MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidovorax sp. JS42 chromosome

Total Repeats: 116928

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_008782	TGC	2	6	102682	102687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_008782	TGC	2	6	102815	102820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592528
3003	NC_008782	GCC	2	6	102838	102843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592528
3004	NC_008782	TGG	2	6	102875	102880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592528
3005	NC_008782	CTG	2	6	102883	102888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592528
3006	NC_008782	CGCA	2	8	102889	102896	25 %	0 %	25 %	50 %	121592528
3007	NC_008782	CTG	2	6	102919	102924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592528
3008	NC_008782	GGA	3	9	102930	102938	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121592528
3009	NC_008782	GGC	2	6	103020	103025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592528
3010	NC_008782	ACG	2	6	103085	103090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592528
3011	NC_008782	TGG	2	6	103106	103111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592528
3012	NC_008782	GGC	2	6	103163	103168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592528
3013	NC_008782	CGC	2	6	103218	103223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592528
3014	NC_008782	GC	3	6	103222	103227	0 %	0 %	50 %	50 %	121592528
3015	NC_008782	TGG	2	6	103253	103258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592528
3016	NC_008782	GTG	2	6	103264	103269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592528
3017	NC_008782	CCGGC	2	10	103319	103328	0 %	0 %	40 %	60 %	121592528
3018	NC_008782	CTGGCG	2	12	103339	103350	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	121592528
3019	NC_008782	GCG	3	9	103361	103369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592528
3020	NC_008782	GCT	2	6	103413	103418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592528
3021	NC_008782	TGAGC	2	10	103422	103431	20 %	20 %	40 %	20 %	121592528
3022	NC_008782	GTG	2	6	103432	103437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592528
3023	NC_008782	TGC	3	9	103457	103465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592528
3024	NC_008782	CG	3	6	103497	103502	0 %	0 %	50 %	50 %	121592528
3025	NC_008782	GCT	2	6	103503	103508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592528
3026	NC_008782	CAC	2	6	103510	103515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592528
3027	NC_008782	CGC	2	6	103520	103525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592528
3028	NC_008782	GC	3	6	103527	103532	0 %	0 %	50 %	50 %	121592528
3029	NC_008782	CCGC	2	8	103533	103540	0 %	0 %	25 %	75 %	121592528
3030	NC_008782	GCG	2	6	103558	103563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592528
3031	NC_008782	GAGC	2	8	103584	103591	25 %	0 %	50 %	25 %	121592528
3032	NC_008782	GCGCG	2	10	103605	103614	0 %	0 %	60 %	40 %	121592528
3033	NC_008782	GTGA	2	8	103627	103634	25 %	25 %	50 %	0 %	121592528
3034	NC_008782	CG	3	6	103636	103641	0 %	0 %	50 %	50 %	121592528
3035	NC_008782	GCC	2	6	103654	103659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592528
3036	NC_008782	GGC	2	6	103663	103668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592528
3037	NC_008782	CCGC	2	8	103767	103774	0 %	0 %	25 %	75 %	121592528
3038	NC_008782	GCG	2	6	103798	103803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592528
3039	NC_008782	ACC	2	6	103859	103864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592528
3040	NC_008782	ACG	2	6	103913	103918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592528
3041	NC_008782	TGCTGG	2	12	103919	103930	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	121592528
3042	NC_008782	CGCC	2	8	103956	103963	0 %	0 %	25 %	75 %	121592528
3043	NC_008782	GCCGC	2	10	104060	104069	0 %	0 %	40 %	60 %	121592528
3044	NC_008782	GGCC	2	8	104121	104128	0 %	0 %	50 %	50 %	121592528
3045	NC_008782	CTGGAC	2	12	104131	104142	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	121592528
3046	NC_008782	GGC	2	6	104200	104205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592528
3047	NC_008782	TGCC	2	8	104253	104260	0 %	25 %	25 %	50 %	121592528
3048	NC_008782	TGG	2	6	104285	104290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592528
3049	NC_008782	GGC	2	6	104296	104301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592528
3050	NC_008782	CG	3	6	104316	104321	0 %	0 %	50 %	50 %	121592528
3051	NC_008782	CG	3	6	104358	104363	0 %	0 %	50 %	50 %	121592528
3052	NC_008782	CG	3	6	104391	104396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3053	NC_008782	GCC	2	6	104483	104488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_008782	CCT	2	6	104534	104539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121592529
3055	NC_008782	CCG	2	6	104557	104562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592529
3056	NC_008782	CCG	2	6	104570	104575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592529
3057	NC_008782	GCTGC	2	10	104593	104602	0 %	20 %	40 %	40 %	121592529
3058	NC_008782	GCT	2	6	104616	104621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592529
