MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Azoarcus sp. EbN1 plasmid 2

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006824	TACGG	2	10	2700	2709	20 %	20 %	40 %	20 %	58616424
2	NC_006824	GCGCA	2	10	3674	3683	20 %	0 %	40 %	40 %	58616425
3	NC_006824	TGCAT	2	10	3817	3826	20 %	40 %	20 %	20 %	58616425
4	NC_006824	GGCGC	2	10	6239	6248	0 %	0 %	60 %	40 %	58616427
5	NC_006824	GCCCG	2	10	6640	6649	0 %	0 %	40 %	60 %	58616427
6	NC_006824	GGCCT	2	10	7592	7601	0 %	20 %	40 %	40 %	58616428
7	NC_006824	GCGCG	2	10	8485	8494	0 %	0 %	60 %	40 %	58616428
8	NC_006824	CGGCC	2	10	9159	9168	0 %	0 %	40 %	60 %	58616429
9	NC_006824	TGAAG	2	10	9652	9661	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006824	CCGCG	2	10	10081	10090	0 %	0 %	40 %	60 %	58616430
11	NC_006824	AAGGC	2	10	12419	12428	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_006824	CCGGT	2	10	13852	13861	0 %	20 %	40 %	40 %	58616434
13	NC_006824	CGCAA	2	10	14903	14912	40 %	0 %	20 %	40 %	58616436
14	NC_006824	TCGCA	2	10	18215	18224	20 %	20 %	20 %	40 %	58616438
15	NC_006824	CGCTG	2	10	18789	18798	0 %	20 %	40 %	40 %	58616439
16	NC_006824	CCCGA	2	10	19474	19483	20 %	0 %	20 %	60 %	58616440
17	NC_006824	GCAGG	2	10	19896	19905	20 %	0 %	60 %	20 %	58616440
18	NC_006824	CACAG	2	10	20408	20417	40 %	0 %	20 %	40 %	58616440
19	NC_006824	GGCTG	2	10	21711	21720	0 %	20 %	60 %	20 %	58616443
20	NC_006824	GCAAG	2	10	22817	22826	40 %	0 %	40 %	20 %	58616443
21	NC_006824	GGCAC	2	10	22968	22977	20 %	0 %	40 %	40 %	58616443
22	NC_006824	ATCGC	2	10	23023	23032	20 %	20 %	20 %	40 %	58616443
23	NC_006824	ATCGA	2	10	23103	23112	40 %	20 %	20 %	20 %	58616443
24	NC_006824	CGAGG	2	10	23449	23458	20 %	0 %	60 %	20 %	58616444
25	NC_006824	CGGTG	2	10	24647	24656	0 %	20 %	60 %	20 %	58616446
26	NC_006824	CCGCA	2	10	25337	25346	20 %	0 %	20 %	60 %	58616447
27	NC_006824	GGCAA	2	10	27604	27613	40 %	0 %	40 %	20 %	58616448
28	NC_006824	GCTCA	2	10	27951	27960	20 %	20 %	20 %	40 %	58616449
29	NC_006824	CGACC	2	10	29666	29675	20 %	0 %	20 %	60 %	58616449
30	NC_006824	GGTTC	2	10	30388	30397	0 %	40 %	40 %	20 %	58616450
31	NC_006824	CGATC	2	10	34100	34109	20 %	20 %	20 %	40 %	58616452
32	NC_006824	CGGCG	2	10	36864	36873	0 %	0 %	60 %	40 %	58616455
33	NC_006824	GCAGC	2	10	37934	37943	20 %	0 %	40 %	40 %	58616456
34	NC_006824	GCACG	2	10	38008	38017	20 %	0 %	40 %	40 %	58616456
35	NC_006824	GGCGA	2	10	38581	38590	20 %	0 %	60 %	20 %	58616457
36	NC_006824	CGCAG	2	10	41024	41033	20 %	0 %	40 %	40 %	58616459
37	NC_006824	ACACA	2	10	44707	44716	60 %	0 %	0 %	40 %	58616461
38	NC_006824	CGGCC	2	10	45011	45020	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_006824	GCCGC	2	10	45023	45032	0 %	0 %	40 %	60 %	58616462
40	NC_006824	CGATG	2	10	45938	45947	20 %	20 %	40 %	20 %	58616462
41	NC_006824	CGTCA	2	10	51172	51181	20 %	20 %	20 %	40 %	58616466
42	NC_006824	GTCGG	2	10	51267	51276	0 %	20 %	60 %	20 %	58616467
