MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 3447

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_000854	ATGG	2	8	731632	731639	25 %	25 %	50 %	0 %	14601230
1502	NC_000854	TCCT	2	8	731720	731727	0 %	50 %	0 %	50 %	14601230
1503	NC_000854	TCTA	2	8	732473	732480	25 %	50 %	0 %	25 %	14601230
1504	NC_000854	CCTA	2	8	732851	732858	25 %	25 %	0 %	50 %	14601231
1505	NC_000854	TATG	2	8	732875	732882	25 %	50 %	25 %	0 %	14601231
1506	NC_000854	ATAC	2	8	733957	733964	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_000854	CTAT	2	8	734010	734017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_000854	TTTA	2	8	734147	734154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_000854	TCTT	2	8	734402	734409	0 %	75 %	0 %	25 %	14601232
1510	NC_000854	CAGT	2	8	735340	735347	25 %	25 %	25 %	25 %	14601232
1511	NC_000854	TAAG	2	8	735665	735672	50 %	25 %	25 %	0 %	14601232
1512	NC_000854	CCTA	2	8	735738	735745	25 %	25 %	0 %	50 %	14601232
1513	NC_000854	TTAA	2	8	736807	736814	50 %	50 %	0 %	0 %	14601233
1514	NC_000854	TAAT	2	8	736960	736967	50 %	50 %	0 %	0 %	14601233
1515	NC_000854	AATA	2	8	737843	737850	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_000854	AAAT	2	8	738674	738681	75 %	25 %	0 %	0 %	14601234
1517	NC_000854	TCGA	2	8	739611	739618	25 %	25 %	25 %	25 %	118431353
1518	NC_000854	TATG	2	8	739711	739718	25 %	50 %	25 %	0 %	118431353
1519	NC_000854	TTTC	2	8	739769	739776	0 %	75 %	0 %	25 %	118431353
1520	NC_000854	AAGC	2	8	740440	740447	50 %	0 %	25 %	25 %	118431353
1521	NC_000854	TAAA	2	8	740678	740685	75 %	25 %	0 %	0 %	118431354
1522	NC_000854	TGAC	2	8	740739	740746	25 %	25 %	25 %	25 %	118431354
1523	NC_000854	GTAA	2	8	740813	740820	50 %	25 %	25 %	0 %	118431354
1524	NC_000854	ACTT	2	8	741249	741256	25 %	50 %	0 %	25 %	118431354
1525	NC_000854	CGTA	2	8	741353	741360	25 %	25 %	25 %	25 %	118431354
1526	NC_000854	AAGC	2	8	742278	742285	50 %	0 %	25 %	25 %	118431354
1527	NC_000854	TGTC	2	8	744736	744743	0 %	50 %	25 %	25 %	14602202
1528	NC_000854	ATAG	2	8	744924	744931	50 %	25 %	25 %	0 %	118431355
1529	NC_000854	GTAT	2	8	745527	745534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_000854	CCTT	2	8	747626	747633	0 %	50 %	0 %	50 %	14601240
1531	NC_000854	AAAT	2	8	748265	748272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_000854	TAGA	2	8	748412	748419	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_000854	TGCC	2	8	749518	749525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1534	NC_000854	CCCT	2	8	749827	749834	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1535	NC_000854	AGGC	2	8	749988	749995	25 %	0 %	50 %	25 %	118431359
1536	NC_000854	CCTC	2	8	750072	750079	0 %	25 %	0 %	75 %	118431359
1537	NC_000854	ACAG	2	8	750228	750235	50 %	0 %	25 %	25 %	118431359
1538	NC_000854	TAGG	2	8	750259	750266	25 %	25 %	50 %	0 %	118431359
1539	NC_000854	TCGG	2	8	750631	750638	0 %	25 %	50 %	25 %	118431359
1540	NC_000854	GGAG	2	8	750658	750665	25 %	0 %	75 %	0 %	118431360
1541	NC_000854	AGGC	2	8	751101	751108	25 %	0 %	50 %	25 %	118431360
1542	NC_000854	CTGG	2	8	751300	751307	0 %	25 %	50 %	25 %	118431360
1543	NC_000854	AACC	2	8	752834	752841	50 %	0 %	0 %	50 %	14601246
1544	NC_000854	AGCA	2	8	753031	753038	50 %	0 %	25 %	25 %	14601246
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1547	NC_000854	GGCC	2	8	754218	754225	0 %	0 %	50 %	50 %	118431361
1548	NC_000854	GCGA	2	8	754310	754317	25 %	0 %	50 %	25 %	118431361
1549	NC_000854	GGGA	2	8	754604	754611	25 %	0 %	75 %	0 %	118431361
1550	NC_000854	GCCC	2	8	755058	755065	0 %	0 %	25 %	75 %	118431362
1551	NC_000854	CCTC	2	8	755145	755152	0 %	25 %	0 %	75 %	118431362
1552	NC_000854	GGCA	2	8	755791	755798	25 %	0 %	50 %	25 %	118431362
1553	NC_000854	GGCT	2	8	756273	756280	0 %	25 %	50 %	25 %	118431362
1554	NC_000854	TACA	2	8	756314	756321	50 %	25 %	0 %	25 %	118431362
1555	NC_000854	AGCA	2	8	756347	756354	50 %	0 %	25 %	25 %	118431362
1556	NC_000854	CTAC	2	8	756784	756791	25 %	25 %	0 %	50 %	118431363
1557	NC_000854	GGCG	2	8	757234	757241	0 %	0 %	75 %	25 %	118431363
