MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alcanivorax borkumensis SK2 chromosome

Total Repeats: 61368

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008260	CCGG	2	8	275528	275535	0 %	0 %	50 %	50 %	110833115
5502	NC_008260	GC	3	6	275586	275591	0 %	0 %	50 %	50 %	110833115
5503	NC_008260	GTTG	2	8	275672	275679	0 %	50 %	50 %	0 %	110833115
5504	NC_008260	GGCA	2	8	275718	275725	25 %	0 %	50 %	25 %	110833115
5505	NC_008260	TTGGTG	2	12	275752	275763	0 %	50 %	50 %	0 %	110833115
5506	NC_008260	GTTGA	2	10	275812	275821	20 %	40 %	40 %	0 %	110833115
5507	NC_008260	GCG	2	6	275854	275859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_008260	CA	3	6	275878	275883	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_008260	C	6	6	275921	275926	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5510	NC_008260	ACC	2	6	275975	275980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	110833117
5511	NC_008260	ACCTCC	2	12	276020	276031	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	110833117
5512	NC_008260	GGA	2	6	276085	276090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	110833117
5513	NC_008260	TGG	2	6	276102	276107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110833117
5514	NC_008260	GTC	2	6	276115	276120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110833117
5515	NC_008260	TGG	2	6	276122	276127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110833117
5516	NC_008260	GCG	2	6	276128	276133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110833117
5517	NC_008260	CGG	2	6	276228	276233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110833117
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5519	NC_008260	GTG	2	6	276468	276473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110833117
5520	NC_008260	CGG	2	6	276534	276539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110833117
5521	NC_008260	CGG	2	6	276622	276627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110833117
5522	NC_008260	GC	4	8	276664	276671	0 %	0 %	50 %	50 %	110833117
5523	NC_008260	TG	3	6	276672	276677	0 %	50 %	50 %	0 %	110833117
5524	NC_008260	TGC	2	6	276690	276695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110833117
5525	NC_008260	TGA	2	6	276703	276708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833117
5526	NC_008260	TTTG	2	8	276780	276787	0 %	75 %	25 %	0 %	110833117
5527	NC_008260	CGG	2	6	276802	276807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110833117
5528	NC_008260	GGCG	2	8	276871	276878	0 %	0 %	75 %	25 %	110833117
5529	NC_008260	GCA	2	6	276967	276972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833117
5530	NC_008260	AGCTC	2	10	276991	277000	20 %	20 %	20 %	40 %	110833117
5531	NC_008260	TTG	2	6	277119	277124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110833117
5532	NC_008260	GT	3	6	277131	277136	0 %	50 %	50 %	0 %	110833117
5533	NC_008260	CAT	2	6	277165	277170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110833117
5534	NC_008260	GCC	2	6	277171	277176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110833117
5535	NC_008260	GAT	2	6	277193	277198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833117
5536	NC_008260	T	7	7	277284	277290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_008260	GTG	2	6	277338	277343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5538	NC_008260	CGA	2	6	277477	277482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_008260	CGG	2	6	277483	277488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_008260	GTG	2	6	277525	277530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_008260	CGAA	2	8	277732	277739	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5542	NC_008260	ATT	2	6	277883	277888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	110833118
5543	NC_008260	ACTGG	2	10	277954	277963	20 %	20 %	40 %	20 %	110833118
5544	NC_008260	A	6	6	278032	278037	100 %	0 %	0 %	0 %	110833118
5545	NC_008260	CCG	2	6	278102	278107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110833118
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5549	NC_008260	AG	3	6	278366	278371	50 %	0 %	50 %	0 %	110833119
5550	NC_008260	CTGGAT	2	12	278373	278384	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	110833119
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5553	NC_008260	GCA	2	6	278750	278755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833119
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5555	NC_008260	AAG	2	6	278773	278778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110833119
5556	NC_008260	ATG	2	6	278787	278792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833119
5557	NC_008260	AAGG	2	8	278793	278800	50 %	0 %	50 %	0 %	110833119
5558	NC_008260	GTC	2	6	278814	278819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110833119
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5562	NC_008260	TCA	2	6	278958	278963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_008260	TGA	2	6	278990	278995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_008260	AG	3	6	279039	279044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_008260	GC	3	6	279067	279072	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5566	NC_008260	T	6	6	279075	279080	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_008260	CGG	2	6	279090	279095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_008260	AT	3	6	279174	279179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_008260	TG	3	6	279190	279195	0 %	50 %	50 %	0 %	110833120
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5578	NC_008260	TTC	2	6	279765	279770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_008260	TGG	2	6	279803	279808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_008260	A	6	6	279857	279862	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5581	NC_008260	GC	3	6	279952	279957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5582	NC_008260	GTT	2	6	279972	279977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	110833121
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5584	NC_008260	GCGG	2	8	280094	280101	0 %	0 %	75 %	25 %	110833121
5585	NC_008260	CGA	2	6	280198	280203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833121
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5592	NC_008260	AG	4	8	280364	280371	50 %	0 %	50 %	0 %	110833121
5593	NC_008260	CTA	2	6	280390	280395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	110833121
5594	NC_008260	GT	3	6	280422	280427	0 %	50 %	50 %	0 %	110833121
5595	NC_008260	GGCCA	2	10	280443	280452	20 %	0 %	40 %	40 %	110833121
5596	NC_008260	AAGA	2	8	280476	280483	75 %	0 %	25 %	0 %	110833121
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5612	NC_008260	CGA	2	6	281118	281123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833123
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5616	NC_008260	CGG	2	6	281295	281300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	110833123
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5623	NC_008260	GAC	2	6	281579	281584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833123
5624	NC_008260	GGC	2	6	281588	281593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_008260	TCG	2	6	281599	281604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5626	NC_008260	GCG	2	6	281630	281635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_008260	GCA	2	6	281639	281644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5628	NC_008260	GCG	2	6	281781	281786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_008260	GC	3	6	281881	281886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5630	NC_008260	AGC	2	6	281911	281916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5749	NC_008260	GAT	2	6	287982	287987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833127
5750	NC_008260	TGA	2	6	288131	288136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	110833127
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5752	NC_008260	GCA	2	6	288182	288187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833127
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5758	NC_008260	TCG	2	6	288550	288555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	110833127
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5763	NC_008260	TTC	2	6	288705	288710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110833127
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5837	NC_008260	T	7	7	292786	292792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5838	NC_008260	TCCGC	2	10	292858	292867	0 %	20 %	20 %	60 %	110833130
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5842	NC_008260	GCAG	2	8	292976	292983	25 %	0 %	50 %	25 %	110833130
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5859	NC_008260	TGG	2	6	294068	294073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	110833130
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5861	NC_008260	TCA	2	6	294194	294199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5862	NC_008260	TGA	3	9	294235	294243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5863	NC_008260	CCTT	2	8	294244	294251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5864	NC_008260	CCT	2	6	294259	294264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5865	NC_008260	TACC	2	8	294305	294312	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5866	NC_008260	AGTC	2	8	294360	294367	25 %	25 %	25 %	25 %	110833131
5867	NC_008260	TCT	2	6	294485	294490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	110833131
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5993	NC_008260	ACG	2	6	300880	300885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	110833136
5994	NC_008260	GAA	2	6	300889	300894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	110833136
5995	NC_008260	GCC	3	9	300931	300939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	110833136
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