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ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Repeats of Candida norvegica strain CBS 2874 mitochondrion

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S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_022175(AATA)4p4304516Design Primer
2NC_022175(AT)6p21667167812Design Primer
3NC_022175(TTA)4attttaattatttaattatattatttataatatatttttatataatcttttaattattaattatttataattattactttatatttct(TTA)6c22902407118Design Primer
4NC_022175(ATTA)3p42650266112Design Primer
5NC_022175(C)11p13420343011Design Primer
6NC_022175(G)10atactattttataaaatagtgtaggtaaaagatgtagttaatatag(TTAA)3c3670373768Design Primer
7NC_022175(ATAA)3p43988399912Design Primer
8NC_022175(AT)6p24272428312Design Primer
9NC_022175(AAT)4p34603461412Design Primer
10NC_022175(AT)6p25298530912Design Primer
11NC_022175(AATT)3p46819683012Design Primer
12NC_022175(ATTA)3p47269728012Design Primer
13NC_022175(G)10p17513752210Design Primer
14NC_022175(TTA)4p37793780412Design Primer
15NC_022175(TAA)7p37985800521Design Primer
16NC_022175(TATG)3p48366837712Design Primer
17NC_022175(G)10p19063907210Design Primer
18NC_022175(TAT)4p39755976612Design Primer
19NC_022175(TTA)4p3101701018112Design Primer
20NC_022175(ATA)5p3108751088915Design Primer
21NC_022175(TAA)4p3110111102212Design Primer
22NC_022175(AAT)5a(AATT)3atcaacatataacatatatttatgaattatcatttattaaacataatttattcttagttattagttta(ATT)4ggttcatttattggtataccacctttattaggtttttatggtaaatataatatattaatttcatctat(TAA)4tttatttttatctattttattaataatttctagtgttatttcttctatattttatttatatttcttaaataaagtattaat(TAA)6tattattata(AAT)7c1188812205318Design Primer
23NC_022175(ATTAA)3p5123281234215Design Primer
24NC_022175(T)12p1128541286512Design Primer
25NC_022175(A)10ccgcccctcactcattgagtga(G)10c130821312342Design Primer
26NC_022175(TAA)12p3134541348936Design Primer
27NC_022175(AT)8p2137101372516Design Primer
28NC_022175(TATT)3p4142791429012Design Primer
29NC_022175(ATT)4p3145101452112Design Primer
30NC_022175(AAT)4p3150591507012Design Primer
31NC_022175(AAT)4p3152151522612Design Primer
32NC_022175(C)17p1153321534817Design Primer
33NC_022175(AAT)5catc(AT)8aataaatataaatatgattaagattactttaataaaaattaaagagataaaaaataaccttaaataatataatatataa(AATT)4c1549715626130Design Primer
34NC_022175(ATA)4p3158521586312Design Primer
35NC_022175(TAA)5tattataaataatag(TAA)4ttattatacatcaataattaatgatataaataatatattaggtagttataatataaataaat(ATA)5c1603616154119Design Primer
36NC_022175(AAT)6p3164121642918Design Primer
37NC_022175(TA)7ataatatataagttaatataaataatatatttaattaaataaaaaaataataaata(TATT)3c174661754782Design Primer
38NC_022175(A)15p1176601767415Design Primer
39NC_022175(TATT)3ttt(ATTA)5c184601849435Design Primer
40NC_022175(AT)7taataaataataaaggatatctattaat(A)10c186811873252Design Primer
41NC_022175(TA)6p2189161892712Design Primer
42NC_022175(TA)6p2213142132512Design Primer
43NC_022175(AATA)3p4214482145912Design Primer
44NC_022175(AT)6p2223172232812Design Primer
45NC_022175(A)12p1225062251712Design Primer
46NC_022175(AATA)3p4230472305812Design Primer
47NC_022175(ATT)4p3235972360812Design Primer
48NC_022175(TATAA)3p5238942390815Design Primer
49NC_022175(C)10p1241162412510Design Primer
50NC_022175(ATAA)3p4244362444712Design Primer
51NC_022175(TTTA)3p4246992471012Design Primer
52NC_022175(G)10p1252592526810Design Primer
53NC_022175(TAT)4attaattgttgtgaatttataaataattatataat(TAA)7c264342650168Design Primer
54NC_022175(AAT)7p3267012672121Design Primer
55NC_022175(TTA)4p3272912730212Design Primer
56NC_022175(AATA)3p4274052741612Design Primer
57NC_022175(A)10gaaatattattttatattaatattttagtaataattatattcataattattattaatatatattttaataaaaaaataaattcaaatatattatta(AAT)7aaattaaatatatattcatta(AAT)5c2807928241163Design Primer
58NC_022175(TAT)4p3288372884812Design Primer
59NC_022175(A)10p1290782908710Design Primer
60NC_022175(AT)6p2299592997012Design Primer
61NC_022175(TATT)3p4303173032812Design Primer
62NC_022175(TTA)4p3311073111812Design Primer
63NC_022175(TA)6p2314963150712Design Primer
64NC_022175(ATT)5p3322493226315Design Primer
65NC_022175(T)13p1331623317413Design Primer
66NC_022175(AT)7taaatcatatta(ATTT)3c336213365838Design Primer
67NC_022175(ATA)6p3339003391718Design Primer
68NC_022175(A)11p1340213403111Design Primer
69NC_022175(TATTTA)3p6343313434818Design Primer
70NC_022175(AT)6p2346533466412Design Primer
71NC_022175(TTAA)3p4355553556612Design Primer
72NC_022175(ATAA)3tataaataagtaaa(AT)6tattaattattaa(AATT)3c358433590563Design Primer
73NC_022175(C)12tttgaggggggttattagtaatttaatatatatattata(TTAT)3c363803644263Design Primer
74NC_022175(ATTA)5p4366513667020Design Primer
75NC_022175(TTA)5attataattaagaaataatatttttataataattattattataatataagtaatatattt(TA)6gatagctacataataatttttaagctaatagaa(AT)7taacgttaatt(ATTA)3ttaataaatacgtccttttat(A)10ttttttaataatgatatataatatatt(ATA)5(AT)7*taaaaggaaataaattatctaattatacccccactatgagggtgaaacttatttaataaattacgcctacgacgtaatgaaagatatttat(A)13c*3708737431345Design Primer
76NC_022175(TA)7p2375383755114Design Primer
77NC_022175(ATA)4p3380053801612Design Primer
78NC_022175(TAT)4p3381643817512Design Primer
79NC_022175(AATA)3p4384703848112Design Primer
80NC_022175(AATA)4p4386543866916Design Primer
81NC_022175(TAA)4p3388993891012Design Primer
82NC_022175(AAT)4p3391403915112Design Primer
83NC_022175(TAA)4p3394763948712Design Primer
84NC_022175(ATA)5p3397693978315Design Primer
85NC_022175(TTAT)4p4399573997216Design Primer
86NC_022175(A)10t(A)12c407774079923Design Primer
87NC_022175(ATT)7p3416404166021Design Primer
88NC_022175(TAT)7p3420314205121Design Primer
89NC_022175(AT)6p2421584216912Design Primer