MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 431

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003065	AT	3	6	8	13	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003065	GT	4	8	182	189	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003065	TA	3	6	263	268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003065	AT	3	6	274	279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003065	TA	3	6	303	308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003065	GT	3	6	1749	1754	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003065	TA	3	6	2069	2074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003065	CG	3	6	2323	2328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_003065	GA	3	6	2784	2789	50 %	0 %	50 %	0 %	16119814
10	NC_003065	TG	3	6	2818	2823	0 %	50 %	50 %	0 %	16119814
11	NC_003065	TG	3	6	2974	2979	0 %	50 %	50 %	0 %	16119814
12	NC_003065	AT	3	6	3135	3140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003065	TG	3	6	3450	3455	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003065	AG	3	6	3870	3875	50 %	0 %	50 %	0 %	159161953
15	NC_003065	GC	3	6	4586	4591	0 %	0 %	50 %	50 %	159161953
16	NC_003065	GC	3	6	4671	4676	0 %	0 %	50 %	50 %	159161953
17	NC_003065	AG	3	6	5680	5685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003065	GC	3	6	6369	6374	0 %	0 %	50 %	50 %	16119816
19	NC_003065	CA	3	6	8617	8622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_003065	TG	4	8	8666	8673	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003065	AG	3	6	8925	8930	50 %	0 %	50 %	0 %	16119818
22	NC_003065	CT	3	6	10184	10189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_003065	TC	3	6	10817	10822	0 %	50 %	0 %	50 %	16119819
24	NC_003065	AC	3	6	11172	11177	50 %	0 %	0 %	50 %	16119819
25	NC_003065	AT	3	6	11548	11553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003065	TA	3	6	13033	13038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003065	CA	3	6	13542	13547	50 %	0 %	0 %	50 %	16119821
28	NC_003065	CA	3	6	13777	13782	50 %	0 %	0 %	50 %	16119821
29	NC_003065	GT	3	6	14150	14155	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003065	AT	4	8	14325	14332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_003065	CA	3	6	15491	15496	50 %	0 %	0 %	50 %	16119822
32	NC_003065	AT	3	6	17164	17169	50 %	50 %	0 %	0 %	16119823
33	NC_003065	AG	3	6	17592	17597	50 %	0 %	50 %	0 %	16119823
34	NC_003065	GT	3	6	17825	17830	0 %	50 %	50 %	0 %	16119823
35	NC_003065	GT	3	6	21220	21225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_003065	GT	3	6	22472	22477	0 %	50 %	50 %	0 %	159162008
37	NC_003065	CG	4	8	22980	22987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_003065	GC	3	6	23005	23010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_003065	AG	3	6	23569	23574	50 %	0 %	50 %	0 %	16119827
40	NC_003065	TC	3	6	24056	24061	0 %	50 %	0 %	50 %	16119827
41	NC_003065	AT	3	6	24819	24824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003065	CT	3	6	27627	27632	0 %	50 %	0 %	50 %	41223318
43	NC_003065	CG	4	8	28459	28466	0 %	0 %	50 %	50 %	16119831
44	NC_003065	TC	3	6	28728	28733	0 %	50 %	0 %	50 %	16119831
45	NC_003065	GC	3	6	28866	28871	0 %	0 %	50 %	50 %	16119831
46	NC_003065	AT	3	6	29189	29194	50 %	50 %	0 %	0 %	16119831
