ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Compound Compound Repeats of Cyberlindnera jadinii strain CBS 1600 mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDSSRSSR TypeStartEndTract LengthPrimer Design
1NC_022163(TA)6ttataca(TAT)5ttattatttattattattgattattat(TTA)4c75082273Design Primer
2NC_022163(TA)7ttatatattattactattataaatattattatatatttattattatactatactattatattattatatattattatatattat(TA)9ttatttatattataattactatatacatg(TAT)5ttattatatattatagtat(TTA)8c13451547203Design Primer
3NC_022163(TAT)4aatattatataga(TAT)6aatat(TA)6c2359241860Design Primer
4NC_022163(AAT)4atata(TAT)4attataaagggtaaaaactgagaatcgaactcagacatactgcgccacaagcagttattctacctttgaattatatttaccttaaatg(ATTA)5c36993835137Design Primer
5NC_022163(AATA)3a(ATTT)4c5806583429Design Primer
6NC_022163(TAT)4aataattttagaactacaaagaattgaactttgatccatccattatgagtggactgctttaccattaagctataattctta(AT)11aaataaatataa(AT)7taatataaatt(ATTA)4c59446111168Design Primer
7NC_022163(ATT)9gatgaatatgaaaattatataaatatatat(TA)6c8250831869Design Primer
8NC_022163(TA)10tcttacttaattataaaaatggactatatcttaaaaaattaaattttta(TTAT)4c8759884385Design Primer
9NC_022163(AT)6aaatatatagacatatattaatatttcgtaaaacatttccatgatgttttaccattaaacaatactctctaatata(AT)7c1481014911102Design Primer
10NC_022163(AT)8tacttatatttaaatatattaataataatataattatttgt(ATAA)3c157151578369Design Primer
11NC_022163(ATA)4tatagtatattatatatatttattatatatataatatatatatactatat(TA)7c171501722576Design Primer
12NC_022163(TA)9ttgagaaat(ATA)4c178011783939Design Primer
13NC_022163(ATA)5taatattatattatatatattattttttaatgaatatgaataataataaaaaaatta(T)10c201542023582Design Primer
14NC_022163(TAAT)3a(TAAT)4c214552148329Design Primer
15NC_022163(TA)8ataattaatatttaagaaatatattaattatatataaataattattcataattataatcataattata(ATT)6c2260422705102Design Primer
16NC_022163(TATT)4ttcattgttttattaataattat(TAA)5c233632341654Design Primer
17NC_022163(AT)9tataattattattataataattat(TAA)4tatatattaacttatatataaataataaattgaaatgaatatg(AATA)3c2389023998109Design Primer
18NC_022163(TA)7atcttatagtaaattatact(ATA)4aatattgtaattattttatattactta(TATAT)3atatattatgttatataatattatttgtaatgaatatgaaaaatgataaattataataagaattataattatgattgtacagcaggtgtat(TGAA)3c2513925329191Design Primer
19NC_022163(ATA)4ttatttatattattaattaaataaatatattaaattaaaattaatataatatactaaattaatttaaaaaatgattataaattata(AT)8tatgatgtattaaataattaaactttattaaataagttcactctcatatgttgaaatata(AT)8c2999230181190Design Primer
20NC_022163(ATT)4ttaat(TA)6(AT)6c383413838141Design Primer
21NC_022163(AAT)8aaatactataatatataata(AAT)5acatgtatatagtaattataatataaata(AT)9aataatatataataatatataataatataatagtatagtataataataaatatataataatatttataatagtaataatatata(AT)7c4040640609204Design Primer
22NC_022163(AAT)4aaataataatcaataataataaataata(AAT)5atgtata(AT)6c411314120474Design Primer