MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 chromosome linear

Total Repeats: 45739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_003063	GTTC	2	8	138037	138044	0 %	50 %	25 %	25 %	159185617
3002	NC_003063	GCAG	2	8	138046	138053	25 %	0 %	50 %	25 %	159185617
3003	NC_003063	TTC	2	6	138081	138086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159185617
3004	NC_003063	CTTC	2	8	138187	138194	0 %	50 %	0 %	50 %	159185617
3005	NC_003063	CGA	2	6	138346	138351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185617
3006	NC_003063	CCG	2	6	138373	138378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185617
3007	NC_003063	TCT	2	6	138427	138432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159185617
3008	NC_003063	ACG	2	6	138435	138440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185617
3009	NC_003063	GCG	2	6	138528	138533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185617
3010	NC_003063	CGCC	2	8	138565	138572	0 %	0 %	25 %	75 %	159185617
3011	NC_003063	GGT	2	6	138581	138586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159185617
3012	NC_003063	GAA	2	6	138593	138598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159185617
3013	NC_003063	GGT	2	6	138611	138616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159185617
3014	NC_003063	GCA	2	6	138634	138639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185617
3015	NC_003063	GTG	2	6	138804	138809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159185617
3016	NC_003063	CGC	2	6	138871	138876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185617
3017	NC_003063	GGC	2	6	138878	138883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185617
3018	NC_003063	CAC	2	6	138924	138929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159185617
3019	NC_003063	CGG	2	6	138952	138957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185617
3020	NC_003063	GGC	2	6	138983	138988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185617
3021	NC_003063	CAT	2	6	139004	139009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159185617
3022	NC_003063	TCA	2	6	139015	139020	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159185617
3023	NC_003063	TTG	2	6	139027	139032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159185617
3024	NC_003063	TCC	2	6	139036	139041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_003063	CTC	2	6	139067	139072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891798
3026	NC_003063	ACC	2	6	139278	139283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15891798
3027	NC_003063	TGC	2	6	139306	139311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891798
3028	NC_003063	CCA	2	6	139427	139432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15891798
3029	NC_003063	ATG	2	6	139516	139521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891798
3030	NC_003063	CTT	2	6	139716	139721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891798
3031	NC_003063	GC	3	6	139727	139732	0 %	0 %	50 %	50 %	15891798
3032	NC_003063	GCT	2	6	139769	139774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891798
3033	NC_003063	AGC	2	6	139789	139794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891798
3034	NC_003063	GC	3	6	139812	139817	0 %	0 %	50 %	50 %	15891798
3035	NC_003063	TCG	2	6	139822	139827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891798
3036	NC_003063	CAC	2	6	139994	139999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15891798
3037	NC_003063	TCC	2	6	140008	140013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891798
3038	NC_003063	CCA	2	6	140021	140026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15891798
3039	NC_003063	CGT	2	6	140034	140039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891798
3040	NC_003063	CGA	2	6	140063	140068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891798
3041	NC_003063	CCA	2	6	140128	140133	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15891798
3042	NC_003063	GAA	2	6	140228	140233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891797
3043	NC_003063	GGT	2	6	140300	140305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15891797
3044	NC_003063	ACG	2	6	140445	140450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891797
3045	NC_003063	GCC	2	6	140493	140498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891797
3046	NC_003063	AGCG	2	8	140517	140524	25 %	0 %	50 %	25 %	15891797
3047	NC_003063	GAA	2	6	140549	140554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891797
3048	NC_003063	CCAG	2	8	140602	140609	25 %	0 %	25 %	50 %	15891797
3049	NC_003063	AT	3	6	140628	140633	50 %	50 %	0 %	0 %	15891797
3050	NC_003063	GAC	2	6	140648	140653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891797
3051	NC_003063	TTC	2	6	140697	140702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891797
3052	NC_003063	GCC	2	6	140733	140738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891797
3053	NC_003063	GAT	2	6	140777	140782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891797
3054	NC_003063	AGA	2	6	140797	140802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891797
3055	NC_003063	CCAG	2	8	140926	140933	25 %	0 %	25 %	50 %	15891797
3056	NC_003063	AGC	2	6	140997	141002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891797
