MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Acidovorax sp. JS42 plasmid pAOVO01

Total Repeats: 199

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008765	ACTC	2	8	62	69	25 %	25 %	0 %	50 %	121582467
2	NC_008765	GTTG	2	8	1237	1244	0 %	50 %	50 %	0 %	121582469
3	NC_008765	TGCC	2	8	1319	1326	0 %	25 %	25 %	50 %	121582469
4	NC_008765	TCTG	2	8	1866	1873	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008765	TCAC	2	8	2647	2654	25 %	25 %	0 %	50 %	121582471
6	NC_008765	TTGG	2	8	2691	2698	0 %	50 %	50 %	0 %	121582471
7	NC_008765	CACG	2	8	2846	2853	25 %	0 %	25 %	50 %	121582471
8	NC_008765	GATT	2	8	2914	2921	25 %	50 %	25 %	0 %	121582471
9	NC_008765	GTGC	2	8	2974	2981	0 %	25 %	50 %	25 %	121582471
10	NC_008765	ACCC	2	8	3374	3381	25 %	0 %	0 %	75 %	121582471
11	NC_008765	CGGC	2	8	3535	3542	0 %	0 %	50 %	50 %	121582471
12	NC_008765	CCGA	2	8	3645	3652	25 %	0 %	25 %	50 %	121582471
13	NC_008765	TTGC	2	8	3766	3773	0 %	50 %	25 %	25 %	121582471
14	NC_008765	GCGA	2	8	5208	5215	25 %	0 %	50 %	25 %	121582472
15	NC_008765	TCGG	2	8	5697	5704	0 %	25 %	50 %	25 %	121582472
16	NC_008765	CACC	2	8	5779	5786	25 %	0 %	0 %	75 %	121582472
17	NC_008765	GTAG	2	8	6533	6540	25 %	25 %	50 %	0 %	121582472
18	NC_008765	GCCA	2	8	9388	9395	25 %	0 %	25 %	50 %	121582476
19	NC_008765	GGTC	2	8	9946	9953	0 %	25 %	50 %	25 %	121582476
20	NC_008765	GCCC	2	8	10079	10086	0 %	0 %	25 %	75 %	121582476
21	NC_008765	CGGC	2	8	10240	10247	0 %	0 %	50 %	50 %	121582476
22	NC_008765	AGGG	2	8	10441	10448	25 %	0 %	75 %	0 %	121582477
23	NC_008765	CGGC	2	8	10683	10690	0 %	0 %	50 %	50 %	121582477
24	NC_008765	CATC	2	8	10719	10726	25 %	25 %	0 %	50 %	121582477
25	NC_008765	AGCC	2	8	11486	11493	25 %	0 %	25 %	50 %	121582478
26	NC_008765	GGCA	2	8	12674	12681	25 %	0 %	50 %	25 %	121582479
27	NC_008765	GCCA	2	8	12945	12952	25 %	0 %	25 %	50 %	121582480
28	NC_008765	CGGC	2	8	13567	13574	0 %	0 %	50 %	50 %	121582481
29	NC_008765	CGGC	2	8	13871	13878	0 %	0 %	50 %	50 %	121582482
30	NC_008765	CCCA	2	8	14563	14570	25 %	0 %	0 %	75 %	121582482
31	NC_008765	CGCC	2	8	14747	14754	0 %	0 %	25 %	75 %	121582482
32	NC_008765	GTGC	2	8	15217	15224	0 %	25 %	50 %	25 %	121582482
33	NC_008765	CACG	2	8	15392	15399	25 %	0 %	25 %	50 %	121582482
34	NC_008765	GGAA	2	8	15698	15705	50 %	0 %	50 %	0 %	121582482
35	NC_008765	GGCT	2	8	16138	16145	0 %	25 %	50 %	25 %	121582482
36	NC_008765	GCCG	2	8	16441	16448	0 %	0 %	50 %	50 %	121582483
37	NC_008765	CCGG	2	8	16494	16501	0 %	0 %	50 %	50 %	121582483
38	NC_008765	CAGC	2	8	16537	16544	25 %	0 %	25 %	50 %	121582483
39	NC_008765	TCCC	2	8	16926	16933	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_008765	TGCG	2	8	16935	16942	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_008765	AGCG	2	8	16995	17002	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_008765	CGGC	2	8	17086	17093	0 %	0 %	50 %	50 %	121582484
43	NC_008765	CAGG	2	8	17149	17156	25 %	0 %	50 %	25 %	121582484
44	NC_008765	GCTC	2	8	17281	17288	0 %	25 %	25 %	50 %	121582484
45	NC_008765	CAGC	2	8	17767	17774	25 %	0 %	25 %	50 %	121582484
46	NC_008765	GAGC	2	8	17984	17991	25 %	0 %	50 %	25 %	121582485
47	NC_008765	AGCC	2	8	18473	18480	25 %	0 %	25 %	50 %	121582485
48	NC_008765	TTTG	2	8	19129	19136	0 %	75 %	25 %	0 %	121582485
49	NC_008765	CTCA	2	8	19146	19153	25 %	25 %	0 %	50 %	121582485
50	NC_008765	GTCC	2	8	19183	19190	0 %	25 %	25 %	50 %	121582486
