MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidovorax sp. JS42 chromosome

Total Repeats: 3866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008782	TCGCC	2	10	552976	552985	0 %	20 %	20 %	60 %	121592959
502	NC_008782	ATTGA	2	10	553504	553513	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
503	NC_008782	GCGCC	2	10	554881	554890	0 %	0 %	40 %	60 %	121592961
504	NC_008782	CGCGG	2	10	555583	555592	0 %	0 %	60 %	40 %	121592962
505	NC_008782	GGTGC	2	10	556086	556095	0 %	20 %	60 %	20 %	121592963
506	NC_008782	CGCAG	2	10	556516	556525	20 %	0 %	40 %	40 %	121592964
507	NC_008782	CGGTG	2	10	557047	557056	0 %	20 %	60 %	20 %	121592964
508	NC_008782	TGCGC	2	10	558264	558273	0 %	20 %	40 %	40 %	121592966
509	NC_008782	GCAGC	2	10	559780	559789	20 %	0 %	40 %	40 %	121592968
510	NC_008782	CAGCC	2	10	560866	560875	20 %	0 %	20 %	60 %	121592969
511	NC_008782	CAGGG	2	10	561079	561088	20 %	0 %	60 %	20 %	121592969
512	NC_008782	CGGAG	2	10	562277	562286	20 %	0 %	60 %	20 %	121592971
513	NC_008782	TGCAT	2	10	562324	562333	20 %	40 %	20 %	20 %	121592971
514	NC_008782	TGCGC	2	10	563831	563840	0 %	20 %	40 %	40 %	121592972
515	NC_008782	GCTGG	2	10	563993	564002	0 %	20 %	60 %	20 %	121592972
516	NC_008782	GCTGG	2	10	564056	564065	0 %	20 %	60 %	20 %	121592972
517	NC_008782	GCTGG	2	10	564119	564128	0 %	20 %	60 %	20 %	121592972
518	NC_008782	GCGCC	2	10	564323	564332	0 %	0 %	40 %	60 %	121592972
519	NC_008782	CCACG	2	10	564659	564668	20 %	0 %	20 %	60 %	121592972
520	NC_008782	GCAGG	2	10	564821	564830	20 %	0 %	60 %	20 %	121592972
521	NC_008782	GCCCA	2	10	567781	567790	20 %	0 %	20 %	60 %	121592974
522	NC_008782	GTCGT	2	10	569249	569258	0 %	40 %	40 %	20 %	121592975
523	NC_008782	TGGCC	2	10	570004	570013	0 %	20 %	40 %	40 %	121592975
524	NC_008782	GGCAT	2	10	571411	571420	20 %	20 %	40 %	20 %	121592977
525	NC_008782	TTCAC	2	10	573789	573798	20 %	40 %	0 %	40 %	121592978
526	NC_008782	AGCGC	2	10	573867	573876	20 %	0 %	40 %	40 %	121592978
527	NC_008782	GCAAG	2	10	574241	574250	40 %	0 %	40 %	20 %	121592979
528	NC_008782	GCCAG	2	10	575199	575208	20 %	0 %	40 %	40 %	121592980
529	NC_008782	GCCCA	2	10	575717	575726	20 %	0 %	20 %	60 %	121592981
530	NC_008782	ATGCC	2	10	576522	576531	20 %	20 %	20 %	40 %	121592981
531	NC_008782	CCATG	2	10	576994	577003	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
532	NC_008782	CGCAG	2	10	577834	577843	20 %	0 %	40 %	40 %	121592982
533	NC_008782	GGGCT	2	10	578264	578273	0 %	20 %	60 %	20 %	121592982
534	NC_008782	AGCTG	2	10	578817	578826	20 %	20 %	40 %	20 %	121592982
535	NC_008782	GGGCT	2	10	578969	578978	0 %	20 %	60 %	20 %	121592982
536	NC_008782	GCGCG	2	10	581465	581474	0 %	0 %	60 %	40 %	121592984
537	NC_008782	CCCGC	2	10	582608	582617	0 %	0 %	20 %	80 %	121592985
538	NC_008782	GCTGG	2	10	584327	584336	0 %	20 %	60 %	20 %	121592987
539	NC_008782	CTGAG	2	10	585099	585108	20 %	20 %	40 %	20 %	121592987
540	NC_008782	GCCGC	2	10	586359	586368	0 %	0 %	40 %	60 %	121592988
541	NC_008782	AACCT	2	10	586719	586728	40 %	20 %	0 %	40 %	121592988
542	NC_008782	GGGCA	2	10	588608	588617	20 %	0 %	60 %	20 %	121592988
543	NC_008782	ACGAT	2	10	590008	590017	40 %	20 %	20 %	20 %	121592988
544	NC_008782	CCTGG	2	10	591023	591032	0 %	20 %	40 %	40 %	121592988
