MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Aquifex aeolicus VF5 plasmid ece1

Total Repeats: 90

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001880	TC	3	6	99	104	0 %	50 %	0 %	50 %	10957042
2	NC_001880	CA	3	6	274	279	50 %	0 %	0 %	50 %	10957042
3	NC_001880	GA	3	6	284	289	50 %	0 %	50 %	0 %	10957042
4	NC_001880	AT	3	6	448	453	50 %	50 %	0 %	0 %	10957042
5	NC_001880	AT	3	6	513	518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_001880	AT	3	6	580	585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001880	AT	3	6	646	651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_001880	GA	3	6	1554	1559	50 %	0 %	50 %	0 %	10957043
9	NC_001880	CA	3	6	1944	1949	50 %	0 %	0 %	50 %	10957044
10	NC_001880	GA	3	6	2815	2820	50 %	0 %	50 %	0 %	10957045
11	NC_001880	GA	3	6	2912	2917	50 %	0 %	50 %	0 %	10957045
12	NC_001880	TC	3	6	2921	2926	0 %	50 %	0 %	50 %	10957045
13	NC_001880	TA	3	6	3715	3720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_001880	TA	3	6	4031	4036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_001880	AG	3	6	4413	4418	50 %	0 %	50 %	0 %	10957046
16	NC_001880	GA	3	6	4773	4778	50 %	0 %	50 %	0 %	10957046
17	NC_001880	CT	3	6	5380	5385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_001880	TA	3	6	5763	5768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_001880	GA	3	6	6444	6449	50 %	0 %	50 %	0 %	10957047
20	NC_001880	CT	3	6	7318	7323	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_001880	AG	3	6	7409	7414	50 %	0 %	50 %	0 %	10957048
22	NC_001880	AG	3	6	7779	7784	50 %	0 %	50 %	0 %	10957048
23	NC_001880	AT	4	8	8499	8506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001880	TC	3	6	9640	9645	0 %	50 %	0 %	50 %	10957049
25	NC_001880	AC	3	6	10246	10251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_001880	TA	3	6	11122	11127	50 %	50 %	0 %	0 %	10957051
27	NC_001880	AT	3	6	11189	11194	50 %	50 %	0 %	0 %	10957051
28	NC_001880	AG	3	6	11737	11742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_001880	GA	3	6	14460	14465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_001880	AT	3	6	14674	14679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_001880	TC	3	6	15001	15006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_001880	TC	3	6	15109	15114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_001880	TC	3	6	16017	16022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_001880	GA	3	6	16632	16637	50 %	0 %	50 %	0 %	10957055
35	NC_001880	CT	3	6	16667	16672	0 %	50 %	0 %	50 %	10957055
36	NC_001880	AT	3	6	17227	17232	50 %	50 %	0 %	0 %	10957055
37	NC_001880	AG	3	6	19071	19076	50 %	0 %	50 %	0 %	10957058
38	NC_001880	CA	3	6	20005	20010	50 %	0 %	0 %	50 %	10957059
39	NC_001880	GA	3	6	20079	20084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_001880	TA	3	6	20911	20916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_001880	TA	3	6	21366	21371	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_001880	CT	4	8	22304	22311	0 %	50 %	0 %	50 %	10957060
43	NC_001880	CT	3	6	22407	22412	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_001880	CT	3	6	22613	22618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_001880	AT	4	8	22664	22671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_001880	AG	3	6	24278	24283	50 %	0 %	50 %	0 %	10957061
47	NC_001880	AG	3	6	24660	24665	50 %	0 %	50 %	0 %	10957061
48	NC_001880	TA	3	6	25208	25213	50 %	50 %	0 %	0 %	10957062
49	NC_001880	AG	3	6	26033	26038	50 %	0 %	50 %	0 %	10957063
50	NC_001880	TA	3	6	26273	26278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_001880	AT	3	6	26519	26524	50 %	50 %	0 %	0 %	10957064
52	NC_001880	GA	3	6	26611	26616	50 %	0 %	50 %	0 %	10957064
53	NC_001880	CT	3	6	26805	26810	0 %	50 %	0 %	50 %	10957064
54	NC_001880	AG	3	6	26984	26989	50 %	0 %	50 %	0 %	10957064
55	NC_001880	TA	3	6	27154	27159	50 %	50 %	0 %	0 %	10957065
56	NC_001880	TC	3	6	27383	27388	0 %	50 %	0 %	50 %	10957065
57	NC_001880	AT	3	6	27474	27479	50 %	50 %	0 %	0 %	10957065
58	NC_001880	TA	3	6	28261	28266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_001880	AT	3	6	28290	28295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_001880	AT	3	6	28932	28937	50 %	50 %	0 %	0 %	10957066
61	NC_001880	CT	3	6	29437	29442	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_001880	TA	4	8	29613	29620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_001880	AC	3	6	29659	29664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_001880	TA	3	6	29810	29815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_001880	TA	4	8	29860	29867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_001880	CT	3	6	30190	30195	0 %	50 %	0 %	50 %	10957067
67	NC_001880	CT	3	6	30881	30886	0 %	50 %	0 %	50 %	10957067
68	NC_001880	CA	3	6	31053	31058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_001880	TC	3	6	31377	31382	0 %	50 %	0 %	50 %	10957068
70	NC_001880	TA	3	6	31436	31441	50 %	50 %	0 %	0 %	10957068
71	NC_001880	GA	3	6	31763	31768	50 %	0 %	50 %	0 %	10957068
72	NC_001880	TA	3	6	31914	31919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_001880	TC	4	8	32780	32787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_001880	GT	3	6	33109	33114	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_001880	GA	3	6	33237	33242	50 %	0 %	50 %	0 %	10957069
76	NC_001880	GA	3	6	33488	33493	50 %	0 %	50 %	0 %	10957069
77	NC_001880	AG	3	6	34438	34443	50 %	0 %	50 %	0 %	10957070
78	NC_001880	AT	3	6	34446	34451	50 %	50 %	0 %	0 %	10957070
79	NC_001880	GA	3	6	34461	34466	50 %	0 %	50 %	0 %	10957070
80	NC_001880	TA	4	8	34899	34906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_001880	AT	3	6	35032	35037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_001880	TG	3	6	35827	35832	0 %	50 %	50 %	0 %	10957071
83	NC_001880	AC	3	6	36180	36185	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_001880	TG	3	6	36665	36670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_001880	TA	3	6	37012	37017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_001880	TA	3	6	38224	38229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_001880	TA	3	6	38551	38556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_001880	AT	3	6	39023	39028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_001880	AT	3	6	39155	39160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_001880	AG	3	6	39344	39349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.