MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 chromosome

Total Repeats: 115736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008570	TGG	2	6	247542	247547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117618239
6002	NC_008570	TC	3	6	247569	247574	0 %	50 %	0 %	50 %	117618239
6003	NC_008570	CTT	2	6	247658	247663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117618239
6004	NC_008570	CTG	2	6	247674	247679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618239
6005	NC_008570	CCCG	2	8	247684	247691	0 %	0 %	25 %	75 %	117618239
6006	NC_008570	TGC	2	6	247696	247701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618239
6007	NC_008570	ATC	2	6	247785	247790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117618239
6008	NC_008570	TGC	2	6	247822	247827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618239
6009	NC_008570	CTG	2	6	247833	247838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618239
6010	NC_008570	GCT	3	9	247844	247852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618239
6011	NC_008570	GGC	2	6	247870	247875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618239
6012	NC_008570	GCCA	2	8	247889	247896	25 %	0 %	25 %	50 %	117618239
6013	NC_008570	CCAG	2	8	247898	247905	25 %	0 %	25 %	50 %	117618239
6014	NC_008570	GCC	2	6	247912	247917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618239
6015	NC_008570	GC	3	6	248108	248113	0 %	0 %	50 %	50 %	117618967
6016	NC_008570	GTG	2	6	248123	248128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117618967
6017	NC_008570	GCG	2	6	248154	248159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618967
6018	NC_008570	GGC	2	6	248162	248167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618967
6019	NC_008570	GC	3	6	248166	248171	0 %	0 %	50 %	50 %	117618967
6020	NC_008570	CAG	2	6	248207	248212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618967
6021	NC_008570	GAT	2	6	248260	248265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618967
6022	NC_008570	TCC	2	6	248271	248276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117618967
6023	NC_008570	CGA	2	6	248344	248349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618967
6024	NC_008570	CTG	2	6	248376	248381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618967
6025	NC_008570	TG	4	8	248438	248445	0 %	50 %	50 %	0 %	117618967
6026	NC_008570	GCC	2	6	248490	248495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618967
6027	NC_008570	CAG	2	6	248543	248548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618967
6028	NC_008570	GCC	2	6	248650	248655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117618967
6029	NC_008570	CGG	2	6	248747	248752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618967
6030	NC_008570	CGGCT	2	10	248792	248801	0 %	20 %	40 %	40 %	117618967
6031	NC_008570	GCT	2	6	248812	248817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618967
6032	NC_008570	GTA	2	6	248837	248842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618967
6033	NC_008570	GCTCC	2	10	248855	248864	0 %	20 %	20 %	60 %	117618967
6034	NC_008570	TGCT	2	8	248872	248879	0 %	50 %	25 %	25 %	117618967
6035	NC_008570	ATG	2	6	248930	248935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618967
6036	NC_008570	ACC	2	6	248958	248963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117618967
6037	NC_008570	GA	3	6	249001	249006	50 %	0 %	50 %	0 %	117618967
6038	NC_008570	GT	3	6	249118	249123	0 %	50 %	50 %	0 %	117618967
6039	NC_008570	TC	3	6	249132	249137	0 %	50 %	0 %	50 %	117618967
6040	NC_008570	GT	3	6	249209	249214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_008570	TGA	2	6	249296	249301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_008570	GCG	2	6	249325	249330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_008570	GAG	2	6	249368	249373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_008570	GTT	2	6	249387	249392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_008570	GGTC	2	8	249395	249402	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6046	NC_008570	CACC	2	8	249504	249511	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6047	NC_008570	TGA	2	6	249544	249549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6048	NC_008570	AG	3	6	249593	249598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_008570	CAG	2	6	249730	249735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619403
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6051	NC_008570	ATC	2	6	249821	249826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117619403
6052	NC_008570	T	6	6	249887	249892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_008570	CGG	2	6	249901	249906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6054	NC_008570	A	6	6	249968	249973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_008570	CG	3	6	250020	250025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6056	NC_008570	GTC	2	6	250028	250033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6057	NC_008570	AGGT	2	8	250051	250058	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_008570	G	6	6	250095	250100	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_008570	CAAC	2	8	250137	250144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6060	NC_008570	TCG	2	6	250170	250175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619017
6061	NC_008570	CGC	3	9	250234	250242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619017
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6063	NC_008570	TCG	2	6	250284	250289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619017
6064	NC_008570	TGC	2	6	250293	250298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619017
6065	NC_008570	AGCA	2	8	250304	250311	50 %	0 %	25 %	25 %	117619017
6066	NC_008570	CTG	2	6	250321	250326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619017
6067	NC_008570	GTG	2	6	250343	250348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117619017
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6069	NC_008570	GC	3	6	250411	250416	0 %	0 %	50 %	50 %	117619017
6070	NC_008570	TCAG	2	8	250467	250474	25 %	25 %	25 %	25 %	117619017
