Compound Compound Repeats of Candida blackwellae strain AS2.3639 mitochondrion
Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
| S.No. | Genome ID | SSR | SSR Type | Start | End | Tract Length | Primer Design |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | NC_022173 | (AGATA)3tatataaagtatattatatataatctaattatttatataataataaagtatattctaaataatctaataatttat(ATA)5tttaatatagttataacacctccccgactcttacgaagtaagagtcggggagaggtatagtatttatgttaatcataataattataattaatattct(ATA)14 | c | 942 | 1185 | 244 | Design Primer |
| 2 | NC_022173 | (TTA)4atacttatat(TTA)5 | c | 10130 | 10166 | 37 | Design Primer |
| 3 | NC_022173 | (TTA)4atattcttcaccccgcaccttcggtgcggggatagatatctttgttatattatattgttattat(TA)7tttaaattaataa(ATT)4actatgaatgttcaccccgcaccaaaggtgcggggatacttattttatc(ATT)4catatttta(TAT)4 | c | 10291 | 10487 | 197 | Design Primer |
| 4 | NC_022173 | (TAT)6atttataatacttaatatattaattattattcttctcctcaccgactcttactttgtaagagtcggtgaggtg(TTA)5 | c | 13906 | 14011 | 106 | Design Primer |
| 5 | NC_022173 | (TAT)6acttattatacttattgtataatattaatattatacttattatacttattatatattattaatataatacttttatgtaa(ATT)5aatactactttcctccccgactcttacttcgtaagagtcggggtggtgttataatatgtta(ATT)5 | c | 14133 | 14321 | 189 | Design Primer |
| 6 | NC_022173 | (ATT)5ataatcattaatattatatctaataagataattattaaaacataccccgccgactgtgtcggcgggttcttatactttatctta(TCTAT)4aatatattattataagatattaattatacttatacctttaatatgatattaatac(TTAT)3ataaaat(AATA)3 | c | 14481 | 14685 | 205 | Design Primer |
| 7 | NC_022173 | (TAA)4ttaatatctataata(AAT)5(TAA)6 | c | 15060 | 15119 | 60 | Design Primer |
| 8 | NC_022173 | (TAA)6agaactaataatattaataacaacacatcccgccgacgtagtcggcgggtactaactacttatatattatatactataatatttt(ATA)4 | c | 19484 | 19598 | 115 | Design Primer |
| 9 | NC_022173 | (TATATT)7aatattaatatatatattt(ATA)4 | c | 24911 | 24983 | 73 | Design Primer |
| 10 | NC_022173 | (TATT)3a(ATTT)7 | c | 25171 | 25211 | 41 | Design Primer |
| 11 | NC_022173 | (ATAA)3atagaacacctccccgactcttacttcgtaagagtcgggg(AAT)4 | c | 26795 | 26858 | 64 | Design Primer |
| 12 | NC_022173 | (TTAA)3taattattatca(AT)8 | c | 29810 | 29849 | 40 | Design Primer |
| 13 | NC_022173 | (TTAT)3tttcctctcgccgactcttacgaagtaagagtcggcgagaggttttattatattattattaatattta(TAT)5 | c | 30004 | 30098 | 95 | Design Primer |
| 14 | NC_022173 | (TAT)4taatattatacttcccctcgccgacatagtcggcgaggtgtattc(TTA)4attattattatatatatttacattattattttaattatatattat(TTATA)3ttcccctcgccgactcttacttcgtaagagtcggcgagaggttatttat(ATTTA)3 | c | 30556 | 30748 | 193 | Design Primer |
| 15 | NC_022173 | (ATT)6(TTATA)3tgttcccctcgccgacatagtcggcgagaggttatgtattatactatatattattatacatattatttattatttatatacatatat(TA)6tttattatattttatgag(AT)6tagttatagttattatgccccccaccaaaggtggggggagacttgtattatatatatttacatatttttattatattatttatattatatatagt(TATTA)3 | c | 31000 | 31271 | 272 | Design Primer |
| 16 | NC_022173 | (TTATAT)3ttcattta(ATT)4 | c | 31418 | 31455 | 38 | Design Primer |