MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 24012

< Previous12...3233343536373839404142...4849Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_004842	CAA	2	6	903729	903734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417064
18002	NC_004842	CG	3	6	903780	903785	0 %	0 %	50 %	50 %	56417064
18003	NC_004842	TAC	2	6	903863	903868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18004	NC_004842	ATTG	2	8	903923	903930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18005	NC_004842	GGTA	2	8	903952	903959	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18006	NC_004842	TCA	2	6	903989	903994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18007	NC_004842	GTG	2	6	903999	904004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18008	NC_004842	ACC	2	6	904057	904062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417065
18009	NC_004842	CAGG	2	8	904074	904081	25 %	0 %	50 %	25 %	56417065
18010	NC_004842	AAT	2	6	904131	904136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417065
18011	NC_004842	AAG	2	6	904150	904155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417065
18012	NC_004842	TCA	2	6	904181	904186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417065
18013	NC_004842	TTTG	2	8	904221	904228	0 %	75 %	25 %	0 %	56417065
18014	NC_004842	AAGCT	2	10	904238	904247	40 %	20 %	20 %	20 %	56417065
18015	NC_004842	ATG	2	6	904336	904341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417065
18016	NC_004842	CGG	2	6	904377	904382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417065
18017	NC_004842	AAT	2	6	904561	904566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417065
18018	NC_004842	TGA	2	6	904591	904596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417065
18019	NC_004842	AGA	3	9	904712	904720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417066
18020	NC_004842	AG	3	6	904758	904763	50 %	0 %	50 %	0 %	56417066
18021	NC_004842	A	6	6	904796	904801	100 %	0 %	0 %	0 %	56417066
18022	NC_004842	GGC	2	6	904831	904836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56417066
18023	NC_004842	ATC	2	6	904869	904874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417066
18024	NC_004842	TGA	2	6	904888	904893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417066
18025	NC_004842	CGT	2	6	904929	904934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417066
18026	NC_004842	CATT	2	8	904957	904964	25 %	50 %	0 %	25 %	56417066
18027	NC_004842	CGGG	2	8	905003	905010	0 %	0 %	75 %	25 %	56417066
18028	NC_004842	AAT	2	6	905021	905026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417066
18029	NC_004842	GGT	2	6	905078	905083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417066
18030	NC_004842	TGG	2	6	905131	905136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417066
18031	NC_004842	GAA	2	6	905151	905156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417066
18032	NC_004842	A	6	6	905314	905319	100 %	0 %	0 %	0 %	56417066
18033	NC_004842	G	6	6	905324	905329	0 %	0 %	100 %	0 %	56417066
18034	NC_004842	TTG	2	6	905382	905387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417066
18035	NC_004842	GAA	2	6	905391	905396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417066
18036	NC_004842	CGA	2	6	905411	905416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417066
18037	NC_004842	AGATA	2	10	905417	905426	60 %	20 %	20 %	0 %	56417066
18038	NC_004842	GCAA	2	8	905448	905455	50 %	0 %	25 %	25 %	56417066
18039	NC_004842	CGC	2	6	905492	905497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56417066
18040	NC_004842	AGGG	2	8	905526	905533	25 %	0 %	75 %	0 %	56417066
18041	NC_004842	ACT	2	6	905555	905560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417066
18042	NC_004842	ACT	2	6	905598	905603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417066
18043	NC_004842	GTT	2	6	905612	905617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417066
18044	NC_004842	GAC	2	6	905718	905723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417066
18045	NC_004842	AGG	2	6	905883	905888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417066
18046	NC_004842	ATGA	2	8	906102	906109	50 %	25 %	25 %	0 %	56417067
18047	NC_004842	GCA	2	6	906154	906159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417067
18048	NC_004842	AGG	2	6	906197	906202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417067
18049	NC_004842	GA	3	6	906293	906298	50 %	0 %	50 %	0 %	56417067
18050	NC_004842	CAAT	2	8	906304	906311	50 %	25 %	0 %	25 %	56417067
18051	NC_004842	GGA	2	6	906350	906355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417067
18052	NC_004842	ACT	2	6	906382	906387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417067
18053	NC_004842	AG	3	6	906423	906428	50 %	0 %	50 %	0 %	56417067
18054	NC_004842	AGG	2	6	906439	906444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417067
18055	NC_004842	AAGG	2	8	906466	906473	50 %	0 %	50 %	0 %	56417067
18056	NC_004842	GTT	2	6	906512	906517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417067
18057	NC_004842	ATAC	2	8	906595	906602	50 %	25 %	0 %	25 %	56417067
18058	NC_004842	ACAG	2	8	906606	906613	50 %	0 %	25 %	25 %	56417067
18059	NC_004842	CAC	2	6	906628	906633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417067
18060	NC_004842	TG	3	6	906799	906804	0 %	50 %	50 %	0 %	56417068
18061	NC_004842	AGC	2	6	906982	906987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417068
18062	NC_004842	TCT	2	6	907018	907023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417068
18063	NC_004842	CTT	2	6	907045	907050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417068
18064	NC_004842	A	6	6	907104	907109	100 %	0 %	0 %	0 %	56417068
18065	NC_004842	AT	3	6	907123	907128	50 %	50 %	0 %	0 %	56417068
18066	NC_004842	CTT	2	6	907169	907174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417068