3057	NC_003063	CGG	2	6	141015	141020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891797
3058	NC_003063	GCC	2	6	141021	141026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891797
3059	NC_003063	CTT	2	6	141096	141101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891796
3060	NC_003063	CGA	2	6	141102	141107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891796
3061	NC_003063	CGA	2	6	141116	141121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891796
3062	NC_003063	TGA	2	6	141134	141139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891796
3063	NC_003063	CTT	2	6	141186	141191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891796
3064	NC_003063	TCG	2	6	141199	141204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891796
3065	NC_003063	AG	3	6	141212	141217	50 %	0 %	50 %	0 %	15891796
3066	NC_003063	GCCC	2	8	141242	141249	0 %	0 %	25 %	75 %	15891796
3067	NC_003063	TGA	2	6	141254	141259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891796
3068	NC_003063	ATG	2	6	141301	141306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891796
3069	NC_003063	GAA	2	6	141312	141317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891796
3070	NC_003063	CAG	2	6	141330	141335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891796
3071	NC_003063	TGA	2	6	141344	141349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891796
3072	NC_003063	AGA	2	6	141350	141355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891796
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3075	NC_003063	CCGAA	2	10	141446	141455	40 %	0 %	20 %	40 %	15891796
3076	NC_003063	CAG	2	6	141460	141465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891796
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3079	NC_003063	TCGC	2	8	141562	141569	0 %	25 %	25 %	50 %	15891796
3080	NC_003063	GCAATC	2	12	141592	141603	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15891796
3081	NC_003063	GGAT	2	8	141614	141621	25 %	25 %	50 %	0 %	15891796
3082	NC_003063	GAA	2	6	141642	141647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891796
3083	NC_003063	TGA	2	6	141650	141655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891796
3084	NC_003063	CGC	2	6	141678	141683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891796
3085	NC_003063	TCA	2	6	141821	141826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891796
3086	NC_003063	CAG	2	6	141885	141890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891796
3087	NC_003063	CGA	2	6	141893	141898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891796
3088	NC_003063	ATG	2	6	141943	141948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891796
3089	NC_003063	TCC	2	6	142064	142069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3090	NC_003063	CCGC	2	8	142193	142200	0 %	0 %	25 %	75 %	159185618
3091	NC_003063	CGA	2	6	142227	142232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185618
3092	NC_003063	TCA	2	6	142290	142295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159185618
3093	NC_003063	TCG	2	6	142389	142394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185618
3094	NC_003063	GCA	2	6	142432	142437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185618
3095	NC_003063	GCC	2	6	142458	142463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185618
3096	NC_003063	CTC	2	6	142564	142569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159185618
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3098	NC_003063	TGA	2	6	142695	142700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159185618
3099	NC_003063	GAT	2	6	142711	142716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159185618
3100	NC_003063	CGAC	2	8	142755	142762	25 %	0 %	25 %	50 %	159185618
3101	NC_003063	ATT	2	6	142782	142787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159185618
3102	NC_003063	GTCG	2	8	142811	142818	0 %	25 %	50 %	25 %	159185618
3103	NC_003063	CGC	2	6	142821	142826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185618
3104	NC_003063	GCC	3	9	142898	142906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185618
3105	NC_003063	TAT	2	6	142928	142933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159185618
3106	NC_003063	CG	3	6	142971	142976	0 %	0 %	50 %	50 %	159185618
3107	NC_003063	CGC	2	6	142994	142999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185618
3108	NC_003063	CGGCA	2	10	143003	143012	20 %	0 %	40 %	40 %	159185618
3109	NC_003063	ACGAAC	2	12	143028	143039	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	159185618
3110	NC_003063	GCT	2	6	143047	143052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185618
3111	NC_003063	CAGC	2	8	143163	143170	25 %	0 %	25 %	50 %	15891794
3112	NC_003063	GAA	2	6	143191	143196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891794
3113	NC_003063	GCC	2	6	143233	143238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891794
3114	NC_003063	CGG	2	6	143272	143277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891794
3115	NC_003063	ATC	2	6	143306	143311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891794
3116	NC_003063	GAT	2	6	143377	143382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891794
3117	NC_003063	AGC	3	9	143414	143422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891794
