MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Aquifex aeolicus VF5

Total Repeats: 3693

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_000918	TTCA	2	8	1464262	1464269	25 %	50 %	0 %	25 %	15607042
3502	NC_000918	TTGG	2	8	1464295	1464302	0 %	50 %	50 %	0 %	15607042
3503	NC_000918	GGGC	2	8	1464765	1464772	0 %	0 %	75 %	25 %	15607043
3504	NC_000918	CTTT	2	8	1464800	1464807	0 %	75 %	0 %	25 %	15607043
3505	NC_000918	CTAC	2	8	1464957	1464964	25 %	25 %	0 %	50 %	15607043
3506	NC_000918	AAAG	2	8	1465157	1465164	75 %	0 %	25 %	0 %	15607043
3507	NC_000918	AGGA	2	8	1465284	1465291	50 %	0 %	50 %	0 %	15607043
3508	NC_000918	AGAA	2	8	1465736	1465743	75 %	0 %	25 %	0 %	15607043
3509	NC_000918	GAAC	2	8	1465873	1465880	50 %	0 %	25 %	25 %	15607043
3510	NC_000918	TTTC	2	8	1466881	1466888	0 %	75 %	0 %	25 %	15607044
3511	NC_000918	ACGT	2	8	1468530	1468537	25 %	25 %	25 %	25 %	15607047
3512	NC_000918	TCTT	2	8	1468660	1468667	0 %	75 %	0 %	25 %	15607047
3513	NC_000918	TACA	2	8	1469097	1469104	50 %	25 %	0 %	25 %	15607048
3514	NC_000918	CTTT	2	8	1469110	1469117	0 %	75 %	0 %	25 %	15607048
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3517	NC_000918	AAAG	2	8	1471375	1471382	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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3520	NC_000918	CCTT	2	8	1473245	1473252	0 %	50 %	0 %	50 %	15607051
3521	NC_000918	CCTC	2	8	1473273	1473280	0 %	25 %	0 %	75 %	15607051
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3550	NC_000918	TGAT	2	8	1486935	1486942	25 %	50 %	25 %	0 %	15607064
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3569	NC_000918	CCTT	2	8	1496339	1496346	0 %	50 %	0 %	50 %	15607073
3570	NC_000918	TTAT	2	8	1496422	1496429	25 %	75 %	0 %	0 %	15607073
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3573	NC_000918	TCTT	2	8	1496852	1496859	0 %	75 %	0 %	25 %	15607073
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3614	NC_000918	CGGG	2	8	1515355	1515362	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_000918	ATAC	2	8	1515566	1515573	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.