MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 plasmid Ti

Total Repeats: 4258

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_003065	CTTT	2	8	101625	101632	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2002	NC_003065	ATT	2	6	101644	101649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_003065	ATT	2	6	101652	101657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_003065	TA	3	6	101678	101683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2005	NC_003065	AGGC	2	8	101747	101754	25 %	0 %	50 %	25 %	16119898
2006	NC_003065	GGC	2	6	101771	101776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119898
2007	NC_003065	CGG	2	6	101796	101801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119898
2008	NC_003065	CGCC	2	8	101829	101836	0 %	0 %	25 %	75 %	16119898
2009	NC_003065	TCG	2	6	101867	101872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119898
2010	NC_003065	TCGA	2	8	101884	101891	25 %	25 %	25 %	25 %	16119898
2011	NC_003065	TCGTC	2	10	101931	101940	0 %	40 %	20 %	40 %	16119898
2012	NC_003065	GGC	2	6	101967	101972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119898
2013	NC_003065	GGC	2	6	102004	102009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119898
2014	NC_003065	TCA	3	9	102016	102024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119898
2015	NC_003065	GCC	3	9	102040	102048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119898
2016	NC_003065	GCG	2	6	102077	102082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119898
2017	NC_003065	GC	3	6	102127	102132	0 %	0 %	50 %	50 %	16119898
2018	NC_003065	GAG	2	6	102163	102168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119898
2019	NC_003065	AAG	2	6	102250	102255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119898
2020	NC_003065	CCA	2	6	102275	102280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119898
2021	NC_003065	CTT	2	6	102309	102314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119898
2022	NC_003065	CGCC	2	8	102343	102350	0 %	0 %	25 %	75 %	16119898
2023	NC_003065	GTC	2	6	102356	102361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119898
2024	NC_003065	TCG	2	6	102431	102436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119898
2025	NC_003065	GC	3	6	102453	102458	0 %	0 %	50 %	50 %	16119898
2026	NC_003065	GGT	2	6	102489	102494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119898
2027	NC_003065	GGC	2	6	102499	102504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119898
2028	NC_003065	TCC	2	6	102527	102532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119898
2029	NC_003065	GGTC	2	8	102549	102556	0 %	25 %	50 %	25 %	16119898
2030	NC_003065	AGGC	2	8	102614	102621	25 %	0 %	50 %	25 %	16119898
2031	NC_003065	TCA	2	6	102734	102739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119898
2032	NC_003065	GC	3	6	102741	102746	0 %	0 %	50 %	50 %	16119898
2033	NC_003065	CTT	2	6	102804	102809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119898
2034	NC_003065	GGA	2	6	102828	102833	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119898
2035	NC_003065	CAGT	2	8	102840	102847	25 %	25 %	25 %	25 %	16119898
2036	NC_003065	GCGT	2	8	102867	102874	0 %	25 %	50 %	25 %	16119898
2037	NC_003065	CGA	2	6	102912	102917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119898
2038	NC_003065	CGT	2	6	102936	102941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119898
2039	NC_003065	ACC	2	6	102988	102993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119898
2040	NC_003065	GCCA	2	8	103020	103027	25 %	0 %	25 %	50 %	16119898
2041	NC_003065	AAC	2	6	103047	103052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119898
2042	NC_003065	GC	3	6	103062	103067	0 %	0 %	50 %	50 %	16119898
2043	NC_003065	TGA	2	6	103098	103103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159161970
2044	NC_003065	CG	5	10	103207	103216	0 %	0 %	50 %	50 %	159161970
2045	NC_003065	CGC	2	6	103282	103287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161970
2046	NC_003065	TCGG	2	8	103331	103338	0 %	25 %	50 %	25 %	159161970
2047	NC_003065	GTG	2	6	103368	103373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159161970
2048	NC_003065	CAT	2	6	103417	103422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161970
2049	NC_003065	ACG	2	6	103431	103436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161970
2050	NC_003065	AAG	2	6	103469	103474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159161970
2051	NC_003065	CGG	2	6	103494	103499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159161970
2052	NC_003065	TCC	2	6	103512	103517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159161970
2053	NC_003065	GCC	2	6	103570	103575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159161970
2054	NC_003065	CAT	2	6	103672	103677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161970
2055	NC_003065	GCT	2	6	103727	103732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161970
2056	NC_003065	TCG	2	6	103764	103769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161970
2057	NC_003065	CGAT	2	8	103938	103945	25 %	25 %	25 %	25 %	159161970
2058	NC_003065	TAT	2	6	103949	103954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159161970
2059	NC_003065	ATC	2	6	103964	103969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159161970
2060	NC_003065	AAG	2	6	103973	103978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159161970
2061	NC_003065	CTG	2	6	103994	103999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161970
2062	NC_003065	TC	3	6	104010	104015	0 %	50 %	0 %	50 %	159161970
2063	NC_003065	CAGA	2	8	104021	104028	50 %	0 %	25 %	25 %	159161970
2064	NC_003065	GAT	2	6	104050	104055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119900
2065	NC_003065	CAG	2	6	104082	104087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119900
2066	NC_003065	TCG	2	6	104133	104138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119900
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2069	NC_003065	CGC	2	6	104196	104201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119900
