MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 chromosome linear

Total Repeats: 5116

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_003063	CCTG	2	8	2036018	2036025	0 %	25 %	25 %	50 %	159186349
5002	NC_003063	CCTT	2	8	2036380	2036387	0 %	50 %	0 %	50 %	159186349
5003	NC_003063	TGGC	2	8	2036540	2036547	0 %	25 %	50 %	25 %	159186349
5004	NC_003063	GGGA	2	8	2036607	2036614	25 %	0 %	75 %	0 %	159186349
5005	NC_003063	GGCC	2	8	2036747	2036754	0 %	0 %	50 %	50 %	159186349
5006	NC_003063	CTGT	2	8	2037472	2037479	0 %	50 %	25 %	25 %	159186349
5007	NC_003063	CACG	2	8	2037869	2037876	25 %	0 %	25 %	50 %	159186349
5008	NC_003063	TCGG	2	8	2038957	2038964	0 %	25 %	50 %	25 %	159186349
5009	NC_003063	GCGA	2	8	2038991	2038998	25 %	0 %	50 %	25 %	159186349
5010	NC_003063	TTCC	2	8	2039048	2039055	0 %	50 %	0 %	50 %	159186349
5011	NC_003063	TTGA	2	8	2039508	2039515	25 %	50 %	25 %	0 %	159186349
5012	NC_003063	AGAC	2	8	2040154	2040161	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5013	NC_003063	CCAA	2	8	2041242	2041249	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_003063	GCTC	2	8	2041477	2041484	0 %	25 %	25 %	50 %	15890133
5015	NC_003063	CCGC	2	8	2041995	2042002	0 %	0 %	25 %	75 %	15890132
5016	NC_003063	GACA	2	8	2042008	2042015	50 %	0 %	25 %	25 %	15890132
5017	NC_003063	GGCA	2	8	2042486	2042493	25 %	0 %	50 %	25 %	15890132
5018	NC_003063	GCTG	2	8	2042796	2042803	0 %	25 %	50 %	25 %	15890132
5019	NC_003063	CATC	2	8	2042977	2042984	25 %	25 %	0 %	50 %	15890132
5020	NC_003063	CAGC	2	8	2043166	2043173	25 %	0 %	25 %	50 %	15890132
5021	NC_003063	CCGG	2	8	2043180	2043187	0 %	0 %	50 %	50 %	15890132
5022	NC_003063	CAGG	2	8	2043344	2043351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5023	NC_003063	GCGT	2	8	2043551	2043558	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5024	NC_003063	GCAA	2	8	2043817	2043824	50 %	0 %	25 %	25 %	15890131
5025	NC_003063	GGCA	2	8	2044071	2044078	25 %	0 %	50 %	25 %	15890131
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5027	NC_003063	TTCA	2	8	2044833	2044840	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_003063	TGCA	2	8	2044872	2044879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5029	NC_003063	TCGA	2	8	2044970	2044977	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5031	NC_003063	CGCT	2	8	2045652	2045659	0 %	25 %	25 %	50 %	159186351
5032	NC_003063	GCCT	2	8	2045860	2045867	0 %	25 %	25 %	50 %	159186351
5033	NC_003063	TGGC	2	8	2046034	2046041	0 %	25 %	50 %	25 %	159186351
5034	NC_003063	TGCG	2	8	2046689	2046696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5035	NC_003063	GCCT	2	8	2046720	2046727	0 %	25 %	25 %	50 %	15890129
5036	NC_003063	CAGT	2	8	2046815	2046822	25 %	25 %	25 %	25 %	15890129
5037	NC_003063	CGCA	2	8	2048056	2048063	25 %	0 %	25 %	50 %	15890128
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5040	NC_003063	CGAT	2	8	2048410	2048417	25 %	25 %	25 %	25 %	15890128
5041	NC_003063	GAAG	2	8	2049005	2049012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_003063	CCGC	2	8	2049033	2049040	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5043	NC_003063	GCCA	2	8	2049152	2049159	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5044	NC_003063	TTTG	2	8	2049271	2049278	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5045	NC_003063	TGAC	2	8	2049368	2049375	25 %	25 %	25 %	25 %	15890126
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5049	NC_003063	GCTC	2	8	2051720	2051727	0 %	25 %	25 %	50 %	15890123