1558	NC_000854	AGGG	2	8	757455	757462	25 %	0 %	75 %	0 %	118431363
1559	NC_000854	CCTA	2	8	757518	757525	25 %	25 %	0 %	50 %	118431363
1560	NC_000854	CTCG	2	8	757867	757874	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1561	NC_000854	TGCG	2	8	758741	758748	0 %	25 %	50 %	25 %	14601251
1562	NC_000854	GTGG	2	8	759637	759644	0 %	25 %	75 %	0 %	118431364
1563	NC_000854	CATT	2	8	760603	760610	25 %	50 %	0 %	25 %	14601253
1564	NC_000854	ACGA	2	8	761172	761179	50 %	0 %	25 %	25 %	118431368
1565	NC_000854	CCCT	2	8	761322	761329	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1566	NC_000854	TTAT	2	8	761499	761506	25 %	75 %	0 %	0 %	118431369
1567	NC_000854	ATTT	2	8	761555	761562	25 %	75 %	0 %	0 %	118431369
1568	NC_000854	TAGT	2	8	762316	762323	25 %	50 %	25 %	0 %	118431369
1569	NC_000854	GGAG	2	8	762454	762461	25 %	0 %	75 %	0 %	118431369
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1571	NC_000854	GCTG	2	8	763577	763584	0 %	25 %	50 %	25 %	118431370
1572	NC_000854	CTAG	2	8	763854	763861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1573	NC_000854	CTCC	2	8	764611	764618	0 %	25 %	0 %	75 %	118431371
1574	NC_000854	AGGG	2	8	765098	765105	25 %	0 %	75 %	0 %	118431371
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1576	NC_000854	CCTA	2	8	766148	766155	25 %	25 %	0 %	50 %	118431371
1577	NC_000854	CAGG	2	8	766923	766930	25 %	0 %	50 %	25 %	118431371
1578	NC_000854	GGGC	2	8	767192	767199	0 %	0 %	75 %	25 %	118431371
1579	NC_000854	GTGG	2	8	767238	767245	0 %	25 %	75 %	0 %	118431371
1580	NC_000854	TCCC	2	8	767260	767267	0 %	25 %	0 %	75 %	118431371
1581	NC_000854	CCTA	2	8	767624	767631	25 %	25 %	0 %	50 %	118431371
1582	NC_000854	GTGA	2	8	767656	767663	25 %	25 %	50 %	0 %	118431371
1583	NC_000854	CCTC	2	8	767966	767973	0 %	25 %	0 %	75 %	118431371
1584	NC_000854	CTAT	2	8	768187	768194	25 %	50 %	0 %	25 %	118431371
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1600	NC_000854	GCTA	2	8	776236	776243	25 %	25 %	25 %	25 %	118431374
1601	NC_000854	CAGG	2	8	777034	777041	25 %	0 %	50 %	25 %	14601271
1602	NC_000854	AAAG	2	8	777138	777145	75 %	0 %	25 %	0 %	14601271
1603	NC_000854	CCTC	2	8	777470	777477	0 %	25 %	0 %	75 %	14601271
1604	NC_000854	CACT	2	8	777787	777794	25 %	25 %	0 %	50 %	14601271
1605	NC_000854	GCGG	2	8	778056	778063	0 %	0 %	75 %	25 %	14601272
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1608	NC_000854	ATCT	2	8	779711	779718	25 %	50 %	0 %	25 %	14601273
1609	NC_000854	CCTG	2	8	779966	779973	0 %	25 %	25 %	50 %	14601273
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1614	NC_000854	CCCT	2	8	783105	783112	0 %	25 %	0 %	75 %	118431377
1615	NC_000854	TGGG	2	8	785268	785275	0 %	25 %	75 %	0 %	118431380
1616	NC_000854	CAAC	2	8	785442	785449	50 %	0 %	0 %	50 %	118431380
1617	NC_000854	TAGC	2	8	785747	785754	25 %	25 %	25 %	25 %	118431381
1618	NC_000854	TCCT	2	8	785755	785762	0 %	50 %	0 %	50 %	118431381
1619	NC_000854	AACA	2	8	786277	786284	75 %	0 %	0 %	25 %	118431381
1620	NC_000854	TAAA	2	8	786626	786633	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_000854	AGAA	2	8	786740	786747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_000854	AGAA	2	8	787059	787066	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_000854	GGCG	2	8	787085	787092	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1624	NC_000854	GGCA	2	8	788349	788356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_000854	GCCT	2	8	788463	788470	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1626	NC_000854	CGCC	2	8	788659	788666	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1627	NC_000854	GCCA	2	8	788733	788740	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_000854	CAGC	2	8	789158	789165	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1629	NC_000854	CTCC	3	12	789820	789831	0 %	25 %	0 %	75 %	118431383
1630	NC_000854	AGGG	2	8	790110	790117	25 %	0 %	75 %	0 %	118431383
1631	NC_000854	CCGG	2	8	790163	790170	0 %	0 %	50 %	50 %	118431383
1632	NC_000854	GCCA	2	8	790268	790275	25 %	0 %	25 %	50 %	118431383
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