MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008340	GCG	2	6	165535	165540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319305
4002	NC_008340	GGC	2	6	165544	165549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319305
4003	NC_008340	CTG	2	6	165555	165560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319305
4004	NC_008340	GCA	2	6	165620	165625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319305
4005	NC_008340	AGA	2	6	165740	165745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319305
4006	NC_008340	CCG	2	6	165746	165751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319305
4007	NC_008340	GC	3	6	165782	165787	0 %	0 %	50 %	50 %	114319305
4008	NC_008340	GCA	2	6	165806	165811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319305
4009	NC_008340	GCC	3	9	165822	165830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319305
4010	NC_008340	G	6	6	165870	165875	0 %	0 %	100 %	0 %	114319305
4011	NC_008340	CCG	2	6	165889	165894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319305
4012	NC_008340	CCG	2	6	166069	166074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319305
4013	NC_008340	TCC	2	6	166078	166083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319305
4014	NC_008340	GGGCC	2	10	166121	166130	0 %	0 %	60 %	40 %	114319305
4015	NC_008340	TGGC	2	8	166162	166169	0 %	25 %	50 %	25 %	114319305
4016	NC_008340	CGA	2	6	166187	166192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319305
4017	NC_008340	GCG	2	6	166194	166199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319305
4018	NC_008340	CCG	3	9	166202	166210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319305
4019	NC_008340	GAA	2	6	166239	166244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319305
4020	NC_008340	CG	3	6	166331	166336	0 %	0 %	50 %	50 %	114319305
4021	NC_008340	GCG	2	6	166343	166348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319305
4022	NC_008340	AGT	2	6	166367	166372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319305
4023	NC_008340	TCCACG	2	12	166375	166386	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	114319305
4024	NC_008340	CAC	2	6	166398	166403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319305
4025	NC_008340	GGC	2	6	166424	166429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319305
4026	NC_008340	GTC	2	6	166444	166449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319305
4027	NC_008340	TGC	2	6	166454	166459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319306
4028	NC_008340	GGC	2	6	166492	166497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319306
4029	NC_008340	TCG	2	6	166580	166585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319306
4030	NC_008340	TTC	2	6	166646	166651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319306
4031	NC_008340	C	6	6	166676	166681	0 %	0 %	0 %	100 %	114319306
4032	NC_008340	TCC	2	6	166688	166693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319306
4033	NC_008340	CTC	2	6	166741	166746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319306
4034	NC_008340	CCG	2	6	166789	166794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319306
4035	NC_008340	GCC	2	6	166801	166806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319306
4036	NC_008340	AAT	2	6	166809	166814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	114319306
4037	NC_008340	GATG	2	8	166815	166822	25 %	25 %	50 %	0 %	114319306
4038	NC_008340	CCT	2	6	166836	166841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319306
4039	NC_008340	CCACC	2	10	166861	166870	20 %	0 %	0 %	80 %	114319306
4040	NC_008340	GGT	2	6	166926	166931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319306
4041	NC_008340	GCT	2	6	166956	166961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319306
4042	NC_008340	AGC	2	6	167021	167026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319306
4043	NC_008340	CTC	2	6	167065	167070	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319306
4044	NC_008340	CGT	2	6	167076	167081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319306
4045	NC_008340	CAG	2	6	167110	167115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319306
4046	NC_008340	CG	3	6	167127	167132	0 %	0 %	50 %	50 %	114319306
4047	NC_008340	GCA	2	6	167142	167147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319306
4048	NC_008340	CCG	2	6	167184	167189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319306
4049	NC_008340	TCC	2	6	167195	167200	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319306
4050	NC_008340	CCA	2	6	167271	167276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319306
4051	NC_008340	GGT	2	6	167317	167322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319306
4052	NC_008340	TGA	2	6	167346	167351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319306
4053	NC_008340	CTC	2	6	167362	167367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319306
4054	NC_008340	CGG	2	6	167402	167407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319306
4055	NC_008340	TGC	2	6	167415	167420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319306
4056	NC_008340	AGA	2	6	167424	167429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319306
4057	NC_008340	AGC	2	6	167519	167524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319307
4058	NC_008340	CCG	2	6	167541	167546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319307
4059	NC_008340	GAC	2	6	167555	167560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319307
4060	NC_008340	CG	3	6	167590	167595	0 %	0 %	50 %	50 %	114319307
4061	NC_008340	GGC	2	6	167623	167628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319307
4062	NC_008340	GC	3	6	167627	167632	0 %	0 %	50 %	50 %	114319307
4063	NC_008340	GTC	2	6	167644	167649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319307
4064	NC_008340	GTG	2	6	167696	167701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319307
4065	NC_008340	GCC	2	6	167740	167745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319307
4066	NC_008340	TGC	2	6	167841	167846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319307
4067	NC_008340	GCGCC	2	10	167867	167876	0 %	0 %	40 %	60 %	114319307
4068	NC_008340	GAA	2	6	167887	167892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319307
4069	NC_008340	TCG	2	6	167912	167917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319307
