MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Aeromonas hydrophila subsp. hydrophila ATCC 7966 chromosome

Total Repeats: 115736

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008570	TA	3	6	10	15	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008570	GCT	2	6	101	106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008570	AATC	2	8	201	208	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_008570	GCA	2	6	240	245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117617947
5	NC_008570	CAT	2	6	405	410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117617947
6	NC_008570	AGA	2	6	527	532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117617947
7	NC_008570	TCG	2	6	611	616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117617947
8	NC_008570	CGGG	2	8	671	678	0 %	0 %	75 %	25 %	117617947
9	NC_008570	GGC	2	6	703	708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117617947
10	NC_008570	CTG	2	6	730	735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117617947
11	NC_008570	TTA	2	6	861	866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117617947
12	NC_008570	CAA	2	6	912	917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117617947
13	NC_008570	AGG	2	6	929	934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117617947
14	NC_008570	CAG	2	6	973	978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117617947
15	NC_008570	ATC	2	6	979	984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117617947
16	NC_008570	GCC	2	6	1074	1079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117617947
17	NC_008570	CTT	2	6	1155	1160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117617947
18	NC_008570	GCCAAC	2	12	1222	1233	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	117617947
19	NC_008570	CTG	2	6	1285	1290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117617947
20	NC_008570	ACA	2	6	1319	1324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117617947
21	NC_008570	AGA	2	6	1328	1333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117617947
22	NC_008570	TAC	2	6	1345	1350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117617947
23	NC_008570	GCG	2	6	1380	1385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117617947
24	NC_008570	GCCC	2	8	1399	1406	0 %	0 %	25 %	75 %	117617947
25	NC_008570	ACCA	2	8	1441	1448	50 %	0 %	0 %	50 %	117617947
26	NC_008570	TGG	2	6	1476	1481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117617947
27	NC_008570	TGCC	2	8	1506	1513	0 %	25 %	25 %	50 %	117617947
28	NC_008570	AGC	2	6	1523	1528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117617947
29	NC_008570	GAAG	2	8	1530	1537	50 %	0 %	50 %	0 %	117617947
30	NC_008570	AG	3	6	1536	1541	50 %	0 %	50 %	0 %	117617947
31	NC_008570	TTC	2	6	1584	1589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117617947
32	NC_008570	AACGG	2	10	1595	1604	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_008570	TCC	2	6	1650	1655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_008570	TAA	2	6	1656	1661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008570	GGCC	2	8	1743	1750	0 %	0 %	50 %	50 %	117619320
36	NC_008570	TGC	2	6	1774	1779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619320
37	NC_008570	CTG	2	6	1797	1802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619320
38	NC_008570	GACC	2	8	1814	1821	25 %	0 %	25 %	50 %	117619320
39	NC_008570	GAT	2	6	1832	1837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117619320
40	NC_008570	CAC	2	6	1877	1882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117619320
41	NC_008570	GC	3	6	1890	1895	0 %	0 %	50 %	50 %	117619320
42	NC_008570	GCT	2	6	1898	1903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619320
43	NC_008570	ATC	2	6	1968	1973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117619320
44	NC_008570	GCCA	2	8	2115	2122	25 %	0 %	25 %	50 %	117619320
45	NC_008570	TAC	2	6	2133	2138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117619320
46	NC_008570	CGAC	2	8	2188	2195	25 %	0 %	25 %	50 %	117619320
47	NC_008570	GCC	2	6	2215	2220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619320
48	NC_008570	GGT	2	6	2225	2230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117619320
49	NC_008570	ATC	2	6	2248	2253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117619320
50	NC_008570	CTG	2	6	2295	2300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619320
51	NC_008570	GCA	2	6	2338	2343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619320
52	NC_008570	TGG	2	6	2386	2391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117619320
53	NC_008570	GCC	2	6	2487	2492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619320
54	NC_008570	CTG	2	6	2544	2549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619320
55	NC_008570	CAA	2	6	2561	2566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117619320
56	NC_008570	GAA	2	6	2577	2582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117619320
57	NC_008570	GCT	2	6	2591	2596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619320
58	NC_008570	CAG	2	6	2711	2716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619320
59	NC_008570	ATT	2	6	2721	2726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117619320
60	NC_008570	CAG	2	6	2825	2830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618875
61	NC_008570	CTCGGT	2	12	2918	2929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618875
62	NC_008570	CGGG	2	8	2953	2960	0 %	0 %	75 %	25 %	117618875
63	NC_008570	GCCCAG	2	12	3080	3091	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	117618875
64	NC_008570	TGC	2	6	3114	3119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618875
65	NC_008570	ATCC	2	8	3131	3138	25 %	25 %	0 %	50 %	117618875
66	NC_008570	CTG	2	6	3152	3157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618875
67	NC_008570	CGG	2	6	3160	3165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618875
68	NC_008570	TCG	2	6	3175	3180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618875
69	NC_008570	TCA	2	6	3205	3210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117618875
70	NC_008570	CTT	2	6	3220	3225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117618875
71	NC_008570	CTG	2	6	3251	3256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618875
72	NC_008570	GCT	2	6	3271	3276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117618875
73	NC_008570	AGC	2	6	3284	3289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618875
74	NC_008570	CGG	2	6	3402	3407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117618875
75	NC_008570	T	6	6	3409	3414	0 %	100 %	0 %	0 %	117618875
76	NC_008570	AGC	2	6	3659	3664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618875
77	NC_008570	T	7	7	3675	3681	0 %	100 %	0 %	0 %	117618875
78	NC_008570	TGA	2	6	3685	3690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618875
79	NC_008570	ATG	2	6	3800	3805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117618875
80	NC_008570	GTT	2	6	3823	3828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117618875
81	NC_008570	AG	3	6	3871	3876	50 %	0 %	50 %	0 %	117618875
82	NC_008570	CTC	2	6	3903	3908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117619604
