MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida A449 plasmid 5

Total Repeats: 393

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009350	CAAT	2	8	90	97	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_009350	AGGG	2	8	207	214	25 %	0 %	75 %	0 %	145301386
3	NC_009350	GACA	2	8	295	302	50 %	0 %	25 %	25 %	145301386
4	NC_009350	GGCA	2	8	585	592	25 %	0 %	50 %	25 %	145301387
5	NC_009350	CCCT	2	8	1130	1137	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_009350	CAGG	2	8	1625	1632	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009350	CAGG	2	8	2535	2542	25 %	0 %	50 %	25 %	145301388
8	NC_009350	GTTC	2	8	2773	2780	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_009350	TATC	2	8	4092	4099	25 %	50 %	0 %	25 %	145301390
10	NC_009350	AGAA	2	8	4118	4125	75 %	0 %	25 %	0 %	145301390
11	NC_009350	TCGG	2	8	4381	4388	0 %	25 %	50 %	25 %	145301391
12	NC_009350	TTTG	2	8	4400	4407	0 %	75 %	25 %	0 %	145301391
13	NC_009350	GCCA	2	8	4846	4853	25 %	0 %	25 %	50 %	145301391
14	NC_009350	GTCA	2	8	6458	6465	25 %	25 %	25 %	25 %	145301392
15	NC_009350	TCGC	2	8	6490	6497	0 %	25 %	25 %	50 %	145301392
16	NC_009350	GAGT	2	8	6742	6749	25 %	25 %	50 %	0 %	145301392
17	NC_009350	TTGA	2	8	6752	6759	25 %	50 %	25 %	0 %	145301392
18	NC_009350	TTTG	2	8	6806	6813	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009350	CTGA	2	8	7043	7050	25 %	25 %	25 %	25 %	145301393
20	NC_009350	CCAT	2	8	7111	7118	25 %	25 %	0 %	50 %	145301393
21	NC_009350	ACTC	2	8	7583	7590	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_009350	CAGC	2	8	7997	8004	25 %	0 %	25 %	50 %	145301394
23	NC_009350	GGGT	2	8	8810	8817	0 %	25 %	75 %	0 %	145301394
24	NC_009350	CAGT	2	8	9066	9073	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_009350	GCAG	2	8	9435	9442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_009350	CTGG	2	8	9784	9791	0 %	25 %	50 %	25 %	145301395
27	NC_009350	GATT	2	8	10285	10292	25 %	50 %	25 %	0 %	145301395
28	NC_009350	CAAC	2	8	11337	11344	50 %	0 %	0 %	50 %	145301396
29	NC_009350	GAAT	2	8	11409	11416	50 %	25 %	25 %	0 %	145301396
30	NC_009350	GCTG	2	8	11760	11767	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_009350	GCAA	2	8	12108	12115	50 %	0 %	25 %	25 %	145301397
32	NC_009350	CCAC	2	8	12362	12369	25 %	0 %	0 %	75 %	145301398
33	NC_009350	TGAA	2	8	12551	12558	50 %	25 %	25 %	0 %	145301398
34	NC_009350	TTAA	2	8	12686	12693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009350	GAAC	2	8	13156	13163	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_009350	CCAT	2	8	13209	13216	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009350	TATT	2	8	13982	13989	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009350	TTGG	2	8	14025	14032	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009350	TGAA	2	8	14885	14892	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009350	TATC	2	8	15668	15675	25 %	50 %	0 %	25 %	145301400
41	NC_009350	CAAT	2	8	16040	16047	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009350	TGAT	2	8	16057	16064	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009350	GGCA	2	8	16534	16541	25 %	0 %	50 %	25 %	145301402
44	NC_009350	GGCA	2	8	17579	17586	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_009350	TGAA	2	8	18440	18447	50 %	25 %	25 %	0 %	145301403