3059	NC_008782	CGG	2	6	104645	104650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592529
3060	NC_008782	CAG	2	6	104660	104665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592529
3061	NC_008782	CCGA	2	8	104674	104681	25 %	0 %	25 %	50 %	121592529
3062	NC_008782	CTG	2	6	104710	104715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592529
3063	NC_008782	CCG	2	6	104716	104721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592529
3064	NC_008782	C	6	6	104728	104733	0 %	0 %	0 %	100 %	121592529
3065	NC_008782	TGGC	2	8	104804	104811	0 %	25 %	50 %	25 %	121592529
3066	NC_008782	CCG	2	6	104867	104872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592529
3067	NC_008782	GC	4	8	104899	104906	0 %	0 %	50 %	50 %	121592529
3068	NC_008782	GCT	2	6	104952	104957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592529
3069	NC_008782	GCA	2	6	104979	104984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592529
3070	NC_008782	GGC	2	6	104998	105003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592529
3071	NC_008782	GCG	2	6	105004	105009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592529
3072	NC_008782	GGC	2	6	105021	105026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592529
3073	NC_008782	CCG	2	6	105038	105043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592529
3074	NC_008782	CGG	2	6	105053	105058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592529
3075	NC_008782	CGG	2	6	105060	105065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592529
3076	NC_008782	GC	3	6	105091	105096	0 %	0 %	50 %	50 %	121592529
3077	NC_008782	GC	3	6	105130	105135	0 %	0 %	50 %	50 %	121592529
3078	NC_008782	TCACGC	2	12	105140	105151	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	121592529
3079	NC_008782	GCCT	2	8	105155	105162	0 %	25 %	25 %	50 %	121592529
3080	NC_008782	TGC	2	6	105269	105274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592529
3081	NC_008782	GCC	2	6	105346	105351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592529
3082	NC_008782	GTG	2	6	105352	105357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592529
3083	NC_008782	GC	3	6	105379	105384	0 %	0 %	50 %	50 %	121592529
3084	NC_008782	CTGG	2	8	105393	105400	0 %	25 %	50 %	25 %	121592529
3085	NC_008782	C	6	6	105463	105468	0 %	0 %	0 %	100 %	121592529
3086	NC_008782	GC	3	6	105473	105478	0 %	0 %	50 %	50 %	121592529
3087	NC_008782	GC	3	6	105733	105738	0 %	0 %	50 %	50 %	121592530
3088	NC_008782	GC	3	6	105764	105769	0 %	0 %	50 %	50 %	121592530
3089	NC_008782	GC	3	6	105791	105796	0 %	0 %	50 %	50 %	121592530
3090	NC_008782	GCA	2	6	105801	105806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592530
3091	NC_008782	TGC	2	6	105861	105866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592530
3092	NC_008782	GGCC	2	8	105874	105881	0 %	0 %	50 %	50 %	121592530
3093	NC_008782	GCC	2	6	105945	105950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592530
3094	NC_008782	CGA	2	6	105982	105987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592530
3095	NC_008782	GGC	2	6	105988	105993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592530
3096	NC_008782	CTG	3	9	105998	106006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592530
3097	NC_008782	GCG	2	6	106064	106069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592530
3098	NC_008782	GGC	2	6	106070	106075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592530
3099	NC_008782	TAC	2	6	106094	106099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592530
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3101	NC_008782	GAG	2	6	106127	106132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121592530
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3103	NC_008782	GCC	2	6	106157	106162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592530
3104	NC_008782	GCT	2	6	106213	106218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592530
3105	NC_008782	GATC	2	8	106242	106249	25 %	25 %	25 %	25 %	121592530
3106	NC_008782	GAAC	2	8	106267	106274	50 %	0 %	25 %	25 %	121592530
3107	NC_008782	GC	3	6	106324	106329	0 %	0 %	50 %	50 %	121592530
3108	NC_008782	GC	3	6	106346	106351	0 %	0 %	50 %	50 %	121592530
3109	NC_008782	GCG	2	6	106365	106370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592530
3110	NC_008782	TGC	2	6	106371	106376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592530
3111	NC_008782	CGG	2	6	106378	106383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592530
3112	NC_008782	CAG	2	6	106445	106450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592530
3113	NC_008782	GAG	2	6	106502	106507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121592530
3114	NC_008782	CGC	2	6	106510	106515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592530
3115	NC_008782	CGG	2	6	106516	106521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592530
3116	NC_008782	CCA	2	6	106539	106544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592530
3117	NC_008782	GCG	2	6	106550	106555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592530
3118	NC_008782	TGC	2	6	106572	106577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592530
3119	NC_008782	TAC	2	6	106580	106585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592530
