MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Anaplasma phagocytophilum HZ

Total Repeats: 953

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007797	GAAAA	2	10	128	137	80 %	0 %	20 %	0 %	88607943
2	NC_007797	ACAGC	2	10	2108	2117	40 %	0 %	20 %	40 %	88607943
3	NC_007797	TATGG	2	10	2192	2201	20 %	40 %	40 %	0 %	88607943
4	NC_007797	AGAGA	2	10	2949	2958	60 %	0 %	40 %	0 %	88607073
5	NC_007797	TGATG	2	10	2999	3008	20 %	40 %	40 %	0 %	88607073
6	NC_007797	ACAGA	2	10	3960	3969	60 %	0 %	20 %	20 %	88607911
7	NC_007797	GTAGT	2	10	4355	4364	20 %	40 %	40 %	0 %	88607911
8	NC_007797	TCGTA	2	10	6909	6918	20 %	40 %	20 %	20 %	88607386
9	NC_007797	TAAGT	2	10	9148	9157	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_007797	CATAG	2	10	10976	10985	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_007797	TGGGA	2	10	12163	12172	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007797	TATCT	2	10	12392	12401	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_007797	GAGTT	2	10	13569	13578	20 %	40 %	40 %	0 %	88606787
14	NC_007797	TGCGA	2	10	14759	14768	20 %	20 %	40 %	20 %	88606787
15	NC_007797	TTGTA	2	10	16249	16258	20 %	60 %	20 %	0 %	88606746
16	NC_007797	AAAGC	2	10	18840	18849	60 %	0 %	20 %	20 %	88607040
17	NC_007797	CTTCT	2	10	20220	20229	0 %	60 %	0 %	40 %	88607724
18	NC_007797	TGTAA	2	10	20354	20363	40 %	40 %	20 %	0 %	88607724
19	NC_007797	AAAAT	2	10	20879	20888	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_007797	ACAAT	2	10	21549	21558	60 %	20 %	0 %	20 %	88607215
21	NC_007797	TTCTT	2	10	22300	22309	0 %	80 %	0 %	20 %	88607432
22	NC_007797	TTATT	2	10	23332	23341	20 %	80 %	0 %	0 %	161486833
23	NC_007797	TGATG	2	10	25621	25630	20 %	40 %	40 %	0 %	88606918
24	NC_007797	ACAAT	2	10	25929	25938	60 %	20 %	0 %	20 %	88607776
25	NC_007797	GCAAC	2	10	32550	32559	40 %	0 %	20 %	40 %	88607522
26	NC_007797	AAATA	2	10	34291	34300	80 %	20 %	0 %	0 %	88607630
27	NC_007797	AACTC	2	10	35527	35536	40 %	20 %	0 %	40 %	88607103
28	NC_007797	GTTTT	2	10	35557	35566	0 %	80 %	20 %	0 %	88607103
29	NC_007797	CTGAC	2	10	35643	35652	20 %	20 %	20 %	40 %	88607103
30	NC_007797	TAGGT	2	10	37043	37052	20 %	40 %	40 %	0 %	88607245
31	NC_007797	CTGTT	2	10	39389	39398	0 %	60 %	20 %	20 %	88607511
32	NC_007797	AAAGC	2	10	42138	42147	60 %	0 %	20 %	20 %	88606722
33	NC_007797	TTTCC	2	10	42698	42707	0 %	60 %	0 %	40 %	88606722
34	NC_007797	AATAC	2	10	42904	42913	60 %	20 %	0 %	20 %	88606722
35	NC_007797	CTTCA	2	10	43747	43756	20 %	40 %	0 %	40 %	88606722
36	NC_007797	CTTTT	2	10	44687	44696	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_007797	GCTTG	2	10	45406	45415	0 %	40 %	40 %	20 %	88607852
38	NC_007797	TAGGA	2	10	46805	46814	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_007797	AAGTG	2	10	47898	47907	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_007797	TATGA	2	10	48372	48381	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_007797	TTGCA	2	10	53520	53529	20 %	40 %	20 %	20 %	88606817
42	NC_007797	TTCTA	2	10	55429	55438	20 %	60 %	0 %	20 %	88606817
43	NC_007797	AAATT	2	10	56213	56222	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_007797	ATCAA	2	10	56886	56895	60 %	20 %	0 %	20 %	88607541
45	NC_007797	ATGGC	2	10	57143	57152	20 %	20 %	40 %	20 %	88607541
46	NC_007797	TACTA	2	10	57236	57245	40 %	40 %	0 %	20 %	88607541
47	NC_007797	ATTAG	2	10	59129	59138	40 %	40 %	20 %	0 %	88607541
48	NC_007797	AACCC	2	10	62589	62598	40 %	0 %	0 %	60 %	88607830
49	NC_007797	CATAC	2	10	63522	63531	40 %	20 %	0 %	40 %	88607830
