MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 81156

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008340	G	6	6	63890	63895	0 %	0 %	100 %	0 %	114319221
1502	NC_008340	CTG	2	6	63915	63920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1503	NC_008340	GAC	2	6	63969	63974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1504	NC_008340	TCG	2	6	63999	64004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1505	NC_008340	GAG	2	6	64071	64076	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319221
1506	NC_008340	GCC	2	6	64092	64097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319221
1507	NC_008340	GCGG	2	8	64133	64140	0 %	0 %	75 %	25 %	114319221
1508	NC_008340	TGCC	2	8	64249	64256	0 %	25 %	25 %	50 %	114319221
1509	NC_008340	TGGA	2	8	64261	64268	25 %	25 %	50 %	0 %	114319221
1510	NC_008340	GGC	2	6	64297	64302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319221
1511	NC_008340	GTG	2	6	64309	64314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319221
1512	NC_008340	AGC	2	6	64333	64338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1513	NC_008340	GGCC	2	8	64379	64386	0 %	0 %	50 %	50 %	114319221
1514	NC_008340	CGG	2	6	64410	64415	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319221
1515	NC_008340	GGA	2	6	64427	64432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319221
1516	NC_008340	CTT	2	6	64442	64447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319221
1517	NC_008340	GCG	2	6	64449	64454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319221
1518	NC_008340	GGC	2	6	64455	64460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319221
1519	NC_008340	CTT	2	6	64472	64477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319221
1520	NC_008340	CGA	2	6	64502	64507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1521	NC_008340	CTG	2	6	64518	64523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1522	NC_008340	GCT	2	6	64544	64549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1523	NC_008340	GCGG	2	8	64577	64584	0 %	0 %	75 %	25 %	114319221
1524	NC_008340	GCT	2	6	64619	64624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1525	NC_008340	GCG	2	6	64670	64675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319221
1526	NC_008340	C	6	6	64723	64728	0 %	0 %	0 %	100 %	114319221
1527	NC_008340	CGC	2	6	64813	64818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319221
1528	NC_008340	CCA	2	6	64829	64834	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319221
1529	NC_008340	GCCTGG	2	12	64839	64850	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	114319221
1530	NC_008340	CGA	2	6	64862	64867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319221
1531	NC_008340	GTG	2	6	64875	64880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319221
1532	NC_008340	CGGAC	2	10	64951	64960	20 %	0 %	40 %	40 %	114319221
1533	NC_008340	TGCC	2	8	65002	65009	0 %	25 %	25 %	50 %	114319221
1534	NC_008340	CGG	2	6	65030	65035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319221
1535	NC_008340	CGG	2	6	65070	65075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_008340	GGT	2	6	65169	65174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_008340	GCTG	2	8	65227	65234	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_008340	GAAG	2	8	65270	65277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_008340	AGG	2	6	65409	65414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319222
1540	NC_008340	GCT	2	6	65521	65526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319222
1541	NC_008340	GCC	2	6	65540	65545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319222
1542	NC_008340	TGC	2	6	65553	65558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319222
1543	NC_008340	GGT	2	6	65563	65568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319222
1544	NC_008340	CAC	3	9	65617	65625	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319222
1545	NC_008340	CCA	2	6	65637	65642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319222
1546	NC_008340	CGA	2	6	65773	65778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319222
1547	NC_008340	GCC	2	6	65894	65899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319223
1548	NC_008340	ACCG	2	8	65946	65953	25 %	0 %	25 %	50 %	114319223
1549	NC_008340	C	6	6	66023	66028	0 %	0 %	0 %	100 %	114319223
1550	NC_008340	CCTG	2	8	66083	66090	0 %	25 %	25 %	50 %	114319223
1551	NC_008340	GCG	2	6	66134	66139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319223
1552	NC_008340	TGG	2	6	66146	66151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319223
1553	NC_008340	TCT	2	6	66259	66264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_008340	TCC	2	6	66348	66353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319224
1555	NC_008340	TCG	2	6	66444	66449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319224
1556	NC_008340	ATG	2	6	66495	66500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319224
1557	NC_008340	GAT	2	6	66521	66526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319224
1558	NC_008340	TGT	2	6	66534	66539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	114319224
1559	NC_008340	ACA	2	6	66565	66570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	114319224
1560	NC_008340	GGA	2	6	66589	66594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319224
1561	NC_008340	TTC	2	6	66693	66698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	114319224
1562	NC_008340	ACT	2	6	66784	66789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319224
1563	NC_008340	TGA	2	6	66799	66804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319224
1564	NC_008340	CAG	2	6	66851	66856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319224
1565	NC_008340	CGC	3	9	66985	66993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1566	NC_008340	AGCCC	2	10	67092	67101	20 %	0 %	20 %	60 %	114319225
1567	NC_008340	CCG	2	6	67126	67131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319225
1568	NC_008340	CTG	2	6	67157	67162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319225
1569	NC_008340	CGGCG	2	10	67170	67179	0 %	0 %	60 %	40 %	114319225
1570	NC_008340	GAT	2	6	67274	67279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	114319225
1571	NC_008340	GCCG	2	8	67295	67302	0 %	0 %	50 %	50 %	114319225