4070	NC_008340	GTC	2	6	167923	167928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319307
4071	NC_008340	TGT	2	6	167931	167936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319307
4072	NC_008340	TCG	3	9	167960	167968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319307
4073	NC_008340	GCC	2	6	167974	167979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319307
4074	NC_008340	GAT	2	6	167995	168000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319307
4075	NC_008340	CAA	2	6	168010	168015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319307
4076	NC_008340	TCC	2	6	168017	168022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319307
4077	NC_008340	GAA	2	6	168025	168030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319307
4078	NC_008340	GC	3	6	168086	168091	0 %	0 %	50 %	50 %	114319307
4079	NC_008340	TGG	2	6	168162	168167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319307
4080	NC_008340	GTC	2	6	168208	168213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319307
4081	NC_008340	TCG	2	6	168215	168220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319307
4082	NC_008340	GTT	2	6	168238	168243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319307
4083	NC_008340	CTG	2	6	168269	168274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319307
4084	NC_008340	CTC	2	6	168349	168354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319307
4085	NC_008340	GGCCG	2	10	168394	168403	0 %	0 %	60 %	40 %	114319307
4086	NC_008340	TGC	2	6	168450	168455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319307
4087	NC_008340	GGT	2	6	168456	168461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319307
4088	NC_008340	CTG	2	6	168490	168495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319307
4089	NC_008340	CGCCCA	2	12	168582	168593	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	114319307
4090	NC_008340	AG	3	6	168605	168610	50 %	0 %	50 %	0 %	114319307
4091	NC_008340	AAG	2	6	168647	168652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	114319307
4092	NC_008340	GTT	2	6	168736	168741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319307
4093	NC_008340	GCCG	2	8	168768	168775	0 %	0 %	50 %	50 %	114319307
4094	NC_008340	TGA	2	6	168813	168818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319307
4095	NC_008340	CTC	2	6	168826	168831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319307
4096	NC_008340	GCCGTC	2	12	168908	168919	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	114319307
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4100	NC_008340	GGT	2	6	169103	169108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319308
4101	NC_008340	TGC	2	6	169125	169130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319308
4102	NC_008340	GC	3	6	169143	169148	0 %	0 %	50 %	50 %	114319308
4103	NC_008340	CCA	3	9	169180	169188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319308
4104	NC_008340	TGA	2	6	169189	169194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319308
4105	NC_008340	GGCC	2	8	169207	169214	0 %	0 %	50 %	50 %	114319308
4106	NC_008340	TGG	2	6	169231	169236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319308
4107	NC_008340	CAG	2	6	169238	169243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319308
4108	NC_008340	GAT	2	6	169262	169267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319308
4109	NC_008340	GTC	2	6	169271	169276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319308
4110	NC_008340	CAT	2	6	169307	169312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319308
4111	NC_008340	CGG	2	6	169357	169362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319308
4112	NC_008340	GCA	2	6	169363	169368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319308
4113	NC_008340	GCA	3	9	169393	169401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319308
4114	NC_008340	CATC	2	8	169435	169442	25 %	25 %	0 %	50 %	114319308
4115	NC_008340	CAG	2	6	169508	169513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319308
4116	NC_008340	GTG	2	6	169560	169565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319308
4117	NC_008340	TCACCA	2	12	169597	169608	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	114319308
4118	NC_008340	TGC	2	6	169636	169641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319308
4119	NC_008340	TCA	2	6	169672	169677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319308
4120	NC_008340	CTC	2	6	169685	169690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319308
4121	NC_008340	CGC	2	6	169704	169709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319308
4122	NC_008340	GAT	2	6	169721	169726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319308
4123	NC_008340	CTG	2	6	169763	169768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319308
4124	NC_008340	GCC	3	9	169797	169805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319308
4125	NC_008340	GTTGCG	2	12	169810	169821	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	114319308
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4127	NC_008340	TGC	2	6	169920	169925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319308
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4132	NC_008340	CGGTGG	2	12	170040	170051	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	114319309
4133	NC_008340	GCC	2	6	170076	170081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319309
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4142	NC_008340	ACG	2	6	170412	170417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319309
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4144	NC_008340	GGCG	2	8	170463	170470	0 %	0 %	75 %	25 %	114319309
4145	NC_008340	CTC	2	6	170485	170490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319309
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4174	NC_008340	G	7	7	171636	171642	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4175	NC_008340	GTG	2	6	171644	171649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4177	NC_008340	AGCC	2	8	171817	171824	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4183	NC_008340	CCG	2	6	172084	172089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319310
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4192	NC_008340	CA	3	6	172310	172315	50 %	0 %	0 %	50 %	114319310
