MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anabaena variabilis ATCC 29413 chromosome

Total Repeats: 127738

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_007413	T	6	6	151251	151256	0 %	100 %	0 %	0 %	75906338
3002	NC_007413	CTT	2	6	151298	151303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75906338
3003	NC_007413	ACA	2	6	151378	151383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75906338
3004	NC_007413	AGG	2	6	151392	151397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	75906338
3005	NC_007413	TTA	2	6	151408	151413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75906338
3006	NC_007413	CAT	2	6	151457	151462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906338
3007	NC_007413	AAT	2	6	151487	151492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906338
3008	NC_007413	AT	3	6	151496	151501	50 %	50 %	0 %	0 %	75906338
3009	NC_007413	GC	3	6	151538	151543	0 %	0 %	50 %	50 %	75906338
3010	NC_007413	ATTC	2	8	151625	151632	25 %	50 %	0 %	25 %	75906338
3011	NC_007413	AT	3	6	151644	151649	50 %	50 %	0 %	0 %	75906338
3012	NC_007413	GATT	2	8	151749	151756	25 %	50 %	25 %	0 %	75906338
3013	NC_007413	TC	3	6	151800	151805	0 %	50 %	0 %	50 %	75906338
3014	NC_007413	TTC	2	6	151849	151854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75906338
3015	NC_007413	ATT	2	6	151878	151883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_007413	AACT	2	8	151927	151934	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3017	NC_007413	TAT	2	6	151985	151990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3018	NC_007413	T	6	6	151990	151995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_007413	CGA	2	6	152020	152025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_007413	TTA	3	9	152324	152332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75906339
3021	NC_007413	ATT	2	6	152407	152412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	75906339
3022	NC_007413	ACT	2	6	152426	152431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906339
3023	NC_007413	ATC	2	6	152503	152508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906339
3024	NC_007413	CTG	2	6	152553	152558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906339
3025	NC_007413	CCA	2	6	152561	152566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	75906339
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3027	NC_007413	ATA	2	6	152615	152620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	75906339
3028	NC_007413	ATTTAA	2	12	152656	152667	50 %	50 %	0 %	0 %	75906339
3029	NC_007413	GAA	2	6	152817	152822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906339
3030	NC_007413	AAC	2	6	152836	152841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75906339
3031	NC_007413	CTA	2	6	152861	152866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906339
3032	NC_007413	AGT	2	6	152912	152917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906339
3033	NC_007413	A	6	6	153008	153013	100 %	0 %	0 %	0 %	75906339
3034	NC_007413	CAG	2	6	153138	153143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_007413	CAAAAT	2	12	153158	153169	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3036	NC_007413	TTA	2	6	153264	153269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_007413	ACT	2	6	153270	153275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_007413	ATC	2	6	153335	153340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3039	NC_007413	AGC	2	6	153373	153378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3040	NC_007413	ATT	2	6	153396	153401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_007413	GGCTT	2	10	153402	153411	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3042	NC_007413	AGC	2	6	153462	153467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_007413	ATT	2	6	153470	153475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_007413	AAT	2	6	153489	153494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_007413	A	7	7	153546	153552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_007413	CTGT	2	8	153556	153563	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3047	NC_007413	AAT	2	6	153588	153593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_007413	CAG	2	6	153777	153782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75906340
3049	NC_007413	CAT	2	6	153783	153788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906340
3050	NC_007413	AGCT	2	8	153874	153881	25 %	25 %	25 %	25 %	75906340
3051	NC_007413	GTGCT	2	10	153919	153928	0 %	40 %	40 %	20 %	75906340
3052	NC_007413	TAC	2	6	153940	153945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906340
3053	NC_007413	CAA	2	6	153963	153968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	75906340
3054	NC_007413	AGA	2	6	153987	153992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906340
3055	NC_007413	ATCA	2	8	154030	154037	50 %	25 %	0 %	25 %	75906340
3056	NC_007413	TG	3	6	154039	154044	0 %	50 %	50 %	0 %	75906340
3057	NC_007413	ATC	2	6	154048	154053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906340
3058	NC_007413	CTG	2	6	154089	154094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906340
3059	NC_007413	TGA	2	6	154101	154106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906340
3060	NC_007413	TGA	2	6	154276	154281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_007413	A	7	7	154306	154312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_007413	GTTA	2	8	154363	154370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_007413	TTGT	2	8	154371	154378	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_007413	CAG	2	6	154441	154446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	75906341
3065	NC_007413	T	6	6	154592	154597	0 %	100 %	0 %	0 %	75906341
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3067	NC_007413	T	6	6	154620	154625	0 %	100 %	0 %	0 %	75906341
3068	NC_007413	GGT	2	6	154681	154686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906341
3069	NC_007413	TTG	2	6	154693	154698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	75906341
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3071	NC_007413	TAG	2	6	154814	154819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906341
3072	NC_007413	TGG	3	9	154824	154832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	75906341
3073	NC_007413	TGA	2	6	154905	154910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	75906341
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3089	NC_007413	GAA	2	6	155651	155656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906341
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3093	NC_007413	GT	3	6	155854	155859	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_007413	TGA	2	6	155937	155942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_007413	A	6	6	155959	155964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_007413	GCGTC	2	10	156045	156054	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3097	NC_007413	AATTG	2	10	156082	156091	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_007413	TTTA	2	8	156106	156113	25 %	75 %	0 %	0 %	75906342
3099	NC_007413	T	6	6	156141	156146	0 %	100 %	0 %	0 %	75906342
3100	NC_007413	CAT	2	6	156185	156190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906342
3101	NC_007413	TC	3	6	156213	156218	0 %	50 %	0 %	50 %	75906342
3102	NC_007413	T	6	6	156274	156279	0 %	100 %	0 %	0 %	75906342
3103	NC_007413	TTC	2	6	156297	156302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	75906342
3104	NC_007413	TGA	2	6	156376	156381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_007413	AT	3	6	156445	156450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_007413	AGG	2	6	156454	156459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_007413	GAAAA	2	10	156481	156490	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_007413	TAA	2	6	156502	156507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_007413	CTG	2	6	156633	156638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906343
3110	NC_007413	ACT	2	6	156680	156685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	75906343
3111	NC_007413	TA	3	6	156761	156766	50 %	50 %	0 %	0 %	75906343
3112	NC_007413	AAG	2	6	156816	156821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	75906343
3113	NC_007413	GTC	2	6	156960	156965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	75906343
3114	NC_007413	TGT	2	6	157063	157068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_007413	A	6	6	157104	157109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_007413	CAAT	2	8	157167	157174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3117	NC_007413	TCTA	2	8	157232	157239	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3118	NC_007413	TCA	2	6	157252	157257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3119	NC_007413	TCT	2	6	157365	157370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_007413	CAT	2	6	157371	157376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3121	NC_007413	TTG	2	6	157382	157387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_007413	A	7	7	157397	157403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3123	NC_007413	CAG	2	6	157552	157557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_007413	TTA	2	6	157562	157567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3125	NC_007413	T	6	6	157597	157602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_007413	A	6	6	157890	157895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3128	NC_007413	AT	3	6	158006	158011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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