MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 24012

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_004842	GCA	3	9	283801	283809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416598
5502	NC_004842	ATC	2	6	283839	283844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416598
5503	NC_004842	TCT	2	6	283890	283895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416598
5504	NC_004842	TA	3	6	283963	283968	50 %	50 %	0 %	0 %	56416598
5505	NC_004842	ATG	2	6	284016	284021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416598
5506	NC_004842	A	6	6	284085	284090	100 %	0 %	0 %	0 %	56416598
5507	NC_004842	TAATA	2	10	284115	284124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_004842	CA	3	6	284165	284170	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5509	NC_004842	ACA	2	6	284315	284320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_004842	CTG	2	6	284336	284341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_004842	TGGGCT	2	12	284374	284385	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5512	NC_004842	CTG	2	6	284541	284546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_004842	TTG	2	6	284587	284592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416599
5514	NC_004842	ATCC	2	8	284596	284603	25 %	25 %	0 %	50 %	56416599
5515	NC_004842	CCT	2	6	284605	284610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416599
5516	NC_004842	CTTT	2	8	284617	284624	0 %	75 %	0 %	25 %	56416599
5517	NC_004842	CA	3	6	284634	284639	50 %	0 %	0 %	50 %	56416599
5518	NC_004842	ACG	2	6	284656	284661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416599
5519	NC_004842	ACC	2	6	284677	284682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416599
5520	NC_004842	GAT	2	6	284734	284739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416599
5521	NC_004842	TGT	2	6	284777	284782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416599
5522	NC_004842	TTC	2	6	284803	284808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416599
5523	NC_004842	TAC	2	6	284880	284885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416599
5524	NC_004842	CAT	2	6	284951	284956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416599
5525	NC_004842	CAAG	2	8	284963	284970	50 %	0 %	25 %	25 %	56416599
5526	NC_004842	AT	3	6	285062	285067	50 %	50 %	0 %	0 %	56416599
5527	NC_004842	AGTTG	2	10	285098	285107	20 %	40 %	40 %	0 %	56416599
5528	NC_004842	TGC	2	6	285238	285243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416599
5529	NC_004842	ACA	2	6	285286	285291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416599
5530	NC_004842	CGC	2	6	285293	285298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416599
5531	NC_004842	CACG	2	8	285354	285361	25 %	0 %	25 %	50 %	56416599
5532	NC_004842	TGA	2	6	285392	285397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416599
5533	NC_004842	CCTC	2	8	285410	285417	0 %	25 %	0 %	75 %	56416599
5534	NC_004842	CTT	2	6	285425	285430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416599
5535	NC_004842	AT	4	8	285486	285493	50 %	50 %	0 %	0 %	56416599
5536	NC_004842	CAA	2	6	285505	285510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416599
5537	NC_004842	GCT	2	6	285534	285539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416599
5538	NC_004842	GCG	2	6	285592	285597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416599
5539	NC_004842	ACC	2	6	285598	285603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416599
5540	NC_004842	C	6	6	285616	285621	0 %	0 %	0 %	100 %	56416599
5541	NC_004842	CTTG	2	8	285864	285871	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5542	NC_004842	GAC	2	6	285881	285886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_004842	TCC	2	6	285926	285931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416600
5544	NC_004842	CCA	2	6	285959	285964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416600
5545	NC_004842	TCAA	2	8	286016	286023	50 %	25 %	0 %	25 %	56416600
5546	NC_004842	TAT	2	6	286039	286044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416600
5547	NC_004842	CTT	2	6	286076	286081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416600
5548	NC_004842	TTG	2	6	286097	286102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416600
5549	NC_004842	AC	3	6	286130	286135	50 %	0 %	0 %	50 %	56416600
5550	NC_004842	TAG	2	6	286147	286152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416600
5551	NC_004842	AATT	2	8	286191	286198	50 %	50 %	0 %	0 %	56416600
5552	NC_004842	GCT	2	6	286268	286273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416600
