MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aquifex aeolicus VF5 plasmid ece1

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_001880	GAAAA	2	10	1031	1040	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_001880	AAATA	2	10	1675	1684	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_001880	AGGAA	2	10	2752	2761	60 %	0 %	40 %	0 %	10957045
4	NC_001880	TTTCC	2	10	4698	4707	0 %	60 %	0 %	40 %	10957046
5	NC_001880	AGTGG	2	10	4863	4872	20 %	20 %	60 %	0 %	10957046
6	NC_001880	AAAGG	2	10	5486	5495	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_001880	TGGAG	2	10	7771	7780	20 %	20 %	60 %	0 %	10957048
8	NC_001880	GAAGA	2	10	8926	8935	60 %	0 %	40 %	0 %	10957049
9	NC_001880	CCTTC	2	10	10340	10349	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_001880	CAACA	2	10	12650	12659	60 %	0 %	0 %	40 %	10957052
11	NC_001880	TTCTG	2	10	13000	13009	0 %	60 %	20 %	20 %	10957053
12	NC_001880	TGAGA	2	10	13264	13273	40 %	20 %	40 %	0 %	10957053
13	NC_001880	CCAGA	2	10	13802	13811	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_001880	TTCCT	2	10	14445	14454	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_001880	AGGAA	2	10	14762	14771	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_001880	GGCTT	2	10	14837	14846	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_001880	TTTAA	2	10	17443	17452	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_001880	AGCAG	2	10	17680	17689	40 %	0 %	40 %	20 %	10957056
19	NC_001880	GATTT	2	10	18189	18198	20 %	60 %	20 %	0 %	10957056
20	NC_001880	ACAGG	2	10	18777	18786	40 %	0 %	40 %	20 %	10957057
21	NC_001880	ATTTT	2	10	18911	18920	20 %	80 %	0 %	0 %	10957058
22	NC_001880	CTTTT	2	10	19659	19668	0 %	80 %	0 %	20 %	10957058
23	NC_001880	TTTAT	2	10	20426	20435	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_001880	CTTTT	2	10	21736	21745	0 %	80 %	0 %	20 %	10957060
25	NC_001880	CATAT	2	10	22658	22667	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_001880	AGGTA	2	10	24489	24498	40 %	20 %	40 %	0 %	10957061
27	NC_001880	TAGTA	2	10	25498	25507	40 %	40 %	20 %	0 %	10957062
28	NC_001880	TTTTC	2	10	26621	26630	0 %	80 %	0 %	20 %	10957064
29	NC_001880	CCTGG	2	10	27025	27034	0 %	20 %	40 %	40 %	10957064
30	NC_001880	TGAAG	2	10	27649	27658	40 %	20 %	40 %	0 %	10957065
31	NC_001880	TAATA	2	10	28313	28322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_001880	AAAAG	2	10	29281	29290	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_001880	CTCTT	2	10	29398	29407	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_001880	ACTTA	2	10	29707	29716	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_001880	GAAAG	2	10	35275	35284	60 %	0 %	40 %	0 %	10957071

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.