43	NC_006824	GCATC	2	10	54825	54834	20 %	20 %	20 %	40 %	58616469
44	NC_006824	CCTTC	2	10	55770	55779	0 %	40 %	0 %	60 %	58616470
45	NC_006824	TCGCC	2	10	58110	58119	0 %	20 %	20 %	60 %	58616472
46	NC_006824	ACCAC	2	10	58226	58235	40 %	0 %	0 %	60 %	58616472
47	NC_006824	ACGAA	2	10	58931	58940	60 %	0 %	20 %	20 %	58616473
48	NC_006824	GAGCA	2	10	59041	59050	40 %	0 %	40 %	20 %	58616473
49	NC_006824	AGGGA	2	10	59258	59267	40 %	0 %	60 %	0 %	58616474
50	NC_006824	TCGGG	2	10	60413	60422	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_006824	GGCGG	2	10	61636	61645	0 %	0 %	80 %	20 %	58616477
52	NC_006824	TCGAC	2	10	66245	66254	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_006824	CCGTG	2	10	70721	70730	0 %	20 %	40 %	40 %	58616484
54	NC_006824	CCCGG	2	10	75639	75648	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_006824	CGGGC	2	10	76564	76573	0 %	0 %	60 %	40 %	58616489
56	NC_006824	GCCGC	2	10	77759	77768	0 %	0 %	40 %	60 %	58616490
57	NC_006824	CGTGC	2	10	80847	80856	0 %	20 %	40 %	40 %	58616492
58	NC_006824	GCGCG	2	10	82313	82322	0 %	0 %	60 %	40 %	58616493
59	NC_006824	CGGGG	2	10	83221	83230	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
60	NC_006824	GCGGG	2	10	83605	83614	0 %	0 %	80 %	20 %	58616495
61	NC_006824	GCCCT	2	10	85346	85355	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_006824	GCTGC	2	10	86840	86849	0 %	20 %	40 %	40 %	58616497
63	NC_006824	CTTGC	2	10	88067	88076	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_006824	AGTCC	2	10	94600	94609	20 %	20 %	20 %	40 %	58616506
65	NC_006824	CGCGC	2	10	97264	97273	0 %	0 %	40 %	60 %	58616508
66	NC_006824	GGTCG	2	10	98861	98870	0 %	20 %	60 %	20 %	58616510
67	NC_006824	TCGCT	2	10	98961	98970	0 %	40 %	20 %	40 %	58616510
68	NC_006824	GATGC	2	10	99875	99884	20 %	20 %	40 %	20 %	58616511
69	NC_006824	TCCGC	2	10	104397	104406	0 %	20 %	20 %	60 %	58616514
70	NC_006824	CCGGG	2	10	105266	105275	0 %	0 %	60 %	40 %	58616516
71	NC_006824	GCGCT	2	10	106430	106439	0 %	20 %	40 %	40 %	58616517
72	NC_006824	TGCCG	2	10	107456	107465	0 %	20 %	40 %	40 %	58616518
73	NC_006824	TGCGC	2	10	107478	107487	0 %	20 %	40 %	40 %	58616518
74	NC_006824	CCGCG	2	10	109988	109997	0 %	0 %	40 %	60 %	58616520
75	NC_006824	GGCAC	2	10	112299	112308	20 %	0 %	40 %	40 %	58616520
76	NC_006824	TGGAC	2	10	114678	114687	20 %	20 %	40 %	20 %	58616521
77	NC_006824	TGATC	2	10	114852	114861	20 %	40 %	20 %	20 %	58616521
78	NC_006824	CTCAC	2	10	116705	116714	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_006824	ATCGC	2	10	117124	117133	20 %	20 %	20 %	40 %	58616523
80	NC_006824	TTCTT	2	10	117753	117762	0 %	80 %	0 %	20 %	58616524
81	NC_006824	CACGC	2	10	120584	120593	20 %	0 %	20 %	60 %	58616524
82	NC_006824	GATGC	2	10	122800	122809	20 %	20 %	40 %	20 %	58616525
83	NC_006824	GCGCG	2	10	122847	122856	0 %	0 %	60 %	40 %	58616525
84	NC_006824	GATGC	2	10	123232	123241	20 %	20 %	40 %	20 %	58616526