6071	NC_008570	ACT	2	6	250488	250493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117619017
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6090	NC_008570	CCGGC	2	10	251627	251636	0 %	0 %	40 %	60 %	117621305
6091	NC_008570	GCA	2	6	251638	251643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621305
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6093	NC_008570	TGCC	2	8	251679	251686	0 %	25 %	25 %	50 %	117621305
6094	NC_008570	CTC	2	6	251711	251716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117621305
6095	NC_008570	CGGGCT	2	12	251734	251745	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	117621305
6096	NC_008570	AAGC	2	8	251815	251822	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6097	NC_008570	CGGC	2	8	251920	251927	0 %	0 %	50 %	50 %	117619874
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6101	NC_008570	CATC	2	8	252008	252015	25 %	25 %	0 %	50 %	117619874
6102	NC_008570	CAG	2	6	252024	252029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619874
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6105	NC_008570	GGC	2	6	252186	252191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619874
6106	NC_008570	GCCGGG	2	12	252207	252218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619874
6107	NC_008570	TCA	2	6	252245	252250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117619874
6108	NC_008570	GTA	2	6	252273	252278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117619874
6109	NC_008570	CAG	2	6	252309	252314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619874
6110	NC_008570	AGC	2	6	252358	252363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619874
6111	NC_008570	CTG	2	6	252432	252437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619874
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6113	NC_008570	CAG	2	6	252501	252506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619874
6114	NC_008570	CCA	2	6	252512	252517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117619874
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6116	NC_008570	GCG	2	6	252646	252651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6117	NC_008570	GGC	2	6	252674	252679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6118	NC_008570	GAT	2	6	252713	252718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6119	NC_008570	CGC	2	6	252783	252788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117621458
6120	NC_008570	GGC	2	6	252828	252833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621458
6121	NC_008570	GCT	3	9	252843	252851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621458
6122	NC_008570	CCTG	2	8	252854	252861	0 %	25 %	25 %	50 %	117621458
6123	NC_008570	CACC	2	8	252872	252879	25 %	0 %	0 %	75 %	117621458
6124	NC_008570	CAC	2	6	252888	252893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621458
6125	NC_008570	GCT	2	6	252939	252944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621458
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6127	NC_008570	GCGG	2	8	253086	253093	0 %	0 %	75 %	25 %	117621458
6128	NC_008570	GCT	2	6	253212	253217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621458
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6131	NC_008570	GCT	2	6	253319	253324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621458
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6152	NC_008570	TAC	2	6	254189	254194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117621504
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6155	NC_008570	CGA	2	6	254349	254354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621504
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6157	NC_008570	GGC	2	6	254451	254456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6179	NC_008570	GAG	2	6	255139	255144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6233	NC_008570	CCAG	2	8	257203	257210	25 %	0 %	25 %	50 %	117619220
6234	NC_008570	CGC	2	6	257227	257232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619220
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6240	NC_008570	GTA	2	6	257429	257434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117619220
6241	NC_008570	GAAGCC	2	12	257501	257512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619220
6242	NC_008570	C	6	6	257577	257582	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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6367	NC_008570	GAC	2	6	262426	262431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117620884
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6369	NC_008570	GTG	2	6	262501	262506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117620884
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6486	NC_008570	CTG	2	6	266818	266823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117621370
6487	NC_008570	CCA	2	6	266868	266873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117621370
6488	NC_008570	CAG	2	6	266935	266940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621370
6489	NC_008570	CAG	2	6	266977	266982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621370
6490	NC_008570	GGC	2	6	266989	266994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621370
6491	NC_008570	AC	3	6	266998	267003	50 %	0 %	0 %	50 %	117621370
6492	NC_008570	AGA	2	6	267018	267023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117621370
6493	NC_008570	GCCG	2	8	267028	267035	0 %	0 %	50 %	50 %	117621370
6494	NC_008570	GGC	2	6	267043	267048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117621370
6495	NC_008570	ATG	2	6	267077	267082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117621370
6496	NC_008570	GCC	2	6	267094	267099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117621370
6497	NC_008570	TGG	2	6	267165	267170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117621370
6498	NC_008570	ACCG	2	8	267220	267227	25 %	0 %	25 %	50 %	117621370
6499	NC_008570	GCA	2	6	267243	267248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117621370
6500	NC_008570	CCT	2	6	267276	267281	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117621370

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