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5053	NC_003063	GTCG	2	8	2053300	2053307	0 %	25 %	50 %	25 %	15890121
5054	NC_003063	TGGC	2	8	2053928	2053935	0 %	25 %	50 %	25 %	15890120
5055	NC_003063	ATCA	2	8	2054040	2054047	50 %	25 %	0 %	25 %	15890120
5056	NC_003063	TCTG	2	8	2054075	2054082	0 %	50 %	25 %	25 %	15890120
5057	NC_003063	ATCC	2	8	2054760	2054767	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_003063	ATAG	2	8	2054854	2054861	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_003063	CTGG	2	8	2055429	2055436	0 %	25 %	50 %	25 %	15890118
5060	NC_003063	TCGC	2	8	2055605	2055612	0 %	25 %	25 %	50 %	15890118
5061	NC_003063	GCAC	2	8	2055847	2055854	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5062	NC_003063	TTGA	2	8	2057096	2057103	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_003063	CGGC	2	8	2057643	2057650	0 %	0 %	50 %	50 %	159186353
5064	NC_003063	GCGA	3	12	2058117	2058128	25 %	0 %	50 %	25 %	15890114
5065	NC_003063	TGCG	2	8	2058349	2058356	0 %	25 %	50 %	25 %	15890114
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5069	NC_003063	TGAG	2	8	2059331	2059338	25 %	25 %	50 %	0 %	15890113
5070	NC_003063	GCAA	2	8	2059603	2059610	50 %	0 %	25 %	25 %	15890113
5071	NC_003063	CTGA	2	8	2060019	2060026	25 %	25 %	25 %	25 %	15890112
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5073	NC_003063	AGCG	2	8	2060489	2060496	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5075	NC_003063	AGAA	2	8	2061120	2061127	75 %	0 %	25 %	0 %	15890110
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5088	NC_003063	TCGA	2	8	2065716	2065723	25 %	25 %	25 %	25 %	15890099
5089	NC_003063	GGCT	2	8	2065768	2065775	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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5093	NC_003063	ATCC	2	8	2066679	2066686	25 %	25 %	0 %	50 %	15890097
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5095	NC_003063	ATCG	2	8	2068323	2068330	25 %	25 %	25 %	25 %	159186358
5096	NC_003063	GGCG	2	8	2068649	2068656	0 %	0 %	75 %	25 %	159186358
5097	NC_003063	GATG	2	8	2068764	2068771	25 %	25 %	50 %	0 %	159186358
5098	NC_003063	GTCC	2	8	2068966	2068973	0 %	25 %	25 %	50 %	159186358
5099	NC_003063	GTTA	2	8	2069238	2069245	25 %	50 %	25 %	0 %	159186358
5100	NC_003063	CTAT	2	8	2069306	2069313	25 %	50 %	0 %	25 %	159186358
5101	NC_003063	GAGC	2	8	2069781	2069788	25 %	0 %	50 %	25 %	159186358
5102	NC_003063	CCGT	2	8	2069867	2069874	0 %	25 %	25 %	50 %	159186358
5103	NC_003063	ATTC	2	8	2070260	2070267	25 %	50 %	0 %	25 %	15890094
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5105	NC_003063	TGTT	2	8	2071670	2071677	0 %	75 %	25 %	0 %	159186359
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5107	NC_003063	GCCT	2	8	2072812	2072819	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5108	NC_003063	ACGG	2	8	2073278	2073285	25 %	0 %	50 %	25 %	15890092
5109	NC_003063	GATT	2	8	2073375	2073382	25 %	50 %	25 %	0 %	15890092
5110	NC_003063	CCTG	2	8	2074414	2074421	0 %	25 %	25 %	50 %	15890090
5111	NC_003063	GGCG	2	8	2074463	2074470	0 %	0 %	75 %	25 %	15890090
5112	NC_003063	CATT	2	8	2074997	2075004	25 %	50 %	0 %	25 %	17938587
5113	NC_003063	ATAA	2	8	2075353	2075360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_003063	AACC	2	8	2075366	2075373	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_003063	ATTT	2	8	2075484	2075491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_003063	GGAA	2	8	2075504	2075511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.