1572	NC_008340	CGA	2	6	67354	67359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319225
1573	NC_008340	CGGTC	2	10	67360	67369	0 %	20 %	40 %	40 %	114319225
1574	NC_008340	TGGAGG	2	12	67449	67460	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	114319225
1575	NC_008340	GGT	2	6	67465	67470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319225
1576	NC_008340	TGC	2	6	67509	67514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319225
1577	NC_008340	GTC	2	6	67700	67705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319225
1578	NC_008340	GGC	2	6	67710	67715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319225
1579	NC_008340	GGA	2	6	67729	67734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319225
1580	NC_008340	GTGGAC	2	12	67739	67750	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	114319225
1581	NC_008340	CGG	2	6	67756	67761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319225
1582	NC_008340	CCGGC	2	10	67809	67818	0 %	0 %	40 %	60 %	114319225
1583	NC_008340	GC	3	6	67887	67892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1584	NC_008340	GCA	2	6	67915	67920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319226
1585	NC_008340	CGA	2	6	67945	67950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319226
1586	NC_008340	GCC	2	6	67958	67963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319226
1587	NC_008340	GC	3	6	68037	68042	0 %	0 %	50 %	50 %	114319226
1588	NC_008340	CGG	2	6	68043	68048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319226
1589	NC_008340	GC	3	6	68101	68106	0 %	0 %	50 %	50 %	114319226
1590	NC_008340	CTG	2	6	68120	68125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319226
1591	NC_008340	GC	3	6	68188	68193	0 %	0 %	50 %	50 %	114319226
1592	NC_008340	CGGTG	2	10	68203	68212	0 %	20 %	60 %	20 %	114319226
1593	NC_008340	GCT	4	12	68266	68277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319226
1594	NC_008340	CTGC	2	8	68314	68321	0 %	25 %	25 %	50 %	114319226
1595	NC_008340	GGA	2	6	68323	68328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319226
1596	NC_008340	CGA	2	6	68329	68334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319226
1597	NC_008340	TCA	2	6	68358	68363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319226
1598	NC_008340	AGC	2	6	68400	68405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319226
1599	NC_008340	CGG	2	6	68445	68450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319226
1600	NC_008340	G	6	6	68475	68480	0 %	0 %	100 %	0 %	114319226
1601	NC_008340	GGC	2	6	68584	68589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319226
1602	NC_008340	CCG	3	9	68593	68601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319226
1603	NC_008340	GAC	2	6	68633	68638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319227
1604	NC_008340	CT	3	6	68678	68683	0 %	50 %	0 %	50 %	114319227
1605	NC_008340	CCA	2	6	68725	68730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319227
1606	NC_008340	CCG	2	6	68785	68790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319227
1607	NC_008340	CGC	3	9	68794	68802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319227
1608	NC_008340	GCC	2	6	68889	68894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319227
1609	NC_008340	CGG	2	6	68907	68912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319227
1610	NC_008340	C	6	6	68925	68930	0 %	0 %	0 %	100 %	114319227
1611	NC_008340	CGA	2	6	68965	68970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319227
1612	NC_008340	GCC	2	6	68972	68977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	114319227
1613	NC_008340	GGA	2	6	68998	69003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	114319227
1614	NC_008340	CTC	2	6	69049	69054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319227
1615	NC_008340	TGG	2	6	69117	69122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319227
1616	NC_008340	GGT	2	6	69124	69129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	114319227
1617	NC_008340	CGG	2	6	69149	69154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319227
1618	NC_008340	CTGG	2	8	69193	69200	0 %	25 %	50 %	25 %	114319227
1619	NC_008340	CGG	2	6	69234	69239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319227
1620	NC_008340	GCG	2	6	69255	69260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319227
1621	NC_008340	TC	3	6	69265	69270	0 %	50 %	0 %	50 %	114319227
1622	NC_008340	CG	3	6	69271	69276	0 %	0 %	50 %	50 %	114319227
1623	NC_008340	CGGC	2	8	69322	69329	0 %	0 %	50 %	50 %	114319227
1624	NC_008340	TGC	2	6	69345	69350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319227
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1956	NC_008340	AAGG	2	8	82396	82403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1984	NC_008340	ATC	2	6	83229	83234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319240
1985	NC_008340	CGG	2	6	83253	83258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	114319240
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1987	NC_008340	GCT	2	6	83320	83325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	114319240
1988	NC_008340	GGATGG	2	12	83398	83409	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	114319240
1989	NC_008340	CAG	2	6	83459	83464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319240
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1991	NC_008340	CCA	2	6	83516	83521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319240
1992	NC_008340	TCA	2	6	83587	83592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	114319240
1993	NC_008340	CAC	2	6	83594	83599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319240
1994	NC_008340	GCA	2	6	83632	83637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319240
1995	NC_008340	CAC	2	6	83660	83665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319240
1996	NC_008340	CCA	2	6	83680	83685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319240
1997	NC_008340	CAG	2	6	83732	83737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319240
1998	NC_008340	CAC	2	6	83738	83743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	114319240
1999	NC_008340	CCT	2	6	83805	83810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	114319241
2000	NC_008340	AGC	2	6	83885	83890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	114319241

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