85	NC_006824	GAACC	2	10	125223	125232	40 %	0 %	20 %	40 %	58616527
86	NC_006824	GCATC	2	10	128970	128979	20 %	20 %	20 %	40 %	58616529
87	NC_006824	AGCAG	2	10	129652	129661	40 %	0 %	40 %	20 %	58616530
88	NC_006824	GCGCA	2	10	131542	131551	20 %	0 %	40 %	40 %	58616532
89	NC_006824	ACGGC	2	10	131563	131572	20 %	0 %	40 %	40 %	58616532
90	NC_006824	GCGCC	2	10	131580	131589	0 %	0 %	40 %	60 %	58616532
91	NC_006824	CGGCG	2	10	131808	131817	0 %	0 %	60 %	40 %	58616532
92	NC_006824	CGCTG	2	10	133508	133517	0 %	20 %	40 %	40 %	58616534
93	NC_006824	GCCGA	2	10	134821	134830	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
94	NC_006824	GCCTT	2	10	135181	135190	0 %	40 %	20 %	40 %	58616535
95	NC_006824	GCTGC	2	10	137033	137042	0 %	20 %	40 %	40 %	58616537
96	NC_006824	CGCCC	2	10	139764	139773	0 %	0 %	20 %	80 %	58616540
97	NC_006824	CGACC	2	10	139983	139992	20 %	0 %	20 %	60 %	58616540
98	NC_006824	TCGGG	2	10	140925	140934	0 %	20 %	60 %	20 %	58616541
99	NC_006824	CGTTG	2	10	141066	141075	0 %	40 %	40 %	20 %	58616541
100	NC_006824	TGCGG	2	10	141304	141313	0 %	20 %	60 %	20 %	58616541
101	NC_006824	GCCTG	2	10	143064	143073	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_006824	CGGCA	2	10	145354	145363	20 %	0 %	40 %	40 %	58616546
103	NC_006824	CGGTG	2	10	146489	146498	0 %	20 %	60 %	20 %	58616547
104	NC_006824	CCGCG	2	10	149354	149363	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
105	NC_006824	CTGCC	2	10	151651	151660	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
106	NC_006824	CCCTC	3	15	152480	152494	0 %	20 %	0 %	80 %	58616553
107	NC_006824	TGGAC	2	10	154625	154634	20 %	20 %	40 %	20 %	58616555
108	NC_006824	ACTCG	2	10	155494	155503	20 %	20 %	20 %	40 %	58616556
109	NC_006824	CGATC	2	10	156338	156347	20 %	20 %	20 %	40 %	58616556
110	NC_006824	GCTGC	2	10	157340	157349	0 %	20 %	40 %	40 %	58616557
111	NC_006824	GACGC	2	10	158185	158194	20 %	0 %	40 %	40 %	58616558
112	NC_006824	AGTGC	2	10	158884	158893	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_006824	GATGC	2	10	159338	159347	20 %	20 %	40 %	20 %	58616559
114	NC_006824	AGGGG	3	15	160076	160090	20 %	0 %	80 %	0 %	58616559
115	NC_006824	GTTGA	2	10	160094	160103	20 %	40 %	40 %	0 %	58616559
116	NC_006824	TAAGT	2	10	160518	160527	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006824	TCGGG	2	10	160726	160735	0 %	20 %	60 %	20 %	58616560
118	NC_006824	CTGCA	2	10	160770	160779	20 %	20 %	20 %	40 %	58616560
119	NC_006824	CGTCG	2	10	162319	162328	0 %	20 %	40 %	40 %	58616561
120	NC_006824	AGAGA	2	10	162362	162371	60 %	0 %	40 %	0 %	58616561
121	NC_006824	GGTCG	2	10	165563	165572	0 %	20 %	60 %	20 %	58616564
122	NC_006824	GTGCG	2	10	166184	166193	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_006824	CGGCG	2	10	169082	169091	0 %	0 %	60 %	40 %	58616567
124	NC_006824	CGCAT	2	10	171858	171867	20 %	20 %	20 %	40 %	58616569
125	NC_006824	AGCGA	2	10	172773	172782	40 %	0 %	40 %	20 %	58616570