5553	NC_004842	GTA	2	6	286289	286294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416600
5554	NC_004842	CCG	2	6	286353	286358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416600
5555	NC_004842	TGA	2	6	286368	286373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416600
5556	NC_004842	TTA	2	6	286407	286412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416600
5557	NC_004842	GCA	2	6	286494	286499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416600
5558	NC_004842	TGT	2	6	286521	286526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416600
5559	NC_004842	CTC	2	6	286536	286541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416600
5560	NC_004842	TCC	2	6	286604	286609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416600
5561	NC_004842	TGC	2	6	286678	286683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416600
5562	NC_004842	A	6	6	286694	286699	100 %	0 %	0 %	0 %	56416600
5563	NC_004842	AGG	2	6	286858	286863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416600
5564	NC_004842	GAC	2	6	286907	286912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416600
5565	NC_004842	CAAC	2	8	286914	286921	50 %	0 %	0 %	50 %	56416600
5566	NC_004842	CTG	2	6	286958	286963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_004842	GTA	2	6	287012	287017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5568	NC_004842	TGT	2	6	287027	287032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_004842	CG	3	6	287054	287059	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5570	NC_004842	GTT	2	6	287088	287093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5571	NC_004842	GAA	2	6	287360	287365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416601
5572	NC_004842	GATA	2	8	287404	287411	50 %	25 %	25 %	0 %	56416601
5573	NC_004842	A	6	6	287418	287423	100 %	0 %	0 %	0 %	56416601
5574	NC_004842	GGA	2	6	287476	287481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416601
5575	NC_004842	TA	3	6	287575	287580	50 %	50 %	0 %	0 %	56416601
5576	NC_004842	GC	3	6	287616	287621	0 %	0 %	50 %	50 %	56416601
5577	NC_004842	C	7	7	287639	287645	0 %	0 %	0 %	100 %	56416601
5578	NC_004842	CGA	2	6	287700	287705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416601
5579	NC_004842	TA	3	6	287714	287719	50 %	50 %	0 %	0 %	56416601
5580	NC_004842	GTCCCT	2	12	287794	287805	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	56416601
5581	NC_004842	ATG	2	6	287864	287869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416601
5582	NC_004842	GCC	2	6	287885	287890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416601
5583	NC_004842	CCA	2	6	287912	287917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416601
5584	NC_004842	CGC	2	6	287956	287961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416601
5585	NC_004842	GGC	3	9	287971	287979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416601
5586	NC_004842	CACT	2	8	287994	288001	25 %	25 %	0 %	50 %	56416601
5587	NC_004842	TTTC	2	8	288128	288135	0 %	75 %	0 %	25 %	56416601
5588	NC_004842	GCC	2	6	288148	288153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416601
5589	NC_004842	CTG	2	6	288234	288239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416601
5590	NC_004842	ATG	2	6	288254	288259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416601
5591	NC_004842	T	6	6	288272	288277	0 %	100 %	0 %	0 %	56416601
5592	NC_004842	TTC	2	6	288286	288291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416601
5593	NC_004842	CA	3	6	288431	288436	50 %	0 %	0 %	50 %	56416601
5594	NC_004842	AAC	2	6	288518	288523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56416601
5595	NC_004842	TGA	2	6	288581	288586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_004842	CGC	2	6	288603	288608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5597	NC_004842	ATGT	2	8	288648	288655	25 %	50 %	25 %	0 %	56416602
5598	NC_004842	AT	3	6	288662	288667	50 %	50 %	0 %	0 %	56416602
5599	NC_004842	CCT	2	6	288692	288697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416602
5600	NC_004842	TCC	2	6	288724	288729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416602
5601	NC_004842	AGAA	2	8	288798	288805	75 %	0 %	25 %	0 %	56416602
5602	NC_004842	CAC	2	6	288911	288916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416602