50	NC_007797	TTCCT	2	10	68894	68903	0 %	60 %	0 %	40 %	88607026
51	NC_007797	GGCGC	2	10	70189	70198	0 %	0 %	60 %	40 %	88606901
52	NC_007797	ACTTC	2	10	72176	72185	20 %	40 %	0 %	40 %	88606942
53	NC_007797	CAGCT	2	10	73154	73163	20 %	20 %	20 %	40 %	88606942
54	NC_007797	GCTGC	2	10	73371	73380	0 %	20 %	40 %	40 %	88606942
55	NC_007797	GGAAA	2	10	73452	73461	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_007797	CTACA	2	10	73969	73978	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
57	NC_007797	TTTAG	2	10	75174	75183	20 %	60 %	20 %	0 %	88606778
58	NC_007797	TTGTA	2	10	77451	77460	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_007797	AGGAA	2	10	78705	78714	60 %	0 %	40 %	0 %	88607257
60	NC_007797	GCAAG	2	10	78916	78925	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_007797	GGGTA	2	10	79572	79581	20 %	20 %	60 %	0 %	88607805
62	NC_007797	GGCAG	2	10	80395	80404	20 %	0 %	60 %	20 %	88607805
63	NC_007797	CCCTA	2	10	80880	80889	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
64	NC_007797	GAAGC	2	10	81136	81145	40 %	0 %	40 %	20 %	88606731
65	NC_007797	TCATT	2	10	82071	82080	20 %	60 %	0 %	20 %	88606731
66	NC_007797	ATCTT	2	10	83807	83816	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_007797	ACATA	2	10	85837	85846	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_007797	CCGTA	2	10	86468	86477	20 %	20 %	20 %	40 %	88607651
69	NC_007797	TTTTG	2	10	87341	87350	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_007797	TCTCG	2	10	87643	87652	0 %	40 %	20 %	40 %	88607434
71	NC_007797	AACGC	2	10	88913	88922	40 %	0 %	20 %	40 %	88607297
72	NC_007797	CCGTA	2	10	91415	91424	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_007797	AGATT	2	10	92568	92577	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_007797	ATTTT	2	10	92873	92882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_007797	TGGTA	2	10	93418	93427	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_007797	TTCTA	2	10	93932	93941	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_007797	GTACT	2	10	94423	94432	20 %	40 %	20 %	20 %	88606915
78	NC_007797	CTTCG	2	10	96813	96822	0 %	40 %	20 %	40 %	88607693
79	NC_007797	AATAA	2	10	97402	97411	80 %	20 %	0 %	0 %	88607899
80	NC_007797	GATGC	2	10	98880	98889	20 %	20 %	40 %	20 %	88607175
81	NC_007797	GAGAG	2	10	99716	99725	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_007797	AAATA	2	10	102688	102697	80 %	20 %	0 %	0 %	88606982
83	NC_007797	GAGGC	2	10	103094	103103	20 %	0 %	60 %	20 %	88607835
84	NC_007797	AGTAT	2	10	104876	104885	40 %	40 %	20 %	0 %	88607349
85	NC_007797	CAGAT	2	10	107318	107327	40 %	20 %	20 %	20 %	88607735
86	NC_007797	TGTCA	2	10	107670	107679	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_007797	TTTAG	2	10	107966	107975	20 %	60 %	20 %	0 %	88607011
88	NC_007797	TTTTC	2	10	108359	108368	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_007797	GTATT	2	10	109307	109316	20 %	60 %	20 %	0 %	88607568
90	NC_007797	ATGGA	2	10	109493	109502	40 %	20 %	40 %	0 %	88607568
91	NC_007797	GGTGC	2	10	111323	111332	0 %	20 %	60 %	20 %	88607738
92	NC_007797	TTGTT	2	10	112196	112205	0 %	80 %	20 %	0 %	88607738
93	NC_007797	TTTTG	2	10	114729	114738	0 %	80 %	20 %	0 %	88606992
