MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003065	GATA	3	12	329	340	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003065	GATC	2	8	932	939	25 %	25 %	25 %	25 %	41223314
3	NC_003065	CAGT	2	8	1448	1455	25 %	25 %	25 %	25 %	41223314
4	NC_003065	AGCA	2	8	1558	1565	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_003065	AGAA	2	8	1707	1714	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003065	ATGT	2	8	2665	2672	25 %	50 %	25 %	0 %	16119814
7	NC_003065	GGGC	2	8	2980	2987	0 %	0 %	75 %	25 %	16119814
8	NC_003065	TTGT	2	8	3027	3034	0 %	75 %	25 %	0 %	16119814
9	NC_003065	TAAA	2	8	3187	3194	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003065	AATG	2	8	3638	3645	50 %	25 %	25 %	0 %	159161953
11	NC_003065	GCCA	2	8	3885	3892	25 %	0 %	25 %	50 %	159161953
12	NC_003065	TTGT	2	8	4002	4009	0 %	75 %	25 %	0 %	159161953
13	NC_003065	AAGA	2	8	4150	4157	75 %	0 %	25 %	0 %	159161953
14	NC_003065	ACCA	2	8	4501	4508	50 %	0 %	0 %	50 %	159161953
15	NC_003065	GCTG	2	8	4849	4856	0 %	25 %	50 %	25 %	159161953
16	NC_003065	GGAG	2	8	5030	5037	25 %	0 %	75 %	0 %	159161953
17	NC_003065	CTTT	2	8	5058	5065	0 %	75 %	0 %	25 %	159161953
18	NC_003065	GAAA	2	8	5285	5292	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003065	CTTT	2	8	6067	6074	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_003065	CCAG	2	8	6423	6430	25 %	0 %	25 %	50 %	16119816
21	NC_003065	ACAG	2	8	7420	7427	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_003065	ATGC	2	8	7795	7802	25 %	25 %	25 %	25 %	16119817
23	NC_003065	TTCA	2	8	7918	7925	25 %	50 %	0 %	25 %	16119817
24	NC_003065	GGTT	2	8	8180	8187	0 %	50 %	50 %	0 %	16119817
25	NC_003065	CCTG	2	8	8263	8270	0 %	25 %	25 %	50 %	16119817
26	NC_003065	AAAT	2	8	8444	8451	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003065	GTTT	2	8	8458	8465	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003065	CATA	2	8	8586	8593	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_003065	TGCA	2	8	8838	8845	25 %	25 %	25 %	25 %	16119818
30	NC_003065	TGTT	2	8	9175	9182	0 %	75 %	25 %	0 %	16119818
31	NC_003065	CCTT	2	8	9251	9258	0 %	50 %	0 %	50 %	16119818
32	NC_003065	TTCT	2	8	9316	9323	0 %	75 %	0 %	25 %	16119818
33	NC_003065	CCCA	2	8	10621	10628	25 %	0 %	0 %	75 %	16119819
34	NC_003065	AACG	2	8	10685	10692	50 %	0 %	25 %	25 %	16119819
35	NC_003065	AGGC	2	8	10763	10770	25 %	0 %	50 %	25 %	16119819
36	NC_003065	ATTC	2	8	10981	10988	25 %	50 %	0 %	25 %	16119819
37	NC_003065	CATG	2	8	11377	11384	25 %	25 %	25 %	25 %	16119819
38	NC_003065	CGAT	2	8	11646	11653	25 %	25 %	25 %	25 %	16119820
39	NC_003065	GTCT	2	8	11774	11781	0 %	50 %	25 %	25 %	16119820
40	NC_003065	CCTG	2	8	11795	11802	0 %	25 %	25 %	50 %	16119820
41	NC_003065	TGCC	2	8	12088	12095	0 %	25 %	25 %	50 %	16119820
42	NC_003065	GATT	2	8	12185	12192	25 %	50 %	25 %	0 %	16119820
43	NC_003065	CCGG	2	8	12298	12305	0 %	0 %	50 %	50 %	16119820
44	NC_003065	TTCC	2	8	12838	12845	0 %	50 %	0 %	50 %	16119820
45	NC_003065	AGGC	2	8	13248	13255	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_003065	AATT	2	8	13338	13345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003065	TGAT	2	8	13360	13367	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003065	TTGC	3	12	13678	13689	0 %	50 %	25 %	25 %	16119821