5603	NC_004842	AT	3	6	288985	288990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_004842	A	6	6	289004	289009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_004842	CCG	2	6	289054	289059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5606	NC_004842	CTGC	2	8	289130	289137	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5607	NC_004842	CGG	2	6	289155	289160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_004842	GC	3	6	289196	289201	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5609	NC_004842	CCA	2	6	289303	289308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5610	NC_004842	CTC	2	6	289323	289328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5611	NC_004842	A	6	6	289372	289377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_004842	CG	3	6	289464	289469	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5613	NC_004842	GGAC	2	8	289482	289489	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5614	NC_004842	ACGC	2	8	289502	289509	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5615	NC_004842	AGC	2	6	289513	289518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_004842	CCTA	2	8	289572	289579	25 %	25 %	0 %	50 %	56416603
5617	NC_004842	TTC	2	6	289585	289590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416603
5618	NC_004842	AG	3	6	289636	289641	50 %	0 %	50 %	0 %	56416603
5619	NC_004842	CAAC	2	8	289647	289654	50 %	0 %	0 %	50 %	56416603
5620	NC_004842	GCT	2	6	289699	289704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416603
5621	NC_004842	T	6	6	289732	289737	0 %	100 %	0 %	0 %	56416603
5622	NC_004842	CAG	2	6	289743	289748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416603
5623	NC_004842	TCG	2	6	289791	289796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5624	NC_004842	G	6	6	289848	289853	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_004842	T	6	6	289974	289979	0 %	100 %	0 %	0 %	56416604
5626	NC_004842	TGC	2	6	290025	290030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416604
5627	NC_004842	TCCC	2	8	290075	290082	0 %	25 %	0 %	75 %	56416604
5628	NC_004842	ATG	2	6	290087	290092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416604
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5632	NC_004842	GCG	2	6	290203	290208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416604
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5659	NC_004842	CAA	2	6	291668	291673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5662	NC_004842	TAT	2	6	291843	291848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5755	NC_004842	CCCT	2	8	295371	295378	0 %	25 %	0 %	75 %	56416608
5756	NC_004842	TG	4	8	295484	295491	0 %	50 %	50 %	0 %	56416608
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5868	NC_004842	CTG	2	6	301229	301234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416613
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5870	NC_004842	CAT	2	6	301287	301292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416613
5871	NC_004842	CATATA	2	12	301392	301403	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	56416613
5872	NC_004842	CCAAG	2	10	301474	301483	40 %	0 %	20 %	40 %	56416613
5873	NC_004842	CATC	2	8	301569	301576	25 %	25 %	0 %	50 %	56416613
5874	NC_004842	CGT	2	6	301577	301582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416613
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5879	NC_004842	TC	3	6	301690	301695	0 %	50 %	0 %	50 %	56416613
5880	NC_004842	CCT	2	6	301696	301701	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416613
5881	NC_004842	TTG	2	6	301710	301715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416613
5882	NC_004842	TTC	2	6	301930	301935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416613
5883	NC_004842	TCT	2	6	301979	301984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416613
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5901	NC_004842	GACT	2	8	302764	302771	25 %	25 %	25 %	25 %	56416613
5902	NC_004842	GCA	2	6	302984	302989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416613
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5951	NC_004842	GC	3	6	305353	305358	0 %	0 %	50 %	50 %	56416613
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5959	NC_004842	CTG	2	6	305867	305872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416614
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5973	NC_004842	GC	3	6	306281	306286	0 %	0 %	50 %	50 %	56416615
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5985	NC_004842	T	8	8	306652	306659	0 %	100 %	0 %	0 %	56416615
5986	NC_004842	CTTTT	2	10	306716	306725	0 %	80 %	0 %	20 %	56416615
5987	NC_004842	CT	4	8	306734	306741	0 %	50 %	0 %	50 %	56416615
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5998	NC_004842	G	6	6	307308	307313	0 %	0 %	100 %	0 %	56416615
5999	NC_004842	GC	3	6	307408	307413	0 %	0 %	50 %	50 %	56416615
6000	NC_004842	CT	3	6	307419	307424	0 %	50 %	0 %	50 %	56416615

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