545	NC_008782	CCGCA	2	10	593305	593314	20 %	0 %	20 %	60 %	121592991
546	NC_008782	CCAGA	2	10	594671	594680	40 %	0 %	20 %	40 %	121592992
547	NC_008782	GCCTG	2	10	595500	595509	0 %	20 %	40 %	40 %	121592994
548	NC_008782	GACAT	2	10	596166	596175	40 %	20 %	20 %	20 %	121592995
549	NC_008782	ACCCC	2	10	596487	596496	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
550	NC_008782	GGCCA	2	10	600758	600767	20 %	0 %	40 %	40 %	121593002
551	NC_008782	CACGG	2	10	601600	601609	20 %	0 %	40 %	40 %	121593002
552	NC_008782	TGGCA	2	10	603349	603358	20 %	20 %	40 %	20 %	121593003
553	NC_008782	CCACT	2	10	605925	605934	20 %	20 %	0 %	60 %	121593004
554	NC_008782	GCAGG	2	10	607079	607088	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
555	NC_008782	TGCGG	2	10	607381	607390	0 %	20 %	60 %	20 %	121593005
556	NC_008782	CGCGG	2	10	608031	608040	0 %	0 %	60 %	40 %	121593005
557	NC_008782	CGCGG	2	10	608089	608098	0 %	0 %	60 %	40 %	121593005
558	NC_008782	GCCGC	2	10	608840	608849	0 %	0 %	40 %	60 %	121593005
559	NC_008782	GGCCC	2	10	608936	608945	0 %	0 %	40 %	60 %	121593006
560	NC_008782	GGCCG	2	10	608954	608963	0 %	0 %	60 %	40 %	121593006
561	NC_008782	GGCCG	2	10	610216	610225	0 %	0 %	60 %	40 %	121593007
562	NC_008782	TGCGT	2	10	610517	610526	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
563	NC_008782	GAGGG	2	10	610644	610653	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
564	NC_008782	AACCC	2	10	611377	611386	40 %	0 %	0 %	60 %	121593008
565	NC_008782	GCTGG	2	10	611838	611847	0 %	20 %	60 %	20 %	121593009
566	NC_008782	GCCTG	2	10	612143	612152	0 %	20 %	40 %	40 %	121593009
567	NC_008782	CGCGC	2	10	612351	612360	0 %	0 %	40 %	60 %	121593009
568	NC_008782	GGCCG	2	10	615026	615035	0 %	0 %	60 %	40 %	121593011
569	NC_008782	CGGGC	2	10	615121	615130	0 %	0 %	60 %	40 %	121593011
570	NC_008782	GCCTG	2	10	615356	615365	0 %	20 %	40 %	40 %	121593011
571	NC_008782	CTGGC	2	10	616383	616392	0 %	20 %	40 %	40 %	121593012
572	NC_008782	CGCAG	2	10	616963	616972	20 %	0 %	40 %	40 %	121593012
573	NC_008782	CCGGC	2	10	617052	617061	0 %	0 %	40 %	60 %	121593012
574	NC_008782	GCCAG	2	10	617629	617638	20 %	0 %	40 %	40 %	121593012
575	NC_008782	GGCGC	2	10	617865	617874	0 %	0 %	60 %	40 %	121593013
576	NC_008782	GTGCA	2	10	618247	618256	20 %	20 %	40 %	20 %	121593013
577	NC_008782	TCTGG	2	10	619480	619489	0 %	40 %	40 %	20 %	121593014
578	NC_008782	ACTTC	2	10	624496	624505	20 %	40 %	0 %	40 %	121593019
579	NC_008782	AAGCA	2	10	626162	626171	60 %	0 %	20 %	20 %	121593020
580	NC_008782	CGCAC	2	10	626599	626608	20 %	0 %	20 %	60 %	121593021
581	NC_008782	GCCGC	2	10	627607	627616	0 %	0 %	40 %	60 %	121593021
582	NC_008782	TGCGC	2	10	627718	627727	0 %	20 %	40 %	40 %	121593021
583	NC_008782	TGCGC	2	10	629794	629803	0 %	20 %	40 %	40 %	121593022
584	NC_008782	CGGCC	2	10	630028	630037	0 %	0 %	40 %	60 %	121593023
585	NC_008782	CCGCC	2	10	632527	632536	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
586	NC_008782	GAAGA	2	10	632772	632781	60 %	0 %	40 %	0 %	121593026
587	NC_008782	GATCC	2	10	633362	633371	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
588	NC_008782	GGCGC	2	10	634778	634787	0 %	0 %	60 %	40 %	121593029
589	NC_008782	GCGCC	2	10	635749	635758	0 %	0 %	40 %	60 %	121593029
