MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Arthrobacter sp. FB24 plasmid 2

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008538	ACGCC	2	10	2445	2454	20 %	0 %	20 %	60 %	116662235
2	NC_008538	TGCGG	2	10	3250	3259	0 %	20 %	60 %	20 %	116662235
3	NC_008538	ACGGA	2	10	3665	3674	40 %	0 %	40 %	20 %	116662235
4	NC_008538	GGGCT	2	10	4077	4086	0 %	20 %	60 %	20 %	116662235
5	NC_008538	GTGCC	2	10	5600	5609	0 %	20 %	40 %	40 %	116662237
6	NC_008538	TGCTC	2	10	8044	8053	0 %	40 %	20 %	40 %	116662239
7	NC_008538	CCGAC	2	10	9140	9149	20 %	0 %	20 %	60 %	116662240
8	NC_008538	GATCG	2	10	11428	11437	20 %	20 %	40 %	20 %	116662241
9	NC_008538	CTGGT	2	10	12022	12031	0 %	40 %	40 %	20 %	116662242
10	NC_008538	GTGCG	2	10	12111	12120	0 %	20 %	60 %	20 %	116662242
11	NC_008538	TCAAG	2	10	16505	16514	40 %	20 %	20 %	20 %	116662247
12	NC_008538	GCTCG	2	10	17414	17423	0 %	20 %	40 %	40 %	116662248
13	NC_008538	CCCCG	2	10	17606	17615	0 %	0 %	20 %	80 %	116662248
14	NC_008538	CGCAG	2	10	18158	18167	20 %	0 %	40 %	40 %	116662249
15	NC_008538	GGCCC	2	10	18921	18930	0 %	0 %	40 %	60 %	116662250
16	NC_008538	CCCAG	2	10	22348	22357	20 %	0 %	20 %	60 %	116662253
17	NC_008538	GTCGC	2	10	23025	23034	0 %	20 %	40 %	40 %	116662253
18	NC_008538	CAGGC	2	10	26249	26258	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_008538	GCACC	2	10	27913	27922	20 %	0 %	20 %	60 %	116662257
20	NC_008538	CGGCC	2	10	28761	28770	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
21	NC_008538	GGCCG	2	10	29577	29586	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_008538	ATGCA	2	10	30087	30096	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_008538	TCACC	2	10	30563	30572	20 %	20 %	0 %	60 %	116662260
24	NC_008538	CGGCT	2	10	30772	30781	0 %	20 %	40 %	40 %	116662260
25	NC_008538	GACCC	2	10	33079	33088	20 %	0 %	20 %	60 %	116662261
26	NC_008538	CGGCC	2	10	33138	33147	0 %	0 %	40 %	60 %	116662261
27	NC_008538	CCTGT	2	10	37148	37157	0 %	40 %	20 %	40 %	116662265
28	NC_008538	CGGCG	2	10	37310	37319	0 %	0 %	60 %	40 %	116662265
29	NC_008538	CAGCG	2	10	40472	40481	20 %	0 %	40 %	40 %	116662267
30	NC_008538	GCGTG	2	10	40713	40722	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_008538	CTTGG	2	10	40845	40854	0 %	40 %	40 %	20 %	116662268
32	NC_008538	CCGTG	2	10	41070	41079	0 %	20 %	40 %	40 %	116662268
33	NC_008538	TGGAC	2	10	41330	41339	20 %	20 %	40 %	20 %	116662268
34	NC_008538	GTGGC	2	10	41840	41849	0 %	20 %	60 %	20 %	116662269
35	NC_008538	TGACC	2	10	42960	42969	20 %	20 %	20 %	40 %	116662270
36	NC_008538	GTCTC	2	10	45743	45752	0 %	40 %	20 %	40 %	116662273
37	NC_008538	TGGGC	2	10	48388	48397	0 %	20 %	60 %	20 %	116662275
38	NC_008538	CCATC	2	10	48485	48494	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_008538	GGTCA	2	10	48749	48758	20 %	20 %	40 %	20 %	116662276
40	NC_008538	GCCCC	2	10	48835	48844	0 %	0 %	20 %	80 %	116662276
41	NC_008538	CCCGG	2	10	49317	49326	0 %	0 %	40 %	60 %	116662277
42	NC_008538	CACGC	2	10	49916	49925	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_008538	GGGCT	2	10	53116	53125	0 %	20 %	60 %	20 %	116662281
44	NC_008538	GAGCA	2	10	53666	53675	40 %	0 %	40 %	20 %	116662281
45	NC_008538	AGGGC	2	10	55447	55456	20 %	0 %	60 %	20 %	116662283