51	NC_008765	CCAT	2	8	19322	19329	25 %	25 %	0 %	50 %	121582486
52	NC_008765	GGTT	2	8	19743	19750	0 %	50 %	50 %	0 %	121582486
53	NC_008765	ATTG	2	8	20390	20397	25 %	50 %	25 %	0 %	121582487
54	NC_008765	CCAA	2	8	20606	20613	50 %	0 %	0 %	50 %	121582488
55	NC_008765	GTTG	2	8	21093	21100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_008765	TGGA	2	8	21279	21286	25 %	25 %	50 %	0 %	121582490
57	NC_008765	TGGC	2	8	21532	21539	0 %	25 %	50 %	25 %	121582490
58	NC_008765	TTCC	2	8	21912	21919	0 %	50 %	0 %	50 %	121582491
59	NC_008765	CACC	2	8	22426	22433	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
60	NC_008765	GGTC	2	8	25374	25381	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_008765	GGTC	2	8	25557	25564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_008765	CTTC	2	8	26298	26305	0 %	50 %	0 %	50 %	121582496
63	NC_008765	CCCG	2	8	26388	26395	0 %	0 %	25 %	75 %	121582496
64	NC_008765	GCTT	2	8	26789	26796	0 %	50 %	25 %	25 %	121582496
65	NC_008765	AGGA	2	8	26981	26988	50 %	0 %	50 %	0 %	121582496
66	NC_008765	TTCC	2	8	27733	27740	0 %	50 %	0 %	50 %	121582496
67	NC_008765	CTTC	2	8	27804	27811	0 %	50 %	0 %	50 %	121582496
68	NC_008765	GCTG	2	8	27879	27886	0 %	25 %	50 %	25 %	121582496
69	NC_008765	TGCG	2	8	28093	28100	0 %	25 %	50 %	25 %	121582496
70	NC_008765	CCGG	2	8	28341	28348	0 %	0 %	50 %	50 %	121582496
71	NC_008765	TGCC	2	8	28555	28562	0 %	25 %	25 %	50 %	121582496
72	NC_008765	GGCT	2	8	29144	29151	0 %	25 %	50 %	25 %	121582498
73	NC_008765	CGGC	2	8	29266	29273	0 %	0 %	50 %	50 %	121582498
74	NC_008765	GCTG	2	8	29701	29708	0 %	25 %	50 %	25 %	121582498
75	NC_008765	GTTG	2	8	30616	30623	0 %	50 %	50 %	0 %	121582498
76	NC_008765	CCCG	2	8	31693	31700	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_008765	CAGG	2	8	31703	31710	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_008765	GCGA	2	8	31873	31880	25 %	0 %	50 %	25 %	121582500
79	NC_008765	GAAG	2	8	32966	32973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_008765	CGGC	2	8	33310	33317	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_008765	GCCG	2	8	33684	33691	0 %	0 %	50 %	50 %	121582502
82	NC_008765	GTGC	2	8	33734	33741	0 %	25 %	50 %	25 %	121582502
83	NC_008765	GAGC	2	8	33964	33971	25 %	0 %	50 %	25 %	121582502
84	NC_008765	TCGG	2	8	34355	34362	0 %	25 %	50 %	25 %	121582503
85	NC_008765	CGCA	2	8	34515	34522	25 %	0 %	25 %	50 %	121582504
86	NC_008765	GCTC	2	8	35052	35059	0 %	25 %	25 %	50 %	121582505
87	NC_008765	GGTA	2	8	35073	35080	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_008765	GAAC	2	8	35854	35861	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_008765	GGAG	2	8	36121	36128	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008765	CCAG	3	12	36152	36163	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
91	NC_008765	AAGG	2	8	36176	36183	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_008765	CAGC	2	8	36226	36233	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_008765	CGGG	2	8	37227	37234	0 %	0 %	75 %	25 %	121582509
94	NC_008765	GCCG	2	8	37252	37259	0 %	0 %	50 %	50 %	121582509
95	NC_008765	GCGT	2	8	37515	37522	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
96	NC_008765	GCGG	2	8	37631	37638	0 %	0 %	75 %	25 %	121582510
97	NC_008765	TCGG	2	8	38440	38447	0 %	25 %	50 %	25 %	121582510
