MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Acidovorax sp. JS42 plasmid pAOVO01

Total Repeats: 1131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008765	CAA	2	6	6	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008765	GGC	2	6	440	445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582468
3	NC_008765	ACC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582468
4	NC_008765	GGC	2	6	551	556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582468
5	NC_008765	GGT	2	6	566	571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582468
6	NC_008765	AGG	2	6	579	584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121582468
7	NC_008765	GCT	2	6	587	592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582468
8	NC_008765	AGC	2	6	601	606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582468
9	NC_008765	GCA	2	6	739	744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582468
10	NC_008765	CTT	2	6	760	765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582468
11	NC_008765	GGC	2	6	793	798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582468
12	NC_008765	GCC	2	6	992	997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582468
13	NC_008765	ATG	2	6	1008	1013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582468
14	NC_008765	GTC	2	6	1069	1074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_008765	CAG	2	6	1256	1261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582469
16	NC_008765	TCA	2	6	1347	1352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582469
17	NC_008765	GCC	2	6	1384	1389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582469
18	NC_008765	GCT	2	6	1392	1397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582469
19	NC_008765	GCT	2	6	1564	1569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582470
20	NC_008765	GCA	2	6	1579	1584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582470
21	NC_008765	GCC	2	6	1618	1623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582470
22	NC_008765	GTG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582470
23	NC_008765	GAC	2	6	1750	1755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582470
24	NC_008765	CCT	2	6	1766	1771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121582470
25	NC_008765	GGC	2	6	1917	1922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_008765	TGG	2	6	1953	1958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008765	TGT	2	6	2051	2056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008765	TCA	2	6	2057	2062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_008765	GTT	2	6	2139	2144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582471
30	NC_008765	GGC	2	6	2157	2162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582471
31	NC_008765	TGT	2	6	2177	2182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582471
32	NC_008765	CGC	2	6	2213	2218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
33	NC_008765	TGT	2	6	2270	2275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582471
34	NC_008765	TGC	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
35	NC_008765	TTC	2	6	2389	2394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582471
36	NC_008765	CCG	2	6	2476	2481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
37	NC_008765	CTT	3	9	2499	2507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582471
38	NC_008765	CTG	2	6	2607	2612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
39	NC_008765	TGG	3	9	2618	2626	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582471
40	NC_008765	CTG	2	6	2628	2633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
41	NC_008765	ACG	2	6	2829	2834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582471
42	NC_008765	GGC	2	6	2880	2885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582471
43	NC_008765	CAC	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582471
44	NC_008765	CGG	2	6	3032	3037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582471
45	NC_008765	TGA	2	6	3074	3079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582471
46	NC_008765	GCC	2	6	3108	3113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
47	NC_008765	TTC	2	6	3121	3126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582471
48	NC_008765	CGC	2	6	3155	3160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
49	NC_008765	CCG	3	9	3238	3246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
50	NC_008765	GCC	2	6	3301	3306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
51	NC_008765	CCA	2	6	3367	3372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582471
52	NC_008765	GCC	2	6	3394	3399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
53	NC_008765	GCT	2	6	3590	3595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
54	NC_008765	CGC	2	6	3662	3667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
55	NC_008765	CCG	2	6	3779	3784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
56	NC_008765	TCA	2	6	3806	3811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582471
57	NC_008765	TGA	2	6	3851	3856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582471
58	NC_008765	GCC	2	6	3901	3906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
59	NC_008765	GCC	2	6	3961	3966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
60	NC_008765	GGT	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582471
61	NC_008765	TGA	2	6	4016	4021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582471
62	NC_008765	CAT	2	6	4062	4067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582471
63	NC_008765	TCT	2	6	4082	4087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582471
64	NC_008765	CAC	2	6	4119	4124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582471
65	NC_008765	AAC	2	6	4125	4130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	121582471
66	NC_008765	GAT	2	6	4146	4151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582471
67	NC_008765	CAG	2	6	4194	4199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582471
68	NC_008765	CAG	2	6	4290	4295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582471
69	NC_008765	CCT	2	6	4316	4321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121582471
70	NC_008765	TGT	2	6	4328	4333	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582471
71	NC_008765	GTT	2	6	4374	4379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582471
72	NC_008765	CGT	2	6	4496	4501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
73	NC_008765	GGT	2	6	4545	4550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582471
74	NC_008765	GTT	2	6	4599	4604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582471
75	NC_008765	GCC	2	6	4629	4634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582471
76	NC_008765	CTG	2	6	4641	4646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
77	NC_008765	CGT	2	6	4670	4675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
78	NC_008765	TGA	2	6	4691	4696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582471
79	NC_008765	TCG	2	6	4733	4738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
80	NC_008765	GTC	2	6	4861	4866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
81	NC_008765	GCT	2	6	5015	5020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582471
82	NC_008765	CAT	2	6	5100	5105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582471