46	NC_008538	ACCCG	2	10	56327	56336	20 %	0 %	20 %	60 %	116662284
47	NC_008538	GGAGG	2	10	57421	57430	20 %	0 %	80 %	0 %	116662286
48	NC_008538	ATCCA	2	10	57994	58003	40 %	20 %	0 %	40 %	116662287
49	NC_008538	TCGCG	2	10	58869	58878	0 %	20 %	40 %	40 %	116662287
50	NC_008538	GGACG	2	10	61008	61017	20 %	0 %	60 %	20 %	116662287
51	NC_008538	CCAGT	2	10	61089	61098	20 %	20 %	20 %	40 %	116662287
52	NC_008538	AACGG	2	10	61933	61942	40 %	0 %	40 %	20 %	116662287
53	NC_008538	ATCGC	2	10	62131	62140	20 %	20 %	20 %	40 %	116662287
54	NC_008538	CGCCT	2	10	64824	64833	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
55	NC_008538	CCGGG	2	10	66458	66467	0 %	0 %	60 %	40 %	116662292
56	NC_008538	TGCGC	2	10	68230	68239	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_008538	CCGGC	2	10	68626	68635	0 %	0 %	40 %	60 %	116662295
58	NC_008538	GAGAC	2	10	69097	69106	40 %	0 %	40 %	20 %	116662295
59	NC_008538	CCACA	2	10	70475	70484	40 %	0 %	0 %	60 %	116662296
60	NC_008538	GCCGC	2	10	72752	72761	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
61	NC_008538	TGAGA	2	10	72818	72827	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008538	CGGAG	2	10	72937	72946	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
63	NC_008538	CGCTG	2	10	73223	73232	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_008538	GGGGA	2	10	73240	73249	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
65	NC_008538	TGAAC	2	10	73784	73793	40 %	20 %	20 %	20 %	116662299
66	NC_008538	TGCCC	2	10	74456	74465	0 %	20 %	20 %	60 %	116662299
67	NC_008538	ACGCT	2	10	74634	74643	20 %	20 %	20 %	40 %	116662299
68	NC_008538	CGCAG	2	10	74811	74820	20 %	0 %	40 %	40 %	116662299
69	NC_008538	CGGAA	2	10	77788	77797	40 %	0 %	40 %	20 %	116662302
70	NC_008538	GCCTG	2	10	78158	78167	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
71	NC_008538	CGCGC	2	10	85719	85728	0 %	0 %	40 %	60 %	116662310
72	NC_008538	CGAAA	2	10	87817	87826	60 %	0 %	20 %	20 %	116662312
73	NC_008538	CAGGT	2	10	88216	88225	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_008538	ACGTC	2	10	88399	88408	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_008538	GTGCC	2	10	88868	88877	0 %	20 %	40 %	40 %	116662313
76	NC_008538	CGCGA	2	10	90110	90119	20 %	0 %	40 %	40 %	116662314
77	NC_008538	CCGGC	2	10	91878	91887	0 %	0 %	40 %	60 %	116662315
78	NC_008538	GTCCG	2	10	94226	94235	0 %	20 %	40 %	40 %	116662318
79	NC_008538	GAATC	2	10	95182	95191	40 %	20 %	20 %	20 %	116662319
80	NC_008538	GCTCG	2	10	99459	99468	0 %	20 %	40 %	40 %	116662324
81	NC_008538	TTTCG	2	10	102294	102303	0 %	60 %	20 %	20 %	116662326
82	NC_008538	CCGGC	2	10	105912	105921	0 %	0 %	40 %	60 %	116662331
83	NC_008538	CATTG	2	10	106835	106844	20 %	40 %	20 %	20 %	116662332
84	NC_008538	ACCCA	2	10	107693	107702	40 %	0 %	0 %	60 %	116662333
85	NC_008538	GCCAG	2	10	107824	107833	20 %	0 %	40 %	40 %	116662333
86	NC_008538	GCCAG	2	10	109718	109727	20 %	0 %	40 %	40 %	116662335
87	NC_008538	CGAGC	2	10	110498	110507	20 %	0 %	40 %	40 %	116662336
88	NC_008538	GTCAT	2	10	112753	112762	20 %	40 %	20 %	20 %	116662337
89	NC_008538	GTCAC	2	10	113351	113360	20 %	20 %	20 %	40 %	116662338

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.