MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 chromosome

Total Repeats: 115736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008570	CGA	2	6	145895	145900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3502	NC_008570	CGC	2	6	145926	145931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619147
3503	NC_008570	CTGA	2	8	145932	145939	25 %	25 %	25 %	25 %	117619147
3504	NC_008570	GTG	2	6	145963	145968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117619147
3505	NC_008570	TGG	2	6	145973	145978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117619147
3506	NC_008570	TGC	2	6	145999	146004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3507	NC_008570	GCT	2	6	146018	146023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3508	NC_008570	GGC	2	6	146037	146042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619147
3509	NC_008570	TCG	2	6	146071	146076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3510	NC_008570	GCC	2	6	146116	146121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619147
3511	NC_008570	GGC	2	6	146127	146132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619147
3512	NC_008570	CGG	2	6	146231	146236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619147
3513	NC_008570	AG	3	6	146269	146274	50 %	0 %	50 %	0 %	117619147
3514	NC_008570	CGT	2	6	146300	146305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3515	NC_008570	CTG	3	9	146310	146318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3516	NC_008570	CTGG	2	8	146334	146341	0 %	25 %	50 %	25 %	117619147
3517	NC_008570	TGT	2	6	146363	146368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117619147
3518	NC_008570	CTG	2	6	146418	146423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3519	NC_008570	CTG	2	6	146427	146432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3520	NC_008570	TGC	2	6	146435	146440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3521	NC_008570	TGC	2	6	146447	146452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3522	NC_008570	CAG	2	6	146466	146471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3523	NC_008570	CTG	2	6	146502	146507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3524	NC_008570	AGC	3	9	146686	146694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3525	NC_008570	GAT	2	6	146703	146708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117619147
3526	NC_008570	GCA	2	6	146729	146734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3527	NC_008570	TGC	2	6	146743	146748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3528	NC_008570	GCT	2	6	146783	146788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3529	NC_008570	TGC	2	6	146800	146805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3530	NC_008570	CTGG	2	8	146826	146833	0 %	25 %	50 %	25 %	117619147
3531	NC_008570	TGT	2	6	146837	146842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117619147
3532	NC_008570	TCGG	2	8	146863	146870	0 %	25 %	50 %	25 %	117619147
3533	NC_008570	TCA	2	6	146876	146881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117619147
3534	NC_008570	AGAT	2	8	146911	146918	50 %	25 %	25 %	0 %	117619147
3535	NC_008570	CCA	2	6	146921	146926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117619147
3536	NC_008570	GCG	2	6	146969	146974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619147
3537	NC_008570	GCC	2	6	147010	147015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619147
3538	NC_008570	CGG	2	6	147062	147067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619147
3539	NC_008570	CTG	2	6	147081	147086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3540	NC_008570	GTG	2	6	147094	147099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117619147
3541	NC_008570	GGCG	2	8	147170	147177	0 %	0 %	75 %	25 %	117619147
3542	NC_008570	GCT	2	6	147183	147188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3543	NC_008570	CAG	2	6	147243	147248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619147
3544	NC_008570	GA	3	6	147285	147290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_008570	TAG	2	6	147320	147325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_008570	GGC	2	6	147401	147406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_008570	G	6	6	147429	147434	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_008570	AG	3	6	147440	147445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_008570	T	7	7	147519	147525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_008570	CCG	2	6	147559	147564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117620195
3551	NC_008570	ACC	2	6	147594	147599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117620195
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3553	NC_008570	TGGC	2	8	147649	147656	0 %	25 %	50 %	25 %	117620195
3554	NC_008570	GCC	2	6	147669	147674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117620195
3555	NC_008570	GC	3	6	147679	147684	0 %	0 %	50 %	50 %	117620195
3556	NC_008570	AAG	2	6	147708	147713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117620195
3557	NC_008570	CTA	2	6	147764	147769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117620195
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3559	NC_008570	GGTC	2	8	147974	147981	0 %	25 %	50 %	25 %	117620195
3560	NC_008570	GC	3	6	148031	148036	0 %	0 %	50 %	50 %	117620195
3561	NC_008570	CGC	2	6	148046	148051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117620195
3562	NC_008570	CCA	2	6	148090	148095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117620195
3563	NC_008570	CCA	2	6	148123	148128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117620195
3564	NC_008570	CCG	2	6	148135	148140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117620195
3565	NC_008570	AAGGC	2	10	148141	148150	40 %	0 %	40 %	20 %	117620195
3566	NC_008570	GGGCC	2	10	148382	148391	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3567	NC_008570	CGG	2	6	148466	148471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618741
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3569	NC_008570	CAG	2	6	148656	148661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618741
3570	NC_008570	CTG	2	6	148692	148697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618741
3571	NC_008570	CGG	2	6	148706	148711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618741
3572	NC_008570	TGGC	2	8	148718	148725	0 %	25 %	50 %	25 %	117618741
3573	NC_008570	CCA	2	6	148730	148735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117618741
3574	NC_008570	GTG	2	6	148780	148785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117618741
3575	NC_008570	TGGC	2	8	148799	148806	0 %	25 %	50 %	25 %	117618741
3576	NC_008570	GGT	2	6	148929	148934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117619056
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3578	NC_008570	CAG	2	6	148956	148961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619056
3579	NC_008570	T	6	6	148989	148994	0 %	100 %	0 %	0 %	117619056