49	NC_003065	ACGT	2	8	13737	13744	25 %	25 %	25 %	25 %	16119821
50	NC_003065	GGAA	2	8	13844	13851	50 %	0 %	50 %	0 %	16119821
51	NC_003065	TCCT	2	8	13939	13946	0 %	50 %	0 %	50 %	16119821
52	NC_003065	AGGA	2	8	14651	14658	50 %	0 %	50 %	0 %	16119822
53	NC_003065	AGGC	2	8	14761	14768	25 %	0 %	50 %	25 %	16119822
54	NC_003065	TGAC	2	8	14861	14868	25 %	25 %	25 %	25 %	16119822
55	NC_003065	GTAG	2	8	15291	15298	25 %	25 %	50 %	0 %	16119822
56	NC_003065	GTCG	2	8	15469	15476	0 %	25 %	50 %	25 %	16119822
57	NC_003065	CATG	2	8	15674	15681	25 %	25 %	25 %	25 %	16119822
58	NC_003065	TAAA	2	8	16070	16077	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_003065	ATCA	2	8	16191	16198	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_003065	TTGA	2	8	16208	16215	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_003065	GTTA	2	8	16336	16343	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_003065	AGTG	2	8	16689	16696	25 %	25 %	50 %	0 %	16119823
63	NC_003065	GCGT	2	8	17433	17440	0 %	25 %	50 %	25 %	16119823
64	NC_003065	GGGA	2	8	17566	17573	25 %	0 %	75 %	0 %	16119823
65	NC_003065	GAAA	2	8	17874	17881	75 %	0 %	25 %	0 %	16119823
66	NC_003065	TCTG	2	8	18257	18264	0 %	50 %	25 %	25 %	16119823
67	NC_003065	TTTC	2	8	18432	18439	0 %	75 %	0 %	25 %	16119823
68	NC_003065	CAAG	2	8	19555	19562	50 %	0 %	25 %	25 %	41223315
69	NC_003065	GAGG	2	8	19622	19629	25 %	0 %	75 %	0 %	41223315
70	NC_003065	ATCT	2	8	19630	19637	25 %	50 %	0 %	25 %	41223315
71	NC_003065	GTTG	2	8	19798	19805	0 %	50 %	50 %	0 %	41223315
72	NC_003065	CGAA	2	8	20329	20336	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_003065	GATT	2	8	20807	20814	25 %	50 %	25 %	0 %	16119825
74	NC_003065	GCCA	2	8	21037	21044	25 %	0 %	25 %	50 %	16119825
75	NC_003065	AATT	2	8	21368	21375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003065	GCAA	2	8	21447	21454	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_003065	TATT	2	8	21515	21522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_003065	CATC	2	8	21938	21945	25 %	25 %	0 %	50 %	16119826
79	NC_003065	GATC	2	8	22954	22961	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_003065	ATAA	2	8	23077	23084	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003065	ATGC	2	8	23371	23378	25 %	25 %	25 %	25 %	16119827
82	NC_003065	GCAT	2	8	23477	23484	25 %	25 %	25 %	25 %	16119827
83	NC_003065	ATCA	2	8	23900	23907	50 %	25 %	0 %	25 %	16119827
84	NC_003065	GATC	2	8	24296	24303	25 %	25 %	25 %	25 %	16119827
85	NC_003065	CGAT	2	8	27141	27148	25 %	25 %	25 %	25 %	41223317
86	NC_003065	GCCG	2	8	27283	27290	0 %	0 %	50 %	50 %	41223318
87	NC_003065	GACT	2	8	28396	28403	25 %	25 %	25 %	25 %	16119831
88	NC_003065	GTCC	2	8	28791	28798	0 %	25 %	25 %	50 %	16119831
89	NC_003065	CGGC	2	8	29540	29547	0 %	0 %	50 %	50 %	16119831
90	NC_003065	GGAA	2	8	29838	29845	50 %	0 %	50 %	0 %	16119832
91	NC_003065	TGCA	2	8	30071	30078	25 %	25 %	25 %	25 %	16119833
92	NC_003065	TTCG	2	8	30960	30967	0 %	50 %	25 %	25 %	16119833
93	NC_003065	ACGC	2	8	30970	30977	25 %	0 %	25 %	50 %	16119833
94	NC_003065	GATT	2	8	31525	31532	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003065	CAAT	2	8	31541	31548	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_003065	GATC	2	8	32045	32052	25 %	25 %	25 %	25 %	16119834
