MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 24012

< Previous12...37383940414243444546474849Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_004842	A	6	6	1078650	1078655	100 %	0 %	0 %	0 %	56417210
21503	NC_004842	TAG	2	6	1078661	1078666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417210
21504	NC_004842	TAA	2	6	1078677	1078682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417210
21505	NC_004842	TC	3	6	1078703	1078708	0 %	50 %	0 %	50 %	56417210
21506	NC_004842	CTT	2	6	1078803	1078808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417210
21507	NC_004842	A	6	6	1078825	1078830	100 %	0 %	0 %	0 %	56417210
21508	NC_004842	CA	3	6	1078926	1078931	50 %	0 %	0 %	50 %	56417210
21509	NC_004842	AATG	2	8	1078944	1078951	50 %	25 %	25 %	0 %	56417210
21510	NC_004842	CG	3	6	1078955	1078960	0 %	0 %	50 %	50 %	56417210
21511	NC_004842	CTT	2	6	1079002	1079007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417210
21512	NC_004842	TCTG	2	8	1079028	1079035	0 %	50 %	25 %	25 %	56417210
21513	NC_004842	GCAT	2	8	1079124	1079131	25 %	25 %	25 %	25 %	56417210
21514	NC_004842	TGT	2	6	1079141	1079146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417210
21515	NC_004842	CTA	2	6	1079162	1079167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417210
21516	NC_004842	GC	3	6	1079212	1079217	0 %	0 %	50 %	50 %	56417210
21517	NC_004842	TAT	2	6	1079236	1079241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56417210
21518	NC_004842	AAT	2	6	1079254	1079259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417210
21519	NC_004842	CGA	2	6	1079270	1079275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417210
21520	NC_004842	TC	3	6	1079276	1079281	0 %	50 %	0 %	50 %	56417210
21521	NC_004842	ATC	2	6	1079293	1079298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417210
21522	NC_004842	CAG	2	6	1079304	1079309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417210
21523	NC_004842	CGG	2	6	1079367	1079372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417210
21524	NC_004842	TAT	2	6	1079373	1079378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56417210
21525	NC_004842	ACC	2	6	1079401	1079406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417210
21526	NC_004842	TTG	2	6	1079412	1079417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417210
21527	NC_004842	TCC	2	6	1079528	1079533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56417210
21528	NC_004842	TAC	2	6	1079664	1079669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21529	NC_004842	ACGTT	2	10	1079675	1079684	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21530	NC_004842	ACC	2	6	1079722	1079727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21531	NC_004842	TAG	2	6	1079750	1079755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417211
21532	NC_004842	TACG	2	8	1079776	1079783	25 %	25 %	25 %	25 %	56417211
21533	NC_004842	TCAC	2	8	1079804	1079811	25 %	25 %	0 %	50 %	56417211
21534	NC_004842	CGCA	2	8	1079817	1079824	25 %	0 %	25 %	50 %	56417211
21535	NC_004842	GC	3	6	1079871	1079876	0 %	0 %	50 %	50 %	56417211
21536	NC_004842	TGA	2	6	1079898	1079903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417211
21537	NC_004842	ATG	2	6	1079933	1079938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417211
21538	NC_004842	TCAC	2	8	1079942	1079949	25 %	25 %	0 %	50 %	56417211
21539	NC_004842	GCC	2	6	1080009	1080014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56417211
21540	NC_004842	T	7	7	1080042	1080048	0 %	100 %	0 %	0 %	56417211
21541	NC_004842	TTC	2	6	1080242	1080247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417211
21542	NC_004842	CTG	2	6	1080253	1080258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417211
21543	NC_004842	CGG	2	6	1080297	1080302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417211
21544	NC_004842	TGA	2	6	1080309	1080314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417211
21545	NC_004842	C	6	6	1080381	1080386	0 %	0 %	0 %	100 %	56417211
21546	NC_004842	A	6	6	1080481	1080486	100 %	0 %	0 %	0 %	56417212
21547	NC_004842	AAC	2	6	1080530	1080535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417212
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21550	NC_004842	AAT	2	6	1080580	1080585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417212
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21552	NC_004842	TA	3	6	1080689	1080694	50 %	50 %	0 %	0 %	56417212
21553	NC_004842	CCA	2	6	1080738	1080743	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417212
21554	NC_004842	A	6	6	1080753	1080758	100 %	0 %	0 %	0 %	56417212
21555	NC_004842	TCTGT	2	10	1080862	1080871	0 %	60 %	20 %	20 %	56417212
21556	NC_004842	GCA	2	6	1080894	1080899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417212
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21558	NC_004842	TGC	2	6	1080995	1081000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417212
21559	NC_004842	C	6	6	1081011	1081016	0 %	0 %	0 %	100 %	56417212