46	NC_009350	AGGG	2	8	18451	18458	25 %	0 %	75 %	0 %	145301403
47	NC_009350	GCAG	2	8	19197	19204	25 %	0 %	50 %	25 %	145301404
48	NC_009350	TGCT	2	8	19392	19399	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_009350	CCGA	2	8	19587	19594	25 %	0 %	25 %	50 %	145301405
50	NC_009350	CCAA	2	8	19910	19917	50 %	0 %	0 %	50 %	145301405
51	NC_009350	ACTC	2	8	20300	20307	25 %	25 %	0 %	50 %	145301406
52	NC_009350	TCAT	2	8	21364	21371	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009350	GCTG	2	8	22723	22730	0 %	25 %	50 %	25 %	145301408
54	NC_009350	CAAC	2	8	23257	23264	50 %	0 %	0 %	50 %	145301410
55	NC_009350	CAGG	2	8	24013	24020	25 %	0 %	50 %	25 %	145301411
56	NC_009350	CCCG	2	8	24161	24168	0 %	0 %	25 %	75 %	145301411
57	NC_009350	GGGT	2	8	24586	24593	0 %	25 %	75 %	0 %	145301412
58	NC_009350	CCAG	2	8	24982	24989	25 %	0 %	25 %	50 %	145301412
59	NC_009350	TCCG	2	8	25102	25109	0 %	25 %	25 %	50 %	145301412
60	NC_009350	TTCA	2	8	25777	25784	25 %	50 %	0 %	25 %	145301412
61	NC_009350	GCGG	2	8	26014	26021	0 %	0 %	75 %	25 %	145301413
62	NC_009350	GCCC	2	8	26025	26032	0 %	0 %	25 %	75 %	145301413
63	NC_009350	GCCC	2	8	26091	26098	0 %	0 %	25 %	75 %	145301413
64	NC_009350	GACG	2	8	28327	28334	25 %	0 %	50 %	25 %	145301414
65	NC_009350	GCGA	2	8	28676	28683	25 %	0 %	50 %	25 %	145301414
66	NC_009350	GTTC	2	8	28809	28816	0 %	50 %	25 %	25 %	145301414
67	NC_009350	CAGG	2	8	29042	29049	25 %	0 %	50 %	25 %	145301415
68	NC_009350	GGAT	2	8	29050	29057	25 %	25 %	50 %	0 %	145301415
69	NC_009350	GGCT	2	8	29101	29108	0 %	25 %	50 %	25 %	145301415
70	NC_009350	GCCA	2	8	29182	29189	25 %	0 %	25 %	50 %	145301415
71	NC_009350	AGCA	2	8	29209	29216	50 %	0 %	25 %	25 %	145301415
72	NC_009350	CAGC	2	8	29380	29387	25 %	0 %	25 %	50 %	145301415
73	NC_009350	CAAC	2	8	29828	29835	50 %	0 %	0 %	50 %	145301416
74	NC_009350	CCAT	2	8	30916	30923	25 %	25 %	0 %	50 %	145301417
75	NC_009350	ACCC	2	8	31279	31286	25 %	0 %	0 %	75 %	145301418
76	NC_009350	ACCA	2	8	32098	32105	50 %	0 %	0 %	50 %	145301419
77	NC_009350	GAAT	2	8	32411	32418	50 %	25 %	25 %	0 %	145301419
78	NC_009350	TCTG	2	8	32822	32829	0 %	50 %	25 %	25 %	145301419
79	NC_009350	AGGC	2	8	32930	32937	25 %	0 %	50 %	25 %	145301419
80	NC_009350	CGAG	2	8	33517	33524	25 %	0 %	50 %	25 %	145301419
81	NC_009350	AGCA	2	8	33728	33735	50 %	0 %	25 %	25 %	145301419
82	NC_009350	TCGC	2	8	33785	33792	0 %	25 %	25 %	50 %	145301419
83	NC_009350	GCGG	2	8	33822	33829	0 %	0 %	75 %	25 %	145301419
84	NC_009350	GCAC	2	8	34591	34598	25 %	0 %	25 %	50 %	145301420
85	NC_009350	CGCC	2	8	34708	34715	0 %	0 %	25 %	75 %	145301421
86	NC_009350	CAGC	2	8	35648	35655	25 %	0 %	25 %	50 %	145301422
87	NC_009350	CCAG	2	8	36361	36368	25 %	0 %	25 %	50 %	145301422
88	NC_009350	ATCA	2	8	36399	36406	50 %	25 %	0 %	25 %	145301422
89	NC_009350	GACA	2	8	36426	36433	50 %	0 %	25 %	25 %	145301422
90	NC_009350	CCCG	2	8	37098	37105	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_009350	GGCT	2	8	37763	37770	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
92	NC_009350	GCGG	2	8	38028	38035	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
93	NC_009350	CAAA	2	8	38277	38284	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_009350	CAGT	2	8	38720	38727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009350	CAAT	2	8	39378	39385	50 %	25 %	0 %	25 %	145301423
