467	CCGGC	2	10	195606	195615	0 %	0 %	40 %	60 %	148243799
171	NC_009467	CGCTG	2	10	197788	197797	0 %	20 %	40 %	40 %	148243801
172	NC_009467	GTCGC	2	10	197956	197965	0 %	20 %	40 %	40 %	148243801
173	NC_009467	CGCAG	2	10	198146	198155	20 %	0 %	40 %	40 %	148243801
174	NC_009467	CCGGG	2	10	198860	198869	0 %	0 %	60 %	40 %	148243802
175	NC_009467	GGCCG	2	10	199114	199123	0 %	0 %	60 %	40 %	148243802
176	NC_009467	TGAGG	2	10	202063	202072	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
177	NC_009467	CACCG	2	10	203529	203538	20 %	0 %	20 %	60 %	148243806
178	NC_009467	GCCGG	2	10	203539	203548	0 %	0 %	60 %	40 %	148243806

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.