3120	NC_008782	GGTG	2	8	106711	106718	0 %	25 %	75 %	0 %	121592530
3121	NC_008782	GCG	2	6	106736	106741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592530
3122	NC_008782	GGC	2	6	106760	106765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592530
3123	NC_008782	CGC	2	6	106786	106791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592530
3124	NC_008782	CAC	2	6	106808	106813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121592530
3125	NC_008782	GGGC	2	8	106837	106844	0 %	0 %	75 %	25 %	121592530
3126	NC_008782	CGC	2	6	106900	106905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592530
3127	NC_008782	GC	3	6	106904	106909	0 %	0 %	50 %	50 %	121592530
3128	NC_008782	TCA	2	6	106956	106961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592530
3129	NC_008782	ATG	2	6	106988	106993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121592530
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3131	NC_008782	GCCC	2	8	107145	107152	0 %	0 %	25 %	75 %	121592531
3132	NC_008782	GC	3	6	107220	107225	0 %	0 %	50 %	50 %	121592531
3133	NC_008782	TGC	2	6	107231	107236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592531
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3139	NC_008782	TGC	2	6	107462	107467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592531
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3144	NC_008782	GCGGG	2	10	107571	107580	0 %	0 %	80 %	20 %	121592531
3145	NC_008782	GCT	2	6	107604	107609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592531
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3167	NC_008782	CAC	2	6	108346	108351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3169	NC_008782	GCCGTC	2	12	108435	108446	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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3196	NC_008782	GC	4	8	109459	109466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3197	NC_008782	CTG	2	6	109516	109521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592533
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3229	NC_008782	GCG	2	6	110681	110686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592533
3230	NC_008782	AAG	2	6	110734	110739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121592533
3231	NC_008782	ATC	2	6	110746	110751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121592533
3232	NC_008782	GGC	2	6	110755	110760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592533
3233	NC_008782	GCTGT	2	10	110788	110797	0 %	40 %	40 %	20 %	121592533
3234	NC_008782	TGG	2	6	110876	110881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592533
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3236	NC_008782	CAC	2	6	111073	111078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3237	NC_008782	GCGCC	2	10	111117	111126	0 %	0 %	40 %	60 %	121592534
3238	NC_008782	CTG	2	6	111160	111165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592534
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3241	NC_008782	CTG	2	6	111250	111255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592534
3242	NC_008782	GCA	3	9	111279	111287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121592534
3243	NC_008782	GTG	2	6	111301	111306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592534
3244	NC_008782	GCGG	2	8	111325	111332	0 %	0 %	75 %	25 %	121592534
3245	NC_008782	TGG	2	6	111473	111478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592534
3246	NC_008782	TGG	3	9	111491	111499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592534
3247	NC_008782	CTGC	2	8	111514	111521	0 %	25 %	25 %	50 %	121592534
3248	NC_008782	A	6	6	111522	111527	100 %	0 %	0 %	0 %	121592534
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3251	NC_008782	CGGC	2	8	111584	111591	0 %	0 %	50 %	50 %	121592534
3252	NC_008782	CGG	2	6	111614	111619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592534
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3259	NC_008782	CAGC	2	8	112141	112148	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3260	NC_008782	GCG	3	9	112149	112157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3262	NC_008782	GCC	2	6	112191	112196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3277	NC_008782	GCT	2	6	112739	112744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121592536
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3492	NC_008782	CGGG	2	8	120482	120489	0 %	0 %	75 %	25 %	121592542
3493	NC_008782	GCC	2	6	120512	120517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592542
3494	NC_008782	CGC	2	6	120533	120538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592542
3495	NC_008782	GCC	2	6	120600	120605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592542
3496	NC_008782	GGC	2	6	120647	120652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592542
3497	NC_008782	TGG	2	6	120659	120664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121592542
3498	NC_008782	GC	3	6	120743	120748	0 %	0 %	50 %	50 %	121592542
3499	NC_008782	CGC	2	6	120800	120805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121592542
3500	NC_008782	GGC	2	6	120827	120832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121592542

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