MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 5b str. L20 chromosome

Total Repeats: 44772

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009053	GCG	2	6	25311	25316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207510
502	NC_009053	GTACC	2	10	25429	25438	20 %	20 %	20 %	40 %	126207510
503	NC_009053	ATT	2	6	25530	25535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207510
504	NC_009053	CGGT	2	8	25579	25586	0 %	25 %	50 %	25 %	126207510
505	NC_009053	CAAGCG	2	12	25605	25616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207510
506	NC_009053	TCG	2	6	25621	25626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207510
507	NC_009053	TCA	2	6	25631	25636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207510
508	NC_009053	GAGC	2	8	25668	25675	25 %	0 %	50 %	25 %	126207510
509	NC_009053	CGG	3	9	25775	25783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207510
510	NC_009053	TAA	2	6	25850	25855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207510
511	NC_009053	ACT	2	6	25884	25889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207510
512	NC_009053	TCC	2	6	25940	25945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	126207510
513	NC_009053	GGC	2	6	25986	25991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207510
514	NC_009053	AATT	2	8	26125	26132	50 %	50 %	0 %	0 %	126207510
515	NC_009053	GTG	2	6	26152	26157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126207510
516	NC_009053	GA	3	6	26189	26194	50 %	0 %	50 %	0 %	126207510
517	NC_009053	A	6	6	26385	26390	100 %	0 %	0 %	0 %	126207510
518	NC_009053	A	6	6	26454	26459	100 %	0 %	0 %	0 %	126207511
519	NC_009053	AAC	2	6	26479	26484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126207511
520	NC_009053	TGG	2	6	26515	26520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126207511
521	NC_009053	TGG	2	6	26547	26552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126207511
522	NC_009053	CGG	2	6	26578	26583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207511
523	NC_009053	GTC	2	6	26706	26711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207511
524	NC_009053	AGC	2	6	26713	26718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207511
525	NC_009053	GAA	2	6	26720	26725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207511
526	NC_009053	GCG	2	6	26790	26795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207511
527	NC_009053	GCG	2	6	26810	26815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207511
528	NC_009053	CCGTT	2	10	26876	26885	0 %	40 %	20 %	40 %	126207511
529	NC_009053	ATTA	2	8	26953	26960	50 %	50 %	0 %	0 %	126207511
530	NC_009053	ATT	2	6	26977	26982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207511
531	NC_009053	ATG	2	6	27008	27013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207511
532	NC_009053	GCG	2	6	27026	27031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207511
533	NC_009053	TTAA	2	8	27089	27096	50 %	50 %	0 %	0 %	126207511
534	NC_009053	GAT	2	6	27145	27150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207511
535	NC_009053	AGTA	2	8	27259	27266	50 %	25 %	25 %	0 %	126207511
536	NC_009053	CGA	2	6	27345	27350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207511
537	NC_009053	GAA	2	6	27431	27436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207511
538	NC_009053	CAA	2	6	27476	27481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126207511
539	NC_009053	CAA	3	9	27503	27511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126207511
540	NC_009053	CAA	2	6	27524	27529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126207511
541	NC_009053	CAA	2	6	27581	27586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126207511
542	NC_009053	CAG	2	6	27602	27607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207511
543	NC_009053	TTC	2	6	27613	27618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	126207511
544	NC_009053	A	6	6	27767	27772	100 %	0 %	0 %	0 %	126207512
545	NC_009053	CGG	2	6	27840	27845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207512
546	NC_009053	ATG	2	6	27906	27911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207512
547	NC_009053	TATT	2	8	28040	28047	25 %	75 %	0 %	0 %	126207512
548	NC_009053	GAA	2	6	28081	28086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207512
549	NC_009053	GAA	2	6	28118	28123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207512
550	NC_009053	GAT	2	6	28198	28203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207512
551	NC_009053	TCAA	2	8	28309	28316	50 %	25 %	0 %	25 %	126207512
552	NC_009053	TGAA	2	8	28377	28384	50 %	25 %	25 %	0 %	126207512
553	NC_009053	TTAT	2	8	28445	28452	25 %	75 %	0 %	0 %	126207512
554	NC_009053	ATT	2	6	28516	28521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207512
555	NC_009053	TGA	2	6	28656	28661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_009053	T	7	7	28675	28681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_009053	A	7	7	28733	28739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_009053	TA	3	6	28749	28754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_009053	TAA	2	6	28806	28811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207513
560	NC_009053	TGAA	2	8	28844	28851	50 %	25 %	25 %	0 %	126207513
561	NC_009053	AAG	2	6	29090	29095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207513
562	NC_009053	AAT	2	6	29116	29121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207513
563	NC_009053	ATT	3	9	29196	29204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207513
564	NC_009053	TTG	2	6	29257	29262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207513
