MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Azoarcus sp. EbN1 plasmid 1

Total Repeats: 97

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006823	TTTGCG	2	12	949	960	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	58616152
2	NC_006823	CGGAGT	2	12	1263	1274	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	58616152
3	NC_006823	GCGCTC	2	12	2291	2302	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	58616153
4	NC_006823	GGCCTG	2	12	2378	2389	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	58616153
5	NC_006823	CGCCAC	2	12	2489	2500	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	58616153
6	NC_006823	GCGAGC	2	12	2529	2540	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58616153
7	NC_006823	CGGGCG	2	12	2846	2857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_006823	AATGTG	2	12	5778	5789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	58616157
9	NC_006823	CATCGG	2	12	8868	8879	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_006823	CGATGT	2	12	11258	11269	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58616163
11	NC_006823	TGGCCG	2	12	11521	11532	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	58616163
12	NC_006823	CCAACG	2	12	16970	16981	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	58616172
13	NC_006823	CGCCTG	2	12	17771	17782	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	58616173
14	NC_006823	GACCAA	2	12	17834	17845	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	58616173
15	NC_006823	GCAGGC	2	12	18301	18312	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58616174
16	NC_006823	CTCTAC	2	12	23537	23548	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_006823	TCCACG	2	12	25116	25127	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	58616181
18	NC_006823	AGGATC	2	12	25238	25249	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_006823	CATGAT	2	12	28564	28575	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	58616185
20	NC_006823	CAAGAT	2	12	30351	30362	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	58616189
21	NC_006823	GTAGGC	2	12	30646	30657	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	58616190
22	NC_006823	CTGCGC	2	12	32321	32332	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	58616191
23	NC_006823	ACGAAA	2	12	33451	33462	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	58616192
24	NC_006823	CTTCGA	2	12	33581	33592	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58616192
25	NC_006823	GCCGAA	2	12	37094	37105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58616196
26	NC_006823	CTTGGC	2	12	37536	37547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616197
27	NC_006823	GCCTGA	2	12	38840	38851	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	58616198
28	NC_006823	CGAACC	2	12	39849	39860	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	58616199
29	NC_006823	TCGAAC	2	12	41287	41298	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_006823	CACACG	2	12	43521	43532	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	58616204
31	NC_006823	TCATCT	2	12	43591	43602	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	58616204
32	NC_006823	CGAAAA	2	12	44692	44703	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	58616207
33	NC_006823	TTGCTG	2	12	48004	48015	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	58616210
34	NC_006823	CTTATC	2	12	49486	49497	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	58616212
35	NC_006823	CCAGAT	2	12	49643	49654	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	58616212
36	NC_006823	GGTTAT	2	12	52239	52250	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	58616214
37	NC_006823	ATTTTC	2	12	54919	54930	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	58616218
38	NC_006823	GTGATG	2	12	55519	55530	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	58616219
39	NC_006823	AAAGAT	2	12	57682	57693	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	58616223
40	NC_006823	GAGCTT	2	12	58102	58113	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58616223
41	NC_006823	CAAGGA	2	12	62656	62667	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	58616229
42	NC_006823	CCTGAT	2	12	62945	62956	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58616230
43	NC_006823	TCGATC	2	12	66017	66028	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58616234
44	NC_006823	GCGCTC	2	12	66277	66288	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	58616234
45	NC_006823	GCAGGC	2	12	66627	66638	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58616234
46	NC_006823	TAAAAA	2	12	71782	71793	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006823	CGCTGT	2	12	72881	72892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616243
48	NC_006823	CTGGAA	2	12	78434	78445	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	58616247
49	NC_006823	CGTCAT	2	12	80376	80387	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58616248
50	NC_006823	GGAGGG	2	12	81930	81941	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	58616249
51	NC_006823	ATTGCG	2	12	87110	87121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58616256
52	NC_006823	ACGTAG	2	12	88443	88454	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	58616258
53	NC_006823	TCTTGT	2	12	91296	91307	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	58616262
54	NC_006823	AGCTCA	2	12	91926	91937	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	58616263
55	NC_006823	GAAAGG	2	12	92601	92612	50 %	0 %	50 %	0 %	58616263
56	NC_006823	GGCCGC	2	12	107433	107444	0 %	0 %	50 %	50 %	58616281
57	NC_006823	TTCCGC	2	12	110194	110205	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	58616285
58	NC_006823	ATCAGT	2	12	111485	111496	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	58616287
59	NC_006823	CAAAGT	2	12	121059	121070	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	58616304
60	NC_006823	CATTTC	2	12	127136	127147	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	58616319
61	NC_006823	GAAGTG	2	12	135164	135175	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	58616332
62	NC_006823	TTGAGC	2	12	140368	140379	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58616340
63	NC_006823	GACACA	2	12	140999	141010	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	58616341
64	NC_006823	GAGATG	2	12	141291	141302	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	58616342
65	NC_006823	CGAAGC	2	12	141320	141331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	58616342
66	NC_006823	TTCCGC	2	12	144584	144595	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	58616347
67	NC_006823	CGCGTG	2	12	146265	146276	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	58616350
68	NC_006823	TCGATC	2	12	148656	148667	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58616354
69	NC_006823	GCGCTC	2	12	148916	148927	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	58616354
70	NC_006823	GCAGGC	2	12	149266	149277	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	58616354
71	NC_006823	CGTTCT	2	12	150452	150463	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	58616355
72	NC_006823	CGATGA	2	12	151624	151635	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	58616357
73	NC_006823	CTGATC	2	12	153085	153096	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006823	GGCCTT	2	12	153836	153847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616361
75	NC_006823	CCTTGT	2	12	153868	153879	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	58616361
76	NC_006823	TCGAGC	2	12	154163	154174	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	58616362
77	NC_006823	TCGCGA	2	12	155335	155346	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	58616363
78	NC_006823	TTCGAG	2	12	157489	157500	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58616364
79	NC_006823	TTCTGC	2	12	157841	157852	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	58616364
80	NC_006823	ATCGTG	2	12	158875	158886	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58616364
81	NC_006823	CGTTGA	2	12	159471	159482	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58616364
82	NC_006823	CGCCCT	2	12	160532	160543	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	58616366
83	NC_006823	TGTCGC	2	12	162998	163009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	58616366
84	NC_006823	ATGACG	2	12	164324	164335	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	58616370
85	NC_006823	TCGTGT	2	12	164538	164549	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	58616370
86	NC_006823	GATCGA	2	12	167918	167929	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	58616373
87	NC_006823	GATCCG	2	12	168625	168636	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	58616374
88	NC_006823	CATCGC	2	12	171538	171549	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	58616377
89	NC_006823	TGCCCT	2	12	172017	172028	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	58616378
90	NC_006823	CGGTCA	2	12	176767	176778	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	58616384
91	NC_006823	TGCGGC	2	12	177798	177809	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	58616385
92	NC_006823	CTATGC	2	12	178592	178603	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	58616386
93	NC_006823	GATCGC	2	12	188032	188043	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	58616400
94	NC_006823	ATCCAG	2	12	197259	197270	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	58616411
95	NC_006823	TCACCC	2	12	198898	198909	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	58616413
96	NC_006823	ACCGCC	2	12	204018	204029	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	58616418
97	NC_006823	TTGAGC	2	12	204200	204211	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	58616418

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.