21560	NC_004842	GCA	2	6	1081030	1081035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417212
21561	NC_004842	GC	3	6	1081039	1081044	0 %	0 %	50 %	50 %	56417212
21562	NC_004842	CAA	2	6	1081069	1081074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417212
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21564	NC_004842	A	6	6	1081100	1081105	100 %	0 %	0 %	0 %	56417212
21565	NC_004842	GCT	2	6	1081113	1081118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417212
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21567	NC_004842	G	6	6	1081134	1081139	0 %	0 %	100 %	0 %	56417212
21568	NC_004842	CAAC	2	8	1081195	1081202	50 %	0 %	0 %	50 %	56417212
21569	NC_004842	CAG	2	6	1081222	1081227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417212
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21571	NC_004842	ACT	2	6	1081293	1081298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417213
21572	NC_004842	ACCA	2	8	1081331	1081338	50 %	0 %	0 %	50 %	56417213
21573	NC_004842	TTGG	2	8	1081410	1081417	0 %	50 %	50 %	0 %	56417213
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21578	NC_004842	TGA	2	6	1081660	1081665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417213
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21580	NC_004842	CAG	2	6	1081840	1081845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417213
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21582	NC_004842	AAC	2	6	1081907	1081912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417213
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21586	NC_004842	CAAC	3	12	1081981	1081992	50 %	0 %	0 %	50 %	56417213
21587	NC_004842	CAAA	2	8	1082051	1082058	75 %	0 %	0 %	25 %	56417213
21588	NC_004842	TAA	2	6	1082078	1082083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21589	NC_004842	GCC	2	6	1082122	1082127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21590	NC_004842	CTT	2	6	1082225	1082230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417214
21591	NC_004842	TCA	2	6	1082231	1082236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417214
21592	NC_004842	TCG	2	6	1082284	1082289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417214
21593	NC_004842	ATT	2	6	1082302	1082307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56417214
21594	NC_004842	TTA	2	6	1082323	1082328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56417214
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21596	NC_004842	T	6	6	1082346	1082351	0 %	100 %	0 %	0 %	56417214
21597	NC_004842	AAC	2	6	1082352	1082357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417214
21598	NC_004842	TG	3	6	1082418	1082423	0 %	50 %	50 %	0 %	56417214
21599	NC_004842	CTGG	2	8	1082562	1082569	0 %	25 %	50 %	25 %	56417214
21600	NC_004842	AAT	2	6	1082795	1082800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417214
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21602	NC_004842	CAGTAG	2	12	1082915	1082926	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56417214
21603	NC_004842	GT	3	6	1082944	1082949	0 %	50 %	50 %	0 %	56417214
21604	NC_004842	GCC	2	6	1083020	1083025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56417214
21605	NC_004842	GCA	2	6	1083061	1083066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417214
21606	NC_004842	TTC	2	6	1083115	1083120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417214
21607	NC_004842	CTG	3	9	1083124	1083132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417214
21608	NC_004842	CAAA	2	8	1083146	1083153	75 %	0 %	0 %	25 %	56417214
21609	NC_004842	AT	3	6	1083207	1083212	50 %	50 %	0 %	0 %	56417214
21610	NC_004842	AGCG	2	8	1083223	1083230	25 %	0 %	50 %	25 %	56417214
21611	NC_004842	GTA	2	6	1083339	1083344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417214
21612	NC_004842	GTTT	2	8	1083371	1083378	0 %	75 %	25 %	0 %	56417214
21613	NC_004842	AACAT	2	10	1083505	1083514	60 %	20 %	0 %	20 %	56417214
21614	NC_004842	CAT	2	6	1083560	1083565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417214
21615	NC_004842	GCAA	2	8	1083718	1083725	50 %	0 %	25 %	25 %	56417214
21616	NC_004842	C	6	6	1083796	1083801	0 %	0 %	0 %	100 %	56417214
21617	NC_004842	AG	3	6	1083820	1083825	50 %	0 %	50 %	0 %	56417214
21618	NC_004842	AG	3	6	1083856	1083861	50 %	0 %	50 %	0 %	56417214
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21620	NC_004842	T	6	6	1083912	1083917	0 %	100 %	0 %	0 %	56417214
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21623	NC_004842	TGT	2	6	1084130	1084135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417214
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21737	NC_004842	TCCCC	2	10	1089700	1089709	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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21982	NC_004842	AAT	2	6	1100860	1100865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417230
21983	NC_004842	CTT	2	6	1100879	1100884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417230
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