126	NC_006824	CGACC	2	10	172873	172882	20 %	0 %	20 %	60 %	58616570
127	NC_006824	TCTCC	2	10	178444	178453	0 %	40 %	0 %	60 %	58616576
128	NC_006824	CGCCA	2	10	180538	180547	20 %	0 %	20 %	60 %	58616578
129	NC_006824	CGATC	2	10	180603	180612	20 %	20 %	20 %	40 %	58616578
130	NC_006824	CTGAT	2	10	180616	180625	20 %	40 %	20 %	20 %	58616578
131	NC_006824	TGCGG	2	10	181019	181028	0 %	20 %	60 %	20 %	58616579
132	NC_006824	CGCGG	2	10	182510	182519	0 %	0 %	60 %	40 %	58616581
133	NC_006824	GCCTT	2	10	184807	184816	0 %	40 %	20 %	40 %	58616582
134	NC_006824	TCGCC	2	10	184979	184988	0 %	20 %	20 %	60 %	58616582
135	NC_006824	TGCCA	2	10	187262	187271	20 %	20 %	20 %	40 %	58616585
136	NC_006824	CTTGG	2	10	187655	187664	0 %	40 %	40 %	20 %	58616585
137	NC_006824	AGCCG	2	10	187718	187727	20 %	0 %	40 %	40 %	58616585
138	NC_006824	CATCA	2	10	190679	190688	40 %	20 %	0 %	40 %	58616588
139	NC_006824	GCAGA	2	10	192483	192492	40 %	0 %	40 %	20 %	58616590
140	NC_006824	CGCAG	2	10	193695	193704	20 %	0 %	40 %	40 %	58616590
141	NC_006824	ATTAT	2	10	194760	194769	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006824	GTGCC	2	10	195210	195219	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
143	NC_006824	TCGGC	2	10	195753	195762	0 %	20 %	40 %	40 %	58616592
144	NC_006824	CGGCG	2	10	199073	199082	0 %	0 %	60 %	40 %	58616596
145	NC_006824	TGCTT	2	10	201156	201165	0 %	60 %	20 %	20 %	58616597
146	NC_006824	GCAGC	2	10	201524	201533	20 %	0 %	40 %	40 %	58616598
147	NC_006824	TGCGT	2	10	203147	203156	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_006824	CGCGG	2	10	204263	204272	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
149	NC_006824	TCAGC	2	10	206757	206766	20 %	20 %	20 %	40 %	58616602
150	NC_006824	AGCGC	2	10	209427	209436	20 %	0 %	40 %	40 %	58616605
151	NC_006824	TGAGC	2	10	210525	210534	20 %	20 %	40 %	20 %	58616605
152	NC_006824	CACCT	2	10	212900	212909	20 %	20 %	0 %	60 %	58616608
153	NC_006824	GGCTG	2	10	213636	213645	0 %	20 %	60 %	20 %	58616608
154	NC_006824	CAAGG	2	10	214168	214177	40 %	0 %	40 %	20 %	58616610
155	NC_006824	GCCGC	2	10	214256	214265	0 %	0 %	40 %	60 %	58616610
156	NC_006824	ATGGC	2	10	216982	216991	20 %	20 %	40 %	20 %	58616611
157	NC_006824	AAAAT	2	10	217524	217533	80 %	20 %	0 %	0 %	58616612
158	NC_006824	GGCAC	2	10	217539	217548	20 %	0 %	40 %	40 %	58616612
159	NC_006824	GGCCT	2	10	218970	218979	0 %	20 %	40 %	40 %	58616612
160	NC_006824	TTGAA	2	10	221027	221036	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_006824	CCATC	2	10	221731	221740	20 %	20 %	0 %	60 %	58616615
162	NC_006824	ACCGG	2	10	223029	223038	20 %	0 %	40 %	40 %	58616616
163	NC_006824	GGCCG	2	10	223214	223223	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
164	NC_006824	GTCCG	2	10	223396	223405	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
165	NC_006824	GGGAG	2	10	223570	223579	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.