590	NC_008782	CAGCC	2	10	635892	635901	20 %	0 %	20 %	60 %	121593029
591	NC_008782	TTTGA	2	10	636687	636696	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
592	NC_008782	TTGCA	2	10	642965	642974	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
593	NC_008782	GCGCT	2	10	645311	645320	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
594	NC_008782	CCGCG	2	10	646008	646017	0 %	0 %	40 %	60 %	121593040
595	NC_008782	CGCCC	2	10	647139	647148	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
596	NC_008782	CACCG	2	10	648513	648522	20 %	0 %	20 %	60 %	121593043
597	NC_008782	CGGGC	2	10	649565	649574	0 %	0 %	60 %	40 %	121593044
598	NC_008782	CGTGG	2	10	650237	650246	0 %	20 %	60 %	20 %	121593044
599	NC_008782	CGGCG	2	10	650493	650502	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
600	NC_008782	TGCGG	2	10	650619	650628	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
601	NC_008782	GCCTG	2	10	650780	650789	0 %	20 %	40 %	40 %	121593045
602	NC_008782	TGCGC	2	10	653513	653522	0 %	20 %	40 %	40 %	121593047
603	NC_008782	CGCAC	2	10	655140	655149	20 %	0 %	20 %	60 %	121593049
604	NC_008782	GGCCG	2	10	655665	655674	0 %	0 %	60 %	40 %	121593050
605	NC_008782	CAAGC	2	10	658956	658965	40 %	0 %	20 %	40 %	121593052
606	NC_008782	TCCGC	2	10	659689	659698	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
607	NC_008782	CGCTG	2	10	659729	659738	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
608	NC_008782	GGTGC	2	10	660597	660606	0 %	20 %	60 %	20 %	121593054
609	NC_008782	AACGG	2	10	660627	660636	40 %	0 %	40 %	20 %	121593054
610	NC_008782	GCCGC	2	10	660762	660771	0 %	0 %	40 %	60 %	121593054
611	NC_008782	GGCCG	2	10	661856	661865	0 %	0 %	60 %	40 %	121593056
612	NC_008782	GGCTG	2	10	662553	662562	0 %	20 %	60 %	20 %	121593057
613	NC_008782	CGAGG	2	10	666180	666189	20 %	0 %	60 %	20 %	121593060
614	NC_008782	CGCGG	2	10	666876	666885	0 %	0 %	60 %	40 %	121593060
615	NC_008782	CCGGA	2	10	667284	667293	20 %	0 %	40 %	40 %	121593061
616	NC_008782	GCGCG	2	10	667314	667323	0 %	0 %	60 %	40 %	121593061
617	NC_008782	GGCCT	2	10	667367	667376	0 %	20 %	40 %	40 %	121593061
618	NC_008782	GCGCT	2	10	669519	669528	0 %	20 %	40 %	40 %	121593063
619	NC_008782	TGGCG	2	10	673387	673396	0 %	20 %	60 %	20 %	121593067
620	NC_008782	CCTTG	2	10	677977	677986	0 %	40 %	20 %	40 %	121593071
621	NC_008782	TGGTC	2	10	678665	678674	0 %	40 %	40 %	20 %	121593072
622	NC_008782	GGCCA	2	10	678940	678949	20 %	0 %	40 %	40 %	121593072
623	NC_008782	AGCAC	2	10	684741	684750	40 %	0 %	20 %	40 %	121593076
624	NC_008782	CAGCG	2	10	685534	685543	20 %	0 %	40 %	40 %	121593077
625	NC_008782	GCAGC	2	10	686001	686010	20 %	0 %	40 %	40 %	121593078
626	NC_008782	GCGCC	2	10	686826	686835	0 %	0 %	40 %	60 %	121593078
627	NC_008782	GGGGC	2	10	687535	687544	0 %	0 %	80 %	20 %	121593078
628	NC_008782	CAGCG	2	10	688359	688368	20 %	0 %	40 %	40 %	121593080
629	NC_008782	GCGCG	2	10	689023	689032	0 %	0 %	60 %	40 %	121593081
630	NC_008782	GCTGC	2	10	689194	689203	0 %	20 %	40 %	40 %	121593081
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632	NC_008782	CGCGG	2	10	690453	690462	0 %	0 %	60 %	40 %	121593081
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