83	NC_008765	GTA	2	6	5127	5132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582471
84	NC_008765	CCT	2	6	5269	5274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121582472
85	NC_008765	TGT	2	6	5281	5286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582472
86	NC_008765	TCC	2	6	5346	5351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121582472
87	NC_008765	CGG	2	6	5377	5382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582472
88	NC_008765	GGC	2	6	5471	5476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582472
89	NC_008765	GTT	2	6	5522	5527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	121582472
90	NC_008765	GTC	2	6	5535	5540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582472
91	NC_008765	TGG	2	6	5590	5595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582472
92	NC_008765	GTC	2	6	5603	5608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582472
93	NC_008765	TCT	2	6	5650	5655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582472
94	NC_008765	TGG	2	6	5680	5685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582472
95	NC_008765	AGC	2	6	5710	5715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582472
96	NC_008765	TGG	2	6	5725	5730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582472
97	NC_008765	GGT	2	6	5768	5773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582472
98	NC_008765	GCA	2	6	5812	5817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582472
99	NC_008765	TGC	2	6	5860	5865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582472
100	NC_008765	ATC	2	6	5868	5873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582472
101	NC_008765	TCG	2	6	5895	5900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582472
102	NC_008765	CTT	2	6	5915	5920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582472
103	NC_008765	GCC	2	6	5982	5987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582472
104	NC_008765	TCA	2	6	6022	6027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582472
105	NC_008765	GCC	2	6	6147	6152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582472
106	NC_008765	GCA	2	6	6289	6294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582472
107	NC_008765	TGA	2	6	6316	6321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582472
108	NC_008765	GCC	2	6	6329	6334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582472
109	NC_008765	GCC	2	6	6350	6355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582472
110	NC_008765	CGG	2	6	6374	6379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582472
111	NC_008765	GCA	2	6	6463	6468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582472
112	NC_008765	GGT	2	6	6542	6547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	121582472
113	NC_008765	CAT	2	6	6669	6674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582473
114	NC_008765	GCA	2	6	6821	6826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582473
115	NC_008765	GAA	3	9	6900	6908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582473
116	NC_008765	TCG	2	6	6970	6975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582473
117	NC_008765	CGC	2	6	7048	7053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582473
118	NC_008765	TCA	2	6	7136	7141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582473
119	NC_008765	CGG	2	6	7184	7189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582473
120	NC_008765	CTG	2	6	7242	7247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582473
121	NC_008765	CAG	2	6	7380	7385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582473
122	NC_008765	CAG	2	6	7389	7394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582473
123	NC_008765	AGT	2	6	7455	7460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582474
124	NC_008765	CTT	2	6	7513	7518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582474
125	NC_008765	TGA	2	6	7566	7571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582474
126	NC_008765	CAG	2	6	7585	7590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582474
127	NC_008765	CGC	2	6	7647	7652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582474
128	NC_008765	CGT	2	6	7686	7691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582474
129	NC_008765	CAG	2	6	7750	7755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582474
130	NC_008765	GTA	2	6	7788	7793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582475
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256	NC_008765	CAT	2	6	14829	14834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582482
257	NC_008765	TGA	2	6	14909	14914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	121582482
258	NC_008765	GTC	2	6	14931	14936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582482
259	NC_008765	GCA	2	6	14990	14995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582482
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264	NC_008765	GCA	2	6	15137	15142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582482
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274	NC_008765	TTC	2	6	15739	15744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582482
275	NC_008765	GAA	2	6	15825	15830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	121582482
276	NC_008765	CAC	2	6	15919	15924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	121582482
277	NC_008765	GCG	2	6	15938	15943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582482
278	NC_008765	GGC	2	6	15968	15973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582482
279	NC_008765	GTC	3	9	15981	15989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582482
280	NC_008765	GGC	2	6	16119	16124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	121582482
281	NC_008765	GCA	2	6	16195	16200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582482
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283	NC_008765	GCC	2	6	16251	16256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
284	NC_008765	CAG	2	6	16315	16320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	121582483
285	NC_008765	GCT	2	6	16398	16403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582483
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287	NC_008765	TCA	2	6	16677	16682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	121582483
288	NC_008765	TGC	2	6	16686	16691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582483
289	NC_008765	CGC	2	6	16725	16730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	121582483
290	NC_008765	TTC	2	6	16757	16762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582483
291	NC_008765	TGC	3	9	16857	16865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	121582483
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293	NC_008765	GCA	2	6	16971	16976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
294	NC_008765	CCT	2	6	17074	17079	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	121582484
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299	NC_008765	CTT	2	6	17261	17266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	121582484
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353	NC_008765	AGG	2	6	20498	20503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	121582488
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