Compound Repeats of Thraustotheca clavata mitochondrion
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| S.No. | Genome ID | SSR | SSR Type | Start | End | Tract Length | Primer Design |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | NC_022179 | (A)10cagaataaactgaatttttagaatatataacaaatatagctgacgttaatgctatacttgaaaat(A)16cttcatgatttataaaaaac(AT)6 | c | 5924 | 6046 | 123 | Design Primer |
| 2 | NC_022179 | (TAA)4tataacaagctattttaaattgcatttattagaattacgatataatgttttcataattcttttttc(T)10 | c | 21886 | 21973 | 88 | Design Primer |
| 3 | NC_022179 | (TA)10(TTAT)3ccttttattttatattttttaattataaacaatatattaaaaataaatatttttttaaaatataaaaaaatttta(TATTT)3atagttatttttattataataccaattgatttgtataatcaatta(TATTT)3gtaattttttttacagagatatctatatatatttattttttaaaaaaaaactataaaaaata(ATTT)3 | c | 22380 | 22635 | 256 | Design Primer |
| 4 | NC_022179 | (A)10caaataaatttattttagaatttag(A)12 | c | 24581 | 24627 | 47 | Design Primer |
| 5 | NC_022179 | (T)10aaaatcgcatgttaaaatatataaatatcaaaaaaatttaaaattttatatttataaatattt(A)17gattaaaagataaaaaaatattaaaatttttaagtatttgtcaaattgcttttgccttaaataaaatagatattatttctaaatacataataagaactat(A)14 | c | 25183 | 25386 | 204 | Design Primer |
| 6 | NC_022179 | (A)11tatatataattcctattt(A)10tttaattt(A)11ttaaacttaaatttaaaaaatt(A)11ctcagtatttttattataaaaatgaattaaaaaaaaataaattaaaatttaatttttcacgaatattttcaattaaagattt(A)14 | c | 26908 | 27094 | 187 | Design Primer |
| 7 | NC_022179 | (T)11agtattaattgtaatatttgttagttggattttagctagatgta(T)11 | c | 35774 | 35839 | 66 | Design Primer |