94	NC_007797	TGTGT	2	10	117597	117606	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_007797	ATTGC	2	10	119063	119072	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_007797	GTAGG	2	10	121176	121185	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_007797	TGTTT	2	10	121402	121411	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_007797	ATTGC	2	10	121840	121849	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_007797	CAATC	2	10	122676	122685	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_007797	GTCTA	2	10	123199	123208	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_007797	ATAGT	2	10	126745	126754	40 %	40 %	20 %	0 %	88607472
102	NC_007797	CTCAA	2	10	126882	126891	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_007797	TTGCG	2	10	128425	128434	0 %	40 %	40 %	20 %	88607924
104	NC_007797	CCTAC	2	10	130308	130317	20 %	20 %	0 %	60 %	88607760
105	NC_007797	TACTG	2	10	134830	134839	20 %	40 %	20 %	20 %	88607023
106	NC_007797	CTCAT	2	10	137594	137603	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
107	NC_007797	CACAG	2	10	137764	137773	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_007797	GTATG	2	10	139417	139426	20 %	40 %	40 %	0 %	88607475
109	NC_007797	TCTTT	2	10	139766	139775	0 %	80 %	0 %	20 %	88607475
110	NC_007797	GTTGT	2	10	140301	140310	0 %	60 %	40 %	0 %	88607475
111	NC_007797	ACTAC	2	10	142115	142124	40 %	20 %	0 %	40 %	88607542
112	NC_007797	ATGAG	2	10	145623	145632	40 %	20 %	40 %	0 %	88607544
113	NC_007797	AGCCA	2	10	145808	145817	40 %	0 %	20 %	40 %	88607544
114	NC_007797	ATTCT	2	10	150002	150011	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_007797	GCATT	2	10	153011	153020	20 %	40 %	20 %	20 %	88607214
116	NC_007797	TTGCT	2	10	155066	155075	0 %	60 %	20 %	20 %	88606855
117	NC_007797	TTAGG	2	10	156839	156848	20 %	40 %	40 %	0 %	88607134
118	NC_007797	TTGCT	2	10	157205	157214	0 %	60 %	20 %	20 %	88607283
119	NC_007797	GCATT	2	10	157950	157959	20 %	40 %	20 %	20 %	88607286
120	NC_007797	TTGTT	2	10	159628	159637	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_007797	AGTTA	2	10	159787	159796	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_007797	TGAAG	2	10	161529	161538	40 %	20 %	40 %	0 %	88607253
123	NC_007797	GTTAT	2	10	162567	162576	20 %	60 %	20 %	0 %	88607430
124	NC_007797	TGAAG	2	10	164307	164316	40 %	20 %	40 %	0 %	88607039
125	NC_007797	ATGTT	2	10	166162	166171	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_007797	AGTGT	2	10	167243	167252	20 %	40 %	40 %	0 %	88607041
127	NC_007797	GTTGC	2	10	167701	167710	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_007797	AAGAT	2	10	168740	168749	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_007797	TAGAA	2	10	172200	172209	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_007797	ATTGT	2	10	172609	172618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_007797	GAACA	2	10	179914	179923	60 %	0 %	20 %	20 %	88607058
132	NC_007797	AACAA	2	10	182406	182415	80 %	0 %	0 %	20 %	88606904
133	NC_007797	GCAGA	2	10	182478	182487	40 %	0 %	40 %	20 %	88606904
134	NC_007797	GCAAA	2	10	182531	182540	60 %	0 %	20 %	20 %	88606904
135	NC_007797	ATAGC	2	10	187251	187260	40 %	20 %	20 %	20 %	88607114
136	NC_007797	TGTTT	2	10	191513	191522	0 %	80 %	20 %	0 %	88607881
137	NC_007797	TGCAA	2	10	191665	191674	40 %	20 %	20 %	20 %	88606696
138	NC_007797	GAGGT	2	10	192294	192303	20 %	20 %	60 %	0 %	88607889
139	NC_007797	GGTAC	2	10	192705	192714	20 %	20 %	40 %	20 %	88607889
140	NC_007797	TGAGG	2	10	195225	195234	20 %	20 %	60 %	0 %	88607673
141	NC_007797	ACAAA	2	10	196920	196929	80 %	0 %	0 %	20 %	88606741
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272	NC_007797	CAATA	2	10	410237	410246	60 %	20 %	0 %	20 %	88606909
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