83	NC_008570	GAT	2	6	3976	3981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117619604
84	NC_008570	CAC	2	6	3994	3999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117619604
85	NC_008570	GTC	2	6	4012	4017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619604
86	NC_008570	TCCGTC	2	12	4087	4098	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	117619604
87	NC_008570	TCA	2	6	4163	4168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117619604
88	NC_008570	TGC	2	6	4175	4180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619604
89	NC_008570	GGC	2	6	4186	4191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619604
90	NC_008570	CGA	2	6	4197	4202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619604
91	NC_008570	CGG	2	6	4221	4226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619604
92	NC_008570	CT	3	6	4261	4266	0 %	50 %	0 %	50 %	117619604
93	NC_008570	GCT	3	9	4272	4280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619604
94	NC_008570	GCACCG	2	12	4364	4375	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	117619604
95	NC_008570	TCCT	2	8	4465	4472	0 %	50 %	0 %	50 %	117619604
96	NC_008570	CTG	2	6	4495	4500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619604
97	NC_008570	GGC	2	6	4540	4545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117619604
98	NC_008570	TCG	2	6	4556	4561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619604
99	NC_008570	CAC	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117619604
100	NC_008570	ACG	2	6	4658	4663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619604
101	NC_008570	CAA	2	6	4692	4697	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117619604
102	NC_008570	TGG	2	6	4713	4718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117619604
103	NC_008570	TGG	2	6	4727	4732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117619604
104	NC_008570	AAG	2	6	4792	4797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117619604
105	NC_008570	GCC	2	6	4807	4812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619604
106	NC_008570	CGA	2	6	4818	4823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619604
107	NC_008570	CGTG	2	8	4824	4831	0 %	25 %	50 %	25 %	117619604
108	NC_008570	TCC	2	6	4879	4884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117619604
109	NC_008570	CCG	2	6	4922	4927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619604
110	NC_008570	CTG	2	6	4963	4968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619604
111	NC_008570	CAA	2	6	4998	5003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117619604
112	NC_008570	ATC	2	6	5005	5010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117619604
113	NC_008570	CGC	2	6	5059	5064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619604
114	NC_008570	GC	3	6	5069	5074	0 %	0 %	50 %	50 %	117619604
115	NC_008570	CTG	2	6	5162	5167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619604
116	NC_008570	GAA	2	6	5196	5201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117619604
117	NC_008570	GAT	2	6	5262	5267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117619604
118	NC_008570	AGG	2	6	5276	5281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117619604
119	NC_008570	CAT	4	12	5358	5369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117619604
120	NC_008570	CTG	3	9	5407	5415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619604
121	NC_008570	CTT	2	6	5418	5423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117619604
122	NC_008570	ATC	2	6	5443	5448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117619604
123	NC_008570	GCC	2	6	5475	5480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619604
124	NC_008570	GAA	2	6	5493	5498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117619604
125	NC_008570	GCT	2	6	5535	5540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619604
126	NC_008570	CGC	2	6	5677	5682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117619604
127	NC_008570	GC	3	6	5681	5686	0 %	0 %	50 %	50 %	117619604
128	NC_008570	GCT	2	6	5736	5741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619604
129	NC_008570	AGC	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619604
130	NC_008570	CTG	2	6	5758	5763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619604
131	NC_008570	ACG	2	6	5837	5842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619604
132	NC_008570	TCC	2	6	5929	5934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117619604
133	NC_008570	GGT	2	6	5989	5994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117619604
134	NC_008570	TCG	2	6	6035	6040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117619604
135	NC_008570	ACC	2	6	6136	6141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117619604
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172	NC_008570	ATA	2	6	7784	7789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_008570	GGCA	2	8	11544	11551	25 %	0 %	50 %	25 %	117617786
265	NC_008570	GCG	2	6	11585	11590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117617786
266	NC_008570	CTG	2	6	11599	11604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117617786
267	NC_008570	GCG	2	6	11629	11634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117617786
268	NC_008570	TGA	2	6	11655	11660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117617786
269	NC_008570	CTG	2	6	11678	11683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117617786
270	NC_008570	CTG	3	9	11711	11719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117617786
271	NC_008570	GCC	2	6	11744	11749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117617786
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276	NC_008570	CTG	2	6	11942	11947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117617786
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279	NC_008570	CTA	2	6	12091	12096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117617786
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285	NC_008570	CGC	3	9	12250	12258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117617786
286	NC_008570	GGCT	2	8	12275	12282	0 %	25 %	50 %	25 %	117617786
287	NC_008570	CTG	2	6	12314	12319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117617786
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294	NC_008570	CTG	2	6	12491	12496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117617786
295	NC_008570	GGT	2	6	12500	12505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117617786
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302	NC_008570	GCA	2	6	12755	12760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117619332
303	NC_008570	TCC	2	6	12793	12798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117619332
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380	NC_008570	TCC	2	6	15592	15597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117618215
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385	NC_008570	CCT	2	6	15713	15718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	117618215
386	NC_008570	GCA	2	6	15740	15745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117618215
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