47	NC_003065	GC	3	6	29618	29623	0 %	0 %	50 %	50 %	16119831
48	NC_003065	CG	3	6	30236	30241	0 %	0 %	50 %	50 %	16119833
49	NC_003065	AC	3	6	30659	30664	50 %	0 %	0 %	50 %	16119833
50	NC_003065	GT	3	6	31210	31215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003065	CG	3	6	32225	32230	0 %	0 %	50 %	50 %	16119834
52	NC_003065	GC	3	6	32457	32462	0 %	0 %	50 %	50 %	16119834
53	NC_003065	TC	3	6	33201	33206	0 %	50 %	0 %	50 %	16119834
54	NC_003065	TC	3	6	33612	33617	0 %	50 %	0 %	50 %	16119834
55	NC_003065	CG	3	6	34416	34421	0 %	0 %	50 %	50 %	16119835
56	NC_003065	CG	3	6	35121	35126	0 %	0 %	50 %	50 %	16119835
57	NC_003065	CG	4	8	35351	35358	0 %	0 %	50 %	50 %	16119835
58	NC_003065	CG	3	6	36522	36527	0 %	0 %	50 %	50 %	16119836
59	NC_003065	GC	3	6	36897	36902	0 %	0 %	50 %	50 %	16119837
60	NC_003065	GA	3	6	37329	37334	50 %	0 %	50 %	0 %	16119837
61	NC_003065	CG	3	6	38910	38915	0 %	0 %	50 %	50 %	41223319
62	NC_003065	GC	3	6	39275	39280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_003065	GC	3	6	39553	39558	0 %	0 %	50 %	50 %	41223320
64	NC_003065	CG	3	6	39653	39658	0 %	0 %	50 %	50 %	41223320
65	NC_003065	CT	3	6	40890	40895	0 %	50 %	0 %	50 %	159161955
66	NC_003065	GC	3	6	41398	41403	0 %	0 %	50 %	50 %	16119842
67	NC_003065	GC	3	6	42489	42494	0 %	0 %	50 %	50 %	16119843
68	NC_003065	TC	3	6	42580	42585	0 %	50 %	0 %	50 %	16119843
69	NC_003065	GC	3	6	42922	42927	0 %	0 %	50 %	50 %	41223322
70	NC_003065	CG	3	6	43749	43754	0 %	0 %	50 %	50 %	41223323
71	NC_003065	AT	3	6	43757	43762	50 %	50 %	0 %	0 %	41223323
72	NC_003065	GC	3	6	44133	44138	0 %	0 %	50 %	50 %	41223323
73	NC_003065	AT	3	6	44569	44574	50 %	50 %	0 %	0 %	16119846
74	NC_003065	GC	3	6	44638	44643	0 %	0 %	50 %	50 %	16119846
75	NC_003065	CG	3	6	44648	44653	0 %	0 %	50 %	50 %	16119846
76	NC_003065	AG	3	6	46567	46572	50 %	0 %	50 %	0 %	16119849
77	NC_003065	CG	3	6	47093	47098	0 %	0 %	50 %	50 %	16119849
78	NC_003065	CG	3	6	47841	47846	0 %	0 %	50 %	50 %	16119850
79	NC_003065	GC	3	6	48114	48119	0 %	0 %	50 %	50 %	16119850
80	NC_003065	GC	4	8	48985	48992	0 %	0 %	50 %	50 %	16119850
81	NC_003065	GC	3	6	49898	49903	0 %	0 %	50 %	50 %	159161956
82	NC_003065	TC	3	6	51523	51528	0 %	50 %	0 %	50 %	16119854
83	NC_003065	CT	3	6	51565	51570	0 %	50 %	0 %	50 %	16119854
84	NC_003065	CG	3	6	51792	51797	0 %	0 %	50 %	50 %	16119854
85	NC_003065	CG	3	6	52123	52128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_003065	AC	3	6	52801	52806	50 %	0 %	0 %	50 %	159161958
87	NC_003065	CG	3	6	52927	52932	0 %	0 %	50 %	50 %	159161958
88	NC_003065	TG	3	6	53044	53049	0 %	50 %	50 %	0 %	159161958
89	NC_003065	GA	3	6	53347	53352	50 %	0 %	50 %	0 %	159161958
90	NC_003065	GC	3	6	54060	54065	0 %	0 %	50 %	50 %	16119856
91	NC_003065	GA	3	6	54081	54086	50 %	0 %	50 %	0 %	16119856
92	NC_003065	CT	3	6	54185	54190	0 %	50 %	0 %	50 %	16119856
93	NC_003065	CA	3	6	54312	54317	50 %	0 %	0 %	50 %	16119856
94	NC_003065	GA	3	6	54589	54594	50 %	0 %	50 %	0 %	16119856
95	NC_003065	CG	3	6	55339	55344	0 %	0 %	50 %	50 %	16119857
96	NC_003065	AG	3	6	55468	55473	50 %	0 %	50 %	0 %	16119857
97	NC_003065	CG	3	6	56331	56336	0 %	0 %	50 %	50 %	159161959
98	NC_003065	TG	3	6	56578	56583	0 %	50 %	50 %	0 %	159161959
99	NC_003065	GC	3	6	56778	56783	0 %	0 %	50 %	50 %	159161959
