MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 37127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3004	NC_000854	AC	3	6	143468	143473	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3005	NC_000854	CTC	2	6	143476	143481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_000854	C	6	6	143486	143491	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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3009	NC_000854	TCA	2	6	143598	143603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3013	NC_000854	TCT	2	6	143835	143840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430926
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3015	NC_000854	AG	3	6	143926	143931	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_000854	CGGC	2	8	143979	143986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_000854	G	6	6	144039	144044	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3019	NC_000854	GAG	2	6	144075	144080	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_000854	TCC	2	6	144086	144091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3022	NC_000854	C	6	6	144121	144126	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3023	NC_000854	TCT	2	6	144152	144157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_000854	CA	3	6	144187	144192	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3030	NC_000854	CAGC	2	8	144421	144428	25 %	0 %	25 %	50 %	118430927
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3124	NC_000854	TCAG	2	8	148550	148557	25 %	25 %	25 %	25 %	118430931
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3230	NC_000854	TAGAT	2	10	153558	153567	40 %	40 %	20 %	0 %	118430934
3231	NC_000854	CTA	2	6	153637	153642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3240	NC_000854	CAT	2	6	153975	153980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430935
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3242	NC_000854	G	6	6	154018	154023	0 %	0 %	100 %	0 %	118430935
3243	NC_000854	GTT	2	6	154087	154092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430935
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3249	NC_000854	CCT	2	6	154426	154431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430935
3250	NC_000854	CCT	2	6	154442	154447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430935
3251	NC_000854	G	6	6	154468	154473	0 %	0 %	100 %	0 %	118430935
3252	NC_000854	AAAT	2	8	154516	154523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3253	NC_000854	GCC	2	6	154557	154562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3254	NC_000854	TGG	2	6	154569	154574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3255	NC_000854	GGA	2	6	154583	154588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430936
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3257	NC_000854	GCC	2	6	154694	154699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430936
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3324	NC_000854	GAG	2	6	157724	157729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3373	NC_000854	CT	3	6	160088	160093	0 %	50 %	0 %	50 %	14600540
3374	NC_000854	GCGTCA	2	12	160100	160111	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	14600540
3375	NC_000854	C	6	6	160116	160121	0 %	0 %	0 %	100 %	14600540
3376	NC_000854	ACT	2	6	160136	160141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600540
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3378	NC_000854	CT	3	6	160228	160233	0 %	50 %	0 %	50 %	14600540
3379	NC_000854	CTCC	2	8	160317	160324	0 %	25 %	0 %	75 %	14600540
3380	NC_000854	CTGG	2	8	160340	160347	0 %	25 %	50 %	25 %	14600540
3381	NC_000854	CT	3	6	160373	160378	0 %	50 %	0 %	50 %	14600540
3382	NC_000854	C	6	6	160379	160384	0 %	0 %	0 %	100 %	14600540
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3390	NC_000854	AGT	2	6	161234	161239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600540
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3394	NC_000854	AGCC	2	8	161340	161347	25 %	0 %	25 %	50 %	118430940
3395	NC_000854	AG	3	6	161348	161353	50 %	0 %	50 %	0 %	118430940
3396	NC_000854	AGGAG	2	10	161447	161456	40 %	0 %	60 %	0 %	118430940
3397	NC_000854	C	7	7	161532	161538	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3398	NC_000854	TGGG	2	8	161565	161572	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3399	NC_000854	G	6	6	161570	161575	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3400	NC_000854	GT	3	6	161584	161589	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3401	NC_000854	G	6	6	161625	161630	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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3403	NC_000854	TG	3	6	161774	161779	0 %	50 %	50 %	0 %	118430941
3404	NC_000854	CT	3	6	161872	161877	0 %	50 %	0 %	50 %	118430941
3405	NC_000854	CCT	2	6	161947	161952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430941
3406	NC_000854	CCT	2	6	162100	162105	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430941
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3415	NC_000854	TTA	2	6	162622	162627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3416	NC_000854	GCA	2	6	162632	162637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3418	NC_000854	GGT	2	6	162667	162672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3419	NC_000854	AGA	2	6	162677	162682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3421	NC_000854	AG	3	6	162722	162727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3422	NC_000854	CAG	3	9	162730	162738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3423	NC_000854	AAG	2	6	162739	162744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3424	NC_000854	GAA	2	6	162747	162752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3425	NC_000854	T	6	6	162801	162806	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3449	NC_000854	TAGAC	2	10	163804	163813	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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3451	NC_000854	GGC	2	6	163897	163902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3452	NC_000854	GTGG	2	8	163941	163948	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3453	NC_000854	GAA	2	6	164059	164064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600545
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3475	NC_000854	CGG	2	6	165087	165092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3483	NC_000854	AAG	2	6	165467	165472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430943
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3494	NC_000854	CT	3	6	166207	166212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3495	NC_000854	GAA	2	6	166306	166311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3496	NC_000854	TGC	2	6	166347	166352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3498	NC_000854	TAT	2	6	166437	166442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430945
3499	NC_000854	CT	3	6	166464	166469	0 %	50 %	0 %	50 %	118430945
3500	NC_000854	CT	3	6	166480	166485	0 %	50 %	0 %	50 %	118430945

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