3118	NC_003063	TGA	2	6	143433	143438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891794
3119	NC_003063	AGC	2	6	143441	143446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891794
3120	NC_003063	GAT	2	6	143449	143454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891794
3121	NC_003063	ATC	2	6	143486	143491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891794
3122	NC_003063	CAGC	2	8	143518	143525	25 %	0 %	25 %	50 %	15891794
3123	NC_003063	GCC	2	6	143534	143539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891794
3124	NC_003063	CAG	2	6	143551	143556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891794
3125	NC_003063	GTG	2	6	143567	143572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15891794
3126	NC_003063	CGA	2	6	143637	143642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891794
3127	NC_003063	GAT	2	6	143713	143718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891794
3128	NC_003063	CAG	2	6	143725	143730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891794
3129	NC_003063	CAG	2	6	143749	143754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891794
3130	NC_003063	ATA	2	6	143755	143760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891794
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3132	NC_003063	CGA	2	6	143814	143819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891794
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3142	NC_003063	ATC	2	6	144029	144034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891794
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3153	NC_003063	ATCAGC	2	12	144347	144358	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15891794
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3158	NC_003063	GAA	3	9	144601	144609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159185619
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3160	NC_003063	CAT	2	6	144658	144663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159185619
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3164	NC_003063	TCC	2	6	144923	144928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3165	NC_003063	CAA	2	6	144940	144945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3166	NC_003063	CG	3	6	144980	144985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3167	NC_003063	CGC	2	6	145064	145069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185620
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3192	NC_003063	AT	3	6	145824	145829	50 %	50 %	0 %	0 %	159185620
3193	NC_003063	CGG	2	6	145870	145875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185620
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3195	NC_003063	TCC	3	9	145968	145976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3196	NC_003063	TTG	2	6	145978	145983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3197	NC_003063	T	6	6	146018	146023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3198	NC_003063	GAT	2	6	146068	146073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3201	NC_003063	TCG	2	6	146222	146227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891791
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3206	NC_003063	TGA	2	6	146465	146470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891791
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3215	NC_003063	TGA	3	9	146784	146792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891791
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3227	NC_003063	CTC	2	6	147456	147461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891790
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3230	NC_003063	TCT	2	6	147598	147603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891790
3231	NC_003063	GATCTT	2	12	147618	147629	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	15891790
3232	NC_003063	GC	3	6	147727	147732	0 %	0 %	50 %	50 %	15891790
3233	NC_003063	AGC	2	6	147757	147762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891790
3234	NC_003063	TGAGGC	2	12	147833	147844	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	15891790
3235	NC_003063	AGCC	2	8	147922	147929	25 %	0 %	25 %	50 %	15891790
3236	NC_003063	TCA	2	6	148000	148005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891790
3237	NC_003063	CCA	2	6	148016	148021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15891790
3238	NC_003063	CCG	2	6	148032	148037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891790
3239	NC_003063	TGCG	2	8	148093	148100	0 %	25 %	50 %	25 %	15891790
3240	NC_003063	CCG	2	6	148103	148108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891790
3241	NC_003063	CTCCC	2	10	148121	148130	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
3242	NC_003063	TG	4	8	148158	148165	0 %	50 %	50 %	0 %	159185621
3243	NC_003063	GCG	2	6	148215	148220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185621
3244	NC_003063	CG	3	6	148219	148224	0 %	0 %	50 %	50 %	159185621
3245	NC_003063	ACCGG	2	10	148226	148235	20 %	0 %	40 %	40 %	159185621
3246	NC_003063	CGG	2	6	148269	148274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185621
3247	NC_003063	AGA	2	6	148320	148325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159185621
3248	NC_003063	GC	3	6	148352	148357	0 %	0 %	50 %	50 %	159185621