98	NC_008765	CCTT	2	8	38824	38831	0 %	50 %	0 %	50 %	121582510
99	NC_008765	CAGC	2	8	38844	38851	25 %	0 %	25 %	50 %	121582510
100	NC_008765	CTTG	2	8	38945	38952	0 %	50 %	25 %	25 %	121582510
101	NC_008765	GACG	2	8	39002	39009	25 %	0 %	50 %	25 %	121582510
102	NC_008765	GCCG	2	8	39402	39409	0 %	0 %	50 %	50 %	121582510
103	NC_008765	GGCC	2	8	39845	39852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_008765	CCGG	2	8	40008	40015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_008765	GCCC	2	8	40575	40582	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_008765	GGCG	2	8	40588	40595	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_008765	CGGC	2	8	40923	40930	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_008765	CGGT	2	8	41299	41306	0 %	25 %	50 %	25 %	121582513
109	NC_008765	TGCC	2	8	41588	41595	0 %	25 %	25 %	50 %	121582513
110	NC_008765	GGGA	2	8	41645	41652	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_008765	TTCG	2	8	42219	42226	0 %	50 %	25 %	25 %	121582514
112	NC_008765	CCGC	2	8	42695	42702	0 %	0 %	25 %	75 %	121582515
113	NC_008765	TCGG	2	8	42770	42777	0 %	25 %	50 %	25 %	121582515
114	NC_008765	GGCC	2	8	43349	43356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_008765	CCGG	2	8	43512	43519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_008765	AGCC	2	8	43965	43972	25 %	0 %	25 %	50 %	121582516
117	NC_008765	AGTC	2	8	44078	44085	25 %	25 %	25 %	25 %	121582516
118	NC_008765	CGGA	2	8	44156	44163	25 %	0 %	50 %	25 %	121582516
119	NC_008765	GCCA	2	8	44189	44196	25 %	0 %	25 %	50 %	121582516
120	NC_008765	GCCG	2	8	44841	44848	0 %	0 %	50 %	50 %	121582517
121	NC_008765	AGGA	2	8	44964	44971	50 %	0 %	50 %	0 %	121582517
122	NC_008765	TGGT	2	8	45799	45806	0 %	50 %	50 %	0 %	121582518
123	NC_008765	CAGC	2	8	45821	45828	25 %	0 %	25 %	50 %	121582518
124	NC_008765	GCCA	2	8	46533	46540	25 %	0 %	25 %	50 %	121582520
125	NC_008765	CAGC	2	8	46711	46718	25 %	0 %	25 %	50 %	121582520
126	NC_008765	GCCA	2	8	46721	46728	25 %	0 %	25 %	50 %	121582520
127	NC_008765	CGGC	2	8	47201	47208	0 %	0 %	50 %	50 %	121582521
128	NC_008765	TTGA	2	8	47388	47395	25 %	50 %	25 %	0 %	121582521
129	NC_008765	TCGC	2	8	47430	47437	0 %	25 %	25 %	50 %	121582521
130	NC_008765	CCCG	2	8	47482	47489	0 %	0 %	25 %	75 %	121582521
131	NC_008765	GCGT	2	8	47536	47543	0 %	25 %	50 %	25 %	121582521
132	NC_008765	GCCG	2	8	47552	47559	0 %	0 %	50 %	50 %	121582521
133	NC_008765	GGTC	2	8	48373	48380	0 %	25 %	50 %	25 %	121582522
134	NC_008765	TCGT	2	8	48720	48727	0 %	50 %	25 %	25 %	121582522
135	NC_008765	CGGC	2	8	48990	48997	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_008765	GGAC	2	8	49090	49097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_008765	CGGC	2	8	49194	49201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_008765	CGGC	2	8	49561	49568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008765	GCCG	2	8	49818	49825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_008765	GGAC	2	8	49916	49923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_008765	TCCC	2	8	50289	50296	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_008765	GCCA	2	8	50387	50394	25 %	0 %	25 %	50 %	121582523
143	NC_008765	CGTT	2	8	50850	50857	0 %	50 %	25 %	25 %	121582523
144	NC_008765	GCCG	2	8	51238	51245	0 %	0 %	50 %	50 %	121582523
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.