100	NC_003065	GC	3	6	56874	56879	0 %	0 %	50 %	50 %	159161959
101	NC_003065	GC	3	6	56926	56931	0 %	0 %	50 %	50 %	159161959
102	NC_003065	CG	4	8	57375	57382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_003065	CG	3	6	57528	57533	0 %	0 %	50 %	50 %	16119859
104	NC_003065	CA	3	6	58259	58264	50 %	0 %	0 %	50 %	16119859
105	NC_003065	CG	3	6	58406	58411	0 %	0 %	50 %	50 %	16119859
106	NC_003065	CG	3	6	58626	58631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_003065	CG	3	6	60931	60936	0 %	0 %	50 %	50 %	16119860
108	NC_003065	AG	4	8	61308	61315	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_003065	GC	3	6	62440	62445	0 %	0 %	50 %	50 %	16119861
110	NC_003065	GC	3	6	62910	62915	0 %	0 %	50 %	50 %	16119862
111	NC_003065	GC	3	6	63043	63048	0 %	0 %	50 %	50 %	16119862
112	NC_003065	GT	3	6	64959	64964	0 %	50 %	50 %	0 %	16119864
113	NC_003065	GC	3	6	65152	65157	0 %	0 %	50 %	50 %	16119864
114	NC_003065	GT	3	6	65204	65209	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_003065	GC	3	6	65781	65786	0 %	0 %	50 %	50 %	16119866
116	NC_003065	GC	3	6	65846	65851	0 %	0 %	50 %	50 %	16119866
117	NC_003065	GA	3	6	66086	66091	50 %	0 %	50 %	0 %	16119866
118	NC_003065	AC	3	6	66155	66160	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_003065	GC	3	6	66215	66220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_003065	GC	3	6	66308	66313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_003065	GC	3	6	66706	66711	0 %	0 %	50 %	50 %	41223326
122	NC_003065	GC	3	6	66774	66779	0 %	0 %	50 %	50 %	41223326
123	NC_003065	CT	3	6	68441	68446	0 %	50 %	0 %	50 %	159162006
124	NC_003065	GA	3	6	68792	68797	50 %	0 %	50 %	0 %	159161960
125	NC_003065	TG	3	6	69490	69495	0 %	50 %	50 %	0 %	159161960
126	NC_003065	GC	3	6	69665	69670	0 %	0 %	50 %	50 %	159161960
127	NC_003065	CG	5	10	70171	70180	0 %	0 %	50 %	50 %	16119872
128	NC_003065	CG	3	6	70413	70418	0 %	0 %	50 %	50 %	16119872
129	NC_003065	CG	3	6	72401	72406	0 %	0 %	50 %	50 %	159161961
130	NC_003065	GA	3	6	72413	72418	50 %	0 %	50 %	0 %	159161961
131	NC_003065	CG	3	6	72439	72444	0 %	0 %	50 %	50 %	159161961
132	NC_003065	GC	4	8	72972	72979	0 %	0 %	50 %	50 %	16119875
133	NC_003065	GC	3	6	74018	74023	0 %	0 %	50 %	50 %	16119876
134	NC_003065	CG	3	6	75106	75111	0 %	0 %	50 %	50 %	16119877
135	NC_003065	CT	3	6	75131	75136	0 %	50 %	0 %	50 %	16119877
136	NC_003065	CT	4	8	75328	75335	0 %	50 %	0 %	50 %	16119877
137	NC_003065	TC	3	6	75470	75475	0 %	50 %	0 %	50 %	16119877
138	NC_003065	AG	3	6	75547	75552	50 %	0 %	50 %	0 %	16119877
139	NC_003065	CG	3	6	75570	75575	0 %	0 %	50 %	50 %	16119877
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141	NC_003065	GC	3	6	78130	78135	0 %	0 %	50 %	50 %	16119879
142	NC_003065	CG	3	6	78397	78402	0 %	0 %	50 %	50 %	16119880
143	NC_003065	CG	3	6	78710	78715	0 %	0 %	50 %	50 %	16119880
144	NC_003065	CG	3	6	78811	78816	0 %	0 %	50 %	50 %	16119880
145	NC_003065	CG	3	6	78872	78877	0 %	0 %	50 %	50 %	16119880
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147	NC_003065	AG	3	6	79014	79019	50 %	0 %	50 %	0 %	16119880
148	NC_003065	GC	3	6	79829	79834	0 %	0 %	50 %	50 %	16119881
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431	NC_003065	GC	3	6	213657	213662	0 %	0 %	50 %	50 %	16119812

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.