MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Arthrobacter sp. Rue61a plasmid pAL1

Total Repeats: 151

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009453	GC	3	6	87	92	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009453	GC	3	6	286	291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009453	AC	3	6	336	341	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009453	GC	3	6	3108	3113	0 %	0 %	50 %	50 %	403571551
5	NC_009453	CG	4	8	3582	3589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009453	GC	3	6	4541	4546	0 %	0 %	50 %	50 %	403571552
7	NC_009453	TG	3	6	4828	4833	0 %	50 %	50 %	0 %	403571552
8	NC_009453	CA	3	6	5072	5077	50 %	0 %	0 %	50 %	403571552
9	NC_009453	GT	4	8	5770	5777	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009453	TG	3	6	7210	7215	0 %	50 %	50 %	0 %	403571555
11	NC_009453	CA	3	6	7240	7245	50 %	0 %	0 %	50 %	403571555
12	NC_009453	TC	3	6	7385	7390	0 %	50 %	0 %	50 %	403571555
13	NC_009453	TC	3	6	9593	9598	0 %	50 %	0 %	50 %	403571555
14	NC_009453	TA	3	6	10154	10159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_009453	GC	3	6	10413	10418	0 %	0 %	50 %	50 %	403571556
16	NC_009453	CG	3	6	10513	10518	0 %	0 %	50 %	50 %	403571556
17	NC_009453	CA	4	8	11290	11297	50 %	0 %	0 %	50 %	403571556
18	NC_009453	GC	3	6	11363	11368	0 %	0 %	50 %	50 %	403571556
19	NC_009453	TC	3	6	11445	11450	0 %	50 %	0 %	50 %	403571556
20	NC_009453	CG	3	6	12500	12505	0 %	0 %	50 %	50 %	403571558
21	NC_009453	GC	3	6	12514	12519	0 %	0 %	50 %	50 %	403571558
22	NC_009453	CT	3	6	12729	12734	0 %	50 %	0 %	50 %	403571558
23	NC_009453	GC	3	6	14195	14200	0 %	0 %	50 %	50 %	403571559
24	NC_009453	CT	3	6	14266	14271	0 %	50 %	0 %	50 %	403571559
25	NC_009453	GA	3	6	15180	15185	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009453	GT	3	6	18427	18432	0 %	50 %	50 %	0 %	403571562
27	NC_009453	CG	4	8	19267	19274	0 %	0 %	50 %	50 %	403571563
28	NC_009453	AT	3	6	19741	19746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009453	GC	3	6	21124	21129	0 %	0 %	50 %	50 %	403571565
30	NC_009453	CG	3	6	21297	21302	0 %	0 %	50 %	50 %	403571565
31	NC_009453	CA	3	6	25168	25173	50 %	0 %	0 %	50 %	403571571
32	NC_009453	CG	3	6	25665	25670	0 %	0 %	50 %	50 %	403571571
33	NC_009453	AC	3	6	30217	30222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009453	CT	3	6	30817	30822	0 %	50 %	0 %	50 %	403571574
35	NC_009453	TC	3	6	31020	31025	0 %	50 %	0 %	50 %	403571575
36	NC_009453	AC	3	6	31137	31142	50 %	0 %	0 %	50 %	403571575
37	NC_009453	CA	3	6	31192	31197	50 %	0 %	0 %	50 %	403571575
38	NC_009453	TA	3	6	32066	32071	50 %	50 %	0 %	0 %	403571576
39	NC_009453	GA	3	6	32373	32378	50 %	0 %	50 %	0 %	403571576
40	NC_009453	AC	3	6	34853	34858	50 %	0 %	0 %	50 %	403571577
41	NC_009453	TG	4	8	35465	35472	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_009453	GC	3	6	35891	35896	0 %	0 %	50 %	50 %	403571578
43	NC_009453	GC	3	6	35990	35995	0 %	0 %	50 %	50 %	403571578
44	NC_009453	GC	3	6	36035	36040	0 %	0 %	50 %	50 %	403571578
45	NC_009453	CG	3	6	36052	36057	0 %	0 %	50 %	50 %	403571578
46	NC_009453	GC	3	6	36643	36648	0 %	0 %	50 %	50 %	403571579
47	NC_009453	AC	3	6	36755	36760	50 %	0 %	0 %	50 %	403571579
48	NC_009453	GC	5	10	37477	37486	0 %	0 %	50 %	50 %	403571579
49	NC_009453	CT	3	6	37572	37577	0 %	50 %	0 %	50 %	403571579