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2071	NC_003065	GGC	2	6	104230	104235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119900
2072	NC_003065	GCG	2	6	104238	104243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119900
2073	NC_003065	GCA	2	6	104251	104256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119900
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2075	NC_003065	GC	3	6	104275	104280	0 %	0 %	50 %	50 %	16119900
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2080	NC_003065	CG	3	6	104716	104721	0 %	0 %	50 %	50 %	16119900
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2082	NC_003065	ATC	2	6	104756	104761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119900
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2084	NC_003065	CTGG	2	8	104791	104798	0 %	25 %	50 %	25 %	16119900
2085	NC_003065	CATC	2	8	104831	104838	25 %	25 %	0 %	50 %	16119900
2086	NC_003065	AG	3	6	104851	104856	50 %	0 %	50 %	0 %	16119900
2087	NC_003065	GACGG	2	10	104978	104987	20 %	0 %	60 %	20 %	159161971
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2090	NC_003065	GAT	2	6	105163	105168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159161971
2091	NC_003065	CG	3	6	105178	105183	0 %	0 %	50 %	50 %	159161971
2092	NC_003065	CGCA	2	8	105250	105257	25 %	0 %	25 %	50 %	159161971
2093	NC_003065	TTGCCC	2	12	105336	105347	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	159161971
2094	NC_003065	CCGC	2	8	105361	105368	0 %	0 %	25 %	75 %	159161971
2095	NC_003065	CTG	2	6	105374	105379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159161971
2096	NC_003065	CG	4	8	105449	105456	0 %	0 %	50 %	50 %	159161971
2097	NC_003065	CA	3	6	105481	105486	50 %	0 %	0 %	50 %	159161971
2098	NC_003065	GAG	2	6	105494	105499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159161971
2099	NC_003065	GAG	2	6	105614	105619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159161971
2100	NC_003065	GAC	2	6	105665	105670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159161971
2101	NC_003065	CGA	2	6	105684	105689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119902
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2103	NC_003065	ACC	2	6	105847	105852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119902
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2105	NC_003065	CCA	2	6	106043	106048	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119902
2106	NC_003065	TTG	2	6	106067	106072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16119902
2107	NC_003065	TCG	2	6	106079	106084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119902
2108	NC_003065	CCG	2	6	106148	106153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119902
2109	NC_003065	GGAT	2	8	106243	106250	25 %	25 %	50 %	0 %	16119902
2110	NC_003065	GA	3	6	106346	106351	50 %	0 %	50 %	0 %	16119902
2111	NC_003065	CGTTCC	2	12	106392	106403	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	16119902
2112	NC_003065	ATC	2	6	106441	106446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119902
2113	NC_003065	GC	3	6	106467	106472	0 %	0 %	50 %	50 %	16119902
2114	NC_003065	ACC	2	6	106515	106520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16119902
2115	NC_003065	CAG	2	6	106575	106580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119902
2116	NC_003065	GCCA	2	8	106600	106607	25 %	0 %	25 %	50 %	16119902
2117	NC_003065	ACG	2	6	106689	106694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119903
2118	NC_003065	GCA	2	6	106702	106707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119903
2119	NC_003065	TCT	2	6	106708	106713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16119903
2120	NC_003065	GAA	2	6	106748	106753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119903
2121	NC_003065	CGG	2	6	106975	106980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119903
2122	NC_003065	CGC	2	6	107049	107054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119903
2123	NC_003065	GC	3	6	107117	107122	0 %	0 %	50 %	50 %	16119903
2124	NC_003065	GGT	2	6	107174	107179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16119903
2125	NC_003065	GC	3	6	107191	107196	0 %	0 %	50 %	50 %	16119903
2126	NC_003065	TCCCGA	2	12	107209	107220	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	16119903
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2246	NC_003065	GGA	2	6	112731	112736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119907
2247	NC_003065	CTCAAT	2	12	112807	112818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119907
2248	NC_003065	GAC	2	6	112822	112827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119907
2249	NC_003065	CGG	2	6	112899	112904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119907
2250	NC_003065	CTCA	2	8	112912	112919	25 %	25 %	0 %	50 %	16119907
2251	NC_003065	CGA	2	6	112929	112934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119907
2252	NC_003065	CGA	2	6	112955	112960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119907
2253	NC_003065	ATC	2	6	112975	112980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119907
2254	NC_003065	GAC	2	6	112993	112998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119907
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2259	NC_003065	TGC	2	6	113207	113212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119907
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2262	NC_003065	TTCG	2	8	113625	113632	0 %	50 %	25 %	25 %	16119907
2263	NC_003065	GCG	2	6	113689	113694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119907
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2267	NC_003065	TCG	2	6	113900	113905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119907
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2274	NC_003065	GCA	2	6	114210	114215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119907
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2279	NC_003065	TCG	2	6	114398	114403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119907
