MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 37127

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_000854	AAG	2	6	1521802	1521807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431858
34003	NC_000854	AG	3	6	1521927	1521932	50 %	0 %	50 %	0 %	118431858
34004	NC_000854	AGG	2	6	1521940	1521945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602037
34005	NC_000854	AG	3	6	1521951	1521956	50 %	0 %	50 %	0 %	14602037
34006	NC_000854	GGC	2	6	1521957	1521962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14602037
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34008	NC_000854	TGG	2	6	1521986	1521991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14602037
34009	NC_000854	GCC	2	6	1522045	1522050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14602037
34010	NC_000854	C	6	6	1522078	1522083	0 %	0 %	0 %	100 %	14602037
34011	NC_000854	TGC	2	6	1522199	1522204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602037
34012	NC_000854	GCCC	2	8	1522266	1522273	0 %	0 %	25 %	75 %	14602037
34013	NC_000854	GCT	2	6	1522300	1522305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602037
34014	NC_000854	GCG	2	6	1522318	1522323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14602037
34015	NC_000854	GCCCA	2	10	1522347	1522356	20 %	0 %	20 %	60 %	14602037
34016	NC_000854	TAA	2	6	1522373	1522378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14602037
34017	NC_000854	AAT	2	6	1522446	1522451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14602037
34018	NC_000854	GGCCC	2	10	1522484	1522493	0 %	0 %	40 %	60 %	14602037
34019	NC_000854	GGA	2	6	1522524	1522529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602037
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34021	NC_000854	TGG	2	6	1522634	1522639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14602037
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34026	NC_000854	CGTGG	2	10	1522771	1522780	0 %	20 %	60 %	20 %	14602037
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34035	NC_000854	GC	3	6	1523206	1523211	0 %	0 %	50 %	50 %	118431859
34036	NC_000854	GAG	2	6	1523229	1523234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431859
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34088	NC_000854	CCTC	2	8	1525510	1525517	0 %	25 %	0 %	75 %	118431861
34089	NC_000854	AGC	2	6	1525518	1525523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431861
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34091	NC_000854	TAGG	2	8	1525592	1525599	25 %	25 %	50 %	0 %	118431861
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34098	NC_000854	GCT	2	6	1525903	1525908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431862
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34100	NC_000854	GCA	2	6	1525974	1525979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431862
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34102	NC_000854	CT	3	6	1526087	1526092	0 %	50 %	0 %	50 %	118431862
34103	NC_000854	AGG	2	6	1526123	1526128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431862
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34107	NC_000854	AT	3	6	1526317	1526322	50 %	50 %	0 %	0 %	118431862
34108	NC_000854	C	6	6	1526369	1526374	0 %	0 %	0 %	100 %	118431862
34109	NC_000854	ACCC	2	8	1526432	1526439	25 %	0 %	0 %	75 %	118431862
34110	NC_000854	CCA	2	6	1526441	1526446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431862
34111	NC_000854	CCA	2	6	1526525	1526530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14602043
34112	NC_000854	CCTC	2	8	1526537	1526544	0 %	25 %	0 %	75 %	14602043
34113	NC_000854	CAG	3	9	1526625	1526633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602043
34114	NC_000854	CGT	2	6	1526666	1526671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602043
34115	NC_000854	GAC	2	6	1526673	1526678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602043
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34117	NC_000854	CT	3	6	1526705	1526710	0 %	50 %	0 %	50 %	14602043
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34230	NC_000854	GGCAG	2	10	1532284	1532293	20 %	0 %	60 %	20 %	14602051
34231	NC_000854	GA	3	6	1532300	1532305	50 %	0 %	50 %	0 %	14602051
34232	NC_000854	GAG	2	6	1532445	1532450	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602051
34233	NC_000854	CT	3	6	1532456	1532461	0 %	50 %	0 %	50 %	14602051
34234	NC_000854	CCG	2	6	1532514	1532519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14602051
34235	NC_000854	GCACA	2	10	1532592	1532601	40 %	0 %	20 %	40 %	14602051
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34237	NC_000854	AGG	2	6	1532622	1532627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602051
34238	NC_000854	AGGC	2	8	1532667	1532674	25 %	0 %	50 %	25 %	14602051
34239	NC_000854	ACT	2	6	1532677	1532682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14602051
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34243	NC_000854	TCT	2	6	1532846	1532851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14602052
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34262	NC_000854	CGG	2	6	1533502	1533507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14602052
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34264	NC_000854	TCA	2	6	1533563	1533568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14602052