50	NC_009453	GC	3	6	38002	38007	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_009453	CA	3	6	38530	38535	50 %	0 %	0 %	50 %	403571580
52	NC_009453	GC	3	6	38633	38638	0 %	0 %	50 %	50 %	403571580
53	NC_009453	TG	3	6	39837	39842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009453	GA	3	6	40437	40442	50 %	0 %	50 %	0 %	403571582
55	NC_009453	AC	3	6	40782	40787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009453	AC	3	6	40796	40801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_009453	GC	3	6	40918	40923	0 %	0 %	50 %	50 %	403571584
58	NC_009453	GC	3	6	43126	43131	0 %	0 %	50 %	50 %	403571587
59	NC_009453	AC	3	6	43698	43703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_009453	TC	3	6	44204	44209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009453	GC	3	6	45184	45189	0 %	0 %	50 %	50 %	403571589
62	NC_009453	CG	3	6	45885	45890	0 %	0 %	50 %	50 %	403571590
63	NC_009453	CA	3	6	46092	46097	50 %	0 %	0 %	50 %	403571590
64	NC_009453	CA	3	6	46457	46462	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_009453	CA	3	6	46828	46833	50 %	0 %	0 %	50 %	403571592
66	NC_009453	AC	3	6	47613	47618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_009453	CG	3	6	48463	48468	0 %	0 %	50 %	50 %	403571594
68	NC_009453	CG	4	8	48822	48829	0 %	0 %	50 %	50 %	403571594
69	NC_009453	CG	3	6	49621	49626	0 %	0 %	50 %	50 %	403571594
70	NC_009453	CT	3	6	50846	50851	0 %	50 %	0 %	50 %	403571595
71	NC_009453	AT	3	6	51290	51295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009453	GT	3	6	51307	51312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009453	CT	4	8	51353	51360	0 %	50 %	0 %	50 %	403571596
74	NC_009453	CG	3	6	52058	52063	0 %	0 %	50 %	50 %	403571597
75	NC_009453	CA	3	6	53388	53393	50 %	0 %	0 %	50 %	403571598
76	NC_009453	TC	3	6	54739	54744	0 %	50 %	0 %	50 %	403571601
77	NC_009453	GT	3	6	55411	55416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009453	CT	3	6	56248	56253	0 %	50 %	0 %	50 %	403571604
79	NC_009453	CT	3	6	56381	56386	0 %	50 %	0 %	50 %	403571605
80	NC_009453	AC	3	6	57309	57314	50 %	0 %	0 %	50 %	403571606
81	NC_009453	TC	3	6	59020	59025	0 %	50 %	0 %	50 %	403571610
82	NC_009453	AC	3	6	59596	59601	50 %	0 %	0 %	50 %	403571610
83	NC_009453	CG	3	6	60232	60237	0 %	0 %	50 %	50 %	403571610
84	NC_009453	TC	3	6	60658	60663	0 %	50 %	0 %	50 %	403571610
85	NC_009453	CA	3	6	60757	60762	50 %	0 %	0 %	50 %	403571610
86	NC_009453	GT	3	6	61381	61386	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009453	GC	3	6	62283	62288	0 %	0 %	50 %	50 %	403571611
88	NC_009453	TA	3	6	63074	63079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_009453	GC	3	6	65760	65765	0 %	0 %	50 %	50 %	403571615
90	NC_009453	TG	3	6	66702	66707	0 %	50 %	50 %	0 %	403571615
91	NC_009453	CA	3	6	66894	66899	50 %	0 %	0 %	50 %	403571615
92	NC_009453	CG	3	6	67277	67282	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_009453	GA	3	6	67500	67505	50 %	0 %	50 %	0 %	403571616
94	NC_009453	CT	3	6	69288	69293	0 %	50 %	0 %	50 %	403571616
95	NC_009453	GT	3	6	70747	70752	0 %	50 %	50 %	0 %	403571618
96	NC_009453	AG	3	6	71497	71502	50 %	0 %	50 %	0 %	403571619
97	NC_009453	CG	4	8	72296	72303	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_009453	AC	3	6	72304	72309	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_009453	CA	3	6	72332	72337	50 %	0 %	0 %	50 %	403571620
100	NC_009453	CA	3	6	72945	72950	50 %	0 %	0 %	50 %	403571620