565	NC_009053	AATGA	2	10	29263	29272	60 %	20 %	20 %	0 %	126207513
566	NC_009053	GAA	2	6	29292	29297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207513
567	NC_009053	GCT	2	6	29358	29363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207513
568	NC_009053	GAA	2	6	29425	29430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207513
569	NC_009053	TA	3	6	29528	29533	50 %	50 %	0 %	0 %	126207513
570	NC_009053	AGA	2	6	29550	29555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207513
571	NC_009053	TTCAGG	2	12	29615	29626	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	126207513
572	NC_009053	GTGA	2	8	29641	29648	25 %	25 %	50 %	0 %	126207513
573	NC_009053	TGG	2	6	29798	29803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	126207513
574	NC_009053	GAA	2	6	29818	29823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207513
575	NC_009053	TCA	2	6	29850	29855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207513
576	NC_009053	GCTG	2	8	29868	29875	0 %	25 %	50 %	25 %	126207513
577	NC_009053	A	6	6	29908	29913	100 %	0 %	0 %	0 %	126207513
578	NC_009053	ATG	2	6	29987	29992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207513
579	NC_009053	TGA	2	6	30018	30023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207513
580	NC_009053	AATTT	2	10	30029	30038	40 %	60 %	0 %	0 %	126207513
581	NC_009053	CGG	2	6	30087	30092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	126207513
582	NC_009053	AAAT	2	8	30135	30142	75 %	25 %	0 %	0 %	126207513
583	NC_009053	ATT	2	6	30157	30162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207513
584	NC_009053	TGA	2	6	30165	30170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207513
585	NC_009053	AAT	2	6	30322	30327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207513
586	NC_009053	TTA	2	6	30349	30354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207513
587	NC_009053	ATT	2	6	30387	30392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207513
588	NC_009053	TGCT	2	8	30419	30426	0 %	50 %	25 %	25 %	126207513
589	NC_009053	T	7	7	30503	30509	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_009053	AAC	2	6	30514	30519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_009053	A	7	7	30542	30548	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_009053	TTG	2	6	30556	30561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
593	NC_009053	AAAC	2	8	30603	30610	75 %	0 %	0 %	25 %	126207514
594	NC_009053	TCAA	2	8	30644	30651	50 %	25 %	0 %	25 %	126207514
595	NC_009053	ATTG	2	8	30699	30706	25 %	50 %	25 %	0 %	126207514
596	NC_009053	TAA	2	6	30709	30714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207514
597	NC_009053	AAT	2	6	30791	30796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207514
598	NC_009053	TTA	2	6	30923	30928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207514
599	NC_009053	CGGT	2	8	30960	30967	0 %	25 %	50 %	25 %	126207514
600	NC_009053	T	6	6	31012	31017	0 %	100 %	0 %	0 %	126207514
601	NC_009053	T	6	6	31220	31225	0 %	100 %	0 %	0 %	126207514
602	NC_009053	ATCGG	2	10	31262	31271	20 %	20 %	40 %	20 %	126207514
603	NC_009053	TGC	2	6	31298	31303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207514
604	NC_009053	GCAA	2	8	31310	31317	50 %	0 %	25 %	25 %	126207514
605	NC_009053	CTG	2	6	31323	31328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207514
606	NC_009053	TAA	2	6	31339	31344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207514
607	NC_009053	T	6	6	31351	31356	0 %	100 %	0 %	0 %	126207514
608	NC_009053	CGC	2	6	31371	31376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207514
609	NC_009053	CGTG	2	8	31401	31408	0 %	25 %	50 %	25 %	126207514
610	NC_009053	TTG	2	6	31426	31431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	126207514
611	NC_009053	CCG	2	6	31520	31525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207514
612	NC_009053	AAG	2	6	31545	31550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207514
613	NC_009053	CCG	2	6	31565	31570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207514
614	NC_009053	T	6	6	31627	31632	0 %	100 %	0 %	0 %	126207514
615	NC_009053	T	6	6	31640	31645	0 %	100 %	0 %	0 %	126207514
616	NC_009053	T	6	6	31660	31665	0 %	100 %	0 %	0 %	126207514
617	NC_009053	CAA	2	6	31668	31673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	126207514
618	NC_009053	ACG	2	6	31726	31731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	126207514
619	NC_009053	GCTT	2	8	31822	31829	0 %	50 %	25 %	25 %	126207514
620	NC_009053	TAAACT	2	12	31924	31935	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	126207514
621	NC_009053	ATT	2	6	32003	32008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	126207514
622	NC_009053	TAG	2	6	32092	32097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	126207515
623	NC_009053	AAT	2	6	32104	32109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	126207515
624	NC_009053	TCA	2	6	32114	32119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	126207515
625	NC_009053	CTG	2	6	32132	32137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	126207515
626	NC_009053	AAG	2	6	32223	32228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	126207515
627	NC_009053	CCCATT	2	12	32275	32286	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	126207515
628	NC_009053	CCAC	2	8	32357	32364	25 %	0 %	0 %	75 %	126207515
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630	NC_009053	CCG	2	6	32497	32502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	126207515
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