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34267	NC_000854	TGG	2	6	1533618	1533623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14602052
34268	NC_000854	CGGG	2	8	1533663	1533670	0 %	0 %	75 %	25 %	14602052
34269	NC_000854	G	6	6	1533686	1533691	0 %	0 %	100 %	0 %	14602052
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34325	NC_000854	CTC	2	6	1535984	1535989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602054
34326	NC_000854	ACG	2	6	1536006	1536011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602054
34327	NC_000854	CGCCA	2	10	1536025	1536034	20 %	0 %	20 %	60 %	14602054
34328	NC_000854	TAG	2	6	1536093	1536098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34329	NC_000854	GAT	2	6	1536110	1536115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34330	NC_000854	CAG	2	6	1536124	1536129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602055
34331	NC_000854	AGGC	2	8	1536190	1536197	25 %	0 %	50 %	25 %	14602055
34332	NC_000854	AGG	3	9	1536287	1536295	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602055
34333	NC_000854	GGA	2	6	1536301	1536306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602055
34334	NC_000854	GAG	2	6	1536380	1536385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602055
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34336	NC_000854	CTG	2	6	1536498	1536503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602055
34337	NC_000854	G	6	6	1536547	1536552	0 %	0 %	100 %	0 %	14602055
34338	NC_000854	G	6	6	1536566	1536571	0 %	0 %	100 %	0 %	14602055
34339	NC_000854	G	6	6	1536579	1536584	0 %	0 %	100 %	0 %	14602055
34340	NC_000854	GGT	2	6	1536637	1536642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14602055
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34342	NC_000854	CTC	2	6	1536704	1536709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602055
34343	NC_000854	GCC	2	6	1536718	1536723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14602055
34344	NC_000854	GTT	2	6	1536758	1536763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14602055
34345	NC_000854	G	6	6	1536801	1536806	0 %	0 %	100 %	0 %	14602055
34346	NC_000854	AGG	2	6	1536836	1536841	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602055
34347	NC_000854	G	6	6	1536868	1536873	0 %	0 %	100 %	0 %	14602055
34348	NC_000854	CTG	2	6	1536880	1536885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602055
34349	NC_000854	AGA	2	6	1536895	1536900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14602055
34350	NC_000854	AGC	2	6	1536947	1536952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602055
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34352	NC_000854	AGG	2	6	1537016	1537021	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602055
34353	NC_000854	CGG	2	6	1537036	1537041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14602055
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34472	NC_000854	TCCC	2	8	1542176	1542183	0 %	25 %	0 %	75 %	14602062
34473	NC_000854	CTC	2	6	1542263	1542268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602062
34474	NC_000854	CAG	2	6	1542295	1542300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602062
34475	NC_000854	GGC	2	6	1542324	1542329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14602062
34476	NC_000854	GCG	2	6	1542373	1542378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14602062
34477	NC_000854	TGG	2	6	1542399	1542404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14602062
34478	NC_000854	GA	4	8	1542417	1542424	50 %	0 %	50 %	0 %	14602062
34479	NC_000854	GCTT	2	8	1542554	1542561	0 %	50 %	25 %	25 %	14602062
34480	NC_000854	A	7	7	1542562	1542568	100 %	0 %	0 %	0 %	14602062
34481	NC_000854	GGC	2	6	1542633	1542638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14602062
34482	NC_000854	GGA	2	6	1542687	1542692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602062
34483	NC_000854	CTC	2	6	1542700	1542705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14602062
34484	NC_000854	TGC	2	6	1542825	1542830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602062
34485	NC_000854	AGGC	2	8	1542862	1542869	25 %	0 %	50 %	25 %	14602062
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34487	NC_000854	GCT	2	6	1542933	1542938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602062
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34489	NC_000854	TAG	2	6	1543059	1543064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14602062
34490	NC_000854	GCT	2	6	1543074	1543079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602062
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34492	NC_000854	GCG	2	6	1543124	1543129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14602062
34493	NC_000854	GCT	2	6	1543131	1543136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602062
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34496	NC_000854	TCA	2	6	1543215	1543220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431871
34497	NC_000854	GTCT	2	8	1543237	1543244	0 %	50 %	25 %	25 %	118431871
34498	NC_000854	CGT	2	6	1543362	1543367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431871
34499	NC_000854	CTC	2	6	1543441	1543446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431871
34500	NC_000854	CTT	2	6	1543450	1543455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431871

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