101	NC_009453	AC	4	8	73084	73091	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_009453	TG	3	6	74534	74539	0 %	50 %	50 %	0 %	403571621
103	NC_009453	AG	3	6	75535	75540	50 %	0 %	50 %	0 %	403571622
104	NC_009453	TC	3	6	76410	76415	0 %	50 %	0 %	50 %	403571622
105	NC_009453	CG	3	6	77035	77040	0 %	0 %	50 %	50 %	403571622
106	NC_009453	GC	3	6	77312	77317	0 %	0 %	50 %	50 %	403571622
107	NC_009453	GC	3	6	77428	77433	0 %	0 %	50 %	50 %	403571622
108	NC_009453	GC	3	6	78896	78901	0 %	0 %	50 %	50 %	403571623
109	NC_009453	CG	3	6	79754	79759	0 %	0 %	50 %	50 %	403571623
110	NC_009453	GC	4	8	80004	80011	0 %	0 %	50 %	50 %	403571623
111	NC_009453	CG	5	10	80195	80204	0 %	0 %	50 %	50 %	403571623
112	NC_009453	CG	3	6	80666	80671	0 %	0 %	50 %	50 %	403571623
113	NC_009453	GC	3	6	80869	80874	0 %	0 %	50 %	50 %	403571623
114	NC_009453	GC	3	6	81188	81193	0 %	0 %	50 %	50 %	403571623
115	NC_009453	GA	3	6	83159	83164	50 %	0 %	50 %	0 %	403571624
116	NC_009453	GC	3	6	83321	83326	0 %	0 %	50 %	50 %	403571624
117	NC_009453	AG	4	8	85312	85319	50 %	0 %	50 %	0 %	403571625
118	NC_009453	CG	4	8	85766	85773	0 %	0 %	50 %	50 %	403571626
119	NC_009453	GC	3	6	86765	86770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_009453	AC	3	6	87325	87330	50 %	0 %	0 %	50 %	403571627
121	NC_009453	CA	3	6	89288	89293	50 %	0 %	0 %	50 %	403571630
122	NC_009453	AC	3	6	90324	90329	50 %	0 %	0 %	50 %	403571631
123	NC_009453	CT	3	6	90395	90400	0 %	50 %	0 %	50 %	403571631
124	NC_009453	GC	3	6	93282	93287	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_009453	CG	4	8	94233	94240	0 %	0 %	50 %	50 %	403571635
126	NC_009453	TA	3	6	94760	94765	50 %	50 %	0 %	0 %	403571636
127	NC_009453	AC	3	6	94869	94874	50 %	0 %	0 %	50 %	403571636
128	NC_009453	TC	3	6	95203	95208	0 %	50 %	0 %	50 %	403571637
129	NC_009453	CA	3	6	96955	96960	50 %	0 %	0 %	50 %	403571639
130	NC_009453	GC	3	6	97646	97651	0 %	0 %	50 %	50 %	403571639
131	NC_009453	CG	4	8	98228	98235	0 %	0 %	50 %	50 %	403571639
132	NC_009453	CG	3	6	98338	98343	0 %	0 %	50 %	50 %	403571639
133	NC_009453	AG	3	6	98702	98707	50 %	0 %	50 %	0 %	403571639
134	NC_009453	CG	3	6	98895	98900	0 %	0 %	50 %	50 %	403571639
135	NC_009453	GC	4	8	100935	100942	0 %	0 %	50 %	50 %	403571642
136	NC_009453	TC	3	6	101442	101447	0 %	50 %	0 %	50 %	403571643
137	NC_009453	CA	3	6	102262	102267	50 %	0 %	0 %	50 %	403571644
138	NC_009453	AT	3	6	102690	102695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_009453	GC	3	6	102930	102935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_009453	CG	3	6	103029	103034	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_009453	TC	3	6	103067	103072	0 %	50 %	0 %	50 %	403571645
142	NC_009453	GC	3	6	104035	104040	0 %	0 %	50 %	50 %	403571645
143	NC_009453	GC	3	6	104189	104194	0 %	0 %	50 %	50 %	403571645
144	NC_009453	CG	3	6	104221	104226	0 %	0 %	50 %	50 %	403571645
145	NC_009453	AC	3	6	104701	104706	50 %	0 %	0 %	50 %	403571646
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147	NC_009453	TG	3	6	106958	106963	0 %	50 %	50 %	0 %	403571648
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149	NC_009453	GC	3	6	109175	109180	0 %	0 %	50 %	50 %	403571648
150	NC_009453	GC	3	6	110838	110843	0 %	0 %	50 %	50 %	403571648
151	NC_009453	AC	3	6	112515	112520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.