MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acinetobacter baumannii ATCC 17978 plasmid pAB2

Total Repeats: 136

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009084	AAC	2	6	65	70	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126640110
2	NC_009084	TTG	2	6	89	94	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126640110
3	NC_009084	CTG	2	6	350	355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640110
4	NC_009084	GAA	2	6	379	384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640110
5	NC_009084	TAG	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640110
6	NC_009084	TAG	2	6	423	428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640110
7	NC_009084	AGA	3	9	680	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640110
8	NC_009084	ATC	2	6	1114	1119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009084	AAG	2	6	1125	1130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009084	TGA	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_009084	GAA	2	6	1196	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009084	CAA	2	6	1211	1216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009084	CAG	2	6	1266	1271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009084	CAC	2	6	1272	1277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_009084	ACA	2	6	1322	1327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009084	CAA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009084	AAT	2	6	1352	1357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009084	ATT	2	6	1569	1574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_009084	GCT	2	6	1583	1588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009084	ATT	2	6	1682	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009084	TGA	2	6	1717	1722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_009084	AAT	2	6	1723	1728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009084	TAT	2	6	1843	1848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009084	AAT	2	6	1933	1938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009084	TTA	2	6	2045	2050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_009084	TAT	2	6	2089	2094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_009084	ATG	2	6	2311	2316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009084	AGA	3	9	2469	2477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_009084	GAA	2	6	2479	2484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009084	CAG	2	6	2583	2588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009084	AAG	2	6	2627	2632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009084	AGC	2	6	2652	2657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009084	ATT	2	6	2713	2718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_009084	GAT	2	6	2753	2758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_009084	TCA	2	6	2775	2780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_009084	TAT	2	6	2887	2892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009084	ATA	2	6	2933	2938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_009084	ATC	2	6	2952	2957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009084	AAG	2	6	3211	3216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640111
40	NC_009084	AGG	2	6	3341	3346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	126640111
41	NC_009084	CAA	2	6	3441	3446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126640111
42	NC_009084	TGC	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640111
43	NC_009084	CAT	2	6	3594	3599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640111
44	NC_009084	GCA	2	6	3657	3662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640111
45	NC_009084	AGC	2	6	3839	3844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640111
46	NC_009084	GCA	2	6	3948	3953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640111
47	NC_009084	ATT	2	6	4000	4005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640111
48	NC_009084	GCT	2	6	4046	4051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640111
49	NC_009084	ATC	2	6	4165	4170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640111
50	NC_009084	AGA	2	6	4307	4312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009084	ATG	2	6	4357	4362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640112
52	NC_009084	TTA	2	6	4372	4377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640112
53	NC_009084	GCA	2	6	4414	4419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640112
54	NC_009084	GAA	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640112
55	NC_009084	AAG	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640112
56	NC_009084	GAT	2	6	4573	4578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640112
57	NC_009084	TGG	4	12	4647	4658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126640112
58	NC_009084	TGC	2	6	4728	4733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640112
59	NC_009084	TCG	2	6	4751	4756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640112
60	NC_009084	CAT	2	6	4847	4852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640112
61	NC_009084	AGC	2	6	4857	4862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640112
62	NC_009084	GCA	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640112
63	NC_009084	TCA	2	6	5071	5076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640112
64	NC_009084	TGG	3	9	5106	5114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126640112
65	NC_009084	AAC	2	6	5202	5207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009084	GCT	2	6	5217	5222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009084	TAA	2	6	5305	5310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_009084	CTT	2	6	5384	5389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009084	AAT	2	6	5393	5398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009084	ATT	2	6	5449	5454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009084	GAA	2	6	5615	5620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009084	TGG	2	6	5664	5669	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009084	TGA	2	6	5683	5688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009084	ATC	2	6	5702	5707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_009084	TGA	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009084	CAA	2	6	5940	5945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_009084	TCA	2	6	6059	6064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009084	TAG	2	6	6136	6141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009084	GTT	2	6	6189	6194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009084	TAC	2	6	6277	6282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640113
81	NC_009084	TGA	2	6	6313	6318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640113
82	NC_009084	TAT	2	6	6472	6477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640113
83	NC_009084	AAT	2	6	6515	6520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
84	NC_009084	GTG	2	6	6606	6611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126640113
85	NC_009084	CAG	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640113
86	NC_009084	CTC	2	6	6837	6842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126640113
87	NC_009084	AGA	2	6	6871	6876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640113
88	NC_009084	ATA	2	6	6975	6980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
89	NC_009084	ATG	2	6	7011	7016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640113
90	NC_009084	TAT	2	6	7115	7120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640113
91	NC_009084	TCA	2	6	7174	7179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640113
92	NC_009084	ACT	2	6	7199	7204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640113
93	NC_009084	ATT	2	6	7320	7325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640113
94	NC_009084	ATA	2	6	7458	7463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
95	NC_009084	AAG	2	6	7488	7493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640113
96	NC_009084	ACC	2	6	7499	7504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126640113
97	NC_009084	CAG	2	6	7517	7522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640113
98	NC_009084	TAA	2	6	7681	7686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
99	NC_009084	TAA	2	6	7714	7719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
100	NC_009084	CTA	2	6	7902	7907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126640113
101	NC_009084	AAT	2	6	7952	7957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
102	NC_009084	GAT	2	6	7982	7987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640113
103	NC_009084	CTG	2	6	8121	8126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126640113
104	NC_009084	CCT	2	6	8309	8314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126640113
105	NC_009084	TGA	2	6	8347	8352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126640113
106	NC_009084	ATA	2	6	8397	8402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
107	NC_009084	AAT	2	6	8507	8512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640113
108	NC_009084	GAA	2	6	8571	8576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640113
109	NC_009084	TCT	2	6	8623	8628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009084	AGA	2	6	8642	8647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009084	AGA	2	6	8803	8808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640114
112	NC_009084	ATT	2	6	8874	8879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640114
113	NC_009084	AGC	2	6	8914	8919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126640114
114	NC_009084	ATT	2	6	8953	8958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640114
115	NC_009084	ATA	2	6	9090	9095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126640114
116	NC_009084	ATT	2	6	9133	9138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640114
117	NC_009084	GAA	2	6	9152	9157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126640114
118	NC_009084	TAT	2	6	9174	9179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640114
119	NC_009084	TAT	2	6	9197	9202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126640114
120	NC_009084	CAC	2	6	9280	9285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	126640114
121	NC_009084	AGA	2	6	9482	9487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009084	TCA	2	6	9574	9579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_009084	AAT	2	6	9705	9710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009084	ACT	2	6	9721	9726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_009084	ATC	2	6	9743	9748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_009084	CAT	2	6	9824	9829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_009084	ATT	2	6	9872	9877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009084	ATC	2	6	9890	9895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_009084	AAT	2	6	9990	9995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009084	TTA	2	6	10106	10111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009084	ACA	2	6	10255	10260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_009084	TTA	2	6	10276	10281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_009084	ACT	2	6	10360	10365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009084	GTG	2	6	10468	10473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009084	ATT	2	6	11093	11098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009084	ATA	2	6	11260	11265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.