97	NC_003065	TCGA	2	8	32109	32116	25 %	25 %	25 %	25 %	16119834
98	NC_003065	GGTG	2	8	32633	32640	0 %	25 %	75 %	0 %	16119834
99	NC_003065	CCTG	2	8	32763	32770	0 %	25 %	25 %	50 %	16119834
100	NC_003065	GACG	2	8	32915	32922	25 %	0 %	50 %	25 %	16119834
101	NC_003065	ATGC	2	8	33390	33397	25 %	25 %	25 %	25 %	16119834
102	NC_003065	GCGT	2	8	33478	33485	0 %	25 %	50 %	25 %	16119834
103	NC_003065	GCCG	2	8	33641	33648	0 %	0 %	50 %	50 %	16119834
104	NC_003065	ACGG	2	8	34020	34027	25 %	0 %	50 %	25 %	16119835
105	NC_003065	CCGA	2	8	34269	34276	25 %	0 %	25 %	50 %	16119835
106	NC_003065	GAGC	2	8	34334	34341	25 %	0 %	50 %	25 %	16119835
107	NC_003065	GCGA	2	8	34345	34352	25 %	0 %	50 %	25 %	16119835
108	NC_003065	TCGG	2	8	35241	35248	0 %	25 %	50 %	25 %	16119835
109	NC_003065	CAGC	2	8	35594	35601	25 %	0 %	25 %	50 %	16119835
110	NC_003065	GCCG	2	8	35685	35692	0 %	0 %	50 %	50 %	16119835
111	NC_003065	TTCA	2	8	35794	35801	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_003065	AACG	2	8	36950	36957	50 %	0 %	25 %	25 %	16119837
113	NC_003065	AAGC	2	8	37066	37073	50 %	0 %	25 %	25 %	16119837
114	NC_003065	CCGC	2	8	39071	39078	0 %	0 %	25 %	75 %	41223319
115	NC_003065	GTCC	2	8	39441	39448	0 %	25 %	25 %	50 %	41223320
116	NC_003065	GTTT	2	8	39616	39623	0 %	75 %	25 %	0 %	41223320
117	NC_003065	GGGT	2	8	40033	40040	0 %	25 %	75 %	0 %	41223320
118	NC_003065	CATT	2	8	40152	40159	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_003065	TTCC	2	8	40690	40697	0 %	50 %	0 %	50 %	159161955
120	NC_003065	TGGC	2	8	40753	40760	0 %	25 %	50 %	25 %	159161955
121	NC_003065	CCTT	2	8	40791	40798	0 %	50 %	0 %	50 %	159161955
122	NC_003065	CTGC	2	8	40808	40815	0 %	25 %	25 %	50 %	159161955
123	NC_003065	CGAC	2	8	41122	41129	25 %	0 %	25 %	50 %	159161955
124	NC_003065	CAGA	2	8	41447	41454	50 %	0 %	25 %	25 %	16119842
125	NC_003065	CGTC	2	8	41875	41882	0 %	25 %	25 %	50 %	16119843
126	NC_003065	GTCC	2	8	41930	41937	0 %	25 %	25 %	50 %	16119843
127	NC_003065	CCGG	2	8	42071	42078	0 %	0 %	50 %	50 %	16119843
128	NC_003065	TCGT	2	8	42342	42349	0 %	50 %	25 %	25 %	16119843
129	NC_003065	CGCT	2	8	42572	42579	0 %	25 %	25 %	50 %	16119843
130	NC_003065	GTCA	2	8	43073	43080	25 %	25 %	25 %	25 %	41223322
131	NC_003065	TGGG	2	8	43352	43359	0 %	25 %	75 %	0 %	41223322
132	NC_003065	ACGG	2	8	43997	44004	25 %	0 %	50 %	25 %	41223323
133	NC_003065	TCCG	2	8	44035	44042	0 %	25 %	25 %	50 %	41223323
134	NC_003065	CGGG	2	8	44888	44895	0 %	0 %	75 %	25 %	16119846
135	NC_003065	CCGA	2	8	45459	45466	25 %	0 %	25 %	50 %	16119847
136	NC_003065	ACAT	2	8	45555	45562	50 %	25 %	0 %	25 %	16119847
137	NC_003065	GGCG	2	8	45728	45735	0 %	0 %	75 %	25 %	16119847
138	NC_003065	ACGA	2	8	46106	46113	50 %	0 %	25 %	25 %	16119847
139	NC_003065	GCTG	2	8	46925	46932	0 %	25 %	50 %	25 %	16119849
140	NC_003065	GGCA	2	8	47408	47415	25 %	0 %	50 %	25 %	16119850
141	NC_003065	GTCC	2	8	47724	47731	0 %	25 %	25 %	50 %	16119850
142	NC_003065	GAGC	2	8	47830	47837	25 %	0 %	50 %	25 %	16119850
143	NC_003065	CTCC	2	8	48009	48016	0 %	25 %	0 %	75 %	16119850
144	NC_003065	GCCG	2	8	48274	48281	0 %	0 %	50 %	50 %	16119850
145	NC_003065	GGAA	2	8	49089	49096	50 %	0 %	50 %	0 %	16119850
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