3249	NC_003063	GCG	2	6	148373	148378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185621
3250	NC_003063	GGT	2	6	148429	148434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159185621
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3252	NC_003063	CGA	2	6	148566	148571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185621
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3256	NC_003063	CTT	2	6	148672	148677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159185621
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3262	NC_003063	ACTG	2	8	149079	149086	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3263	NC_003063	CAA	2	6	149119	149124	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3264	NC_003063	TCA	2	6	149126	149131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3265	NC_003063	ATG	2	6	149142	149147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3267	NC_003063	CAGC	2	8	149178	149185	25 %	0 %	25 %	50 %	15891788
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3273	NC_003063	TTG	2	6	149347	149352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891788
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3281	NC_003063	CGGCG	2	10	149633	149642	0 %	0 %	60 %	40 %	15891788
3282	NC_003063	GAT	2	6	149643	149648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891788
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3310	NC_003063	TTG	2	6	150752	150757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3311	NC_003063	ATA	2	6	150768	150773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3312	NC_003063	GAA	2	6	150861	150866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3316	NC_003063	CGAA	2	8	150993	151000	50 %	0 %	25 %	25 %	159185623
3317	NC_003063	CGG	2	6	151078	151083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185623
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3334	NC_003063	GCG	2	6	152019	152024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891785
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3348	NC_003063	GAG	2	6	152535	152540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3349	NC_003063	GCA	2	6	152549	152554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891784
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3352	NC_003063	GCA	2	6	152866	152871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3353	NC_003063	CAT	2	6	152885	152890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891783
3354	NC_003063	ATC	2	6	152972	152977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891783
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3356	NC_003063	GAA	2	6	153033	153038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891783
3357	NC_003063	CTC	2	6	153073	153078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891783
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3359	NC_003063	ATA	2	6	153121	153126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891783
3360	NC_003063	GCT	2	6	153184	153189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891783
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3362	NC_003063	GCC	2	6	153362	153367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891783
3363	NC_003063	GC	3	6	153447	153452	0 %	0 %	50 %	50 %	15891783
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3365	NC_003063	GCGCC	2	10	153483	153492	0 %	0 %	40 %	60 %	15891783
3366	NC_003063	GGC	2	6	153499	153504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891783
3367	NC_003063	GCC	2	6	153506	153511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891783
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3442	NC_003063	CGACAT	2	12	156563	156574	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15891781
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3482	NC_003063	AGC	2	6	158352	158357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185625
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3487	NC_003063	TGA	2	6	158491	158496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159185625
3488	NC_003063	GAC	2	6	158540	158545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185625
3489	NC_003063	GAT	2	6	158555	158560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159185625
3490	NC_003063	AGC	2	6	158568	158573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185625
3491	NC_003063	CTG	2	6	158594	158599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185625
3492	NC_003063	CGC	2	6	158624	158629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185625
3493	NC_003063	GGAT	2	8	158647	158654	25 %	25 %	50 %	0 %	159185625
3494	NC_003063	GAT	3	9	158669	158677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159185625
3495	NC_003063	GAT	2	6	158711	158716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159185625
3496	NC_003063	GCATTG	2	12	158733	158744	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	159185625
3497	NC_003063	TGATG	2	10	158774	158783	20 %	40 %	40 %	0 %	159185625
3498	NC_003063	TTG	2	6	158787	158792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159185625
3499	NC_003063	ATG	2	6	158793	158798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159185625
3500	NC_003063	CCG	2	6	158830	158835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185625

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