ChloroMitoSSRDB 2.0 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

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Chloroplast Motifs - Imperfect TAATT Repeats

S.NoSequence IDMotifIterationsStartEndTract LengthSequence Name
1NC_010772TAATT514458014460425 Heterosigma akashiwo chloroplast
2NC_008235TAATT4508605087819 Populus alba chloroplast
3NC_012224TAATT4647666478419 Jatropha curcas chloroplast
4NC_011087TAATT3970679708115Paulinella chromatophora chromatophore
5NC_011087TAATT377840577841814Paulinella chromatophora chromatophore
6NC_011087TAATT394165694167116Paulinella chromatophora chromatophore
7NC_014674TAATT3115101152415Castanea mollissima chloroplast
8NC_014699TAATT3781437815715Equisetum arvense chloroplast
9NC_015204TAATT3447664477914Gossypium thurberi chloroplast
10NC_015891TAATT3470694708214Spirodela polyrhiza chloroplast
11NC_016668TAATT3446264463914Gossypium raimondii chloroplast
12NC_016670TAATT3448714488414Gossypium darwinii chloroplast
13NC_016690TAATT3448644487714Gossypium tomentosum chloroplast
14NC_016692TAATT3447554476814Gossypium herbaceum subsp. africanum chloroplast
15NC_016703TAATT3779147792714Phaeocystis antarctica strain CCMP1374 plastid
16NC_016711TAATT3448234483614Gossypium mustelinum chloroplast
17NC_016712TAATT3447284474114Gossypium arboreum chloroplast
18NC_016731TAATT3916479166115Synedra acus chloroplast
19NC_017894TAATT3446454465814Gossypium gossypioides chloroplast
20NC_018109TAATT3442614427414Gossypium incanum chloroplast
21NC_018111TAATT3442234423614Gossypium capitis-viridis chloroplast
22NC_020018TAATT3129071292115Monomorphina aenigmatica strain UTEX1284 chloroplast
23NC_020098TAATT315016415Tectona grandis chloroplast
24NC_020152TAATT3114621147615Quercus rubra plastid
25NC_021110TAATT3232012321515Cephalotaxus oliveri chloroplast
26NC_021637TAATT3797837979614Phaeocystis globosa strain Pg-G(A) chloroplast
27NC_001568TAATT3169571697014 Epifagus virginiana chloroplast
28NC_001799TAATT3274832749816 Toxoplasma gondii RH apicoplast
29NC_001840TAATT313175413176815 Cyanidium caldarium chloroplast
30NC_001879TAATT3148911490515 Nicotiana tabacum plastid
31NC_002652TAATT3198241983714 Euglena longa plastid
32NC_007500TAATT3148891490315 Nicotiana sylvestris chloroplast
33NC_007602TAATT3148431485715 Nicotiana tomentosiformis chloroplast
34NC_007944TAATT3447914480414 Gossypium hirsutum chloroplast
35NC_008117TAATT3660416605515 Zygnema circumcarinatum chloroplast
36NC_008325TAATT312010012011415 Daucus carota chloroplast
37NC_008457TAATT312712312713715 Piper cenocladum chloroplast
38NC_008641TAATT3448424485514 Gossypium barbadense chloroplast
39NC_009275TAATT312400012401415 Nasturtium officinale chloroplast
40NC_010109TAATT3146061461914 Lemna minor chloroplast
41NC_010109TAATT312881812883215 Lemna minor chloroplast
42NC_010776TAATT3776907770314 Fagopyrum esculentum subsp. ancestrale chloroplast
43NC_011600TAATT3996979971216 Vaucheria litorea chloroplast
44NC_012099TAATT3349953500915 Pyramimonas parkeae chloroplast
45NC_012898TAATT3778137782614 Aureococcus anophagefferens chloroplast
46NC_013359TAATT3626846269714 Bryopsis hypnoides chloroplast
47NC_013498TAATT3333743338714 Ectocarpus siliculosus chloroplast