18067	NC_004842	CAT	2	6	907182	907187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417068
18068	NC_004842	CCA	2	6	907210	907215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417068
18069	NC_004842	CAC	2	6	907304	907309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417068
18070	NC_004842	TCT	2	6	907427	907432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56417068
18071	NC_004842	CCA	2	6	907446	907451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417068
18072	NC_004842	CAG	2	6	907487	907492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417068
18073	NC_004842	AGC	2	6	907631	907636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417068
18074	NC_004842	TATAT	2	10	907657	907666	40 %	60 %	0 %	0 %	56417068
18075	NC_004842	CTTCC	2	10	907773	907782	0 %	40 %	0 %	60 %	56417068
18076	NC_004842	GAA	2	6	907848	907853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417068
18077	NC_004842	TCA	2	6	907936	907941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417068
18078	NC_004842	TTG	2	6	907984	907989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417068
18079	NC_004842	GC	3	6	908020	908025	0 %	0 %	50 %	50 %	56417068
18080	NC_004842	GTG	2	6	908041	908046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417068
18081	NC_004842	TCA	2	6	908110	908115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417068
18082	NC_004842	GCA	2	6	908230	908235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18083	NC_004842	GTG	2	6	908251	908256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18084	NC_004842	GAG	2	6	908273	908278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18085	NC_004842	TA	3	6	908293	908298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18086	NC_004842	ACA	2	6	908351	908356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18087	NC_004842	TTC	2	6	908391	908396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18088	NC_004842	GA	3	6	908415	908420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18089	NC_004842	CAT	2	6	908500	908505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18090	NC_004842	A	6	6	908507	908512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18091	NC_004842	A	6	6	908616	908621	100 %	0 %	0 %	0 %	56417069
18092	NC_004842	TGG	2	6	908711	908716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417069
18093	NC_004842	AGG	2	6	908765	908770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56417069
18094	NC_004842	GTC	2	6	908815	908820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417069
18095	NC_004842	TCC	2	6	908821	908826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56417069
18096	NC_004842	TTGCA	2	10	908858	908867	20 %	40 %	20 %	20 %	56417069
18097	NC_004842	ATG	2	6	908993	908998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417069
18098	NC_004842	GC	3	6	909034	909039	0 %	0 %	50 %	50 %	56417069
18099	NC_004842	CAC	2	6	909042	909047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56417069
18100	NC_004842	TA	3	6	909140	909145	50 %	50 %	0 %	0 %	56417069
18101	NC_004842	ACGTA	2	10	909188	909197	40 %	20 %	20 %	20 %	56417069
18102	NC_004842	TGCGG	2	10	909266	909275	0 %	20 %	60 %	20 %	56417069
18103	NC_004842	AAT	2	6	909360	909365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56417069
18104	NC_004842	CGC	2	6	909435	909440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56417069
18105	NC_004842	AAG	3	9	909533	909541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417069
18106	NC_004842	A	6	6	909548	909553	100 %	0 %	0 %	0 %	56417069
18107	NC_004842	ACA	2	6	909570	909575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417069
18108	NC_004842	ACA	2	6	909581	909586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56417069
18109	NC_004842	TAG	2	6	909635	909640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56417069
18110	NC_004842	CAG	2	6	909672	909677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417069
18111	NC_004842	GTG	2	6	909698	909703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417069
18112	NC_004842	CCT	2	6	909786	909791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56417069
18113	NC_004842	TGC	2	6	909886	909891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56417070
18114	NC_004842	TC	3	6	909925	909930	0 %	50 %	0 %	50 %	56417070
18115	NC_004842	TA	4	8	909936	909943	50 %	50 %	0 %	0 %	56417070
18116	NC_004842	AC	3	6	909944	909949	50 %	0 %	0 %	50 %	56417070
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18119	NC_004842	CAT	2	6	910288	910293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417071
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18122	NC_004842	GAA	2	6	910359	910364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56417071
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18124	NC_004842	TCA	2	6	910482	910487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56417071
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18126	NC_004842	GTG	2	6	910620	910625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56417071
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18213	NC_004842	AGAT	2	8	914808	914815	50 %	25 %	25 %	0 %	56417075
18214	NC_004842	GTT	2	6	914819	914824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56417075
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18240	NC_004842	AAC	2	6	916451	916456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18241	NC_004842	TG	3	6	916505	916510	0 %	50 %	50 %	0 %	56417077
18242	NC_004842	GT	3	6	916511	916516	0 %	50 %	50 %	0 %	56417077
18243	NC_004842	AGC	2	6	916528	916533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56417077
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18367	NC_004842	AC	3	6	923024	923029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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