2280	NC_003065	GCG	3	9	114426	114434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119907
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2287	NC_003065	GCA	2	6	114777	114782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2288	NC_003065	ATT	2	6	114864	114869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2312	NC_003065	CG	3	6	116261	116266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2313	NC_003065	GAG	2	6	116328	116333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2352	NC_003065	CGT	2	6	118320	118325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119911
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2355	NC_003065	GGTC	2	8	118465	118472	0 %	25 %	50 %	25 %	16119911
2356	NC_003065	GC	3	6	118615	118620	0 %	0 %	50 %	50 %	16119912
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2360	NC_003065	CGT	2	6	118920	118925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119912
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2363	NC_003065	TTG	2	6	118976	118981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2364	NC_003065	AAT	2	6	119021	119026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2365	NC_003065	AGCG	2	8	119045	119052	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2366	NC_003065	TGAA	2	8	119081	119088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2367	NC_003065	AGG	2	6	119095	119100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2368	NC_003065	GGAA	2	8	119101	119108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2369	NC_003065	AGGGGA	2	12	119111	119122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2370	NC_003065	AGGGA	2	10	119123	119132	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2371	NC_003065	GGC	2	6	119215	119220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2372	NC_003065	AGG	2	6	119225	119230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2373	NC_003065	CGA	2	6	119288	119293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2374	NC_003065	CCG	2	6	119307	119312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2375	NC_003065	TC	3	6	119320	119325	0 %	50 %	0 %	50 %	41223335
2376	NC_003065	CCG	2	6	119357	119362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	41223335
2377	NC_003065	CGA	2	6	119417	119422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223335
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2379	NC_003065	GCA	2	6	119465	119470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223335
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2381	NC_003065	CGA	2	6	119579	119584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	41223335
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2389	NC_003065	CGT	2	6	119956	119961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119915
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2397	NC_003065	CGCT	2	8	120340	120347	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2398	NC_003065	GGC	2	6	120352	120357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2399	NC_003065	CCCA	2	8	120365	120372	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2400	NC_003065	CGT	2	6	120391	120396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2401	NC_003065	CCTT	2	8	120410	120417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2402	NC_003065	CG	3	6	120429	120434	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2403	NC_003065	CGAT	2	8	120479	120486	25 %	25 %	25 %	25 %	16119916
2404	NC_003065	CGA	3	9	120558	120566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119916
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2419	NC_003065	TCC	2	6	121381	121386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119916
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2450	NC_003065	CGT	2	6	122397	122402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16119916
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2471	NC_003065	ATC	3	9	123358	123366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119916
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2477	NC_003065	GAAG	2	8	123507	123514	50 %	0 %	50 %	0 %	16119916
2478	NC_003065	ATC	2	6	123592	123597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119916
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2482	NC_003065	CGG	2	6	123998	124003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119916
2483	NC_003065	GAG	2	6	124126	124131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16119916
2484	NC_003065	GCC	2	6	124140	124145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16119916
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2486	NC_003065	ACGG	2	8	124180	124187	25 %	0 %	50 %	25 %	16119916
2487	NC_003065	GCG	2	6	124195	124200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16119916
2488	NC_003065	GACAAT	2	12	124225	124236	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	16119916
2489	NC_003065	ACA	2	6	124244	124249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119916
2490	NC_003065	CAA	2	6	124254	124259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16119916
2491	NC_003065	GCA	2	6	124301	124306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119916
2492	NC_003065	GAT	2	6	124356	124361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16119916
2493	NC_003065	CGA	2	6	124428	124433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119916
2494	NC_003065	AAG	2	6	124486	124491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16119916
2495	NC_003065	AGC	2	6	124502	124507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119916
2496	NC_003065	CTC	2	6	124554	124559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16119916
2497	NC_003065	CAT	2	6	124609	124614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16119916
2498	NC_003065	TCCC	2	8	124632	124639	0 %	25 %	0 %	75 %	16119916
2499	NC_003065	AGC	2	6	124646	124651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119916
2500	NC_003065	CGA	2	6	124733	124738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16119916

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