Compound Compound Repeats of Cyberlindnera jadinii strain CBS 1600 mitochondrion
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S.No. | Genome ID | SSR | SSR Type | Start | End | Tract Length | Primer Design |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_022163 | (TA)6ttataca(TAT)5ttattatttattattattgattattat(TTA)4 | c | 750 | 822 | 73 | Design Primer |
2 | NC_022163 | (TA)7ttatatattattactattataaatattattatatatttattattatactatactattatattattatatattattatatattat(TA)9ttatttatattataattactatatacatg(TAT)5ttattatatattatagtat(TTA)8 | c | 1345 | 1547 | 203 | Design Primer |
3 | NC_022163 | (TAT)4aatattatataga(TAT)6aatat(TA)6 | c | 2359 | 2418 | 60 | Design Primer |
4 | NC_022163 | (AAT)4atata(TAT)4attataaagggtaaaaactgagaatcgaactcagacatactgcgccacaagcagttattctacctttgaattatatttaccttaaatg(ATTA)5 | c | 3699 | 3835 | 137 | Design Primer |
5 | NC_022163 | (AATA)3a(ATTT)4 | c | 5806 | 5834 | 29 | Design Primer |
6 | NC_022163 | (TAT)4aataattttagaactacaaagaattgaactttgatccatccattatgagtggactgctttaccattaagctataattctta(AT)11aaataaatataa(AT)7taatataaatt(ATTA)4 | c | 5944 | 6111 | 168 | Design Primer |
7 | NC_022163 | (ATT)9gatgaatatgaaaattatataaatatatat(TA)6 | c | 8250 | 8318 | 69 | Design Primer |
8 | NC_022163 | (TA)10tcttacttaattataaaaatggactatatcttaaaaaattaaattttta(TTAT)4 | c | 8759 | 8843 | 85 | Design Primer |
9 | NC_022163 | (AT)6aaatatatagacatatattaatatttcgtaaaacatttccatgatgttttaccattaaacaatactctctaatata(AT)7 | c | 14810 | 14911 | 102 | Design Primer |
10 | NC_022163 | (AT)8tacttatatttaaatatattaataataatataattatttgt(ATAA)3 | c | 15715 | 15783 | 69 | Design Primer |
11 | NC_022163 | (ATA)4tatagtatattatatatatttattatatatataatatatatatactatat(TA)7 | c | 17150 | 17225 | 76 | Design Primer |
12 | NC_022163 | (TA)9ttgagaaat(ATA)4 | c | 17801 | 17839 | 39 | Design Primer |
13 | NC_022163 | (ATA)5taatattatattatatatattattttttaatgaatatgaataataataaaaaaatta(T)10 | c | 20154 | 20235 | 82 | Design Primer |
14 | NC_022163 | (TAAT)3a(TAAT)4 | c | 21455 | 21483 | 29 | Design Primer |
15 | NC_022163 | (TA)8ataattaatatttaagaaatatattaattatatataaataattattcataattataatcataattata(ATT)6 | c | 22604 | 22705 | 102 | Design Primer |
16 | NC_022163 | (TATT)4ttcattgttttattaataattat(TAA)5 | c | 23363 | 23416 | 54 | Design Primer |
17 | NC_022163 | (AT)9tataattattattataataattat(TAA)4tatatattaacttatatataaataataaattgaaatgaatatg(AATA)3 | c | 23890 | 23998 | 109 | Design Primer |
18 | NC_022163 | (TA)7atcttatagtaaattatact(ATA)4aatattgtaattattttatattactta(TATAT)3atatattatgttatataatattatttgtaatgaatatgaaaaatgataaattataataagaattataattatgattgtacagcaggtgtat(TGAA)3 | c | 25139 | 25329 | 191 | Design Primer |
19 | NC_022163 | (ATA)4ttatttatattattaattaaataaatatattaaattaaaattaatataatatactaaattaatttaaaaaatgattataaattata(AT)8tatgatgtattaaataattaaactttattaaataagttcactctcatatgttgaaatata(AT)8 | c | 29992 | 30181 | 190 | Design Primer |
20 | NC_022163 | (ATT)4ttaat(TA)6(AT)6 | c | 38341 | 38381 | 41 | Design Primer |
21 | NC_022163 | (AAT)8aaatactataatatataata(AAT)5acatgtatatagtaattataatataaata(AT)9aataatatataataatatataataatataatagtatagtataataataaatatataataatatttataatagtaataatatata(AT)7 | c | 40406 | 40609 | 204 | Design Primer |
22 | NC_022163 | (AAT)4aaataataatcaataataataaataata(AAT)5atgtata(AT)6 | c | 41131 | 41204 | 74 | Design Primer |