96	NC_009350	GGGC	2	8	40772	40779	0 %	0 %	75 %	25 %	145301425
97	NC_009350	GAAC	2	8	41069	41076	50 %	0 %	25 %	25 %	145301425
98	NC_009350	CATG	2	8	41309	41316	25 %	25 %	25 %	25 %	145301425
99	NC_009350	CCAA	2	8	41899	41906	50 %	0 %	0 %	50 %	145301425
100	NC_009350	CCCT	2	8	42024	42031	0 %	25 %	0 %	75 %	145301425
101	NC_009350	TTTC	2	8	42182	42189	0 %	75 %	0 %	25 %	145301425
102	NC_009350	GGCG	2	8	43447	43454	0 %	0 %	75 %	25 %	145301426
103	NC_009350	ACCA	2	8	43473	43480	50 %	0 %	0 %	50 %	145301426
104	NC_009350	CAGC	2	8	43634	43641	25 %	0 %	25 %	50 %	145301426
105	NC_009350	CGGG	2	8	44231	44238	0 %	0 %	75 %	25 %	145301426
106	NC_009350	AGCC	2	8	44355	44362	25 %	0 %	25 %	50 %	145301426
107	NC_009350	GGCA	2	8	44366	44373	25 %	0 %	50 %	25 %	145301426
108	NC_009350	CAAG	2	8	44567	44574	50 %	0 %	25 %	25 %	145301426
109	NC_009350	AAGC	2	8	45035	45042	50 %	0 %	25 %	25 %	145301426
110	NC_009350	ACAG	2	8	45189	45196	50 %	0 %	25 %	25 %	145301426
111	NC_009350	GCCA	2	8	45243	45250	25 %	0 %	25 %	50 %	145301426
112	NC_009350	CACC	2	8	45959	45966	25 %	0 %	0 %	75 %	145301426
113	NC_009350	GATC	2	8	46413	46420	25 %	25 %	25 %	25 %	145301426
114	NC_009350	CTAT	2	8	46813	46820	25 %	50 %	0 %	25 %	145301426
115	NC_009350	GAGC	2	8	47047	47054	25 %	0 %	50 %	25 %	145301426
116	NC_009350	AAGG	2	8	47175	47182	50 %	0 %	50 %	0 %	145301426
117	NC_009350	TAAA	2	8	47920	47927	75 %	25 %	0 %	0 %	145301426
118	NC_009350	TCGG	2	8	48317	48324	0 %	25 %	50 %	25 %	145301427
119	NC_009350	TTTG	2	8	48336	48343	0 %	75 %	25 %	0 %	145301427
120	NC_009350	GCCA	2	8	48782	48789	25 %	0 %	25 %	50 %	145301427
121	NC_009350	GCTG	2	8	49571	49578	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_009350	GCTT	2	8	49666	49673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009350	TGCT	2	8	50074	50081	0 %	50 %	25 %	25 %	145301428
124	NC_009350	TTGA	2	8	50458	50465	25 %	50 %	25 %	0 %	145301428
125	NC_009350	AGCA	2	8	50923	50930	50 %	0 %	25 %	25 %	145301428
126	NC_009350	TAAA	2	8	51390	51397	75 %	25 %	0 %	0 %	145301429
127	NC_009350	GTTT	2	8	51517	51524	0 %	75 %	25 %	0 %	145301429
128	NC_009350	AACT	2	8	51984	51991	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_009350	CTGC	2	8	52218	52225	0 %	25 %	25 %	50 %	145301430
130	NC_009350	TTGC	2	8	52328	52335	0 %	50 %	25 %	25 %	145301430
131	NC_009350	CGGC	2	8	52802	52809	0 %	0 %	50 %	50 %	145301430
132	NC_009350	CAAA	2	8	53208	53215	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_009350	GGCC	2	8	53598	53605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_009350	TAAA	2	8	53676	53683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009350	CCAA	2	8	54224	54231	50 %	0 %	0 %	50 %	145301431
136	NC_009350	GCCA	2	8	54627	54634	25 %	0 %	25 %	50 %	145301432
137	NC_009350	CTGG	2	8	54887	54894	0 %	25 %	50 %	25 %	145301432
138	NC_009350	ACCG	2	8	55003	55010	25 %	0 %	25 %	50 %	145301432
139	NC_009350	GCTC	2	8	56239	56246	0 %	25 %	25 %	50 %	145301435
140	NC_009350	CGGG	2	8	56587	56594	0 %	0 %	75 %	25 %	145301435
141	NC_009350	CAGC	2	8	56730	56737	25 %	0 %	25 %	50 %	145301436
142	NC_009350	GCCA	2	8	56771	56778	25 %	0 %	25 %	50 %	145301436
143	NC_009350	CCAG	3	12	56897	56908	25 %	0 %	25 %	50 %	145301436
144	NC_009350	CCAG	2	8	56951	56958	25 %	0 %	25 %	50 %	145301436
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.