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4195	NC_008340	GC	3	6	172424	172429	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4196	NC_008340	CCTG	2	8	172486	172493	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4197	NC_008340	G	6	6	172499	172504	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4198	NC_008340	CGT	2	6	172514	172519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4203	NC_008340	GGT	2	6	172702	172707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319311
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4232	NC_008340	CCG	2	6	173823	173828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319312
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4236	NC_008340	TGCG	2	8	174065	174072	0 %	25 %	50 %	25 %	114319312
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4239	NC_008340	CGC	2	6	174264	174269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4240	NC_008340	GAG	2	6	174319	174324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4241	NC_008340	GAG	2	6	174420	174425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4243	NC_008340	GAG	2	6	174545	174550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_008340	GAG	2	6	174598	174603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4245	NC_008340	GAG	2	6	174670	174675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4246	NC_008340	GAG	2	6	174723	174728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_008340	GGTG	2	8	174824	174831	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_008340	TTC	2	6	174848	174853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4364	NC_008340	CCG	2	6	179043	179048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319316
4365	NC_008340	GCT	2	6	179062	179067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319316
4366	NC_008340	GCC	2	6	179068	179073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319316
4367	NC_008340	GCA	2	6	179110	179115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319316
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4369	NC_008340	GTG	2	6	179186	179191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
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4377	NC_008340	TGG	2	6	179469	179474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319316
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4403	NC_008340	CGGC	2	8	180279	180286	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4404	NC_008340	TGC	2	6	180345	180350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4405	NC_008340	GAT	2	6	180514	180519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4407	NC_008340	ATC	2	6	180616	180621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4437	NC_008340	T	7	7	181698	181704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4440	NC_008340	TCC	2	6	181771	181776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4441	NC_008340	TCC	2	6	181780	181785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4442	NC_008340	GTCA	2	8	181804	181811	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4443	NC_008340	CCG	2	6	181834	181839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4444	NC_008340	CCT	2	6	181900	181905	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4445	NC_008340	GAGC	2	8	181959	181966	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4447	NC_008340	GAG	2	6	182018	182023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4450	NC_008340	CGA	2	6	182058	182063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4452	NC_008340	C	7	7	182151	182157	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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4468	NC_008340	CGG	2	6	182672	182677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319318
4469	NC_008340	GTCGGC	2	12	182724	182735	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319318
4470	NC_008340	CTG	2	6	182742	182747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319318
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4473	NC_008340	GGCTG	2	10	182924	182933	0 %	20 %	60 %	20 %	114319318
4474	NC_008340	CAG	2	6	182940	182945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319318
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4477	NC_008340	CCG	2	6	183044	183049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
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4479	NC_008340	TCG	2	6	183070	183075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319318
4480	NC_008340	GTG	2	6	183135	183140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319318
4481	NC_008340	CAG	2	6	183153	183158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319318
4482	NC_008340	GCC	2	6	183169	183174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
4483	NC_008340	CGG	2	6	183178	183183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319318
4484	NC_008340	TCC	2	6	183190	183195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319318
4485	NC_008340	G	7	7	183218	183224	0 %	0 %	100 %	0 %	114319318
4486	NC_008340	CGGC	2	8	183370	183377	0 %	0 %	50 %	50 %	114319318
4487	NC_008340	CTT	2	6	183456	183461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319318
4488	NC_008340	CCT	2	6	183476	183481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319318
4489	NC_008340	GCGCC	2	10	183503	183512	0 %	0 %	40 %	60 %	114319318
4490	NC_008340	GCA	2	6	183554	183559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319318
4491	NC_008340	CCT	2	6	183578	183583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319318
4492	NC_008340	CCGG	2	8	183588	183595	0 %	0 %	50 %	50 %	114319318
4493	NC_008340	TGG	2	6	183617	183622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319318
4494	NC_008340	GCT	2	6	183629	183634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319318
4495	NC_008340	GC	3	6	183661	183666	0 %	0 %	50 %	50 %	114319318
4496	NC_008340	CGC	2	6	183692	183697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319318
4497	NC_008340	GCA	2	6	183701	183706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319318
4498	NC_008340	CAG	2	6	183717	183722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319318
4499	NC_008340	CGGG	2	8	183744	183751	0 %	0 %	75 %	25 %	114319318
4500	NC_008340	CAT	2	6	183804	183809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319318

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