3580	NC_008570	CAT	2	6	149001	149006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117619056
3581	NC_008570	TCA	2	6	149072	149077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117619056
3582	NC_008570	A	6	6	149123	149128	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_008570	GCA	2	6	149152	149157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_008570	CCG	2	6	149194	149199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_008570	CAA	2	6	149229	149234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_008570	GGTTC	2	10	149347	149356	0 %	40 %	40 %	20 %	117618878
3587	NC_008570	TGA	2	6	149362	149367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618878
3588	NC_008570	TAC	2	6	149400	149405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117618878
3589	NC_008570	GCA	2	6	149498	149503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_008570	CTG	2	6	149553	149558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619451
3591	NC_008570	GAA	2	6	149580	149585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117619451
3592	NC_008570	GCA	2	6	149654	149659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619451
3593	NC_008570	CAG	2	6	149679	149684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619451
3594	NC_008570	CTG	2	6	149778	149783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619451
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3598	NC_008570	GGCA	2	8	149908	149915	25 %	0 %	50 %	25 %	117619451
3599	NC_008570	GGC	2	6	149988	149993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619451
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3601	NC_008570	CAG	2	6	150006	150011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619451
3602	NC_008570	TGG	2	6	150014	150019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117619451
3603	NC_008570	GCT	2	6	150068	150073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619451
3604	NC_008570	TTG	2	6	150240	150245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117619451
3605	NC_008570	TGG	2	6	150284	150289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117619451
3606	NC_008570	GCG	2	6	150290	150295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619451
3607	NC_008570	TTG	2	6	150301	150306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117619451
3608	NC_008570	GGC	2	6	150409	150414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619451
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3610	NC_008570	GCC	2	6	150529	150534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619451
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3612	NC_008570	C	6	6	150577	150582	0 %	0 %	0 %	100 %	117619451
3613	NC_008570	CGC	2	6	150656	150661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619451
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3615	NC_008570	CAGG	2	8	150704	150711	25 %	0 %	50 %	25 %	117619451
3616	NC_008570	GA	3	6	150726	150731	50 %	0 %	50 %	0 %	117619451
3617	NC_008570	GCC	2	6	150787	150792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117620003
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3619	NC_008570	CGTGGG	2	12	150825	150836	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	117620003
3620	NC_008570	GTA	2	6	150895	150900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117620003
3621	NC_008570	TCC	2	6	150926	150931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117620003
3622	NC_008570	CAGGC	2	10	150934	150943	20 %	0 %	40 %	40 %	117620003
3623	NC_008570	ATG	2	6	150953	150958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117620003
3624	NC_008570	TCG	2	6	150977	150982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117620003
3625	NC_008570	ATG	4	12	150986	150997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117620003
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3627	NC_008570	GCT	2	6	151080	151085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117620003
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3629	NC_008570	GCT	2	6	151167	151172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117620003
3630	NC_008570	CAGCTC	2	12	151228	151239	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	117620003
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3632	NC_008570	CTG	2	6	151267	151272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117620003
3633	NC_008570	TCG	3	9	151274	151282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117620003
3634	NC_008570	AGC	2	6	151283	151288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117620003
3635	NC_008570	CGCAGC	2	12	151295	151306	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	117620003
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3637	NC_008570	TCG	2	6	151361	151366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117620003
3638	NC_008570	GCG	2	6	151372	151377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117620003
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3666	NC_008570	TGA	2	6	152307	152312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117620062
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3695	NC_008570	GACC	2	8	153195	153202	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3732	NC_008570	TCGGCT	2	12	154664	154675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619676
3733	NC_008570	CAGA	2	8	154699	154706	50 %	0 %	25 %	25 %	117619676
3734	NC_008570	ATC	2	6	154721	154726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117619676
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3740	NC_008570	CTT	2	6	154837	154842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117619676
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3987	NC_008570	GCG	2	6	165063	165068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3988	NC_008570	AGC	2	6	165071	165076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3989	NC_008570	GC	3	6	165090	165095	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3990	NC_008570	CGG	2	6	165154	165159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3991	NC_008570	CTTCT	2	10	165192	165201	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3992	NC_008570	TTC	2	6	165246	165251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3993	NC_008570	AGT	2	6	165306	165311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3994	NC_008570	CTT	2	6	165343	165348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3995	NC_008570	TTG	2	6	165375	165380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3996	NC_008570	CGA	2	6	165403	165408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3997	NC_008570	CTT	2	6	165411	165416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3998	NC_008570	TGG	2	6	165448	165453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3999	NC_008570	ACCC	2	8	165554	165561	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4000	NC_008570	GCG	2	6	165672	165677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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